Candidatus Hepatoplasma crinochetorum: X271_00477
Help
Entry
X271_00477 CDS
T03053
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
hcr
Candidatus Hepatoplasma crinochetorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hcr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
hcr03036
]
X271_00477 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
hcr03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
X271_00477 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_15
AAA_29
APG6_N
AAA_27
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHK22582
UniProt:
W8GK15
LinkDB
All DBs
Position
complement(506466..509309)
Genome browser
AA seq
947 aa
AA seq
DB search
MFLKKIELKGFKSFAFPTVIEFKKGLTVIVGPNGSGKSNINDALKWVLGESSKKTLRAKQ
TDDMIFSGSHTKEAASFAEVNLFFDNSNKLLEHEEDEIIITRKLYRKKNENQYFINREKV
RRKDVKNLFLDTGLGNTDLSIISQGSVAKIAEARPQDLRLLLEEASGVSKYQIHKKEAVL
KLEKVATNLEIFEVKLNGLKKQIAPLKKASEQAKNYLKIKEELTKIELPLIKSLLLDGYN
KQDELKNLEEKSKQEKILIEKILNKLAKDLKEDQVTLLDLDQEITKLHTIQNDLQNNLNK
KISFNGDKKEFSNKIKYSLYGINDLKDIIKQTENEEEDLNKQISSLKTKMFELRSETENY
IAKLNQVNFQLDNLKNADKNYNQAVKSILDNKLIFNLVYGTVKDLIKVDSQYELALETAI
GSKFKNIVVNNEKTIKETVAFLKKNKLGIATFIPAENVKEKFIIDELKSVIIKISGFNSI
LSDVIKADSKFKKVVSSLAGNIVIFNDLDSALLAAKFIQYRLSIVTLEGDIIYPGFTVKG
GFSNKNIKKFELERYQLAKEKLAKVINKNEIMIDNLENNILDFNAKRDIVQKGNIRNAER
LHFLEKDLQQLLESYHTIFKEEFDLEKLEIKKDLKKPLSLEKINNQIRNLNQKKHQLSLK
IIDSQDNQQLQNKKWQDLLQKIQYSEINLDKIERLISENTDILNKDYQLTYQNLLEKDFK
KLKEPIDEIIIKQQEYRKELRAIGYIDQEAIKRYQELTAEYQKLDHEIKELTEAKEKLTS
TIDIMDQEMIKRIKNTYLKINDRFDAIFKTLFRGGHAKIEFIEPDNLLESGLEIRASAPG
KSVKNLSLYSGGEKSLIAISLIFAINEIRNLPLLLLDEVEAALDEANVERFANFAKILNN
QTQLIIVSHRPGTMEKADILYGVTMQEKGVTSIFNVSLDKVKEEFIN
NT seq
2844 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttctaaaaaaaattgagctcaaaggttttaaatcatttgcttttcctacagtaatt
gaatttaaaaaaggacttacagtaattgttggtccaaatggttcaggaaaatcaaatatt
aatgatgctttaaaatgagttctgggagaatcatcaaaaaaaactttacgtgcaaaacaa
acggatgatatgatttttagtggatcacatacaaaagaagctgcttcttttgcagaggtt
aatcttttttttgataatagtaataaattattagaacatgaagaagatgaaataataatt
acgagaaagttgtatcgtaaaaaaaatgaaaatcaatattttattaatagagaaaaagta
agaagaaaagatgttaaaaatctttttttagatacaggattaggaaatactgatctttca
attatctcgcaaggatcggttgcaaaaatagcagaagcaagaccacaagatttgagatta
ttattagaagaggcttcaggtgtaagtaaatatcaaattcataaaaaagaagcagtttta
aaattagaaaaagtagcaactaatttagagatttttgaagttaaattaaatggattaaaa
aaacaaattgctccacttaaaaaagcaagtgaacaagctaaaaattatcttaagataaaa
gaagaacttactaaaattgaattacctttaataaaaagtcttttattagatggatataat
aaacaagacgaattaaaaaatctagaagaaaaatcaaaacaagaaaaaattttaattgaa
aaaattcttaataaactagcaaaagatttaaaagaagatcaagttacattattagattta
gatcaagaaattaccaaattacatacaatccaaaatgatttgcaaaataatttaaataag
aaaataagtttcaatggtgataaaaaagagtttagtaataaaattaaatattctctttat
ggaataaatgatttaaaagatattattaagcaaacagaaaatgaagaagaagatttaaat
aagcaaattagtagtttaaaaacaaaaatgtttgaacttagatcagaaactgaaaattat
attgctaaattaaatcaagttaattttcaattagataatcttaaaaatgctgataaaaat
tataatcaagcagtaaaatcaatattagataataaattaatatttaatttagtatatgga
actgtaaaagatttaattaaagtagattcacaatatgaattagcactagaaactgcaatt
ggatcaaaatttaaaaatattgttgtaaataatgaaaaaacaataaaagaaacagttgct
tttttgaaaaaaaataaattaggaattgctacttttattcctgcggaaaatgtaaaggaa
aaatttattattgatgaacttaaaagtgtaattattaaaattagtggttttaattctatt
ttaagtgatgtaattaaagcagattctaaatttaaaaaagtagtatcttcacttgcggga
aatattgttatttttaatgacttagattctgctcttcttgctgctaaatttattcaatat
cgtttatcaatcgttactttagagggtgatattatttatcctggttttacagtaaaggga
ggatttagcaataaaaatattaaaaaatttgaacttgaaagatatcaattagcaaaagaa
aaattagcaaaagtaattaataaaaatgaaataatgattgataatctggaaaataatatt
ttagattttaatgcaaaaagagatattgttcaaaaaggaaatattcgcaatgctgaaaga
ttacattttttagaaaaagatcttcaacaattattagaaagttatcatacaatttttaag
gaagaatttgatttagaaaaattagaaattaaaaaagatcttaaaaaacccttatcacta
gaaaaaataaataatcaaataagaaatttaaatcaaaaaaaacatcaattatcactaaaa
ataatagattcacaagataatcaacaattacaaaataaaaaatgacaagatttattacaa
aaaattcaatattcagagattaatcttgataaaatcgaaagattaatctctgaaaatacc
gatattttaaataaagattatcaattaacttatcaaaaccttttagaaaaggattttaaa
aaattaaaagaaccaattgatgaaattattattaaacaacaagaatatcgaaaagaatta
cgagcaattggatatattgatcaagaagcaattaaaagatatcaagaattaactgcagaa
tatcaaaaattagatcatgaaattaaagaattaacagaagcaaaagaaaaattaacttct
acaattgatattatggatcaagaaatgatcaagcgaattaaaaatacttatttaaaaata
aatgatcgttttgatgccatttttaaaacattatttagaggtggacatgctaaaattgaa
tttattgaaccagataatttattggaatctggacttgaaataagagcttctgctcctgga
aaatctgtaaaaaatctttccttatattcgggaggagaaaaatcattgattgctatttct
ttaatttttgcaattaatgaaattagaaatcttcctcttttattattggatgaagtagaa
gcagcattagatgaagcaaatgtagaaagatttgcaaattttgctaaaattttaaataat
caaacacaattaattattgtatctcatagaccaggaacaatggaaaaagcagatatctta
tatggtgttacaatgcaagaaaaaggtgttacaagtatttttaatgttagtttagataaa
gtaaaagaagaatttataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system