Haemophilus ducreyi: HD_0878
Help
Entry
HD_0878 CDS
T00135
Symbol
sppA
Name
(GenBank) protease IV, signal peptide peptidase
KO
K04773
protease IV [EC:3.4.21.-]
Organism
hdu
Haemophilus ducreyi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hdu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
hdu01002
]
HD_0878 (sppA)
Peptidases and inhibitors [BR:
hdu01002
]
Serine peptidases
Family S49: protease IV family
HD_0878 (sppA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S49
CLP_protease
NfeD1b_N
SDH_protease
ECH_1
Peptidase_S49_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAP95764
UniProt:
Q7VMT9
LinkDB
All DBs
Position
complement(700711..702567)
Genome browser
AA seq
618 aa
AA seq
DB search
MLKLFKGIYAIFLCVRECIINLFFILFLLTGFASIAFLVNGSDTNKSKEPNEKVALRLNL
SGYLTDNHDDFAHRLIQSELTNDESLKASTFDVVRAIGKAAKDPNITGIVLDLSKFEGSD
HSSLSFIGSELKAFKTSGKPVIAIGENYSQSQYYLASFADKIYLNKAGSINLQGLNFSSL
YFKALLDKIDAVPHIFRVGTYKSAVEPFLRNDMSDEAKQNAQTLLNSIWHQFRTDIAENR
MIAVDQVLPEPKSLIEKYKAVNANDAQYALNQKLVTDIGSKAEIEQALIEQFGKNEKGIY
QHINYADYALNLTDRFAVNAEHKIAVINVEGEIISGKSKERSAGSETISELLRQAREDNN
VDGVILRVNSPGGSVVASEIILQELQSIQQAGKPVVTSMGGLAASGGYWISATSDKIIAS
PNTITGSIGIFGLAMTFEKTAKHLGISEDGVATSPLAKTSSLQHLSNEHAELIQINIENG
YDAFLDLVSRGRNMSKAEVDKVAQGQVWSGEDALKHGLVDQLGDFHTAYDVLTDLINQKR
KAKGENEIKHFTAQWFIESDKGLFSSLLKNIGFKAKSTLAVWLGLPFVPQTQQAAELLQK
FNDPQNTYLYCLTCGTIK
NT seq
1857 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaagctgtttaaaggtatttatgccatttttctctgtgttcgcgaatgtataata
aacctcttttttattttatttctattgacgggctttgcctctatcgcctttttagtgaat
ggaagtgatacaaataaaagcaaagagcctaacgaaaaagtagccttgcggcttaattta
agcggttatttaacagataaccacgatgattttgctcaccgcttaattcaaagcgaatta
acgaatgacgaatcgctcaaagcgtctacttttgatgtcgtacgtgccattggcaaagcg
gcgaaagatccaaatattacgggcatcgtgttagacctttcaaaatttgaaggcagtgat
cattcatcattaagtttcattggtagtgaattaaaagcctttaaaacatcgggtaaacca
gtgattgccattggggaaaactatagtcaatcacaatattatttagccagttttgccgat
aaaatttatttaaataaagcaggttcaatcaatttgcaagggttgaattttagttcgctt
tatttcaaagccttgctcgataaaattgatgctgtaccgcatattttccgagtaggcact
tataaatcagcggttgaaccattcttgcgcaatgatatgtctgatgaagcaaaacaaaat
gcgcaaacattattaaattcaatttggcatcaattccgtacagatattgctgaaaatcgt
atgattgctgtcgatcaagttttacctgaacccaaaagcttgattgaaaaatacaaagcc
gttaacgctaatgacgctcaatatgccttaaaccaaaaattagtgaccgatatcggcagt
aaagcagaaattgaacaagcattaatcgaacaattcggtaaaaatgagaaaggcatctat
caacacattaattatgccgattatgctttgaatctaacggatcgttttgctgtcaatgca
gaacacaaaattgccgtgattaatgtagaaggtgaaattatttctggcaaaagcaaagaa
agatcagcgggtagtgaaactatttctgaattattacgccaagcacgcgaagacaataat
gttgatggtgtgatattacgagttaacagcccgggaggtagcgtggttgcttctgaaata
atcttgcaagaattacagtctattcaacaagccggcaaacctgttgtaacctcaatgggg
ggcttagctgcttcaggtggctattggatttcagcaacgagcgataaaattattgccagc
ccaaatacgatcacaggttcaattggtatttttggcttagccatgacctttgaaaaaacg
gctaaacatctaggcataagtgaagatggtgtagccacttctccattagcgaaaacaagc
tcgttacagcatctatcgaatgaacatgctgaattaattcaaatcaatattgaaaatggc
tatgatgctttcttagatttagtcagtcgtggtcgaaatatgtcaaaagctgaagtagat
aaagttgcgcaaggtcaagtatggtctggtgaagatgcacttaagcacggcttagtcgat
cagctaggcgatttccatactgcatatgatgtactaactgatttaatcaatcaaaaacgt
aaagccaaaggcgaaaatgaaattaaacatttcaccgcgcaatggtttattgaaagtgat
aaaggtttattcagttcactcttgaaaaatattggttttaaagctaaatcaacgctagcg
gtttggttgggtttaccttttgttccccaaactcaacaagcggctgaattattacaaaaa
tttaatgaccctcaaaacacttatttatattgcctgacttgtggcacgataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
