Helicobacter pylori BM012A: U063_0194
Help
Entry
U063_0194 CDS
T02939
Name
(GenBank) Outer membrane protein HopI
Organism
heb
Helicobacter pylori BM012A
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Alpha-E
COG2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA87560
LinkDB
All DBs
Position
complement(194469..198098)
Genome browser
AA seq
1209 aa
AA seq
DB search
MSVGYQIGGTQQFINNKQLLENQNIINSVTQSAINIAGPTTGLITLSSQTVIDALGYGVS
NTVGNQLEGISNILNQIGKRKDFYSSRQISSISQQIIGLKGSSDPLKAHSSQITAKLLSN
TQSAFDQGIALSSNIISAVNSLNPSNNTQEVKAQLQNTAQSMTELLQQIEHSITKTTSTT
YAQSLLSNLTDAVNASSDNTAYVSALVNALNTLGVGVFPTTTSTHVVLNPPGQVVFYPTN
SLLGSTSSNSNNQQQYNNTLLMNTLQGTLSANNQNNPNGCANQVQCLEQFIQNLAPLAAT
PTSTNQANQQVQAIAQKLQSVAINTLDNNAINNTTYNLNNLHNALNFQAYESTIEQYNNA
LKQISWITFSEPKNLLKNTSNNYQIGTVTNAQGQNISAYDCTSATGSLSSNASSGISCSA
TSSTSSTNSFDNSLVATSKVQTINGKEQIGVNSFNLVSQVWSVYNSLKTSEANLQKNAKI
LCPNGSNGSQDACNNASSSGGLSISGNAQLQNILSSRTTTTTQAKSNASKLKAMAVVNNE
EEAKTTNLAQSSGPTTQSPSSTVMGALNTVLQNVSNFQQSIQNAFQNQESNIQAWANAIY
NTNGSQSQEMTPNNNQDLRIQLRANFYQLINTINQQVPTDMSALINQSQQTQQTSGATSN
NNACASGTNGSNSNWCYQQWSDSKAYYSGLQSALGYQTQATTQSGSSGGNSITYNVQQIT
LTSNGLLNQIITNLKGVNGGSNGGSSGNGTSQINTAYQMLTDASDGKLGTYTNNAYQTCT
NGSNGGSGSNCYEPNKQQSTTTATTNATTATTNATTTTNSNLQKVYNDAQKIANIIASSG
NNKGVENGLKQFFEALKSNSSSLSNLCGNGSSGSSGASSTCSGGLINLLGAIPTNGVSDT
NNLINLLTEFIKTAGFIQNNDSNVSTSLTSAFQAITSAISQGFQALQNDISPNAILTLLQ
EITSNTTTIQSFSQTLRQLLGDKTFFMVQQKLIDAMINARNQVQNAQNQANNYGSQPVLS
QYAAAKSTQHGMSNGLGVGLGYKYFFGKARKLGLRHYFFFDYGFSEIGLANQSVKANIFA
YGVGTDFLWNLFRRTYNTKALNFGLFAGVQLGGATWLSSLRQQIIDNWGNANDIHSTNFQ
VALNFGVRTNFAEFKRFAKKFHNQGVISQKSVEFGIKVPLINQAYLNSAGADVSYRRLYT
FYINYIMGF
NT seq
3630 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgtaggctatcaaatcggcggcacgcaacaattcatcaataacaaacaactttta
gaaaatcaaaacatcatcaacagcgtaacccaaagcgcgatcaatattgcagggcctact
accggccttatcactttaagctctcaaaccgtcattgacgctttaggctatggcgtgagt
aacactgttggcaaccaattagaaggcatttctaatatcctaaatcaaattggtaaaaga
aaagacttttattctagccgtcaaatctctagcatttcccaacaaatcatagggcttaaa
ggaagctctgatcccttaaaagcccattcttcacaaatcacagccaaactcctttccaac
acccaaagcgcgtttgatcagggcattgcactaagctctaatatcattagcgcagtcaat
agcctaaaccctagcaacaacacccaagaagtcaaagcccagctccaaaacaccgcgcaa
tccatgacagaattattgcaacaaattgaacacagcatcactaaaaccactagcaccact
tacgcgcaatccttactctccaatctaaccgatgcagtgaatgcctctagcgataatacc
gcttatgtgagcgctcttgttaacgctttaaacactttaggggtgggggttttccccacc
acaacctcaacgcatgtggtgttaaacccaccgggacaagtcgtattctatccaactaat
tcccttttaggctccacttcttcaaacagcaacaaccaacaacaatacaacaacaccctt
ttaatgaacaccttgcaagggacattaagcgctaataatcaaaataaccccaatggttgc
gccaatcaagtccagtgtttagaacaattcatccaaaatttagcccctttagccgcaacc
cccacttcaactaaccaagccaaccagcaagtccaagccatcgctcaaaaacttcaaagc
gttgctatcaacactttagacaacaatgcgatcaacaacaccacctataatttaaacaac
ttgcacaacgctttgaatttccaagcctatgaaagcacgatagaacaatacaataacgct
ttaaaacaaatttcttggattacttttagcgagcctaaaaacttgctcaaaaacacttct
aacaattaccaaatcggcacggttaccaacgctcaagggcaaaatatcagcgcctatgat
tgcacaagcgctaccggaagcctttctagcaatgcttctagcgggatttcatgctcagcc
acaagctccacaagttccacaaatagttttgacaattctttagtcgctacctccaaagtc
caaaccatcaacggcaaagagcagatcggcgtgaattctttcaatcttgtttctcaagtg
tggagcgtttataactctttaaaaacttcagaagccaatttgcaaaaaaacgctaagata
ctatgcccaaatggcagtaacggctcgcaagatgcatgcaataacgctagctcttcaggg
ggtttgagcatcagcgggaacgcccaattgcaaaatattttaagctctaggactaccact
accactcaagctaaaagcaacgcttccaaactaaaggcgatggcggtggtgaataatgaa
gaagaagccaaaacgaccaatttagctcaaagcagtgggccaaccacacaatctcctagc
agcacggtgatgggagctttaaacaccgtattgcaaaatgtcagcaatttccaacaaagc
attcaaaacgcttttcaaaaccaagaaagcaatatccaagcttgggcgaatgcgatttac
aacactaatgggagtcagtcgcaagagatgacacctaacaataaccaagatttacgcatc
caattaagagcgaatttttaccagctcatcaataccattaaccagcaagtgcctacagac
atgagcgctttaattaatcaaagccaacaaacccaacaaacaagtggggcaacgagcaac
aataacgcatgcgcgagcggaacgaatgggagtaatagcaactggtgctatcagcagtgg
tccgattctaaggcttattacagcgggttgcaaagcgctttagggtatcaaacacaagcg
acaactcaaagcgggagcagtggtgggaacagcatcacctacaatgtccaacaaatcacg
ctcactagtaatggtttgctcaatcaaattatcacaaaccttaagggcgttaatgggggc
agtaatgggggaagcagtgggaatggcactagtcaaatcaacacagcctatcaaatgctc
acagacgctagcgatgggaaattagggacttatactaataacgcctaccaaacatgcacc
aacggaagcaatggaggcagtgggagcaattgttatgaacccaacaaacaacaaagtacc
accaccgcaaccactaacgcaaccaccgcaaccactaacgcaaccaccacaaccaacagc
aacttgcaaaaagtctataatgacgcccaaaaaatagctaacattatcgccagctctggg
aacaataagggcgttgaaaacggcttaaaacaattctttgaagcgctaaaaagtaatagc
agcagtctcagtaatttatgtggtaatggtagtagcggtagtagtggcgctagctctact
tgctccggtgggcttatcaaccttttaggggcaatccctacaaatggggtgagcgatacg
aacaatttaattaatttgctcaccgaatttattaaaaccgctgggtttatccaaaataat
gatagtaatgtatctactagtctcacaagcgcttttcaagccattacgagcgctatttct
caagggtttcaagccttgcaaaacgacattagccctaatgcgattttaaccttgctccaa
gaaatcacttctaacaccaccaccattcagtcattctcgcaaaccttacggcagctttta
ggggataaaacgttctttatggtgcaacaaaaactcattgatgcgatgattaacgccaga
aatcaggttcaaaacgcgcaaaatcaagccaataactacggctctcaacccgttttaagc
cagtatgcggccgctaaaagcacccaacacggcatgagcaatggcttaggggttggtttg
ggctataaatacttctttggtaaagcgagaaaattgggccttaggcattattttttcttt
gattacggctttagtgaaataggcctagccaatcaaagcgtgaaagcgaatatctttgct
tatggggtaggcacggattttttatggaatttattcaggaggacttacaacactaaagcg
ttgaattttgggctatttgctggggtccaactgggcggtgcaacctggcttagctcccta
aggcaacaaatcattgacaattgggggaacgctaatgacatccattcaacgaattttcaa
gtggcgctgaattttggggtgcgcaccaacttcgcggagtttaagcgttttgctaagaaa
ttccacaatcaaggggtcatcagccaaaagagcgtggaatttgggatcaaagtgcctctc
atcaatcaagcgtatttgaatagcgccggggctgatgtgagttacaggaggctttatact
ttctatatcaattacatcatggggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
