KEGG   Helicobacter pylori BM012A: U063_0915
Entry
U063_0915         CDS       T02939                                 
Name
(GenBank) vacuolating cytotoxin-like protein
Organism
heb  Helicobacter pylori BM012A
SSDB
Motif
Pfam: VacA2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHA88261
LinkDB
Position
922322..931906
AA seq 3194 aa
MIDKNNKIDLKNKRFKKRSFKGVKKKIAKKYKAKNPSLIAHAFKTQSSFSLSLNKKIFLG
LGFVSALSAEDYKSSVYWLNSVNENNSNKSYYVSPLRTWAGGSRSFTQNYNNSKLYIGTK
NASSTPNHSSVWFGEKGYIGFITGVFKARDIFITGAVGSGNEWKTGGGAILVFESSNELS
ANGAYFQNNKAGTQTSWINLISNNSVNLTNTDFGNQTPNGGFNVMGRKITYNGGIVNGGN
FGFDNVDSNGATTISGVTFNNNGALTYKGGNGIGGSITFTNSNINHYKLNLNANSVTFNN
STLGSMPNGNTNTIGNAYILNASNITFNNLTFNGGWFVFNRPDAHVNFQGTTTINNPTSP
FVNMTGKVTINPNAIFNIQNYTPSIGSTYTLFSMKNGNITYNDVGNLWNIIRLKNTQATK
DNSKSATSNNNTHTYYVTYNLGGTLYHFRQIFSHDSIVLQSIYYGAYGTNDLYYTNSVNI
HDNVFNLKNINDDRADTIFYLNGLNTWNYTQARFAQTYGGKNSALVFNATTPWANGAIPK
SNSTVRFGGYEGVNWGKTGYITGTFTADRVYITGNMMSGNGAQTGGGATLNFVGATEMNI
AGATFKNLKTTSQNSYMTFIALGNGSGSGKINVSQSDFYDWTGGGYDFTGNSAFDSVNFN
KAYYKFQGAENSYNFKNTNFLAGNFKFQGKTTIEKSVLDDASYTFDGANNAFNENKFNGG
SFSFNHAEQTNTFNNNSFNGGSFSFNAKRVDFNHNSFNGGVFNFNNTPKVSFTDDTFNVN
NQFKINGAQTTFTFNKGVVFNMQGLLSSLSVGTTYQLLSAKSVDYKDNNALYQMLRWISG
ENPSGTLVDKDQSVPSNAKIYNVHFTDNGLTYYIKENFNNGITLTRLCTLGYTHCVNIDN
DAFNLKNVNNNASNTVFYLNGMTTWKIAGTGVFTQDYSGANSVLVFNQTTPFLAGANPTS
NSVVGFGKTSGAEWGLVGYIQGVFKANQIDITGTIRSGNGAKTGGGATLVFNAQKRLNIA
NAHLNNDKAGLQNSWMNFIVNNGNLNAINANFSNQTPHGGFNLKANNITFNGGSVSGEGN
FGVDNANSNGATTISGVTFNNNGTLIYKGGENSAGNSLTLENNTFNSYNINAKVQNLIFN
NNSFNGGSYSFNDTKNTTFKGTNTLINSDPFSRLQGSIAIENNSIFNIERDLTNNTTYTL
LSGNSIKYNNEIVADNVFSKNLWNLIHYGGERGTLLRTEKNTYFVQFTQSNGQKFVFEET
FNPGSITYKYFTIHSSPFHTDADSKDIWSQVRKQFDFIPGKTPVCVGVCYIAPYKNQDLI
GSSAFAWSLNFGATVVGTLLLGSAQEKANNNGGSIWFGKNNLLYLHGNFNATNIFLTNNF
NVGNPNAGGGATISFNADETLNADGLNYTNFQTVAMGLQTSASQHSWANFNSRLSMEIKN
SNFRDFTWGGFNFNSGRIAFENTTFSGWTNINGATESGSSYVNMVANTDLMFSNSILGGG
IRYDLKANNIIFNNSQMVIDVSKNVNQSSLNGNVTFNNSRLSVKPNAAINIGGDQTQTAL
ENASSLSFYNNSVANFNGTTAFNGVSYLNLNPNAQVSFNQTNFNNANVTFYGIPLFGKTP
DFGNSVRLINFKGNTNFNQATLNLRAKNIHINFQGASTFKQNSTMNLAESSQASFNTLSV
EGETNFNLNGSSLLNFNGNSVFNAPVSFYANNSQISFTQLATFNSDASFDLSNNSTLNFQ
SVLLNGALNLLGNGANALSINASGNFSFGTQGILNLSNVNLFDAENKPLVYNILQAQNIQ
GLTGNNGYEKIRFYGIQIDKADYSFNNGVHSWRFTNPLNTTETITETLHNNRLKVQISQN
GVSNNTMFNLAPSLYDYQKNPYNETENSYNYTSDKAGTYYLTSNIKGFNQNNETLGTYNA
QNQPLQALHIYNQAITKQDLSVIASLGKEFLPKMANLIASGALDNLNLNSPDSFETLFGI
FEKYGITLTQANWKSLLKIINNFSNTANYHFSQGNLVVGAIKEGQTNTKSVVWFGGDGYK
EPCTVGDNTCQMFRQTNLGQLLHSSAPYLGYINANFKAKNIYITGTIGSGNAWGSGGSAN
VSFESATNLVLNQANIDVQGTDKIFSYLGKEGIEKLFGEKGLGNALSNIIYEESLKNNAI
PKDLASMIPKDFGSKTLSSLLSPTEVNNLLGVSAFKNAIMEILNSKTVGDVFGENGLLNV
LDPIKRKEIDQMLLEQIQAHSSGFEKFIVKTLGIENVENFINTWYGKQSLSSFANNFVPG
GLNQALDKIGSSSDSKDLQGFLDKTTFGDILNQMINQAPLINKLISWLGPQDLSVLVNIA
LNNITNPSKELTSTISSIGEKALNDLLGEGVVNKIMSNQVLGQMINKIVADKGLGGVYHQ
GLGSILPQSLQDELKQLGFGSLLGSRGLHNLWQKGNFNFSAKDYVFINNSSFNNATGGEL
NFVAGKSIIFNGKNTINFTQYYGKLSFVSKDFSNISLDTLNATNGLTLNAPKNDISVQKG
QICVNVLNCMTAKGSAKTANSSSSTITPTDETLEVNANNFAFLGTIKADGLVDFSKVLQN
TTIGTLDLGSNALLRANNLIVNNAFNNNSNYRADISGNLNVVKGATLSTNENGLNVGGNL
KSEGPLIFNLNNPTHQTIINVTGTSTIMSYNNQALIHFNTQLKQGAYTLMDAKRMLYGYD
NQIIRGGSLSDYLKLYTLIDFNGKRMQLNGDSLSYDNQPVNIKDGGLVVSFKDNQGQMVY
SSILYDKVQVSVSDKPINIQAPSLEYYIKYIQGSAGLNAIKSAGNNSLMWLNALFVAKGG
NPLFAPYYLQDTPTKHIVTLMKDITSALGMLSKPNLKNNSTDVLQLNTYTQQMGRLAKLS
NFASFDSTDFSERLSSLKNQKFADAIPNAMDVILKYSQRDKLKNNLWATGVGGVSFVENG
TGTLYGVNVGYDRFIKGVIVGGYAAYGYSGFYERITSSKSDNVDVGLYARTFIKKSELTF
SVNETWGANKTQISSADTLLSMINQSYKYNTWTTNARVNYGYDFMFKNKSIILKPQIGLR
YYYIGMTGLEGVMHNALYNQFKANADPSKKSVLTIDFAFENRHYFNTNSYFYAIGGIGRD
LLVRSMGDKLVRFIGDNTLSYREGELYNTFASITTGGEVRLFKSFYANAGVGARFGLDYK
MINITGNIGMRLAF
NT seq 9585 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgataaaaacaataaaatagatttaaaaaacaaacgctttaaaaaacgctctttt
aagggcgttaaaaagaaaatcgctaaaaaatataaagccaaaaatccgtccttaatcgcc
catgcatttaaaacgcaatcaagtttttctctatctctcaacaaaaaaatcttcttaggg
ctagggtttgtttcagctttgagcgctgaagattataagagttcggtgtattggctcaat
agcgtgaatgaaaataatagcaacaaatcttactatgtcagccctttacgcacttgggct
ggggggagtaggagttttacgcaaaactataataatagtaagttatacatagggacaaaa
aacgcttcttcaacgcctaatcattcttctgtgtggtttggggaaaagggctatatcggt
tttattacaggagtttttaaggctagagacatttttatcacaggagctgttggatcgggt
aatgagtggaaaaccggtgggggtgcgatacttgtttttgaaagctcaaacgaattaagc
gctaatggggcttattttcaaaataataaagctgggacgcaaacttcttggatcaatttg
atttccaataacagcgtgaatttgacaaacacggattttggcaaccaaacccctaatggg
ggctttaatgttatggggcgaaagattacttataatggcgggatcgtcaatggcgggaat
tttggctttgataatgtggatagcaacggcgcaaccaccattagcggagtaactttcaac
aataacggtgcactcacttataagggtgggaatggtattggggggagcatcaccttcact
aactctaatatcaatcattacaaactcaatcttaacgccaatagcgttacttttaataac
agcactctaggaagcatgcctaatggcaacactaatactataggaaatgcctacattctt
aatgcaagcaatattacttttaataatttgaccttcaatgggggttggttcgtttttaat
agacctgatgctcatgttaattttcaaggcacaaccacgatcaacaaccccacttcaccc
tttgtcaatatgaccggtaaggttactattaatcctaatgcgatttttaacattcaaaat
tacacgcctagcataggaagcacttacacgctctttagcatgaaaaatggcaacatcact
tataatgatgtgggtaacttatggaatatcatcagacttaaaaacacgcaagccacaaaa
gataatagcaaaagcgccacttctaataacaacacccatacttactatgtaacctacaat
ttaggcggcacactctatcatttcagacaaatttttagccatgattctattgttttacaa
tctatctattatggcgcgtatggcacgaacgatctttactacaccaatagcgtgaatatt
catgataatgtctttaatttaaaaaatattaatgatgatagagctgatacgattttctac
ctcaacggcttaaacacttggaattatacgcaagcaagatttgctcaaacctatggtggg
aaaaacagcgctttagtctttaacgctacgaccccttgggctaatggcgcaatccctaaa
tctaacagcacggtgcgttttggggggtatgagggagtcaattgggggaaaacgggctat
attactggcactttcacggccgatagggtttatatcaccggcaacatgatgtctggtaac
ggcgctcaaaccggtgggggggcgactttgaattttgtgggcgcgactgaaatgaatatc
gctggagccacttttaaaaacctaaaaaccacttcacaaaactcttacatgacttttatc
gctttagggaatggctccgggagtggcaagatcaatgtttctcaatctgatttttacgat
tggacgggtggggggtatgattttaccggtaacagcgcttttgatagcgtgaatttcaac
aaggcttattacaaatttcaaggcgctgaaaattcttacaattttaaaaacacgaacttt
ttagcagggaattttaagtttcagggcaagaccaccattgaaaaatctgttttagatgac
gcttcttacacttttgatggtgcgaataacgcctttaatgaaaacaaatttaatggcgga
tcgtttagtttcaaccatgcagagcaaacaaacacttttaataataactcgtttaatggc
ggatcgtttagttttaacgccaagcgagtggattttaatcataactcgtttaatgggggc
gtgtttaatttcaataatacccctaaagtcagttttactgatgacactttcaatgtgaat
aaccaatttaaaataaatggcgctcaaacaactttcactttcaataagggcgttgttttt
aacatgcaagggcttttgagtagcctaagcgtaggcacgacttatcaattactcagcgct
aaaagcgtggattataaggataataacgctttgtatcaaatgttgcgttggattagtggg
gaaaaccctagcggcacgctagtggataaggatcaatccgtaccaagcaacgctaaaatt
tataatgtccatttcactgataatggcttgacttactacatcaaagaaaattttaataat
gggatcacgctcactcgtttatgcactctaggctatacgcattgcgtgaatattgataac
gatgcgtttaatcttaaaaatgtcaataataacgccagtaacaccgtgttctatctcaac
ggcatgacgacttggaagatcgctggcacaggcgttttcacgcaagattatagcggcgct
aacagcgttttagtgttcaaccagaccaccccctttcttgctggggcaaatcccacttcc
aatagcgtggtgggttttgggaaaacttcgggggctgaatgggggttagtgggctatatt
caaggcgtttttaaagccaatcaaattgatattaccggcacgattcgctctggtaatggg
gccaaaaccggtgggggtgcgactttagtgtttaacgctcaaaagcgtttgaatatcgct
aacgctcatttgaataacgataaagccggtttgcaaaattcatggatgaatttcattgtt
aataatggtaatttgaatgcaataaacgccaattttagcaaccaaaccccgcatggaggc
tttaaccttaaagccaataacattacttttaatggggggtctgtgagtggagaggggaat
tttggcgtggataacgccaatagcaatggtgcaaccaccattagcggagtaactttcaat
aataacggcaccttgatttataaagggggtgaaaacagcgctggaaattccctaacccta
gaaaacaacactttcaattcctacaatatcaacgcaaaagtgcaaaaccttatttttaac
aacaactcgtttaatggcggtagctattcgtttaatgacactaaaaacaccacttttaaa
ggcacaaacacgctcattaacagcgatcctttcagccgtcttcaaggctcaatcgctatt
gaaaataatagtatttttaacattgaaagggatttgaccaacaacaccacctacacgctt
ttaagcgggaatagcattaaatacaataatgaaattgtggcggataatgttttttcaaaa
aatttatggaatttaatccattatggtggcgagagagggactttattaagaacggagaaa
aacacttattttgtgcaattcacccaaagcaacggccaaaaatttgtttttgaagagact
tttaacccgggctctatcacttataaatatttcactatccattcttcgcctttccacaca
gacgctgattctaaggatatttggagtcaagtgaggaagcaatttgacttcattccagga
aaaacccctgtgtgtgttggcgtgtgctatatcgcgccttataaaaatcaagaccttatt
ggctctagcgcttttgcgtggtcgctgaactttggggctacggtggtagggactttgctt
ttagggagtgcgcaagaaaaggctaacaataatggcggatctatctggtttggtaagaat
aatttgctgtatttgcatggcaatttcaacgcgactaatatctttttaacgaataacttt
aatgtcggcaaccctaacgccggcggtggggcgacgattagttttaacgctgatgaaacc
ttgaacgctgacgggttaaattacacgaatttccaaaccgtggctatgggcttacaaacc
agcgcaagccagcattcttgggcgaattttaattccaggctttctatggagattaaaaac
tctaactttagggatttcacatggggaggctttaattttaattcagggcgtatcgctttt
gaaaacaccacttttagcggttggactaatattaacggggcgactgagagcggttcgtcg
tatgtgaatatggttgcgaatacggatttgatgttttctaattccattttaggagggggc
attcgctatgatttgaaagctaataacattattttcaataactctcaaatggtcattgat
gtgtctaagaatgtgaatcagtcttcattgaatgggaatgttactttcaataattccagg
ctttcagtcaagcccaatgcggctatcaatattgggggggatcagacccaaacggcttta
gaaaacgcctcaagcctttctttttacaacaacagcgtggcaaattttaacggcacaacc
gcttttaacggggtgtcttatttgaatttgaaccctaacgctcaagtaagcttcaatcaa
acgaacttcaataacgctaatgtaactttttatggcatcccattatttggtaaaacgcct
gattttggcaactctgtgcgccttatcaatttcaaagggaatacgaattttaatcaagcg
acactcaatttaagggctaaaaatatccatatcaatttccaaggcgcttccacttttaaa
caaaattctacgatgaatttagctgaaagttctcaagcgagctttaatacgcttagcgtg
gaaggggaaacgaatttcaatctcaacggatcaagcttgttgaatttcaatggcaacagc
gtttttaacgcccctgtgagtttttatgctaacaattctcaaatttctttcactcaatta
gcgacttttaattctgacgcttcttttgatttaagcaacaacagcaccctgaattttcaa
agcgttcttttaaatggcgctttaaaccttttaggcaatggcgctaacgctttatccatt
aatgcaagcgggaatttcagctttggaactcaagggattttgaatctgtctaatgtgaat
ttatttgacgcagaaaacaagcccttagtttataatattttacaagctcaaaacattcag
ggtttaacggggaataacggctatgagaagatccgtttttatggcatacagattgacaag
gctgattactcgtttaataacggcgttcattcgtggagattcactaacccgctcaatacg
actgaaacgattacagaaaccttgcataacaaccgcttgaaagtgcagatctctcaaaac
ggcgtttctaataatacgatgtttaatctcgctcctagcttgtatgattaccaaaaaaac
ccttataatgaaaccgagaattcctataattacacaagcgataaggccggcacttattat
ttaacgagcaatatcaaaggctttaatcaaaacaatgaaacactagggacttataacgca
caaaaccaacccttacaagccttacacatttataatcaggctatcactaagcaggattta
agcgttattgccagtttgggtaaggaatttttgcctaaaatggctaatcttatcgcttca
ggggctttggacaatctcaatctcaatagcccggatagttttgaaactctttttggtatc
tttgaaaaatatggtatcactttaactcaagcaaattggaagagcttattaaagattatc
aataatttttccaacacggctaattatcatttctctcaaggcaatctcgtggtgggggcg
atcaaagaagggcaaacgaacactaaaagcgtggtgtggtttggaggcgatgggtataaa
gagccatgcacggttggggataacacttgccagatgtttagacagactaatttaggacag
ttgctccattctagcgcgccttatttgggctacattaacgctaattttaaggctaaaaac
atttacattaccggaaccatcggtagcgggaacgcttgggggagcggagggagcgcgaat
gtgtcttttgaaagcgcgacgaatttggtgctcaatcaagccaatattgacgttcaaggg
accgataaaatcttttcttacttggggaaagagggcattgaaaagctttttggagaaaaa
ggtttagggaatgcgctttctaatatcatttatgaagagagtttgaaaaataacgctatc
cctaaagatttagctagcatgatccctaaagattttggatctaagactttaagctcattg
cttagccctactgaagtgaataacctcttaggcgtgagcgcttttaaaaacgcgatcatg
gaaatcttaaattctaaaacggtgggcgatgtttttggtgaaaacgggcttttaaacgtg
ctagatcctataaaaagaaaagaaatcgatcaaatgcttttagagcaaatccaagcccat
tcttcagggtttgaaaaattcatcgtgaaaactttagggattgaaaatgtagagaatttc
atcaatacttggtatggcaagcaaagcttgagttcttttgccaataattttgtgcctgga
ggcttgaatcaagcccttgataaaataggttctagctctgattccaaagacttacagggt
ttcttagacaaaacgacttttggggatattctcaatcaaatgatcaatcaagccccctta
atcaataagctcatttcttggctaggcccacaagatttgagcgttttagtgaatatcgct
ttaaataacatcactaaccccagcaaagagctgactagcaccatttctagcataggtgaa
aaagcgttaaatgacttattaggcgaaggcgtagtgaataaaatcatgagcaatcaagtc
ctagggcaaatgatcaataaaatcgtcgctgataagggattaggaggcgtttatcatcaa
ggtttaggctctatactgcctcaatctttacaagatgagttaaaacaattgggctttgga
tctttactaggttctaggggattgcacaatctttggcaaaaagggaattttaatttctca
gctaaagattatgtgtttatcaataacagctcgttcaataacgctacagggggggaattg
aattttgtagcaggcaagtccattatttttaacgggaaaaatacgatcaatttcacgcag
tattatggcaagctttcttttgtatctaaagatttttctaatatttcattagatacctta
aacgctaccaacggcttaacgctgaatgctcctaaaaatgacattagcgttcaaaaaggt
cagatttgcgtgaatgttttaaattgcatgaccgctaaaggaagtgcaaaaacagctaat
tcttcttcaagcaccataaccccaaccgatgaaacgctagaagtgaatgcaaataatttc
gctttcttaggaacgattaaagcggacggattagtggatttttcaaaagttttacaaaat
accacgatcgggactttggatttagggtcaaacgctcttttaagggcgaataacttgatc
gtgaataacgcttttaacaacaactctaattacagggctgatattagcggtaatctcaat
gtggtaaaaggagcgactctcagcacgaatgaaaatggtttgaatgtgggggggaatttg
aagagcgaagggccattaatctttaatcttaataaccccacccatcaaacgattattaat
gtaactggcacttctacgatcatgtcttacaacaatcaggctttaatccattttaatacc
caactcaagcaaggtgcttacacgcttatggacgctaaacgcatgctttatggctatgat
aatcaaatcattcgtggagggagcttgagcgattacctcaagctttacaccctcattgat
tttaacggcaaacgcatgcaattaaacggcgattcactaagctatgacaaccaaccggtc
aatattaaagatgggggtcttgtggtaagctttaaagataatcaagggcaaatggtgtat
tcatctatcctttatgataaagttcaagttagcgtctctgataaacccattaacattcaa
gcccctagtttggagtattacatcaaatacattcaaggtagtgctggtttgaatgcgatc
aaatctgcgggcaataattcccttatgtggctgaatgcactttttgtggctaaggggggt
aatcccttgttcgctccttattatttgcaagacacgcccaccaaacacattgtgacttta
atgaaagatattaccagcgctttaggcatgctttctaaacccaatcttaaaaataattcc
accgatgttttacagctcaacacttacacgcaacaaatgggccgtttagctaagctttct
aatttcgcttcctttgattcaacggattttagcgaacgcttgagcagccttaaaaaccaa
aaatttgctgatgcaatccctaatgcgatggatgtgattttaaaatactctcaaagggat
aaattaaaaaacaacctttgggcaaccggcgttgggggcgtgagttttgtggaaaatggc
acaggaacgctctatggtgtcaatgtgggctatgacagatttattaagggtgtgattgtt
ggagggtatgcggcttatgggtatagcgggttttatgaacgcatcactagttctaaatcc
gataatgtggatgtgggcttgtatgcgaggacttttatcaaaaagagcgagctgactttt
agcgttaatgaaacttggggggctaacaaaacccaaatcagttctgccgacactttgctt
tctatgatcaaccagtcttataaatacaacacatggacgacgaacgcgagagtcaattac
gggtatgatttcatgtttaaaaataaaagcatcattttaaaacctcaaattggtttaaga
tattactatatcggcatgaccggtttagaaggggtgatgcataacgcgctttataaccag
tttaaagcgaacgcggatccatctaaaaaatccgttttaacgattgattttgcttttgag
aaccgccattattttaacacaaactcttatttttatgcgattggcggcattggtagggat
ctattggtgcgatcaatgggggacaaattggtgcgtttcattggcgataacactttgagc
tacagagaaggcgaactttacaatacttttgcaagcatcactacgggcggggaagtgagg
ttgtttaaaagcttttatgcgaatgctggggtgggggctaggtttggattggattacaaa
atgatcaatatcaccggaaatattggaatgcgtttagcgttttaa

DBGET integrated database retrieval system