KEGG   Helicobacter pylori F16: HPF16_0296
Entry
HPF16_0296        CDS       T01910                                 
Symbol
vacA-2-N
Name
(GenBank) putative vacuolating cytotoxin-like protein VacA2, N terminus fragment (deletion of central part)
Organism
hef  Helicobacter pylori F16
SSDB
Motif
Pfam: VacA
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAJ54893
LinkDB
Position
304039..305010
AA seq 323 aa
MKKFKKKPKKITRNQKTILKRPLWLAPLLISGFASGVYANNLWDLLNSKVGGEYVHWVKG
SQYCAWWEFAGCLKNVWGANHKGYDAGNAANYLSSQNYQAISVGSGNETGTYSLSGFTNY
VGGNLTINLGNSVVLDLSGSNSFTSYQGYHQGKDDVSFNVGAINLSGALEVGNRVGSGAG
THTGTATLNLNANKVNINSNISAFKTSQVNIGNANSAITIGSVSLSGDICSSLASVGVGA
NCSTSRPSYSFKGTTNATNTAFSNASGSFTFEENATFSGAKLNGGAFTFNKEFKATNNTA
FNSGSFNFKGASSFNDTTFNTSI
NT seq 972 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaagtttaaaaagaaaccaaaaaagataacacgcaatcaaaaaacaatcttaaag
cgtcctttatggcttgcacctttactgatcagtgggtttgctagtggggtgtatgcgaat
aatctgtgggatttgttaaactcaaaagtggggggtgagtatgtgcattgggttaagggc
agtcagtattgcgcatggtgggaatttgcagggtgtttaaagaatgtatggggggcaaat
cataaaggctatgatgctggaaatgccgctaactatttatcttctcaaaactatcaagct
atttctgtgggtagcgggaatgaaacgggaacttatagtttaagcggttttaccaattat
gttgggggcaatctcacgatcaatctgggcaatagcgttgttttagatttaagcggttct
aatagtttcacttcgtatcaaggttatcatcaaggcaaagatgatgtaagctttaatgtt
ggcgcaatcaatttaagtggtgctttagaagtgggcaatcgtgtgggatctggagctggc
acgcacaccggcacagccactttaaacttgaacgctaataaggtcaatatcaattctaat
atcagcgcgtttaaaacttcgcaagtgaatataggcaatgctaacagtgctattaccatt
ggttcggtttctttaagcggggatatttgcagttctttagcgagtgttggcgtaggggct
aattgctccacttctaggcctagctattcttttaaagggacgactaacgctactaatacg
gcttttagtaatgcaagcggtagtttcacttttgaagagaacgccacttttagtggggcg
aaattgaatgggggggcattcactttcaataaagagtttaaagccaccaataataccgcc
tttaatagcggtagttttaattttaaaggcgcaagttcctttaatgacacgacttttaac
acttctatataa

DBGET integrated database retrieval system