Helicobacter pylori Gambia94/24: HPGAM_00425
Help
Entry
HPGAM_00425 CDS
T01917
Name
(GenBank) outer membrane protein (omp3)
Organism
heg
Helicobacter pylori Gambia94/24
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADU80939
LinkDB
All DBs
Position
83240..85048
Genome browser
AA seq
602 aa
AA seq
DB search
MKKSFKKLGFVSLAASSVLLGSMNATDLETYAALQKPSHVFSNYAKKSNKGSELSSDLPT
QQQAQNTASSDSQEVTTLENTATTDSQTATTDQTYTKSTDTTVADAAKQVETDNTAVQSA
DTALQSAVTQVENDAKATNFDEKTFESDQQAEQTAEANLQKAENQLTNDQNALETALKDQ
TPSTPPTKETPPAKKDETSGTPSSSGGTGGDKHTASSGSPTPSTPPTPTPSTSGGSTITS
QLTKDTTMVNNLKSVSVSAMNTTLSGVTQLSQQTAAISNLLSGNSNLGSVITNAQGLSSA
FNALESAQNTLKGYLDSSSATIGQLTNGTNAVVGALDKAINQVDMALADLATADAQKTQA
VALVAASDSATTTTDAINFLNALKTNLMAQKDAFMSVHKNIQTAVAQAQATYTPSVINTN
NYGQMYGVDAMAGYKWFFGKKKRFGFRSYGYYSYNHANLSFVGSQLGIMEGASQVNNFTY
GVGFDALYNFYESKEGYNTAGLFLGFGLGGDSFIVQGESYLKSQMRICNDTAGCSASMNT
SYFQMPVEFGFRSNFSKHSGIEVGLKLPLFANQFYKERGVDGSVDVFYKRNFSIYFNYMI
NF
NT seq
1809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagtcattcaaaaaattaggctttgtttctttagcggccagtagcgtgctttta
gggagcatgaacgctaccgatttagaaacttacgcagcgttgcaaaaaccatcgcatgtt
tttagtaattatgctaaaaagagtaataaaggtagcgaattatcaagcgatttaccaacg
caacaacaagcccaaaacaccgcttcaagcgacagccaagaagtgacaacgcttgaaaac
accgctactactgacagccaaaccgccacaactgatcaaacttatacaaaaagcactgac
actactgtagctgatgcggctaaacaagtagaaaccgataacacagccgttcaaagcgct
gatacagctttacaaagtgctgtaactcaagttgaaaacgacgctaaggctacaaatttt
gatgaaaaaacttttgaaagcgatcaacaagcagagcaaaccgctgaagcaaatttacaa
aaggctgaaaatcagctcactaacgatcaaaacgctttagaaacagcgctaaaagatcag
acaccatcaaccccaccaactaaagaaaccccaccagctaaaaaagatgaaacaagtggc
acaccaagttcaagtggtggcactggtggcgataaacacaccgcttcaagtggctcacca
actccatcaaccccaccaaccccaacgccatcaactagtggtgggagcactataacaagc
cagctaaccaaagataccactatggttaataatcttaagagtgtgagcgtgagtgcgatg
aacaccactttaagtggggtaacgcaactctctcagcaaaccgcagcgatcagcaatctt
ttgagcggtaattctaatttaggcagtgtgattaccaacgctcaagggctaagcagcgcg
tttaacgcattagaaagcgctcaaaacactttaaaaggctatttggattcttctagcgcg
acgattgggcaattgacaaacggaactaatgcggtcgtgggcgcgttagataaggctatc
aatcaagtggatatggctttggccgatctcgctacagctgatgcacaaaaaacgcaagcc
gttgcgcttgtggctgctagtgatagcgcaacgacaacgacagatgccatcaatttctta
aacgcgctaaaaaccaatctaatggctcaaaaagacgctttcatgagcgtgcataaaaac
attcaaaccgctgtcgctcaagcccaagcaacctacacgccaagcgtgattaacaccaat
aattacgggcaaatgtatggggtagatgcgatggcagggtataagtggttctttggtaaa
aagaaacgctttggctttaggtcttatggatactacagctataaccatgcgaatctaagc
tttgtagggagccagcttggaatcatggaaggcgcgtctcaagtgaataacttcacttat
ggcgtgggctttgatgcgctctataacttctatgaaagtaaagagggctataacacggca
gggttgttcttaggctttgggttaggaggggattcgtttatcgttcaaggagagagctac
ttaaaatctcaaatgcgaatttgcaatgacaccgcaggctgttcagcgagcatgaacacg
agctatttccaaatgcctgttgaatttggtttcaggagcaatttctctaaacacagtggg
attgaagtgggccttaaattgcctttatttgccaaccaattctataaagaaaggggcgta
gatggatcagtagacgtgttctataaaaggaacttctctatctattttaactacatgatc
aacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
