Helicobacter pylori Gambia94/24: HPGAM_07480
Help
Entry
HPGAM_07480 CDS
T01917
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
heg
Helicobacter pylori Gambia94/24
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
RIF5_SNase_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADU82269
LinkDB
All DBs
Position
complement(1509968..1512208)
Genome browser
AA seq
746 aa
AA seq
DB search
MKKKSNVFKILMSLCVALSNSHALVIQTMQDWNLRKNSEFKALVVVGNKVQENTIAMGNY
KVSKNRANLSISVTHIKKGNDYKTLQSPPNAIKEIKSKLVLKKGTRIVLGGENDSEMSNA
IGVSKSAYVSSKNGKGFSGSGASGMGYASGYGDTSNNAGSNGTSANGVNGTSGNNGAKGE
NGSSGANGANGTSGYQGVGSNPFPPIAGSGNGSSGSSNSGYTHFMNGGGGIGDMGGGFIP
FPYSPGLQNGSGANGINGTNGINGTSGANGSNSANGGTASADSHYTNEFCTAPIRNGNTM
NIDIVDRNGSCFKMQAFRNDNVCQYNYDFENMKAIKQTQFYFINRENKSINIGGCVDLYG
EQFEFPMYEDANKCKLDTTTNKGYGSGMASFFQTEILFRGLDNLIHVAKPCTDFANVQEQ
LVKYDNDPSTRTVQRVINQYYINPITKEKVFISHDVVSPLKFSYQTYACGQWQFDNAKLE
AYRPTQIRIFDTVSNQYYNVTGCDYTSDMGKVPKIIQPYTKINVESSVKGEDVGDLDTIS
GSNYDLPQYTTFEIQEMSLNSSQWITTSYCNDGWGSWTKTHSYTGYSQGNLRTLAKWVTR
YQTINQGTTIGYIRPRNEGDSDAVYDTYKYYYVSQAQKTLKRFPSTIYVNTPNLSDEYRK
NFELTVLSQKLNLNNGVKQLINTQEFTNWQATYYRPNGNGNLCMSYNFSSGNAWKSSTKG
KYCSWAQTPNANYSCASHNNWVVPNN
NT seq
2241 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagaaatctaatgtgtttaaaattttaatgagtttatgtgtagcactttcaaat
agccatgctcttgtcattcagactatgcaagattggaatttaagaaaaaatagcgaattt
aaggctttagttgttgtgggtaataaggtgcaagaaaataccattgctatgggtaattac
aaggtttctaaaaacagagctaatctttctattagtgtaactcatattaaaaagggcaat
gattataagaccttacaaagccccccaaacgccattaaagaaattaaaagcaaactggtt
cttaaaaaaggcacaaggattgtcttaggcggtgaaaacgatagtgagatgtctaatgcc
ataggggtgagtaaaagtgcgtatgtctctagtaaaaatggcaaaggttttagtgggagt
ggggcaagtggcatgggatatgcaagtggttatggagacacaagtaataacgctggctct
aatggcacaagtgcaaatggagtaaatggcacttctggtaataatggggctaaaggggaa
aatggaagtagtggagcaaatggagctaatggcacaagtggttatcaaggcgtaggctct
aacccattccccccaattgctgggagtggaaatggctctagtgggagttctaatagtggc
tatacccactttatgaatggaggcggaggtataggagacatgggagggggctttattcct
ttcccttattcccccggacttcaaaatggtagtggtgctaatggaattaatggcactaat
ggaattaatggcacaagcggagctaatgggagtaatagtgctaatggaggcactgctagt
gcagatagccattataccaatgaattttgcaccgctcctattagaaatggcaatacgatg
aatatagacattgtggatagaaatggctcttgctttaaaatgcaagcttttagaaatgac
aatgtctgtcaatacaactacgactttgaaaatatgaaagccattaagcaaacacaattt
tattttatcaacagagaaaacaaaagtattaacattgggggttgtgtggatttatatggg
gagcaatttgaatttcctatgtatgaagatgccaataaatgcaagctagataccaccact
aataaaggctatggaagtggcatggcaagtttttttcaaacagaaattttatttcgtggg
cttgataacttaatccatgtagctaaaccttgcactgattttgcaaatgtgcaagaacaa
ttagttaaatacgataatgacccaagcactcgcactgttcaaagagtgattaatcaatac
tatattaaccccattactaaagaaaaagtctttatcagtcatgatgtggttagtccttta
aaatttagctaccaaacttatgcgtgcggtcaatggcagtttgataacgctaaattagag
gcttatcgccccactcaaattcgtatctttgatacggtgtctaaccaatactacaatgta
acaggctgtgattacacttctgatatgggtaaagtgcctaaaattatccaaccttatacc
aaaatcaatgtagaaagtagcgttaaaggcgaagatgtaggcgatttagacactattagt
ggctcaaattatgatttgccacaatataccacttttgaaattcaagaaatgtctttaaat
agcagtcaatggataaccacttcttattgtaatgatggatgggggtcttggactaaaaca
cacagctatacaggctattctcaaggtaatttacgcaccctagctaagtgggttacacga
tatcagactatcaatcaaggcactacgattggatatatccgccctagaaatgagggcgat
agtgatgctgtgtatgacacctataagtattactatgtctcacaagctcaaaaaacactc
aaacgctttccatccactatctatgtgaatacccctaatttaagcgatgagtatcgcaaa
aattttgaactcactgtattaagccaaaagcttaatctcaataatggtgttaaacaactc
attaacacacaagaatttactaattggcaagcgacttattatcgccctaatgggaatggc
aatctttgtatgagttataactttagctctggaaatgcttggaaatctagcactaagggt
aaatattgctcatgggcgcagacgcctaatgctaattactcatgcgcttcgcacaacaat
tgggttgtcccaaacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system