Helicobacter pylori UM298: K748_07605
Help
Entry
K748_07605 CDS
T02757
Name
(GenBank) membrane protein
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hem
Helicobacter pylori UM298
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGR63107
LinkDB
All DBs
Position
complement(1223145..1224689)
Genome browser
AA seq
514 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELERELNAGV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGGNSLTTQSACTAAGYYWLPSLSNRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALTKNGTSGTSGATGQNDQTYSQQAIQYLQDQQNILNNAANLLKQDELLLEAFN
SAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQSVYNELSKNPISGSAVNSAGIDSNQANAVQG
RANQLPNALYNVQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRATNILNGFYTKVGYKQFFG
KKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFFS
GIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEFG
VVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcggacaggttatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagacgaactcgaaagagagcttaacgctggtgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcattgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatccagagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgtgcggctgcaggg
acggctggtggcaactctcttaccactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctcccaagcctttctaacagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcaca
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttaaccaaaaatggaactagcggaactagtggtgcgact
ggtcaaaatgatcaaacttactcccaacaagctatccaataccttcaagaccaacaaaat
attctcaataacgcagccaacttgctcaagcaagatgaattgcttttagaagctttcaac
tctgccgtagccgccaacattgggaataaggaattcaattcagctgtttttaccggtttg
gtgcaaggcattattgatcaatcccaatcggtttataacgaactcagtaaaaaccccatt
agcgggagtgcggttaatagcgctgggatagatagcaaccaagctaacgctgtgcaaggg
cgcgctaatcagctccctaacgctctttataacgtgcaagtaactttggataaaatcaat
gcactcaacaatcaggtgagaagcatgccttacttgccccaattcagagccgggaacagc
cgcgcgacgaatattttaaacgggttttacactaaagtgggctataagcaattcttcggg
aagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacggagcgagcgtg
ggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtggggactgatgtg
ttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggcttttttagc
ggtatccaattagccggtgagaccttccaatccacgctcagagatgaccccaatgtgaaa
ttgcatgggaaaatcaataacacgcacttccagtttctctttgacttcggtatgaggatg
aacttcggtaagttggatgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtggaatttggc
gtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactaccgtgaagtat
ttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
