KEGG   Helicobacter pylori 26695: C694_01460
Entry
C694_01460        CDS       T02282                                 
Name
(GenBank) toxin-like outer membrane protein
Organism
heo  Helicobacter pylori 26695
SSDB
Motif
Pfam: VacA2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFV41513
UniProt: O25063
LinkDB
Position
298029..306710
AA seq 2893 aa
MKKFKKKPKSIKRSHQNQKTILKRPLWLMPLLISGFASGVYANNLWDLLNPKVGGEYVHW
VKGSQYCAWWEFAGCLKNVWGANHKGYDAGNAANYLSSQNYQAISVGSGNETGTYSLSGF
TNYVGGNLTINLGNSVVLDLSGSNSFTSYQGYNQGKDDVTFTVGAINLNGTLEVGNRVGS
GAGTHTGTATLNLNANKVNINSNINAYKTSQVNIGNANSVITIGSVSLSGDVCSSLASVG
IGANCSTSGPSYSFKGTTNATNTAFSNASGSFTFEENATFSGAKWNGGTYTFNKEFSATN
NTAFSSGSFNFKGVSSFNGTSFSNASYTFDNQATFQNSSFNGGTFTFNNQTNPTNNAQHP
QIQNSSFSGNATTLKGFVNFQQAFNNSNHQLTIQNASFNNATFNNTGKITIEKDASFNNT
TFNTSVDTNNMSVTGGVTLSGKNDLKNGSTLDFGSSKITLAQGTTFNLTSLGSEKSVTIL
NSSGGITYSNLLNHAINGLTSALKTNESLSNPQSFAQGLWDIITYNGVTGQLLNENAATS
KPTDSSPSKSSTNSTQVYQVGYKIGDTIYKLQETFSHNSIIIQALESGTYTPPPVINGSK
FDLSASNYINADMPWYDHKYYIPKSQNFTESGTYYLPSVQIWGSYTNSFKQTFSANGSNL
VIGYNSTWTDHNVSSSGTVSFGDTSGSALNGHCGPWPYYQCTGTTNGTYSAYHVYITANL
RSGNRIGTGGAANLIFNGVDSINIANATITQHNAGIYSSSMTFSTQSMDNSQNLNGLNSN
GKLSVYGTTFTNEAKDGKFIFNAGQAVFENTNFNGGSYQFSGDSLNFSNNNQFNSGSFEI
SAKNASFNNANFNNSASFNFNNSNATTSFVGDFTNANSNLQIAGNAVFGNSTNGSQNTAN
FNNTGSVNISGNATFDNVVFNGPTNTSVKGQVTLNNITLKNLNAPLSFGDGTITFNAHSV
INIAESITNGNPITLVSSSKEIEYNNAFSKNLWQLINYQGHGASSEKLVSSAGNGVYDVV
YSFNNQTYNFQEVFSQNSISIRRLGVNMVFDYVDMEKSDHLYYQNALGFMTYMPNSYNNN
LGNANNTIYYYDKSIDFYASGKTLFTKAEFSQTFTGQNSAIVFGAKSIWTSLSDAPQSNT
IIRFGDNKGAGSNDASGHCWNLQCIGFITGHYEAQKIYITGSIESGNRISSGGGASLNFN
GLQGILLTNATLYNRAAGTQSSSMNFISNSANIQAQNSYFIDDTAQNGGNPNFSFNALNL
DFSNSSFRGYVGKTQSVFKFNAKNAISFTNSTNLSSGLYQMQAKSVLFDNSNLSVSVGTS
SIKANAINLSQNASINASNHSTLELQGDLNVNDTSSLNLNQSTINVSNNATINDYASLIA
SNGSHLNFNGAVNFNSANITTSLNNSSIVFKGAVSLGGQFNLSNNSSLDFQGSSAITSNT
AFNFYDNAFSQSPITFHQALDIKAPLSLGGNLLNPNNSSVLDLKNSQLVFGDQGSLNIAN
IDLLSDLNDNKNRVYNIIQADMNSNWYERISFFGMHINDGIYDAKNQTYSFTNPLNNALK
ITESFKDNQLSVTLSQIPGIKNTLYNIGSEIFNYQKVYNNANGVYSYSDDAQGVFYLTSN
VKGYYNPNQSYQASGSNNTTKNNNLTSESSIISQTYNAQGNPISALHIYNKGYNFNNIKA
LGQMALKLYPEIKKVLGNDFSPSSLNALNSNALNQLTKLITPNDWKNINELIDNANNSVV
QNFNNGTLIVGATQIGQTDTNSAVVFGGLGYQTPCDYTDIVCQKFRGTYLGQLLESSSAD
LGYIDTTFNAKEIYLTGTLGSGNAWGTGGSASVTFNSQTSLILNQANIVSSQTDGIFSML
GQEGINKVFNQAGLANILGEVAVQSINKAGGLGNLIVNTLGSNSVIGGYLTPEQKNQTLS
QLLGQNNFDNLMNDSGLNTAIKDLIRQKLGFWTGLVGGLAGLGGIDLQNPEKLIGSMSIN
DLLSKKGLFNQITGFISANDIGQVISVMLQDIVKPSNALKNDVAALGKQMIGEFLGQDTL
NSLESLLQNQQIKSVLDKVLAAKGLGPIYEQGLGDLIPNLGKKGLFAPYGLSQVWQKGDF
SFNAQGNVFVQNSTFSNANGGTLSFNAGNSLIFAGNNHIAFTNHAGTLQLLSDQVSNINI
TTLNASNGLKINAANNNVSVSQGNLFVSASCAQQSDPTTANIANPCALSAQSTNGASSNN
ASNNAPIALSNNDESLMVAANDFNFSGNIYANGVVDFSKIKGSANIKNLYLYNNAQFQAN
NLTISNQAVLEKNASFVTNNLNIQGAFNNNATQKIEVLQNLVIASNASLSTGIYGLEVGG
ALNNSGAIHFNLENTQTPTPLIQAEGIINLNTTQTPFMNVNNSMANNTTYTLLKSSRYID
YNINPNSLQSYLNLYTLININGNHIEEKNGALTYLGQRVLLQDKGLLLSVALPNSNNASQ
NNILSLSVLYNQVKMSCGDKAMDFTPPTLQDYIVGIQGQSALNQIEAVGGNAIKWLSTLM
METKENPFFAPIYLKNHSLNEILGVTKDLQNTASLISNPNFRDNATNLLELASYTQQTSR
LTKLSDFRSREGESDFSLLELKNKRFSDPNPEVFVKYSQLSKHPNNLWVQGVGGASFISG
GNGTLYGLNAGYDRLVKNVILGGYVAYGYSDFNGNIMHSLGNNVDVGMYARAFLKRNEFT
LSANETYGGNATSINSSNSLLSVLNQRYNYNTWTTSVNGNYGYDFMFKQKSVVLKPQVGL
SYHFIGLSGMKGNDAAYKQFLMHSNPSNESVLTLNMGLESRKYFGKNSYYFVTARLGRDL
LIKSKGSNTVRFVGENTLLYRKGEVFNTFASVITGGEMHLWRLVYVNAGVGLKMGLQYQD
INITGNVGMRVAF
NT seq 8682 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaagtttaaaaagaaaccaaaaagtatcaaacgatcgcatcaaaatcaaaaaaca
atcttaaagcgtcctttatggcttatgcctttactcatcagcgggtttgctagtggggtg
tatgcgaataatctgtgggatttgttaaacccaaaagtggggggtgagtatgtgcattgg
gttaagggcagtcagtattgtgcatggtgggaatttgctgggtgtttaaagaatgtatgg
ggggcaaatcataaaggctatgatgctggaaacgccgctaactatttgtcttctcaaaac
tatcaagctatttcggtgggtagtgggaatgaaacggggacttatagtttaagcggtttt
accaattatgttgggggcaatctcacgatcaatctaggcaatagcgttgttttagattta
agcggttctaatagtttcacttcgtatcaaggttataatcaaggcaaagatgatgtaaca
tttacggttggcgcaatcaatttaaacggcactttagaagtgggtaatcgtgtgggatcg
ggagctggcacgcacaccggcacagccactttaaacttgaacgctaataaggtcaatatc
aattccaatatcaacgcgtataaaacttcgcaagtgaatataggcaacgctaacagcgtt
attaccattggttcggtttctttgagtggggatgtttgcagttctttagctagcgttggg
ataggggctaattgctccacttctgggcctagctattcttttaaagggacgactaacgct
actaacacggcgtttagtaatgcaagcggcagtttcacttttgaagagaacgccactttt
agcggggcgaaatggaatggggggacttatacctttaataaagagtttagcgctaccaat
aacaccgcctttagtagcggtagttttaattttaaaggtgtaagctcttttaatggtact
tcgtttagtaacgcttcttatacttttgacaatcaagccactttccaaaacagctccttt
aatggggggacttttacttttaataaccaaactaatccaactaacaacgctcagcacccc
caaattcaaaacagctcttttagtggtaacgctaccactcttaagggctttgtgaatttc
cagcaagcctttaacaattcaaaccaccaactaacgatccaaaacgcttcctttaataac
gccacttttaacaataccggtaaaatcactatagaaaaagatgcgagttttaataacacg
acattcaacacttctgttgatacaaacaacatgagtgttaccggtggcgttactttaagc
ggtaaaaatgacttgaaaaatggctcaacccttgattttgggagttctaaaatcactctc
gctcaagggacgactttcaacctcacaagtttaggcagtgagaagagcgtaacgatttta
aattctagcggtgggatcacttatagtaaccttttaaaccatgcaatcaacggcttgaca
agtgccttaaaaacgaacgaaagcctttcaaatccgcaaagtttcgctcaaggtttgtgg
gatataatcacttacaatggggttaccgggcagcttttgaatgaaaacgctgcaacatct
aaacccactgactcttcgccctctaaatcctctacaaactctacgcaagtctatcaagtg
ggttacaaaataggggatactatctacaaactgcaagaaactttcagccacaattccatt
attattcaggctttagagagcgggacttacacgccaccccctgtcattaacggctccaaa
tttgacttatccgcttcaaattatatcaatgctgacatgccttggtatgaccataaatat
tacatccctaaatcccaaaattttacagagagcgggacttattacttgccgagcgtccaa
atatgggggagctacactaactcgtttaaacaaacttttagcgcaaatggtagtaatctg
gtgattgggtataactcaacatggactgatcataatgtctcttctagcggcacggtgtct
tttggggacacttcagggagcgctcttaatgggcattgcggaccttggccgtattaccaa
tgcacaggcacgactaacggcacttatagcgcctatcatgtgtatatcacagcgaatctg
cgttctggcaatcgtataggcaccggtggggcagctaatctaatctttaatggggtagat
agtatcaatatcgctaacgctaccatcacgcaacataacgccggaatctattcaagctct
atgactttttccacgcaaagcatggataattcgcagaatttgaatggtctaaattctaac
ggcaaactttcggtgtatggcaccactttcactaacgaagctaaagatgggaaattcatt
ttcaatgcagggcaagcggtttttgaaaacaccaactttaatggagggagttaccaattc
agcggcgatagcttgaatttttcaaacaacaaccagttcaatagcggttcgtttgaaatt
agcgcaaaaaacgcttcgttcaataacgctaactttaacaacagcgcttcttttaatttc
aataattctaacgcgaccacttcgtttgtgggggatttcactaacgctaattcaaatttg
caaatcgccgggaacgctgtttttgggaactctactaatggctctcaaaataccgctaat
tttaataataccggctctgttaatatttcagggaatgcaacctttgataatgtggtgttt
aatggccctacgaacacgagcgtgaaagggcaggttactttaaataacatcactttaaaa
aacctgaacgcccctttgtcttttggcgatgggacgattacttttaacgctcattcggtg
attaatattgctgaatctatcactaatggcaaccctatcactcttgtaagctcttctaaa
gaaattgaatacaacaacgctttcagtaaaaatctatggcagctcatcaactaccaaggg
catggggcaagcagtgaaaagctcgtctctagcgcgggtaatggcgtttatgatgtggtg
tattctttcaataaccaaacctacaatttccaagaggttttttcacaaaacagcatttct
atccggcgtttgggcgttaacatggtgtttgattatgtggatatggaaaaatcggatcat
ttatattatcaaaacgctctcggttttatgacctacatgcctaatagctataacaataat
ttagggaatgcaaacaacaccatttactattacgacaagagcattgatttttatgcgagc
gggaaaactctattcactaaagcggaattttctcaaacattcaccgggcaaaacagcgcg
atcgtttttggggctaaaagcatatggacgagcttaagcgatgcaccgcagtctaacacc
atcattcgctttggggacaataagggagcagggagtaatgatgcgagcgggcattgctgg
aatttgcaatgcataggctttattacagggcattatgaagcgcaaaagatttacatcacc
ggtagcattgaaagcgggaatcgcatttctagcggtgggggcgcgagccttaattttaac
gggcttcaaggcattcttttaacgaacgcgactttgtataaccgcgccgctggcacgcaa
agctcgtctatgaattttatctctaacagcgcgaacattcaggctcaaaactcctatttt
atagacgataccgcacaaaatggcggtaaccctaatttcagtttcaacgctttgaatctg
gatttttctaacagctcttttagaggctatgtggggaaaacgcaatctgtttttaaattc
aatgccaagaatgcgatcagtttcaccaacagcacgaatttaagctctggtttgtatcaa
atgcaagctaaaagcgtgttgtttgacaattccaatttaagcgtttcagtggggacaagc
agtattaaagccaatgcgatcaatctttctcaaaatgcctctattaatgcgagcaaccat
tcaaccttagaacttcaaggcgatttgaatgtgaacgacaccagctcgctcaacctcaac
caaagcacgattaatgtttccaataacgccacgatcaacgattatgcgagcttgattgcg
agtaatggctctcaccttaattttaacggggcggttaatttcaattcagcgaatattact
acgagtttgaataattcctctatcgtgtttaagggggcggtctctttaggagggcagttt
aatttaagcaataactcttctttagatttccaaggctctagcgctatcacctctaacacg
gcgtttaatttctatgataacgctttttctcaaagccccatcactttccatcaagccctt
gacattaaagcgcccttaagtttgggaggcaaccttttaaaccctaacaacagcagcgtg
ctggatttaaaaaacagccagcttgtttttggcgatcaagggagtttgaatatcgctaac
attgatttactaagcgatctaaatgataataaaaatcgtgtgtataacatcattcaagcg
gacatgaatagtaattggtatgagcgtatcagcttctttggcatgcacatcaatgacggg
atttatgatgctaaaaaccaaacttatagtttcactaacccccttaataacgccctaaaa
atcaccgagagctttaaagacaaccaactaagcgttacgctctctcaaatcccgggtatt
aaaaacacgctctataacattggctctgaaatttttaactaccaaaaagtttataacaac
gctaatggcgtgtattcttatagcgatgatgcacaaggcgtgttttatctcacaagcaac
gtgaaaggctattacaaccctaaccaatcctatcaagccagcggcagtaacaacaccacg
aaaaataataatctaacctctgaatcttctatcatctcgcaaacctataacgcgcaaggc
aaccctattagcgcgttgcacatctataacaagggctataatttcaacaatatcaaagcg
ttagggcaaatggctctcaaactctaccctgaaatcaaaaaggtattagggaatgatttt
tcgccctcaagtttgaacgctttaaactctaatgcgctaaaccaacttaccaaactcatc
acgcctaacgactggaaaaacattaacgagttgattgataacgcaaacaattcggtggtg
caaaatttcaataacggcactttgattgtgggagcgactcaaatagggcaaacagacacc
aatagcgcggttgtttttgggggcttgggctatcaaacaccttgtgattatactgatatt
gtgtgccaaaaatttagaggcacttatttaggacagcttttagagtccagctcggctgat
ttgggctatattgacacgacttttaacgctaaagaaatttatcttaccggcactttaggg
agcgggaacgcatgggggactggggggagcgcgagcgtaacttttaacagccaaacttcg
ctcattctcaatcaggctaatatcgtaagctcgcaaaccgatgggatctttagcatgctg
ggtcaagagggtattaataaggttttcaatcaagccgggctcgctaatattttgggcgaa
gtggcggtgcaatccatcaacaaagccgggggattagggaatttgatagtaaatacgcta
gggagtaatagcgtgattggggggtatttaacgcctgaacaaaaaaatcaaaccctaagc
cagcttttagggcagaataactttgataatctcatgaacgatagcggtttgaatacggcg
attaaggatttgatcagacaaaaattaggcttttggaccgggctagtggggggattagcc
ggactagggggcattgatttgcaaaaccctgaaaagcttataggcagcatgtcaatcaat
gatttattgagtaaaaaagggttgttcaatcagatcaccggctttatttccgctaacgat
atagggcaagtcataagcgtaatgttgcaagatattgtcaaaccgagcaacgctttaaaa
aacgatgtagcggctttaggcaagcaaatgattggcgaatttttaggccaagacacgctc
aattctttagaaagcttgttgcaaaaccagcagattaaaagcgttttagacaaagtccta
gcggctaaaggtttagggcctatttatgaacaaggcttgggggatttgatacctaatctt
ggtaaaaaagggcttttcgctccttatggcttgagtcaagtgtggcaaaaaggggatttt
agtttcaacgcacaaggcaatgtttttgtgcaaaattccactttctctaacgccaatgga
ggcacgctctcttttaacgcaggaaattcgctcatttttgccggaaacaatcatattgca
ttcactaaccacgctggaactcttcaattattgtccgatcaagtttctaacattaacatc
accacgcttaacgctagcaacggccttaagattaacgccgctaataacaatgtttctgtg
tctcaaggcaatctgtttgtcagcgctagctgcgcgcaacaaagcgatccaactacagct
aatattgcaaacccttgcgcgcttagcgcccaaagcacgaatggcgcttcttctaataat
gcgtcaaataacgcgccaatcgccttgagtaataacgatgaaagcttgatggttgcggcg
aatgatttcaatttttcaggcaatatttacgctaatggggtggttgatttttcaaagatt
aaaggctctgcaaacattaaaaacctgtatctttacaataacgctcaattccaagccaac
aatctcactatttccaatcaagcggtgttagaaaaaaacgccagctttgtaacgaataat
ttaaacattcaaggagcgtttaacaacaacgccacgcaaaaaatagaggtgcttcaaaat
ttagtgatcgcttcaaacgcttctttaagcaccgggatttatgggttagaagtagggggg
gctttgaataattctggagcgatccattttaatttagaaaatacccaaacgccaacgccg
ctcattcaagcagaggggatcattaacctcaacaccacccaaacgccttttatgaatgtc
aataacagcatggccaataatacgacttacactttattaaaaagcagccgttacattgat
tacaatatcaaccccaacagcttgcaatcgtatttgaatctctacactttaatcaatatc
aacgggaaccacatagaggaaaaaaacggcgcattgacttatttgggccaacgggttttg
ttgcaagataaggggttattgttaagcgtagcgctgcccaactcaaacaacgcttctcaa
aacaacattttaagcctttctgtcctttataaccaagttaaaatgtcttgcggcgataaa
gcgatggattttaccccccctaccttacaagattacattgtgggcattcaagggcaaagc
gcgctcaatcaaattgaagctgttggggggaacgctatcaagtggctttcaacattgatg
atggagactaaagaaaacccgttttttgcgccgatttatttaaaaaaccactctttgaat
gaaatcttaggcgtaacaaaagatcttcaaaacaccgcaagcttgatttctaaccctaat
tttagagataacgctaccaatcttttagaattggcgagttacacccaacaaaccagccgt
ttaacaaaactctctgattttagatctagagagggagagtctgatttttctttgttagag
cttaaaaacaagcgttttagcgatcctaatccagaggtttttgtcaaatactctcaactt
agcaaacacccaaataacctttgggttcaaggggtgggaggagcgagctttatttctggg
ggcaatggcacgctttatggcttgaatgcgggctatgacaggttggttaaaaatgtgatc
cttgggggttatgtggcttatggctatagcgactttaatgggaacatcatgcattctttg
ggtaataatgtggatgtggggatgtatgcgagggcttttttaaaaaggaacgaattcact
ttgagcgcgaatgaaacttatggaggcaatgcaactagtatcaattcttctaattctttg
ctctctgtgttgaaccaacgctacaactacaacacctggacaacgagcgtgaacgggaat
tacggctatgatttcatgttcaaacaaaaaagcgtggtgctaaaacctcaagtgggtttg
agctatcatttcataggtctaagtgggatgaaaggcaatgatgccgcttacaaacaattc
ctcatgcattcaaacccctctaacgaatcggttttaacgctcaacatggggttggagagc
cgtaaatattttggtaaaaattcctattattttgtaacggcgagactaggtagggatctt
ttgatcaaatctaaaggcagcaatacggtgcgttttgtgggcgaaaacactttattgtat
cgcaagggggaagtttttaacacttttgcgagcgtgattacagggggcgaaatgcatttg
tggcgtttggtgtatgtgaatgcgggggtggggcttaagatgggcttgcaataccaagat
attaatataaccgggaatgtgggcatgcgagtggcgttttag

DBGET integrated database retrieval system