Helicobacter pylori F32: HPF32_0048
Help
Entry
HPF32_0048 CDS
T01911
Name
(GenBank) Type IIG restriction-modification enzyme
Organism
heq
Helicobacter pylori F32
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Type_ISP_C
N6_Mtase
MmeI_Mtase
ALIX_LYPXL_bnd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAJ57630
LinkDB
All DBs
Position
50479..53817
Genome browser
AA seq
1112 aa
AA seq
DB search
MLKEYLESIKDLTIGEYELTHRSSLENLLNRLKDNFNKEFKIEHEPKREQGSQPDFRVSF
QGLNIGYIENKKAGSDLNKLSESDQIRKYLELNPNLMLTDYLKFVWVGKDENNAPLIKKE
ISIASLDELSKPLKPNPQTECDLIELFKSFFNHEAAPITNAKDFATHLSPRTKYLKDALI
KYQEKAQVSSIFNNFKEYLYEELSFEDFSDALAQTLTYSLFLAKLNHPFEKINLDNVRSS
IPKNFAVIREMADFLKKLDEIKEIQWLLNEILSSINHVDMDSILKDLNDDKDPYLHFYET
FLSAYDPKLRESKGVYYTPDSVVKFIINALDSLLKTHFKDAPLGLKSALDNENIKLLDFA
TGTGTFLLEAFRKALEMRKTSDGGISTKEDKYQNLLKQFYGFEYLIAPYAIAHLNLSQAF
KEEFKKPLKENDALKIILTNTLIQPSEIAAYRGLNPIFETELLNAQEIKKDENILIVTGN
PPYSGASSNEGLFEWEVKATYGIEPEFQTIEIEKKVKLTDKIKTLLKNIQTQKQGDKSVK
NTNKDALKNLKQIYSKYKLQDEKNPKWLLDDYVKFMRFAQNKIESLGHGLFGFISNNAFL
DNPTFRGLRHSLLECYDELYILNLHGNARKKEKTPQGADDENVFNIKQGVSINLFVKKAQ
TTKQKIHYYDVYGERAEKYAFLVQNDLNSIEWLELTPRKPFYLLLPLKTRLLDEDEYEQG
FSVKDMFQVGGTGICSKRDHVVFHKNKESLLELLKDFSTLEPNELHRKYDIGNDGRDWRL
EYAIREVKTNIKRLEEYIVLCQYRPFDYRWTYYTPNSRTFLAYPVYDVFKHMLPPHPTNP
KTPNQTRKNVALIISRRFCQSQKSGVGFVSNKISDLRTWTCPGMKGGDYVNPLYHNPNYT
ENFTPKFRDFIDKHYNHSFEPLEILGYIYALLYSPNYRKRYEGFLKIDYPKILFTENKDL
FRALSLLGIELIGLHVLNQESLNYSFEKLKDATIGESGYIEAHERNPIIKKPSHNEPEQR
LYINHSAYFRGVSQEIYDYRIGGYCVLDKYLKSHKNEPCDFDHVTRIIKVIARTIEIQKT
LGFLTSDLPHLKGNDSKALMQEILQNPPPPPI
NT seq
3339 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaagaatatttagaaagcattaaagatcttacgattggagaatatgaactcacg
caccgctcctctctagaaaacttgcttaatcggttaaaagataatttcaataaagaattt
aagattgaacatgagcctaaaagagagcaaggaagccaacctgattttcgcgtttctttt
caagggcttaacatcggctatatagaaaataaaaaagcagggtccgatcttaacaaactc
tcagaaagcgatcaaatccgtaaatatttagaattaaaccctaacctcatgctcactgat
taccttaaattcgtgtgggtagggaaagatgaaaataacgcccctttaattaaaaaagaa
atctctatcgctagccttgatgaactctctaaacccctaaaacccaacccacaaaccgag
tgcgatttaattgaattgtttaaaagctttttcaaccacgaagcagcccctatcactaac
gctaaagatttcgcaacgcatttaagcccgcgcaccaagtatttaaaagacgctttaatc
aaataccaagaaaaagcgcaagtttctagcatttttaataattttaaagaatatctttat
gaagaattgagctttgaagactttagcgatgcgctcgctcaaacgctcacctacagcctt
tttctagccaagctcaaccacccttttgaaaaaattaatttggataatgtgaggagttcc
atccctaaaaatttcgctgtgatcagagaaatggcggattttttaaagaaacttgatgaa
attaaagaaatccaatggcttttaaatgaaatcttaagctcgataaatcatgttgatatg
gattctatccttaaagatttgaatgacgataaagacccttatttgcacttttatgaaacc
tttttaagcgcttatgaccctaaattgcgagagagtaagggcgtgtattacaccccagat
tctgtggtgaaattcatcattaacgctttggatagtttgcttaaaacgcatttcaaagac
gctcccttaggcttaaaaagtgctttagataacgaaaacatcaagcttttagattttgcc
accggcacaggcacttttttattagaagcgttcagaaaagccctagaaatgaggaaaaca
agcgatggaggcatctccactaaagaggacaaataccaaaaccttttaaagcaattttat
gggtttgaatacttgatcgctccttatgcgatcgctcatttgaatctcagccaagccttt
aaggaggaatttaaaaaacctctcaaagaaaacgatgcgcttaaaatcattttaaccaac
accctcatacagcctagtgagatcgccgcttatcgtgggctaaacccgatttttgaaaca
gagcttttaaacgctcaagaaattaaaaaagatgaaaatatccttattgtcaccggtaat
cccccttatagcggggcgagcagtaatgagggcttgtttgaatgggaagtgaaagccact
tacggcatagagcctgaatttcaaacaatagaaattgaaaaaaaggttaaactcaccgat
aaaatcaaaacgcttttaaaaaacattcaaacccaaaagcaaggcgataaaagcgtcaaa
aacaccaacaaagacgccctaaagaatcttaaacaaatctattccaaatacaaactacaa
gatgagaaaaaccctaaatggctcttagacgattatgtgaaattcatgcgtttcgctcaa
aacaagatcgaatcattagggcatggcctttttggctttatctctaacaacgccttttta
gacaaccctacttttagggggttaaggcactctcttttagaatgctacgatgagctttat
atcttaaacttgcatggaaatgcgaggaaaaaggagaaaaccccacaaggtgcagacgat
gaaaatgttttcaatatcaaacaaggcgtgtccattaacctctttgtcaaaaaggcgcaa
acaacaaagcaaaaaatccactattatgatgtttatggcgaaagagctgaaaaatacgcc
tttttagttcaaaatgatttgaatagtattgagtggcttgagcttaccccaagaaagcct
ttttacttgctgttgcctttaaaaacgcgcttgttagatgaagatgaatatgaacaaggg
tttagcgttaaagatatgtttcaagttggaggcactggtatttgctctaaaagagatcat
gtcgttttccataagaacaaagaaagcttgctagagcttttaaaagatttttcaacctta
gaacccaatgaattgcacagaaaatatgatattggcaatgatggcagagattggcgttta
gaatatgctatcagagaagttaagactaatattaagcgtttagaagaatacattgttttg
tgccaataccgcccttttgattatcgttggacttattatacacctaattcaaggactttt
ttagcatatccagtttatgatgtttttaagcacatgttacccccccacccaacaaaccct
aaaacacctaatcaaacgcgcaaaaatgtcgcgctaattatttctcgcagattttgtcaa
tcacaaaaaagcggcgtaggatttgttagtaataaaatttcagatttgcgcacttggaca
tgtccaggaatgaagggaggcgattatgtgaatccactataccataaccctaactacacc
gaaaattttacgccaaaatttagagattttatagacaagcattataaccactcttttgag
ccgctagagattttaggctatatttatgcgttattgtattccccaaactaccgcaagcgt
tatgaaggctttcttaaaattgattaccctaaaatccttttcacagaaaataaagatttg
tttagagccttaagccttttagggattgagttaatcggcttgcatgttttaaaccaagaa
agcctaaattacagctttgaaaaattaaaagacgctaccataggcgaatccggctatata
gaagcgcatgagcgtaaccccatcatcaaaaaaccctctcataacgagccagaacaacgg
ctttatatcaaccatagcgcttattttaggggggtgagtcaagaaatttatgattacagg
ataggggggtattgcgttttagacaaatatttaaaaagccataaaaacgagccttgcgac
tttgatcatgtaacccgtatcattaaagtcatcgcgcgcacgattgaaatccaaaaaacg
cttggatttttgactagcgatttgcctcatttaaaagggaatgacagcaaagcgttaatg
caagaaatcttgcaaaatccaccccccccccccatttaa
DBGET
integrated database retrieval system