Helicobacter pylori Rif1: C695_04700
Help
Entry
C695_04700 CDS
T02317
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
her
Helicobacter pylori Rif1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV43718
LinkDB
All DBs
Position
965189..966736
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGAKSDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPTKLNGNDVSANALLSGAVGSGTCAAAG
TAGGSTLNTQSACTAAGYYWLPSLTDRILSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAGNVF
FNAMNKALEAKNGSSGASGATGSDGQTYSTQAIQYLQRQQNILNNAANLLKQDELLLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAAFTGLVQGIIDQSQLVYNELTKNTISGSAVNGAEINSNQANAVQ
GRASQLPNALYNAQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRSTNILNGFYTKIGYKQFF
GKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFF
SGIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEF
GVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagcttgggcaggtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcgctaaaagcgacgaactcgctagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatcccacgaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttaagtggtgcggtaggctctgggacttgcgcggctgcaggg
acggctggtggctcaactcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctccctagcttgactgacaggattttaagcacgatcggtagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggggaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttagaggccaaaaatggaagtagtggcgctagcggtgcg
actggttcagatggtcaaacttactccacacaagctatccaataccttcaacgccaacaa
aatatcttaaataacgcagccaacttgctcaagcaagatgaattgctcttagaagctttc
aactctgccgtagccgctaacattgggaataaggaattcaattcagccgcttttacaggt
ttggtgcaaggcattattgatcaatcccaattggtttataacgagctcactaaaaacacc
attagcgggagtgcggttaatggtgctgagataaactccaaccaagctaacgctgtgcaa
gggcgcgctagtcagctccctaacgctctttataacgcgcaagtaactttggataaaatc
aacgcgctcaacaatcaggtgagaagcatgccttacttgccccaattcagagccgggaac
agccgttcaacgaatattttgaatgggttttacaccaaaataggctataagcaattcttc
gggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacggagcgagc
gtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtggggactgat
gtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggctttttt
agcggtatccaattagccggtgagaccttccaatccacgctcagagatgaccccaatgtg
aaattgcatgggaaaatcaataacacgcacttccagttcctctttgacttcggtatgagg
atgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtggaattt
ggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactaccgtgaag
tatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
