Helicobacter pylori Rif1: C695_04715
Help
Entry
C695_04715 CDS
T02317
Name
(GenBank) iron-regulated outer membrane protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
her
Helicobacter pylori Rif1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
her00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
her02000
]
C695_04715
Transporters [BR:
her02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C695_04715
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV43721
LinkDB
All DBs
Position
complement(971040..972728)
Genome browser
AA seq
562 aa
AA seq
DB search
MAKINGYLSERDILTLSYNMTRDNANRPLRANFTGTFLPYSCGDFNAFPNEKNPSDCLFE
NDASLFKTYSVNLVHNVSLNYEREGGSRFGDPKLKINGYTSIRNVQIDPLFKPNDIAASI
PFTPNPKLGEENECVAQGGIYDALKQTCSITFKSLGGGSVVANKNLFIINSGFNANVIHT
IDHKNDNLLEYGLNYQNLTTFDKAIPNSELVKPGDAPDACLRVTSPNDPNMNGRCQRNGA
TANVIGVYAQANYTLHPMVTLGAGTRYDVYTLVDKDWQLHITQGFSPSAALNVSPLENLN
FRLSYAYVTRGPMPGGLVWMRQDNLRYNRNLKPEIGQNVEFNTEYSSQYFDFRAAGFVQL
ISNYINQFSSTLFVTNLPAQDIIYVPGYEVSGTAKYKGFSLGLSVARSWPSLKGRLIADV
YELAATTGNVFILTASYKIPRTGLSITWLSRFVTDLSYCSYSPYRNGPTDIDRRPSNCPK
TPGIFHVHKPGYGVSSFFVTYKPTYKKLKGLSLNAVFNNVFNQQYIDQASPVMSPDEPNQ
DKYARGMAEPGFNARFEISYKF
NT seq
1689 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaagatcaatggttatttgagcgaaagggatattttaacgctcagttataacatg
accagagacaacgctaaccgccctttaagagcgaattttacaggcacttttttaccctat
tcttgcggtgattttaacgctttccctaacgagaaaaaccctagcgattgtttgtttgaa
aacgacgctagtttgtttaaaacttatagcgtcaatttagtgcataatgtgagtttgaat
tatgaaagagaaggggggagccgttttggtgatcctaaattaaaaatcaatggctataca
agcattaggaatgtccaaattgatccgctttttaagcctaacgacatagcggctagtatt
cctttcaccccaaacccaaaacttggcgaagagaatgaatgcgtggcgcaagggggcatt
tatgacgctcttaaacaaacttgctccatcacttttaaaagccttggagggggttctgtg
gtggctaataaaaatttattcatcatcaattctgggtttaatgcgaacgtgatccacacc
atagaccataagaatgacaaccttttggaatacgggttgaattaccaaaacttaaccact
tttgataaagcgatccctaatagcgaattagtcaaacccggcgatgcccctgacgcatgc
ttaagggttacaagccccaatgatcccaacatgaacgggcgttgccaacgaaatggcgct
acggcgaatgtgattggggtgtatgcgcaagcgaattacaccttgcatcctatggtaact
ttaggggcagggactcgttatgatgtctatactttagtggataaagactggcaattgcac
ataacccaagggtttagccctagcgcggctttaaatgtctcgcctttagaaaatttgaat
ttcaggctttcttatgcgtatgtaaccagaggccctatgcctggaggtttggtgtggatg
cgtcaagataatttgcgctacaaccgcaatttaaagccagaaattgggcaaaatgtggaa
tttaacaccgaatacagcagtcagtattttgattttagagccgccggttttgtccaattg
atttctaattacatcaatcaattttcttcaacgctttttgtaaccaacttgcccgcacaa
gatattatttatgtgcctggttatgaagtttcagggacggctaaatacaagggcttttct
ttaggcttgagcgtggcgcgatcatggccttctttaaaggggcgtttgatcgctgatgtg
tatgaattggcggccacgacaggcaatgtgtttattttgacggcaagttataaaatccca
cgcactggtcttagcatcacttggctttcacgcttcgttacggatttgagttattgctct
tatagcccttatcgtaacggccctacggatattgacagacggcctagtaattgccctaaa
acgcccgggatttttcatgttcataaacccggttatggggtgagcagtttttttgtaacc
tacaaacccacctataagaagcttaaagggttgagcttgaatgcggtgtttaacaatgtt
tttaaccaacaatatattgatcaagcaagcccggtgatgagccctgatgaacccaatcaa
gacaaatacgcaagaggcatggcagagcctggctttaacgctagatttgaaatttcctat
aagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
