Helicobacter pylori Rif1: C695_07875
Help
Entry
C695_07875 CDS
T02317
Name
(GenBank) type IIS restriction enzyme R and M protein (ECO57IR)
Organism
her
Helicobacter pylori Rif1
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7814
DUF7149
Eco57I
MmeI_Mtase
TaqI_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV44337
LinkDB
All DBs
Position
complement(1590664..1594503)
Genome browser
AA seq
1279 aa
AA seq
DB search
MDYKKLDLPNTNYPNQEQLKAFETAFDAFLETNQQENENHQNDAFNDLLKGVFKYKVKPT
KKIDSTILNENNEVEVIIEFKALKNPNEFIKKGDLNVKAFHESLLSYLTERKEGNNNLKH
LILATIKELYIIDANEFEVFNKDKEIENAFKNCHDRKGNDTRTKAFYDACQKRLNEFDRS
LKYHYIPLKKENLALIYQALSPNFLLKIPKYSDANTLNKDFYEELLYILGLEEQNDKGKI
LIKPSRTQNSLSDALKKEYKNLDDEEVMALLIAWNNRILFLRLLESLLISFKHFENPFLT
TENFENFNDLNTLFFEVLAKKNSERLPEIKEDKILEKIPYLNSSLFDKTPLELKGHEIKL
LDNKKLEIYKNSVLKKHKDYQKEKPLPLLKYLFKFLRLYKFTTTPKDIKDNTDTSESRLI
NPSVLGLVFEKLNGYKEGSFYTPSFITSYMCKESITPIVLDKFNAIYQWDCENLKALRGE
IDRNFSNEKAKEYLNTLLTLRICDPAVGSGHFLVSALNEMVRVAYELGLIASLYRYDLKL
ENDEIIIHHTPTGEIFNYIKPDSENDPHHHIQKELFNLKKSIIENCLFGVDINPNSCEIT
KLRLWIELLKYSYYIFEKGKNTNALETLPNIDINIKCANSLISRFALKDKALLKSEKNKN
LEYSIAEYKELVKIYKDPKILETLTHPIKDSNAVRKYAKERLYQELKQNPNKDFKKALND
RIEKIKKAFKLTLNPPPKELKFKKFLKEHLELYGKSILEEANYNGLELEALALEKQMANL
FFDYRPYPKLDKSDKVVGLEHFNRYVLTSYKDLQDENERYANALEWRFEFPEVLDDEGDF
SGFDCIIGNPPYIRQEHIKDLKPLLEKQYQDFYNSTADIYTYFFALAFHLLKEKGFSAFI
TSNKYTRAKYGAKLREWLLKKTTIVSYMELNALKVFESAAVDTSIIHFIKQTPSKESEFK
YYEPTPNDKDDLKSTPHLLMKQNVLSTESFIFANATLLDLRDKIESVGTPLKDWDIQINY
GIKTGANEAFIIPTEKREEILNACKTQEERERTERLIKPILRGKDIKRYSYEWAHLWVIN
THNGYTSSLKSKIPPIDIEKYPAIKAHLDAHYDTIATRCDQGDTPYHLRNCAYLEDFEKE
KIVWASVGFVEYCMIPGLLILDTNYFFEVSKFGNTKNYLLGLLNSKLLTFWLKAKNTPLG
DMGAYRNYKYNIMELPMVKITAKNKKIADKIIALVDKILQAKEKDPKANTQKLEKEIDAL
VYQLYHLTDEEIKIIEEGQ
NT seq
3840 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattataaaaaattagatttacccaacacaaactacccaaatcaagagcaactgaaa
gcttttgaaaccgcttttgacgcctttttagaaaccaaccaacaagaaaatgaaaatcac
caaaacgacgcttttaatgatttattgaaaggcgtttttaaatacaaggttaagcccacc
aaaaaaatagacagcactattcttaatgaaaataacgaagtggaggtgatcattgaattt
aaagcccttaaaaaccccaacgaatttattaaaaagggcgatttgaatgttaaagccttt
catgaaagccttttgtcttatctcacagaaagaaaagagggtaataacaaccttaagcat
cttatcttagccactattaaagagctttatatcattgatgcaaacgaatttgaggttttt
aataaagataaagaaattgaaaacgcctttaaaaattgccacgatagaaagggtaacgat
acacgcacaaaagcgttttatgatgcttgccaaaagcgccttaatgagtttgatcgttct
ttgaaataccactatatccccctcaaaaaagaaaatttagccctaatctatcaagcccta
agccctaattttttgctcaaaattccaaaatattctgacgctaacacgcttaacaaagat
ttttatgaagaattgctttacattttagggttagaagagcaaaatgacaaagggaaaatt
ttaatcaagcccagccgcacccaaaattccctaagcgatgctttaaaaaaggaatacaaa
aatttagacgatgaagaagtcatggcgttgctcatcgcttggaataaccgcatcttgttt
ttacggcttttagaaagccttttaatttcttttaagcattttgaaaatcctttcttaacc
acagaaaactttgaaaatttcaacgatttaaacacgctcttttttgaagtcctagccaag
aaaaacagcgagcgcttaccagaaattaaagaagacaagattttagaaaaaatcccttat
ttgaattccagtttgtttgataaaacgcctttagaattaaaggggcatgaaatcaagctt
ttagacaataaaaagctagaaatctataaaaattccgttctcaaaaaacataaagattat
caaaaagaaaaacctttgcccttgctaaaatacctttttaaatttttgcgtctttataaa
ttcaccaccacccctaaagacattaaagataataccgataccagcgaaagccgtttgatt
aaccctagcgttttagggcttgtttttgaaaaactcaacggctataaagaggggagcttt
tataccccaagctttatcacaagctacatgtgcaaagagagcatcacgcccatcgtgttg
gataaattcaacgccatttatcagtgggactgcgaaaatctaaaagcgttgcgaggagaa
atagacagaaatttttcaaatgaaaaagctaaagaatacctaaacacgcttttaaccttg
cgtatttgcgatccggcggtggggagcgggcatttcttggtttcagcgctcaatgaaatg
gtgcgggttgcttatgagctaggacttattgcttccttgtatcgctacgatcttaaatta
gaaaacgatgaaatcatcattcaccacacgccaacgggtgaaatctttaactacataaaa
ccagatagcgaaaacgacccccaccaccacatccaaaaagaactttttaatcttaaaaaa
tccattattgaaaactgcctttttggcgtggatattaaccccaattcttgcgaaatcacc
aagctcaggctatggatagagcttttaaaatacagctattatatttttgaaaagggcaag
aacactaacgcgcttgaaaccctccccaacattgatattaacattaagtgcgctaattcg
ctcatttctaggtttgccctcaaagataaagccttgttaaaaagcgaaaaaaataaaaac
ctagaatactctatcgctgaatacaaagaactcgttaaaatctataaagaccctaaaatc
ttagaaaccctaacgcaccccataaaagactctaacgccgttagaaaatacgctaaagaa
cgcctttatcaagaactaaaacaaaatcctaacaaagattttaaaaaggctctcaatgat
aggatagagaaaattaaaaaagcttttaaactcactttaaacccccctccaaaagaatta
aaatttaaaaaatttttaaaagagcatttagaactctatggcaagagtatcttagaagag
gcaaactacaacggcttagaattggaagccctagcattagaaaagcaaatggcgaatctt
ttttttgattatagaccctaccccaaactagacaaatcggataaagtagtaggactagaa
cattttaaccgctatgtcctaacatcttataaagatttacaagatgaaaacgaacgctac
gctaacgctcttgaatggcgctttgaattccctgaagttttagatgatgagggggatttt
tcaggctttgattgcatcattgggaatccaccttatatccgccaagaacacatcaaagac
ttaaagcctttattagaaaagcaataccaagatttctataacagcaccgctgacatttac
acctacttttttgccctggctttccaccttttaaaagaaaaggggtttagcgctttcatc
acttctaacaaatatacgcgagccaaatacggcgctaaattgagggaatggctgctcaaa
aaaaccaccatcgtcagctacatggaactaaacgccttaaaagtctttgagagcgctgca
gtggataccagcatcattcatttcatcaaacaaacgccctctaaagagagcgaatttaaa
tattacgaacccaccccaaacgataaagacgatttgaaaagcaccccacaccttttgatg
aaacaaaacgtgctttcaacagaaagctttatttttgccaacgccacgcttttagatttg
agggacaaaatagagagtgttggcaccccgcttaaagactgggacattcaaatcaattat
gggataaaaaccggcgcgaacgaagcctttatcattcccactgaaaaaagagaagagatc
ttaaacgcttgcaagacgcaagaagaaagggagcgcacagagaggcttattaagcctatt
ttaagagggaaagacattaaaaggtattcttatgagtgggcgcatttgtgggttatcaac
acccataacggctacacttcttctctcaaatccaaaatccctcccattgatatagaaaaa
taccccgcaattaaagcgcatttagacgctcattacgacactattgcaacacgatgcgat
caaggagacaccccctatcacttaaggaattgcgcgtatttagaggattttgaaaaagag
aaaattgtgtgggcaagtgtgggatttgttgaatattgtatgatcccaggattattgata
cttgatacaaattatttttttgaagtcagtaaatttggcaatacaaaaaactatttgctt
ggacttttaaattcaaaattgctaactttttggttaaaagctaaaaatacaccattaggc
gatatgggagcttatagaaattataagtataatattatggagttaccgatggtaaaaata
acggcaaaaaataaaaaaatcgccgataaaatcatcgctttagtggataaaatcctacaa
gcaaaagaaaaagaccctaaagccaacacccaaaagttagaaaaagaaattgacgcctta
gtctatcagctctaccacctcaccgatgaagaaattaagatcattgaagaggggcagtga
DBGET
integrated database retrieval system