Helicobacter pylori Rif1: C695_08065
Help
Entry
C695_08065 CDS
T02317
Name
(GenBank) recombination protein RecB
Organism
her
Helicobacter pylori Rif1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
Cas_Cas4
NLRC4_HD2
XRCC4_CC
ResIII
AAA_30
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV44373
LinkDB
All DBs
Position
complement(1632615..1635452)
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MDTKRQCMALKASAGSGKTFALSVRFLALLFKGANPSEILTLTFTKKATAEMKERILDYL
KILQQENLENEKEKSQNILKELEEKYHLDPSLVQNSAPKIYQRFLNAEIRISTIDAFFQS
ILRKFCWFVGLSANFEVNEDTKAHQQQLNEGFLSALNGEQLEALSVFIAQCLSYDSYTSD
SILERLRFLKNKLYLFDPNKKEPAFDEKDFLEKLRSLNEQIQSIETASDRAKTAIKCDDF
RGFLNSSLTWLEKKSEYQSFKKLKSEIPTLESECEEIENDLKRYYEAKETAIFKKFPKFI
QLYDNATSKIQALDFDAIKDKVHVLLNGYEEMPAEFFYFRLDSKIAHILIDEFQDTSLND
YKILAPFIDEIKAGIGQAKWHRSVFFVGDVKQSIYAFRGSFSSLFESVSKDFYHDNLEFN
HRSAPLIINYVNTIFKKAYQNSPTAYLEQKYPKTSQNKHVTDGYVKVSLVADERELLLDQ
VLQEAQNLLEHRIEPKDITILCATNDDALEIKNYLQERLSAIRPSTESSAKLSQFVESKI
IKNALEYALAEEPYKPFYKHSVLKLAGYLHDDAIALAGFNPKKESVAGFVWKVMEQFELY
GEPAQSCLELAVGCEDADGFLEKLETKAIASSHSKGAQIMTIHKSKGMQFPYVIVCERLG
KPNSSHSNQLLEEYDGTELLRLYYRMKNREVVDKDYARALDKEEAAKDHEEINVYYVAFT
RAELGLIVVAKDKKESKKESKNKTMREKLDLVPLEEGEIAPVISPQKEPLITSTLIKPHA
YGEQVQEIEEEPSDYEKNNDQEAINFGIALHKGLEYQYAYNIPKQSVLEYLNYHHGFYGL
DYQALEESLELFENDAEIQALFKNLPLKGEAAFLFQGVVSRIDVLLWDRGQNLYVLDYKS
SQNYQQSHKAQVSHYAEFLKTQAPHFKIQAGIIYAHKRLLEKLWV
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataccaaaagacaatgcatggctttaaaggcttcagcagggagcgggaagactttc
gctttgagcgtgcggtttttagccctattgtttaagggggctaatcctagcgagattttg
acgctcactttcactaaaaaagccaccgccgaaatgaaagagcgcattttagactattta
aaaattttgcaacaagaaaaccttgaaaatgaaaaagaaaaatcccaaaatatcctaaaa
gaattagaagaaaaataccatttagaccctagcttggtgcaaaatagcgctccaaaaatc
taccaacgctttttaaacgctgaaattagaatcagcactattgatgcgtttttccaaagc
attttaaggaaattttgctggtttgtggggttgagcgcgaattttgaagtcaatgaagac
accaaagcgcaccagcaacagcttaatgagggttttttgagcgctttaaatggcgaacag
cttgaagcattgagcgtttttatcgctcaatgcttaagttatgatagttacacaagcgat
tctattttagagcggttgcgttttttaaaaaacaagctctatttatttgatcctaataaa
aaagagcctgcatttgatgaaaaggattttttagaaaaactaaggagcttaaacgaacaa
attcaaagcatagaaacagcgtcagatagggctaaaacagccattaaatgcgatgatttt
aggggatttttaaacagctctttaacctggcttgaaaaaaagagcgaatatcaatctttc
aaaaaacttaaaagtgaaatccccactttagagagcgaatgcgaagagattgaaaacgat
ttaaaacgctattatgaagccaaagaaaccgcaatatttaaaaaattccctaaattcatc
caactttatgataacgccacttctaaaatccaagccttagattttgatgcgattaaagat
aaagtccatgtcttattgaatggttatgaagaaatgccggcggagtttttttatttcagg
ttggacagcaagatcgcgcacattttgattgatgagtttcaagacacgagcttgaacgat
tataagattttagccccttttattgatgagattaaagccgggatagggcaagcgaaatgg
cacaggagcgtgttttttgtgggcgatgtcaagcagagcatttatgcctttagggggagt
tttagctctttgtttgaaagcgtttctaaggatttttaccacgataatttggaatttaac
caccgcagtgcgcctttaatcattaattatgtgaacaccatttttaaaaaagcttatcaa
aattcccccaccgcttatttggagcaaaaataccctaaaacttctcaaaataaacatgtt
acagacggctatgttaaagtctctttagtggctgatgaaagagaattgttattagatcag
gtcttacaagaagctcaaaaccttttagaacatcgtattgagcctaaagatattaccatt
ttatgcgccactaatgacgacgctttagaaatcaaaaattatttgcaagagcgtttgagt
gcgattcgcccaagcacggaatctagcgcaaaattgtctcaatttgtagagtctaaaatc
attaagaacgctttagaatacgctctagcggaagaaccttacaagcctttttataagcac
agcgttttaaaactcgctggatacttgcatgatgatgcgatcgctttagctggttttaac
cctaaaaaagagagcgtggcaggctttgtgtggaaggtgatggagcaatttgagctttat
ggagagcctgcacaaagctgtttggaattagcggttgggtgcgaagatgccgatggattt
ttagaaaaattagagactaaagcgatcgcttcttcccattcaaaaggcgcgcagatcatg
accattcacaaatctaaaggcatgcaattcccttatgtgatcgtgtgcgaacgcttgggc
aagcctaattcaagccattccaatcaactccttgaagaatatgacggcacagagcttctt
cgcctttattacagaatgaaaaatcgtgaggtcgtagataaagattacgctagggcttta
gacaaagaagaagcggccaaagatcatgaagagattaatgtgtattatgtcgcattcact
agggctgagttagggctgattgtcgtggccaaagacaaaaaagaaagcaaaaaagaaagc
aaaaacaaaacaatgcgcgaaaaattggatcttgtgcctttagaagagggagaaatcgcg
ccggttatttctccacaaaaagagcctttaattacaagcactctcatcaagccccatgcc
tatggcgagcaagtccaagagatagaagaagagcctagcgattatgaaaagaataacgac
caggaagcgatcaactttggtatcgctttgcacaaggggttagaataccaatacgcttat
aacattcctaaacaaagcgttttagaatatttaaactaccatcatggtttttatggtttg
gattaccaggcgttagaagaaagtttagagctttttgaaaacgatgcagagatacaagct
ctttttaaaaatttgcccttaaagggcgaagcggcttttttattccaaggggttgtgtct
aggatagatgttttgttgtgggatagggggcaaaatttgtatgttttagattacaaaagc
tctcaaaattaccagcaaagccataaagcgcaagtgtctcattatgctgagtttttgaaa
actcaagccccccattttaagatacaagcgggcattatttacgctcataaaagactgctt
gaaaaattatgggtctga
DBGET
integrated database retrieval system
