Helicobacter pylori BM012S: U064_0763
Help
Entry
U064_0763 CDS
T02940
Name
(GenBank) Outer membrane protein HopB
KO
K15844
outer membrane protein HopB/AlpB
Organism
hez
Helicobacter pylori BM012S
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
REase-ARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA89682
UniProt:
V5NPW7
LinkDB
All DBs
Position
complement(753364..754956)
Genome browser
AA seq
530 aa
AA seq
DB search
MKQNLKPFKMIKENLMTQSQKVRFLAPLSLALSLSFNPVGAEEDGGFMTFGYELGQVVQQ
VKNPGKIKAEELAGLLNSNTTNNTNTNIAGTGGNVAGTLGNLFMNQLGNLIDLYPTLNTD
NIHQCGATNNGSSGSGATTAATTSNSPCFQGNLALYNEMVGSIKTLSQNISKNIFQGNNN
TTSQNLSNQLSELNTASVYLTYMNSFLNANNQAGGIFQNHTNQTYGSGVTAQQIAYILKQ
ASITMGPSGDSGAAAAFLDAALAQHVFNSANAGNDLSAKEFTSLVQNIVNNSQNALTLAN
NANISNSTGYQVSYGGNIDQARSTQLLNNTTNTLAKVTALNNELKANPWLGNFAAGNSSQ
VNAFNGFITKIGYKQFFGENKNVGLRYYGFFSYNGAGVGNGPTYNQVNLLTYGVGTDVLY
NVFSRSFGSRSLNAGFFGGIQLAGDTYISTLRNSPQLANRPTATKFQFLFDLGLRMNFGI
LKKDLKSHNQHSIEIGVQIPTIYNTYYKAGGAEVKYFRPYSVYWVYGYAF
NT seq
1593 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaaatttaaagccattcaaaatgattaaggaaaatttaatgacacaatctcaa
aaagtaagattcttagcccctttaagcctagcgttaagcttgagcttcaatccagtgggc
gctgaagaagatgggggctttatgacctttgggtatgaattaggtcaggtggtccaacaa
gtgaaaaacccgggtaaaatcaaagccgaagaattagccggcttgttaaactctaacacg
acaaacaacaccaataccaatattgcaggcacaggaggcaatgtcgccgggactttaggc
aatctctttatgaaccaattaggcaatttgattgatttgtatcccactttaaacactgac
aatatccatcaatgtggtgctactaataatggtagtagtggtagtggtgcgaccactgcc
gctactactagcaatagcccttgtttccaaggtaacctggctctttataacgaaatggtt
ggctctatcaaaactttgagtcaaaacatcagcaagaatatctttcaaggcaacaacaac
accacgagccaaaacctctccaaccagctcagcgagcttaacaccgctagcgtttatttg
acttacatgaactcgttcttaaacgccaataaccaagcgggtgggatttttcaaaaccac
actaatcaaacttacggaagtggtgttaccgctcaacaaatcgcttatatcctaaagcaa
gcttcaatcactatggggccaagcggtgatagcggggctgccgcagcgtttttggacgcc
gctttagcgcaacatgttttcaactccgctaacgctgggaatgatttgagcgctaaggaa
ttcactagcttggtgcaaaacatcgtcaataattctcaaaacgctttaacgctagccaac
aacgctaacatcagcaattcaaccggctatcaagtgagctatggcgggaatattgatcaa
gcgcgctctacccaactgttaaacaacaccacaaacactttggctaaagttaccgctcta
aacaacgagcttaaagctaacccatggcttgggaatttcgctgccggtaacagctctcaa
gtgaatgcgtttaacgggtttatcactaaaatcggttataagcaattcttcggggaaaac
aagaatgtgggcttacgctactacggcttcttcagctataacggcgctggcgtgggtaat
ggccccacttacaatcaagtcaatttgctcacttatggggtggggactgatgtgctttac
aacgtgtttagccgctcttttggtagccgaagtcttaatgcgggcttctttggggggatc
caactcgcaggggatacttacatcagcacgctaagaaacagccctcagcttgcgaataga
cctacagcgacgaaattccagttcttgtttgatttggggttacgcatgaactttggtatc
ttgaaaaaagacttgaaaagccacaaccagcattctatagaaatcggtgtgcaaatccct
acgatttacaacacttattataaagctggcggcgctgaagtgaaatacttccgcccttat
agcgtgtattgggtctatggctacgccttctaa
DBGET
integrated database retrieval system