Helicobacter pylori BM012S: U064_0764
Help
Entry
U064_0764 CDS
T02940
Name
(GenBank) Outer membrane protein HopC
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hez
Helicobacter pylori BM012S
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA89683
UniProt:
V5NNF1
LinkDB
All DBs
Position
complement(754978..756534)
Genome browser
AA seq
518 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGAKSDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPTKLNGNDVSANALLSGAVGSGTCAAAG
TAGSTSLNTQSACTAAGYYWLPSLTDRILSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAGNVF
FNAMNKALEKNGTTNGTSSASGATGSDGQTYSQQAIQYLQGQQNILNNAANLLKQDELLL
EAFNSAVAANIGNKEFNSAAFTGLVQGIIDQSQLVYNELTKNTISGSAVNSAGINSNQAN
AVQGRASQLPNALYNAQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRSTNIMNGFYTKIGYK
QFFGKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNSVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDM
GFFSGIQLAGETVQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHT
VEFGVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1557 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcgggcaagtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcgctaaaagcgacgaactcgccagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatcccacgaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttaagtggtgcggtaggcagtgggacttgcgcggctgcaggg
acggctggtagcacatctcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctccctagcttgactgataggattttaagcacgatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggggaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttagagaagaatgggactactaatggcactagtagcgct
agcggtgcgactggttcagatggtcaaacttactcccaacaagccatccaataccttcaa
ggccaacaaaatatcttaaataacgcagcgaacttgctcaagcaagatgaattgctctta
gaagctttcaactctgccgtagctgctaacattgggaataaggaattcaattcagccgct
tttacaggtttggtgcaaggcattattgatcaatctcaattggtttataacgagctcact
aaaaacaccattagcgggagcgcggttaatagcgctgggataaactccaaccaagctaac
gctgtgcaagggcgcgctagtcagctccctaacgctctttataacgcgcaagtaactttg
gataaaatcaacgcgctcaataatcaggtgagaagcatgccttacttgccccaattcaga
gccggaaacagccgttcaacgaatatcatgaacgggttttacaccaaaataggctataag
caattcttcgggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataac
ggagcgagcgtgggctttagatccactcaaaacagcgtagggttatacacttatggggtg
gggactgatgtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatg
ggcttttttagcggtatccaattagccggcgaaaccgtccaatccacgctcagagatgat
cccaatgtgaaattgcatgggaaaatcaataacacgcacttccagttcctctttgacttc
ggtatgagaatgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacg
gtggaatttggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggact
accgtgaagtatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system