Helicobacter felistomachi: NHP21005_05270
Help
Entry
NHP21005_05270 CDS
T10843
Symbol
ccsA
Name
(GenBank) Bifunctional cytochrome c biogenesis protein CcsA
Organism
hfi Helicobacter felistomachi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
ResB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BEG56839
LinkDB
All DBs
Position
complement(494842..497652)
Genome browser
AA seq
936 aa
AA seq
DB search
MQVKKIFGFFFGSFWVAIPLLVVYATACALATFIENDYGTPASRAIVYDTWWFSALHVYL
LLVIVGTFITSKAWQRKRYASLFFHSSLVFIILGAGVTRFFGFEATMHLRTNQTSDKITT
TDSYLNLTLSKDNAKPLHFSLKTTLSPFSRYLPTAEVMAYGKPLRLEPISVHKMSPEKRD
NKALLEIKLSYGEASHTLYILGGHGVVSQDETTTLDGMHIALNWGVTERILPFKLHLKRF
ELERYPGSMSPSSYASQVEVLNAKGQVVMPFKIFMNHVLDYGGYRFFQSSYDTDEQGTIL
SVNRDPGKNLTYFGYGLLMSGALFLLFSRQGRFQRLSRFLKAQHIVLFLCVLSLGTLAHA
KEGKIDMHGGKSTPIAPPIDKMAKIQPTTAQMHAKILQRFKDLRAHAKGQLTPLARLQVQ
GFEGRIKPLDTLSMELIHKITKEDGFKGMDNLQMMLGMMLYPDDYKSIKMIYTSTPKLRA
LLGTPLKDKRVAFLDLFGPHGYKLQNFVEEVNQKAPKDRDEFDKDILKLDERVNLVYLIF
SGNILKIFPDQSGNTWLSPADAVKNANIKISTEATHFLRDLFKGFDLGVDQNQWAGVHKT
LNDLLAYQRAHSKLALSPGRVDSEILLNHSNFFNTLMFPYLLLGVVLLGVVLVAIFKNRA
VPKWLHLSFYGLLSLCWLAHSVGLALRWYVSGHAPWSNAYESMLYISWAAMLSGLILRSN
LALCASSFLAGIALFVAHLGFMDPQISNLVPVLKSYWLNIHVSIITASYGFLGLCFILGL
LTLLLFLLRSEKRPHIDSSILALSALNEMGMIMGLLLLAVGNFLGGVWANESWGRYWGWD
PKETWALISIAVYAIILHLRFLRFEFMPYVFASASVIGFYSILMTYFGVNYYLSGMHSYA
AGDPLPIPTFLYPLVASTFVLVFVAGLKRKLPMAKV
NT seq
2811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagttaaaaagatttttggatttttctttggctctttttgggtggcgatcccgctg
ttggtggtttacgccaccgcctgcgctctagcgactttcattgaaaacgactatggcacg
ccggcaagccgcgcgattgtctatgacacttggtggtttagtgcgttgcatgtgtatttg
ctcttggtgattgtcggcactttcatcacttctaaggcgtggcaaagaaaacgctacgcc
agtctatttttccacagctctttggtgttcatcattttgggggcgggggttaccagattc
tttggctttgaagcgaccatgcacctacgcaccaaccaaacgagcgacaaaatcaccacc
accgacagctatttaaatttaaccctcagtaaggataatgccaaacccttgcacttctct
ttaaaaaccacgctttcgcccttttcgcggtatttacccaccgctgaggtgatggcctat
ggcaagcccttacgccttgagcccatcagcgtgcataaaatgtcgcctgaaaaaagggac
aacaaggcgttgttagagatcaaactcagttatggggaggcaagccacaccctgtatatt
ttgggcggacatggcgtggtgagccaagatgaaacaaccactttagatggcatgcacatc
gcgctcaactggggtgttactgagcgcattttgccctttaaactgcatttaaagcgtttt
gagttggagcgctaccccggttctatgagtccgtcttcctacgcctcccaagtggaagtg
ttaaatgccaaggggcaagttgtcatgccctttaaaatttttatgaaccatgtcctagat
tatggggggtatcgctttttccaatcctcctatgacacagacgagcagggcacgatttta
tcggtcaatcgcgatccgggcaagaatttaacttactttggctacggcttgctcatgtct
ggggcgttgttcctgctctttagccgacaagggcgcttccagcggctttcacgtttttta
aaagcccagcacattgtgttgtttttatgtgtcttgtctttaggcacactcgcgcacgcc
aaagagggcaaaatcgacatgcacgggggcaaaagcacccccatcgccccccccattgac
aaaatggcaaagattcagcccacgaccgcccaaatgcatgccaaaatcttgcaacgtttt
aaagatttaagggcacacgcaaaagggcagctcaccccgcttgcccgcctacaagtgcag
ggctttgaagggcgcattaaacccctagacactttgagcatggagttgattcacaaaatc
accaaagaagatggctttaagggcatggacaatttgcagatgatgctaggcatgatgctc
tatcccgatgattacaaaagcattaaaatgatctacacctccacgcccaaacttagggca
ctcctaggcacaccgcttaaagataaacgggtggcttttttagacctttttgggccgcat
ggctacaaactccaaaacttcgtggaagaagtcaaccaaaaagcccccaaagacagggac
gaatttgacaaggacattttaaagctggatgagcgggtgaatcttgtttatttgattttc
agcgggaacattttaaagatttttcccgatcaaagcggcaatacatggctaagccccgcc
gatgccgtgaagaatgccaacattaaaatctccacagaagccacacattttttaagggat
ttattcaagggctttgatttgggcgtggatcaaaaccaatgggcgggcgtgcataaaacc
ctaaacgacttgctcgcctaccaacgggcacacagcaaactcgccctaagcccggggcgt
gtggattctgagattctcttaaatcacagcaattttttcaacacgctcatgttcccctat
ttgcttttaggcgtggtgcttttaggcgtggtgctggtggcgatctttaaaaatagagcg
gtgcctaaatggctgcacttgagcttttatggcctcttgtcgctttgttggttggcgcat
agcgtggggctagccttgcgctggtatgtgagcgggcatgccccctggagcaacgcttac
gagtccatgctctacatctcttgggcggcgatgctctcagggctcattttacgctccaac
ttggcgttgtgcgcctctagctttttagccggcattgccttgtttgtggcgcatttgggc
tttatggacccacagatcagcaatttagtccccgtgttgaaatcctattggctcaacatc
catgtatctattattacagcaagttatggctttttggggctatgcttcatactagggcta
ctcactctgcttttattcttgctaagaagcgaaaaacgcccccacatcgactcgagtatt
ttagctctcagtgcgctcaatgaaatggggatgatcatggggcttttattgcttgcggtg
ggtaacttccttggcggggtgtgggcgaatgagtcttgggggcgttactggggctgggat
cctaaagagacatgggctctgatctccattgctgtgtatgcgatcattttgcacttgcgc
tttttgcgctttgagttcatgccctatgtgtttgcgagtgccagcgtgatcggcttttac
tccattttaatgacctattttggggtaaattactatttatcgggcatgcatagttacgcc
gcgggcgaccccttgcccatccccacatttctttaccctctagtggcgagcacttttgtt
ttagtctttgtggctggcttgaagcgcaaattgccgatggcaaaggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system