Hippoglossus hippoglossus (Atlantic halibut): 117778928
Help
Entry
117778928 CDS
T07778
Symbol
casq1a
Name
(RefSeq) calsequestrin-1a isoform X1
KO
K23468
calsequestrin 1
Organism
hhip
Hippoglossus hippoglossus (Atlantic halibut)
Pathway
hhip04020
Calcium signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hhip00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04020 Calcium signaling pathway
117778928 (casq1a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calsequestrin
Thioredoxin_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117778928
NCBI-ProteinID:
XP_034470742
LinkDB
All DBs
Position
17:complement(6416909..6425543)
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MKCTWVLVAVLLSVGRLSLGKESLDFPEYDGKDRVHDLNTKNYKSVMKKYDVMVVYYHDH
PGSSRVAQRQFEIEELALELAAQVLDEFDDEDIGVGLLDAKHDKVVAKKLGLDESDSIFI
FTDDEVIEYDGELAADTLVEFIYDVLEDPVEILDNSRELKGFKNIEEDIKLVGYFKSHKS
EHFEAFVDAAEEFHPHISFFATFNTKVAKALDLKLNEVDFYEPFMDDPVVIPGKPYTEDE
LVKFIEDNDRPTLRKMQPHNMYEIWDDDMDGEHIIAFAEESDPDGFEFLEILKEVAEDNT
DNPDLSIVWIDPDDFPLLLPYWEKTFGIDLSYPQIGVVDTSDADSVWMDMDDGEDLPSVD
ELEDWIEDALSGVIDPDHDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDY
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtgtacctgggtgctagtggcagttttgctgtccgtagggaggctatcactgggc
aaggagagcttggactttcccgagtatgatggcaaggaccgcgtccacgacctcaacacc
aagaactataagtctgtgatgaagaagtacgatgtcatggtggtgtactaccatgaccat
cccggatccagccgcgtcgcccagagacagtttgagattgaggagttggcccttgagctt
gcagcccaggtcctggatgagttcgatgatgaggatatcggagtcggtctccttgatgca
aagcacgacaaagttgttgcaaagaaattaggccttgatgagtccgacagcatcttcatc
ttcacagatgatgaggtcatagaatatgatggcgagcttgctgctgacactcttgtggag
ttcatctatgatgttctagaggaccctgtggaaattcttgataatagcagggaactgaaa
ggcttcaaaaacattgaagaggacatcaaattggtgggctactttaagagtcacaagtca
gaacattttgaggctttcgtcgatgctgcagaagagttccaccctcacatcagcttcttt
gccacattcaataccaaggttgccaaggctctggacctgaagctcaatgaggttgacttc
tatgaacccttcatggatgatccagtggtcatccctggaaagccttacactgaggatgag
ctggtgaaattcattgaagacaatgacagaccaaccctgaggaagatgcaaccacacaac
atgtatgagatctgggatgacgatatggatggtgaacatatcattgcttttgcagaggaa
tctgacccagatggttttgagttcctggagatcctgaaggaagttgcagaggacaacaca
gacaaccctgacctcagcattgtctggattgaccctgatgacttccccctgcttctgcca
tactgggagaagacttttggcattgacctgtcctatccacagattggtgttgttgatact
agtgatgctgacagtgtgtggatggacatggatgatggagaagacctgccatccgtggac
gagctggaagactggattgaggatgctctgtcaggtgtaatcgatcctgatcatgatgat
gatgatgatgatgatgatgatgatgatgacgatgatgatgacgatgatgatgatgatgat
gatgacgacgacgatgatgatgatgatgatgatgacgatgatgatgacgatgatgatgat
gatgatgatgacgatgatgacgatgatgacgacgacgacgacgatgatgatgatgacgat
gatgatgatgatgatgatgacgacgacgatgacgacgatgatgatgatgatgatgacgat
gatgatgatgatgatgattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
