Halobacteroides halobius: Halha_0288
Help
Entry
Halha_0288 CDS
T02401
Name
(GenBank) DNA helicase, putative
Organism
hhl
Halobacteroides halobius
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_11
AAA_12
SMUBP-2_HCS1_1B
AAA_30
DbpA
AAA_19
Viral_helicase1
ResIII
SLFN-g3_helicase
AAA_22
AAA
NPHP3_N
UvrD_C
PhoH
T2SSE
DEAD
AAA_16
Mg_chelatase
nSTAND3
nSTAND6
RuvB_N
Dna2_Rift
AAA_7
UvrD_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGB40299
UniProt:
L0K7I9
LinkDB
All DBs
Position
302455..304707
Genome browser
AA seq
750 aa
AA seq
DB search
MTDLIVRNLPGHIGPGDIVGAFTNEIGMDGKQIGKIDFNSGAAIVEVEDSVAHKAAKIMD
NNQIAGIRVQVEVDDGYKEKLKEIKNYTDNYRHLVQLEREEEMRRHEIEIKELSAKQREK
KGRAILYLSGRDEGQGFGGRELIKFIRQKKGEKLPDTEISVGDLVMLSKNRPLADNNPTG
TVVEKTNYSLTVVFDSNPAGFLYDKGLRLDLYVNDITFQRMLDALGNLESATGRLKVLRD
KLLGLADVEFNQLPKIDYYNKDLNDSQRQAVRSALAAKDFFLVHGPPGTGKTMTSIEILQ
QEAGEKNILATADSNTAVDNLVERLVARGVKVLRVGHPARVNSLVREYTLDHIIQEHPKY
KEASQLRDKAYKLSKQQDDNPQCIFPSGENRRGFSNQQIRDLGSKNINGRPRGLSPKKIK
GMAKWLELQDEINQLFSQIERLEDEAVTELIEEAEVVCTTNSTAGSEVLAEQNFDLLLID
EATQSTEPAALIPVVKSNKVILVGDHKQLPPTILNEEAARKGLSKSLFERLLEVHGAKIK
EILNVQYRMNQAIMNFSSSQFYDQQLVAAKKVKEWNITDLNIQLPKGNSPAEKVLKIKDA
VVFLDTSGMSAPEYTKGDSTSLQNRIEAELVSEIINQTVNTKIDLSEVAVITPYKDQVDL
IKQLIKLEEVEVNTVDGFQGREKELVILSLVRSNQQDNIGFLRDIRRLNVSLTRAKKKLI
ILGDSSTITSHETYQSLVEYIEKNGYLYSL
NT seq
2253 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgatttaattgttagaaatttaccagggcatattggcccaggagatattgtaggt
gcttttaccaatgaaattggtatggatggaaagcaaattggtaaaatagattttaattct
ggagctgctattgttgaagttgaagatagtgtagctcataaagcagctaagattatggat
aataaccagatagctggaattagggtacaagtagaggttgatgatggatataaagagaaa
ttaaaggaaattaaaaattatactgataattataggcatttagttcagttagaacgggaa
gaagaaatgagacgccatgagatagaaattaaagaattaagtgctaagcaaagagagaaa
aaagggcgtgctattttatatttatcaggtcgtgatgaaggtcaaggttttggtggtaga
gaattaattaagtttattagacaaaaaaagggagaaaagttacctgatactgaaattagt
gttggggatttagtaatgttaagtaaaaatcgccctttagctgataataatcccacaggt
actgtagtagaaaagactaattattctctaacagttgtttttgatagtaatcctgctggt
tttttgtatgataaagggttaagattagatttatatgttaatgatattacttttcagcgt
atgttagatgctttaggtaatttggaatctgcaacgggtagattaaaggtgcttagagat
aaattattaggcttagctgatgtagagtttaatcaattacctaagattgactattacaat
aaagatttaaatgattctcagcgtcaagctgtacgttctgctttagctgctaaagatttc
tttttggtgcatggtcctccggggacaggaaaaacaatgacttctattgaaattttacaa
caagaagcaggagaaaaaaatattttagctacagctgattctaatacagcagttgataat
cttgtagaaagattagttgctagaggagttaaggtattacgggtaggacatcccgctcga
gttaattcattagtaagagaatatacgctagatcatattatacaagagcatcctaaatac
aaagaagcaagtcaactaagagataaagcttataaacttagcaagcaacaagatgataat
cctcagtgtatatttcctagtggagaaaatagaagaggatttagtaatcaacaaattagg
gatctaggtagtaaaaatattaatggacgcccgcgaggattaagtcctaaaaagataaag
ggaatggctaagtggttagaattacaggatgaaattaatcaattatttagtcaaattgaa
agattggaagatgaagcagttactgagttaatagaagaagctgaagttgtttgtaccact
aactctactgcaggttctgaagttttagcagagcaaaattttgatttgttattaattgat
gaggcaactcaatctactgagccagctgctttaatacctgtagttaagagtaataaggtg
attttggtaggagatcataaacaactgccgccaactattttaaatgaagaggcagctagg
aagggattatctaaatcactatttgaacgtttattagaagttcatggtgcaaaaattaaa
gagatattaaatgtacagtatagaatgaatcaagccataatgaatttttctagttcacaa
ttttatgatcagcagttggtagcagctaaaaaggttaaggaatggaatataactgattta
aatattcaactccctaaagggaattcacctgctgaaaaagtcttaaaaataaaagatgca
gttgtctttttagatacatctgggatgagtgcacctgagtacactaaaggagattcaact
tcacttcaaaacagaatagaggctgagttagtttctgaaattattaatcaaactgtaaat
acaaagattgatctatcagaggtagcagtaattactccttataaagaccaggttgattta
attaaacaattaattaagttagaagaagttgaagtaaatactgtagatggttttcaaggt
agagaaaaggaattggtgattctttctttagttagaagtaatcaacaagataatattggt
tttctaagagatattagaaggcttaatgtttctttgactagggccaagaaaaaattaatt
attcttggtgattcttctacaataactagtcatgagacttatcaatcattagtagaatat
atagagaagaacggttacctgtattctctataa
DBGET
integrated database retrieval system
