KEGG   Halobacteroides halobius: Halha_0700
Entry
Halha_0700        CDS       T02401                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha chain
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
hhl  Halobacteroides halobius
Pathway
hhl03030  DNA replication
hhl03430  Mismatch repair
hhl03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hhl00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    Halha_0700
   03430 Mismatch repair
    Halha_0700
   03440 Homologous recombination
    Halha_0700
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:hhl03032]
    Halha_0700
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:hhl03400]
    Halha_0700
Enzymes [BR:hhl01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     Halha_0700
DNA replication proteins [BR:hhl03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     Halha_0700
DNA repair and recombination proteins [BR:hhl03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     Halha_0700
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T PHP DNA_pol3_finger HHH_6 tRNA_anti-codon DNA_pol3_a_NII RNase_H_2 HHH_3 tRNA_anti_2 SSB DEDDh_C T2SSK
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGB40673
UniProt: L0K978
LinkDB
Position
672445..676743
AA seq 1432 aa
MTMVNIEPDQNNPFRNELKQRLDIADKLINKIKFKKLKVDTTTNECSLQLKVPQSIEINS
ILEELSADFFVKGELKYQIDHYNPDLSLQTILKDDWEEIIKEIRQQSPQANGWLSLSKWN
IKEGILEVEVENQTAIEALEKNKCDRILRKILDGEYNKQVKVNFVVGDFKNESNQLANEQ
QKETKAYMDSLVKNSAGQGPARNRNSQSTNSVKGQTVWLGKKINGEVQPLDEITGEVKNV
VVKGQIFSADIRHLQSGSKLIMFDITDHTNSITVKLFENKNDNLADKVAKGEWLLVEGNV
EFDTYDQELMLKPRNIMVTSNSSKKDEADQKRAELHLHTKMSSLDSVLDVEAAIKQADDW
GHSAIAITDHGVVQAFPDAYNAAKDKDIKVIYGLEAYLVDDGEPIILNPVDQDISKETYI
VFDLETTGFNPHHNEIIEIGAAKVEAGTITESYQTFVNPSQDIPAKITELTGINAEMVAD
APSLKEAITKFLDFIGDATLVAHNLSFDLGFIEDKLRKLDKPKLTNPALDTLNLSRALLP
ELKSYKLNKLAKKFNKNLENHHRAYDDAKVTAEILLELIDLAKNNKVNNLTEINQLTSKI
DYKRMHPYHTTILVKNQQGLRNLYQLVSEAHVENFHRVPRVLKSQLLEKREGLIIGSACE
AGQLYKAILHGKSDDELIELAKFYDYLEVQPLGNNKFLLEKGEVESFKELEEINRKIYQL
GNRLGKPVIAAGDVHFLDAKDSVYRRVLKEGQGFDDAADQPPLYLRTTEEMLAEFDYFSE
DEAYELVIENPKDICEEIEEVEPIPDKLFTPTIEGAEDEIREMAYNKAKKWYGNPLPDLV
VDRLENELESIIGNGYAVIYLISHKLVKKSLSDGYLVGSRGSVGSSFAATMTDITEVNPL
PPHYRCPECKDSTFFTDGSVGLGVDLPDKDCGQCGTELIKDGYDIPFEVFLGFEGDKVPD
IDLNFSGEYQSQVHRYTEKLFGEEYVYRAGTISTIADRTAYGFVKGHMEDNNLSLRQAEI
NRLSSGCTGVKRTTGQHPGGQIVVPQDKEIYDFTPIQRPANDMDSDTLTTHFDFHSIHDN
LLKLDVLGHDDPTSIRMLQDLTGVDPQEIPLDDEETMGIFSSIEPLGVTEDQVGVKLGTL
GIPEFGTQFVRGMLRETRPTTFAELVRISGLSHGADVWLNNAQDLIRSGTAKLAEVISVR
DDIMNYLLQKGVEPSQAFWIMEHVRKGKGLTAEEEQAMRENNVPNWYIESCKKINYMFPK
AHAAAYVMMAFRIAYFKVHHPQAFYNTFFTIKANDFDAQIVLQGEEHIKKQMQEIKSKGN
DATAKDKNTRTVLEIVIEALARGIEFVPVDIYESKAYEFKITDDGLLPPLISLDGLGRSA
AKSIVQVRKEGEFTSIENLKNRSGASKTVIEALRLHGSLEGLPETNQLSLFQ
NT seq 4299 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacaatggttaatattgaacctgaccagaataatcctttccgaaacgaactgaagcaa
aggttagatattgctgataagttaataaataagataaaatttaaaaaacttaaagtagat
accacgacaaatgagtgtagtttgcaattaaaagttcctcaaagtatagagattaattct
atacttgaggaattaagtgctgatttctttgttaagggagagttaaaatatcaaattgat
cattacaatcctgatttatctttacagactatattaaaagatgattgggaagagattatc
aaagaaattagacagcaatcacctcaagccaatggatggctttcgttatctaaatggaat
ataaaagaagggatattagaggttgaggttgagaatcaaacagctattgaggcattagaa
aagaataaatgtgatcgaattttaagaaaaattttagatggagaatataataaacaggtt
aaagtcaattttgttgtaggtgattttaaaaatgagtctaatcagttagctaatgaacag
caaaaagaaactaaagcttatatggatagtttagttaagaattcagctggacaagggcct
gctaggaatcgaaactcacaaagtactaattcagtaaagggccaaacagtatggttaggt
aaaaaaattaatggtgaagtccagccattagatgaaattacaggtgaggttaaaaatgta
gtagttaagggccaaatcttttctgctgatattaggcatttacaaagtggtagtaagttg
attatgtttgatattactgatcatactaattcaattactgttaaattatttgaaaataag
aatgataatttagctgataaagttgctaaaggagaatggttattagtagagggtaatgtt
gagtttgatacttatgaccaagagctaatgttaaagccacgtaatattatggttacttct
aattctagtaagaaggatgaagctgaccaaaaaagagctgaattacacttacatactaag
atgagtagtttggattcagtcttagatgtagaagctgcaataaagcaagcagatgattgg
ggacattcagcgattgctattacagaccatggtgtagtacaggctttccctgatgcttat
aatgcagctaaagataaagatattaaggtgatttatggattagaagcttacttagttgat
gatggagaaccaattattttaaatcctgttgaccaagatatatctaaagagacatatatt
gtctttgatttagaaacaacaggctttaatccacatcataatgaaattatagaaattgga
gcagctaaggttgaagcagggactataactgaaagctaccaaacatttgttaatcctagt
caggatattcctgctaagattactgaattaacagggattaatgcagaaatggtagctgat
gctccttcgttaaaagaagctataactaagtttttagattttataggggatgctacttta
gtagctcataatctatcttttgatttaggatttattgaggataaattaaggaaattagat
aagcctaagttaactaatcctgcccttgatactttgaatttatctcgtgctttattacct
gagctgaagtcttataaattaaataaattggctaaaaagtttaataaaaatttagaaaac
catcatcgagcttatgatgatgctaaagtaacagctgagatactattagaattaatagat
ttagctaagaataataaggttaataatttaactgaaattaatcaattaaccagtaagatt
gattataaacgaatgcatccttatcacactactattttagttaaaaatcaacaaggcctt
aggaatttataccaattagtatctgaggcccatgtcgagaatttccatcgagtaccacgg
gttttaaagagtcagttattagaaaaaagagagggcttgattattggttcagcatgtgaa
gcaggacaattatataaagcaattttgcatggtaaatccgatgatgaattaattgagtta
gctaaattctatgattatttagaagtacaacctttaggtaataataaatttttattagaa
aaaggagaggttgaatcttttaaggaactagaagaaataaatcgtaaaatttatcaatta
ggaaaccgtctaggtaagccagtgattgctgctggggatgttcattttctagatgctaaa
gatagtgtttatcgtagagttttaaaagaaggtcaaggttttgatgatgcagctgaccaa
ccacctttatatctaagaacaactgaggaaatgttagcagaatttgattatttttctgag
gatgaagcttatgaattagtaattgagaatccgaaagatatttgtgaggaaatagaagaa
gttgagcctatccctgataaattatttactccaactattgaaggagctgaagatgagatt
agagagatggcttataataaagctaagaaatggtatggaaatcctttacctgatttagta
gtagatagattggagaatgaactagaatcaataatcgggaatggttatgcggtaatctat
ttaatttctcataagttagttaaaaagtcgttaagtgatggttatttagtaggttctcga
gggtcagttgggtcttcttttgctgcaacgatgaccgatattactgaagttaacccttta
cctcctcattataggtgtcctgaatgtaaggattctacattctttactgatggttcagta
ggattaggtgttgacttgccagataaagactgtggtcaatgtggtacagaattaattaaa
gatggctatgatattccatttgaagtctttttaggttttgaaggagataaagttcctgat
attgatcttaatttctctggtgaatatcaatctcaagttcataggtatacagaaaaactt
tttggggaagagtatgtgtatagagcgggaactatatctacaattgctgacagaacagca
tatggttttgtgaaaggacatatggaggataataatttatccttacgtcaagctgaaatt
aaccggttatcttcaggttgtacaggagtaaaaagaacaactggacaacacccaggagga
caaatagttgttcctcaagataaggagatttatgattttactccaattcaacgtccagct
aatgatatggatagtgatacattaacaacccactttgattttcattcgattcatgataat
ttactaaagttagatgtgctaggtcatgatgatccaactagtattcgaatgttacaggat
cttacaggggtcgacccccaggagattccattagatgatgaggagacgatgggaattttc
tccagcatagagcctttaggggtaactgaggatcaagtaggagttaagttaggaacttta
ggaattccagaattcgggactcaatttgtgcgcgggatgttacgtgaaacaagaccaaca
acttttgctgagttagtgcggattagtggtttatctcatggagcagatgtttggttaaat
aatgctcaagatttaattagatcgggcacggctaaattagcagaagttatatcagttcgt
gatgatattatgaattatttattgcaaaagggagttgagccatcacaagctttctggatt
atggaacatgttagaaagggtaagggattgacagcagaggaagagcaggcaatgcgagag
aacaatgtacctaattggtatattgaatcatgtaaaaaaattaattatatgttccctaaa
gctcacgctgctgcttatgtaatgatggcctttcgaattgcttattttaaggttcatcat
cctcaagctttttataataccttttttaccattaaagctaatgattttgatgcgcaaatt
gttctacaaggggaagaacatattaaaaagcagatgcaagagattaaaagtaaaggaaat
gatgctacggccaaagataaaaatacaagaacagtattagaaattgtgattgaagcttta
gctcggggaattgagtttgtgcctgtagatatttatgaatccaaagcttatgaatttaag
atcacagatgatggtctattacctcctctaattagtttagatggtttaggtagaagtgca
gctaaaagtatagtgcaagtacgtaaagagggcgagtttacttcaatagagaatttaaag
aatcggtctggagcaagtaaaacagtaatcgaagctctaaggttgcatggttctttagaa
ggattaccggagactaatcaactctctttatttcaataa

DBGET integrated database retrieval system