Halobacteroides halobius: Halha_0877
Help
Entry
Halha_0877 CDS
T02401
Name
(GenBank) diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein
Organism
hhl
Halobacteroides halobius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
HAMP
DUF4229
DUF4446
TarH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGB40843
UniProt:
L0K9S8
LinkDB
All DBs
Position
857063..858757
Genome browser
AA seq
564 aa
AA seq
DB search
MKLYLDIKTKIFLLILVFNLVLIVALISLSLTLFNQAFTQFAVESQAIKETSQASNHLRD
TLNLVNKQLIVIGLIALIIAMILSYIIAKKFADPLKKLKNIFIKGAQGDLSVRASIIKSS
SEIKEVADSFNQMMDRISELTYRDLLTGVLNFSYFQDKLSLALDNLESDEKLVLFTIGID
DFKTINDNYGYHTGDKIIKKLANRLIRSLDDNVVARHGDEFFLYFTESTKRSQIINLGRE
ILDRINQPYEIEGMIIYITASLGIAIYPQAGTTNQILIKHASMAMHLVKNRSEQKMEIYS
ANMEEKLSKRLKLEAKLQEGLEKEHFLLHYQPLFNSKAEEIVGVEALIRWQEPGVGMISP
GKFIPIAERNGMIVKIGDWVLKRACKQLKKWHQLGYEDIYISINIAPQQFSDDDFVHKVE
SILLETKLDPSYLELEITERATMKNIEHTINMLGQLRELGVKIAIDDFGTGYSSLSYLKE
FAITKLKIDKSFVMDLTTNSKNLAITETIIMMAHNLNLEVTAEGVENNGQLERLKEQGCD
TLQGYFLSLPLPENDLLKLLKIKK
NT seq
1695 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttgtatttagatattaaaactaaaatatttctattaatattggtctttaatcta
gtattaatagtagctctaattagtctttctttaactttgtttaaccaggcatttactcaa
tttgcagtagaaagccaagctataaaagaaacttctcaggcaagcaatcacttaagggat
accttaaatttagttaataaacaattaatagtaattggtctgatagccttaattattgct
atgattttaagctatataattgctaaaaaatttgcggacccactaaagaagttaaagaat
atttttattaaaggagctcaaggtgatctatcagttagagctagtattataaagtctagt
tctgaaattaaagaagttgcagatagtttcaaccaaatgatggataggataagtgaacta
acatatcgtgatttattaactggggtattaaattttagctattttcaagataagcttagt
ttagccttagataatttggaatctgatgaaaaattagtattatttactataggaattgat
gactttaaaacaattaatgataactatggatatcatactggagataaaataataaaaaaa
ttagctaatcgtttgataagaagtttagatgataatgtagtagcaagacatggtgatgag
ttctttctctactttactgaaagtactaaaagaagccaaattattaatttaggaagagaa
attttggatagaataaatcaaccttatgaaattgaaggaatgattatttatattactgct
agtttagggattgcaatttatcctcaagcaggcactactaatcaaatattaatcaaacat
gcaagtatggcaatgcatctggttaaaaatagaagcgagcaaaagatggagatttattca
gctaatatggaagaaaaattgtcaaaaagattaaaattagaagcaaaattacaggaaggc
ttagaaaaagaacacttcctgcttcattatcagccattatttaatagtaaagcagaagag
attgtaggtgtagaagcattaattagatggcaagaacctggagtaggtatgatttctccg
ggaaagtttattcccatagcagagagaaatggtatgatagttaaaataggagattgggta
ctaaaaagggcttgtaaacaattaaaaaagtggcatcaacttggctatgaagatatatac
atatctattaatattgcgccccaacaatttagtgacgatgattttgtacataaagtagaa
agtatattattagaaactaaactagaccctagttatctagagttagaaattactgaaagg
gctactatgaagaatattgaacatacaatcaatatgttgggccaacttcgggaattaggt
gttaaaattgcaattgatgattttggaactggttattcttcattaagttacctaaaagaa
tttgcaattactaaattaaagattgataagtcatttgtaatggatttaaccaccaatagt
aaaaatcttgctattacggaaaccattattatgatggctcataatcttaatttggaagtg
acagctgaaggagtagaaaataatggtcaattagagcgtttaaaggagcaaggttgtgat
accttacagggatactttcttagtctgcctttacctgaaaatgacttattaaagttatta
aaaataaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system