Halobacteroides halobius: Halha_2541
Help
Entry
Halha_2541 CDS
T02401
Name
(GenBank) PAS domain S-box
Organism
hhl
Halobacteroides halobius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
PAS
Sigma54_activ_2
PAS_9
PAS_8
HTH_50
PAS_10
PTS-HPr
PAS_4
AAA_5
PAS_7
AAA_16
bpMoxR
AAA
SpoVT_C
HTH_8
Mg_chelatase
AAA_2
nSTAND3
DUF1542
AAA_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGB42415
UniProt:
L0KCZ6
LinkDB
All DBs
Position
complement(2559285..2561312)
Genome browser
AA seq
675 aa
AA seq
DB search
MIKKEKLTFTHKKGLHARVAAMIVKKANRIKNEYGDKLFVGAREDNLLPATSLISVTSSN
IAYQDDIIAVSKGENADQSIEEFVNFLKGEFNLEDSKTKDEVDELLQQTTTAMDKVFNNI
ANGVIIVDQKGIITSFNPAAERITALEANQVIGEEITKVIPNSRLKKVLESGASELGQRQ
KINQATIITNRTPIMSGDQVVGAIAVFQDISTLEKLSGELKEVKALKERLDLILESVQDG
ICVVDSKGLIDYLNSTYTQMLGITADEAVGNKIDQISNNKTYQQVLDTGESKTGVVTKKN
SQLIIISNIYPIKVEGVVEGAVIVSKKKTEVEELAQRLKELSAKAEYLEQELKREKKLDK
PFQRIIGKSDELREALVNASKAAETNSTVLIRGESGTGKELVAEAIHYASNRANGPFIRV
NCAAIPPNLIESELFGHEKGAFTGAVQKKIGKFELADGGTIFLDEIGELPSELQVKLLRV
LQERIFSRVGGTERIKVDIRIVTATNCNLEEMMQEGTFREDLYYRLNVIPILLPPLRARR
EDIPLLVNHFLEKLSAKLEKPVDSISKESLEILTNYSWPGNIRELQNIIERAINFTDNDK
ISLDNLPNYIKEDYKNGKTLVNLKEDGDVASLEEYEKEIIKLALKKHGSFNASGKALGIT
HRTVANKARKYGLVD
NT seq
2028 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgatcaaaaaggagaaattaacctttactcataaaaaaggtttacatgctcgagtggcg
gctatgattgttaagaaggctaaccgaataaaaaatgaatatggggataaactttttgta
ggggctagggaagataatttattaccagctactagtttaatttctgtaacatcctcaaat
atagcttatcaagatgatattattgctgttagtaagggggagaatgctgaccagtcaatt
gaggagtttgtaaattttttaaagggagagtttaatttagaggatagtaagactaaagat
gaagttgatgaattattacaacaaactactacagctatggataaagtatttaataatata
gctaatggagtaattattgttgatcaaaaagggattattactagttttaatcctgctgca
gaaagaattactgccttagaagctaatcaggtaattggtgaagaaataactaaagttatt
cctaattctcgcttgaagaaggtcttagaatctggtgcttcagaattaggccaacggcaa
aagattaatcaagctacaattataactaatagaactcctattatgtcaggagatcaagta
gttggcgctatagcagtttttcaagatatatctaccttagaaaaattatctggtgaatta
aaggaagttaaggccttaaaagaaagacttgatttgattttggagtcggttcaagatggt
atttgtgttgttgatagtaaggggttaatagattatctaaattctacttatactcaaatg
ttaggtataactgctgatgaggctgtagggaataaaatagaccaaattagtaataataaa
acatatcaacaggtattagatactggtgagagtaaaacaggggtagtaactaaaaaaaat
agtcagttaattattatctctaatatttatccaattaaagttgaaggggtagtagaagga
gcagtaatagtatctaaaaagaaaaccgaagtagaagaattggcccaacgattaaaagag
ttatcagctaaggctgaatatctagagcaagagctgaagcgagaaaagaaattagacaag
ccgtttcaaagaattataggaaagagtgatgaattaagggaagcattagttaatgcttct
aaggcagcagagactaattcaactgttttaattagaggagaaagtggaacaggaaaggaa
ttggtagctgaggctattcattatgctagtaaccgagctaatggtccatttattagggtt
aattgtgctgctatcccgcctaatttaattgaaagtgaattgtttggccatgaaaaggga
gcttttacaggagcagtgcaaaagaagattggcaagtttgaattagcagatggaggaact
atatttttagatgagattggtgaattgccaagtgagttacaggttaaactattaagggtt
ctacaagaaaggatttttagcagagttggtggtactgaaagaattaaagtggatattaga
atcgtaactgcgactaattgtaatttagaagaaatgatgcaagaaggaacatttagggaa
gacttatactatagattaaatgtaattccaattcttctacctcctttgagagctagaaga
gaggatattcctttattagttaatcattttttagaaaaattatcagctaaattagagaaa
ccggttgatagtatttctaaagaatcactagagattttaacgaattattcttggcccggc
aatataagagagctgcagaatataattgaacgagcaattaattttacggataatgacaag
atttctttagataatttgcctaattatattaaagaagattataaaaatggaaaaacatta
gttaatttaaaggaagacggagatgtcgcttcattagaagagtacgaaaaggaaattatt
aaactggcattaaagaagcatggtagttttaatgcttctggaaaagcattagggattaca
catcgaactgtagctaataaagctcggaagtatggattagtagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
