Hydrogenobaculum sp. HO: HydHO_0146
Help
Entry
HydHO_0146 CDS
T02482
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
hho
Hydrogenobaculum sp. HO
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
DUF267
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGG14483
UniProt:
M1QH49
LinkDB
All DBs
Position
129073..130470
Genome browser
AA seq
465 aa
AA seq
DB search
MGGGEPSAVVPEMNAINTGKANYNRLGAFILADIYRFTYINDVYGFDIGDELLKAVGRRL
RDIFRPTDIIGRVSSDTFGIILTDLKDKEDVIILLDRLRKAFEQPFNINGNVISVAMQMG
IAIFPDNGKSAKEVYKNADISLAKAKKNTEWSYVFFSDDLNSKASQFLLYKTHLEKAFEK
GEFVIYYQPYFDINTLCIAGFEALTRWKSEELGFISPIHFIPILEESGLISKLETWLINQ
ACKDLEYLNSIKLFANMPIPISINISPISFKNEDVYEKIVNITSRYKKTDRAASTHFESE
EHAQSLNSSENGLQVYHGLQHTLFGCINIEITESLFLENFDKAISTLEKLRSSGFKISID
DFGTGYSSFSYLKDLPIDYLKIDISFVRHILNDKKSRSITKTIIELAHNLEMKTIAEGVE
TKEQFELLKSLGCDIVQGFWLAKPMPISELVDFIESWEHEKINYY
NT seq
1398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggggggtgagccgtcggccgtggttcccgagatgaatgctataaacactggtaaa
gctaattacaataggcttggggctttcatactggcggatatctatagatttacttatatc
aacgacgtatatggttttgatataggcgatgagcttttgaaagctgttggcaggaggcta
agagatatatttaggccaacagatataataggtagggttagttctgatacctttggtata
attttgacagatttaaaggacaaggaagatgtaataatacttttggatagattaagaaaa
gcttttgagcaacctttcaacataaatggcaatgttataagtgtagctatgcaaatgggt
atagctattttcccagataatggaaagtctgccaaagaggtgtataaaaatgctgatata
tctttagctaaagctaaaaaaaatacagagtggagttatgtatttttcagcgacgattta
aactcaaaagcttcccagtttttactttacaaaacacaccttgagaaagcttttgagaaa
ggagagtttgtaatatattatcagccttactttgatatcaacactctttgtattgctggc
tttgaagcgcttacaaggtggaaatccgaagaactcggctttatctcgcccattcatttc
atacctatacttgaagagtctggtcttatatcaaaattagaaacttggcttataaatcaa
gcgtgtaaagacttggagtatctgaatagcataaagctttttgcaaatatgccaatacca
atatctatcaatatatcacctatttcttttaaaaatgaagatgtatatgaaaaaattgta
aatattacctcaagatacaagaagacagatagagcggcatcgacgcatttcgagtctgag
gaacatgcacagtcactcaatagctctgagaacggcttacaagtataccacggcttacag
cacactttatttggctgtataaacatagaaattaccgagagtttatttttagaaaatttc
gacaaagccatatctacgcttgaaaagcttaggagctctggttttaagatatctattgat
gattttggaactggttatagttctttttcctatcttaaagatttaccaatagattatctt
aaaatagacatatcttttgtaaggcatatattaaacgataaaaaatcaagatctatcacg
aaaactataatagaactagcccacaaccttgagatgaagaccatagcagaaggtgtagaa
acaaaagaacagtttgagttgctaaagtctttagggtgcgatattgttcaaggtttttgg
ttggcaaaaccaatgccgataagtgagttagtagattttattgaaagttgggagcatgaa
aaaataaattattattga
DBGET
integrated database retrieval system
