Hathewaya histolytica: NCTC503_01180
Help
Entry
NCTC503_01180 CDS
T05971
Symbol
wapA_2
Name
(GenBank) putative cell wall associated protein
Organism
hhw
Hathewaya histolytica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
CBM96
CBM_4_9
DUF6531
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VTQ88082
UniProt:
A0A4U9R939
LinkDB
All DBs
Position
1:1201288..1207839
Genome browser
AA seq
2183 aa
AA seq
DB search
MELEIKSDFLKENIILNNPIENPEFRYILYTKNLKVNINENKEILFFDNTDGKEVFTMEV
PYMIDNQGELSKDIDVQCIEKEDGVQELVIKPNKEWLNAPKRAYPVKIDPPVRSSLDVKK
IQDAFVASGLPTQNYREADRLGVGNGKYSKTTRSFLKFELPQISSADMIIDAKLYSLLFS
DQNNNTQINVHKVLGNWDSKSITWNRKPNFSSKIEDYAIVKGKVGSIFHWDITAIAKEWY
NSGNNYGLMLKNNNESSGYTEFLSSDIHKDFKGIRPQVVFYYVNNSGLEDYWSYHSQEVG
RAGTGHVNDYNGNLVFTHNDLSTNGNLMPASISHVYNSNEKDKSIGFGLGWRLNYYQTIE
PKIIEGKRWYEYTDSDGTKHHFKYDDKEKIYKEDSGLDLKFKINSDGSYEIKDKDDNTLT
FTKWGYLYIVKDKNNNKLTINYGGTKVRSITDGAGKQIKFDVLSNGYLVGITDPAGRRTS
FTYSGIKLSKITYPDGKYTLYEYNSDNTLKLVTNYDGYQMQYEYYGSKPNRVKKVLEKHS
NGTLGGELSLVYGFNQTTFKDVKGRSHIYQFNNLGNTVSVKDTDGSAEYYKYFDKENNKN
KLELESKLQKTTKNYLKNHNIELNNTEWTKDSWTGSSGSADVTSEDKYLGNKSLKINKTN
DKSRQFYSQSLNLEKGKTYTLSAYVKSKNISNKNSKGAGVFVNYQNNKGSWETVESRFIS
GSNDWDRLEVKFTLPKDSASNQVLARAGIMSETGIAYIDSFQLEEGSIANRYNMLENANF
MYTSGDKPLYWTKAAECDSGDKYEVFEGRKTFKVNGNATKNKNIGQVVSASGKKGDTFVV
SGWGKSDSVPTHSQRYFALDVGIKKKGSNEYQWTVVPFNQDSSQWQFVSEKVVAKHDYDR
ITVYGLYYLNANTAHFSDIQLFKEEFGQSYTYDSKGNVISVEDLSKQKSKFEYNGNNDLV
KSIDPKGNEFKYEYDGKRNVTKATTSENVVYSFTYDSKGNPLTSKVSGSGLFMESSAEYT
ANGNYMKSMTDSSGNKIGYDWNETKGLLNKSIDSKGNETNYKYDNLDRVISVDKDIKNES
LVQIPFNHNLNNNSGIQPIESQSVTFERDLKGDMSMGAFQSTYNLLSKNSSFENTTSEWA
LTDWNKSTGKWRLVQDGAVGKYSLECYDSDGKTDGSITNAIAYQYVEYPSVTTEEKILSL
SAYAKRIGNATPGLSVVCYDNSGNEIGGSYKIHMQDIVENKWCRISKEFNVPKGTKKVRA
VLRSNVKDKELVRFDGVQLEEKPFPTPYTDNRRSGGTSLKYNFNINDEEGAFSSFFKLAG
NKNDSKTIISTEKEEKSLFSLYLDKENNLQLSVKDKNKQIKNIITVNKDQIKKDNWHFVL
VNWKKLGDEYKFSLYLDDKNYEAKVKDVEDFSGGITSIGSNAKGTQILEGYLERFVYSNK
NLSVEEIGTLKQKKDIKSQNIKVTNNYTYENDNIKTVSHNGFSYIFNYDVFGNTTSVNVG
KQQLINNKYEARTGKLLESTYGNGHKTSLDYDGTDAVIGKRFNGQLKYRYEHDANGNLGY
KEDLENGVNYRYIYDVADRLVKVEDSKGNYFTTDYDKNNNKSKIIERINGKVYTTSYSYD
KDNRVKDTTLPSGSKVLNNYDSIGRITKNEVNTGKTSLNTTFTFEAGYKGSQTNRISSMK
NNNKEILYTYDKNGNIETIKSEGKLIKYHYNSLNEVIREDNEPLGKTIVYNYDVGGNITS
KIEYEYVGSQKLGKEIKTYNYEYGDSNWKDKLTSFDGKEITYDAIGNPLSYDGYKFTWQH
GRQLKSISGNNKNISYKYNDSGIRTEKSVNGEVTKYHLNGSDVAYEETLDSTGKVKDSIY
YNYDASNHLVSMTLNSEEYFYIRNAQNDIIALTDKSGKEVVTYNYDTWGKLISVEGTLKD
TVGIKNPYRYRGYRYDIETGFYYLSTRYYNTNFGRFINMDSLGGKIGVLLSHNVFAYCMN
NPVNMEDSSGNFPLALRCFGELTGGAIAAVGAVLSSTVVIAGALILTTCFLGYTIYNYYS
HSSSGSSSSKISSKGGVTGKTNINGGGIRRGGSNRKPPKKYKKPRKIKKTTHGHHTYPKY
LGGAVAQKLVELAPQIHRELHAAIHKFEGGWLAPKKGYTGKTIQYIYDKQQIQEGLIRFY
NSIDEFKDLLEPLKEAIRYTMEK
NT seq
6552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacttgaaattaaatctgactttttaaaggaaaatataatattaaataatcctata
gaaaacccagaatttaggtacatactatatactaaaaacttaaaagtcaatattaatgaa
aataaggaaattttattttttgataataccgatggtaaagaagttttcaccatggaagtt
ccttatatgatagataatcaaggggaattaagcaaggatattgatgtacagtgtatagaa
aaggaagatggtgtacaagaactagttataaaacctaataaggaatggttaaatgcacct
aaaagggcatatccagtaaagatagatccaccagtgagaagctccttagatgtgaaaaaa
atacaagatgctttcgttgcatcaggacttccaacccaaaactatagagaagcagaccgc
ctaggagtggggaatggtaaatactctaaaacaacaagaagttttttaaagtttgagtta
ccacaaatatcgtctgctgatatgattatagatgcaaaactctactcattgttattttca
gatcaaaataataatactcaaataaatgttcataaggtcttaggaaattgggattctaaa
agtattacttggaatagaaaacctaacttcagtagcaagatagaggactacgcaattgta
aaaggaaaagttggatcaatatttcattgggatataacggctatagcaaaggaatggtat
aattccgggaataattatgggctaatgcttaaaaacaataatgaaagtagtggatataca
gaatttttatcctccgatatacacaaggattttaaaggtataagacctcaagtcgtattt
tattatgttaataattcgggtttagaggattactggagttatcattctcaagaagtgggt
agagcaggaacaggacatgttaatgattataatgggaatttagtttttacccataatgat
ttaagtaccaatggcaacttaatgcctgcatctatttctcatgtatataatagtaatgaa
aaagataaaagtataggttttggactaggctggagacttaattattaccaaacaatagaa
cctaagattatagaaggaaaacgatggtatgaatataccgattcagacggtacaaaacac
cattttaaatatgatgataaagaaaaaatttataaggaagattcaggattagaccttaaa
tttaaaataaattctgatggaagttatgagataaaggataaagatgataatactttaaca
tttactaaatggggttatctttatatagttaaggataagaataataataagttaacaatt
aactatggtggtaccaaagtaagatccataactgatggagcaggaaaacagataaaattc
gatgtgctatctaatggatatcttgtaggaataacagatccagcaggacgaagaacatca
tttacgtatagtggtattaaattaagtaaaattacatatccagatggtaagtatacatta
tatgaatacaatagtgataatacattaaagcttgtaactaattatgatggctatcaaatg
cagtatgagtattatggaagtaaacctaatagagtaaaaaaggtattagaaaaacattca
aatggaaccttaggtggagaattatctttagtttatggatttaatcaaaccacctttaaa
gatgtaaagggtagaagtcatatatatcaatttaataatcttggaaatacagtttctgtt
aaggatactgatgggagtgctgaatattacaagtattttgacaaggaaaataataaaaat
aaactagaattagaatcaaaattacaaaaaaccactaagaattatttaaaaaatcataat
attgaacttaataatacagaatggacaaaagactcatggacaggatcaagtggatcagca
gatgtaacatcagaagataaatatttaggaaataaaagtttaaaaattaataaaactaat
gataaatcaaggcaattctatagtcaaagtttaaacttggaaaaaggaaagacatatacg
ctatcggcctatgttaaaagcaaaaatataagtaataaaaattcaaaaggagcaggcgta
tttgtaaattatcagaataacaaaggaagttgggaaaccgtagagtcaagatttatttct
ggaagtaatgattgggataggttggaagttaaatttacactgccaaaagattcagcttca
aatcaagttttagctagggctgggattatgtctgaaactggtatagcttacattgattca
tttcaactagaagagggaagcatagcaaatagatataatatgcttgagaatgctaacttt
atgtatacctcaggagacaaacctttatattggactaaggcagcagaatgtgactcagga
gataaatacgaagtttttgagggaagaaagacatttaaagtaaatggaaatgccactaaa
aataaaaatataggacaagttgtatcagcatctggtaaaaaaggagatacatttgtagta
agtggttggggaaaatcggattccgttcctacacattcacaaagatactttgccctagat
gtaggtattaagaaaaaaggatctaatgaatatcagtggactgttgtgccatttaatcaa
gattcatcacaatggcaatttgtatctgaaaaggttgtagcaaagcatgattatgataga
ataacggtttatggattatattatttaaatgccaacactgcacactttagtgatatacaa
ttatttaaagaagagtttgggcaaagctatacctatgattcaaaaggaaatgttatttct
gtcgaagacctatcgaagcaaaaaagtaagtttgaatataacggtaataatgatctagta
aagtctatcgatccaaagggaaatgaatttaagtatgagtatgatggtaagcgtaatgtt
acaaaagctactacatcagaaaatgtagtttattctttcacttatgacagtaaaggaaat
cctcttacatcaaaagtatctggttcaggtttatttatggaatcctctgcggaatacact
gcaaatggaaactatatgaagtctatgacagacagtagtggtaataagataggttacgat
tggaatgaaacaaagggattattaaataagtccatagattctaaaggtaatgaaactaat
tataaatatgataatctagatagagttataagtgtagataaggatattaaaaatgagagt
ttagtacaaattccatttaaccataatctaaataataatagtggaatacaacctatagaa
agccaaagtgtcacttttgagagagaccttaaaggtgatatgagcatgggggccttccag
tcaacatataacttactaagtaagaattcctcttttgaaaatactactagtgagtgggca
ttaactgattggaataaatctactggaaagtggagactagtacaagatggtgcagtaggt
aaatattcgttagaatgctatgatagtgatggaaagactgatggaagtataaccaatgct
atagcatatcagtatgtggaatatccaagtgtaacaactgaggaaaaaattcttagtcta
agtgcttatgcaaaacgaataggaaatgccacaccagggcttagtgtagtttgttatgat
aatagtggaaatgaaataggtggctcttataaaatacacatgcaagatatcgtagagaat
aaatggtgcagaatatcaaaagaatttaatgtgccaaagggaactaaaaaagttagagct
gttcttagaagtaatgttaaagataaggaattggttagatttgatggtgtacagttagaa
gagaagcctttcccaaccccatatactgataacagaagatcaggggggacaagtcttaag
tataactttaatataaatgatgaagaaggtgctttttctagtttctttaagctagcaggc
aacaagaatgactctaaaacaataatatctacagaaaaagaagaaaagtccctatttagt
ctttatttagataaagaaaataatcttcaactttctgtaaaagataaaaataagcagatt
aaaaatattataacagtaaataaggatcaaattaaaaaggacaactggcattttgtccta
gttaactggaaaaagcttggagatgaatataaatttagcctgtacctagatgataaaaat
tacgaggcaaaggtaaaggatgtagaagatttttcaggtggaattacatcaataggaagt
aatgcaaagggaacacagatattagaaggttatcttgaaagattcgtatactctaataaa
aatttaagtgtagaagaaataggaacacttaagcaaaagaaagatataaagtctcaaaac
ataaaagtaaccaacaattacacttatgaaaatgacaatattaaaactgtaagtcataat
gggtttagctatatatttaattatgatgtttttggtaatacaacctcagtaaatgtaggt
aaacaacaacttataaataataaatacgaagctagaactggaaaactattagaatctacc
tatggtaatggacataaaacaagtcttgactatgatggtacagatgccgttataggaaaa
agatttaatgggcagttaaaatataggtatgagcatgatgctaatggtaatttaggttac
aaagaagaccttgaaaatggcgtgaattataggtatatttatgatgtagccgatagatta
gtaaaggttgaagattcaaaaggaaattactttactacagattacgataagaacaataat
aagagcaaaataatagaaagaataaatggaaaagtctataccacatcatactcctatgat
aaagacaatagggttaaagatactacacttccaagtggaagtaaggtgttaaataactat
gatagtataggaagaataactaaaaatgaagtaaatacaggaaaaacaagtttaaatact
acatttacctttgaggcaggttacaaaggttctcaaactaacagaattagtagtatgaaa
aacaataacaaggagatactttatacctacgataaaaatggaaacatagaaaccataaaa
tcagaaggaaagttaataaagtatcactataactctctaaatgaagttataagagaagat
aatgaacctttaggaaaaactatagtttataattatgatgttggtggcaatattacttca
aaaatagaatatgagtatgtaggttctcaaaaattaggaaaagaaataaaaacatataat
tatgaatatggagattctaattggaaagacaagctaacaagctttgatggaaaagaaata
acctatgatgccataggaaacccactaagttatgatggatataagttcacatggcagcat
ggaagacagttaaaatctataagtggaaacaataaaaatatatcatacaagtacaatgat
tctggaataagaacagagaaaagtgtaaatggagaagtcacaaaatatcacttaaatggt
tcagatgtagcctatgaagaaactctagattccacaggtaaagtaaaagacagcatatat
tacaactacgatgcatcaaaccacttagtaagtatgaccctaaatagtgaagagtatttc
tatataagaaacgctcaaaatgatataatagcattaacagataaatcaggaaaagaagta
gtaacttataactatgatacctggggaaaactgatatctgtggaagggactttaaaagat
accgtaggaataaaaaatccatataggtatagaggatatagatatgatatagaaacagga
ttttattatttaagtacaagatattataatactaattttggaagatttattaatatggat
tcactaggtggaaagattggagtactattatctcataatgtatttgcttattgtatgaat
aatccggtaaatatggaggattcaagtgggaattttcctttagcacttaggtgttttggg
gaacttacgggaggagcaatagcagcagttggagcagtattatcatcaacagtagttatt
gcaggagcactgatattaacaacttgttttttaggttatacaatatataattattattca
cattcaagttctggtagttcttcatcaaaaatttctagtaaggggggagtaactggtaaa
accaatataaatggtggtggtattagaagaggaggaagcaataggaaaccacctaaaaaa
tataaaaaacctagaaaaataaaaaaaacaacacatggacatcatacatatcctaaatac
ttaggtggagcagttgcacaaaaacttgttgaactggcaccacaaatacacagagaatta
catgcagccatacataaatttgaaggtggatggcttgctcctaagaaaggatatacaggt
aaaaccatacagtatatttacgataagcagcaaatacaagaggggttaataagattttat
aatagtattgatgagtttaaagatttgttagaaccgcttaaggaagccataagatataca
atggaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
