Haliscomenobacter hydrossis: Halhy_5656
Help
Entry
Halhy_5656 CDS
T01491
Name
(GenBank) PKD domain containing protein
Organism
hhy
Haliscomenobacter hydrossis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ice_binding
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE53479
UniProt:
F4KUS6
LinkDB
All DBs
Position
7216355..7224505
Genome browser
AA seq
2716 aa
AA seq
DB search
MKTFLPKYLIILLLALIPRLNYGQAPNLGSAASFAVFTAAGEFSNGGATQITGDVGTNVG
AFTGFLPGIVVGSIHVVNTASAEAATDVATAYGELSSLDCGAMIGTTLGNGQVLTPNIYC
LGAASTLDGELILDAQGDAGAIFIFKIDGALSTTTLSKITLINGASLCNVYFQVNGAVSL
GGNSNSSGTVIAAGAISLAQGASLTGQALSTQGAISLNNNTITGSGPSESTIAGSSAITF
CAGGSVVLSGNVGGTWSNGSSAESITVTTSGDYFVTNTAPCGSVTSNHIMVTVIPLPSCL
ITGDIAICAGQSTELCVAAGAASYLWSTGGTTNCITVSAAGTYSVTVTDGNGCQNTCNTT
VVVNPLPSCLITGDVTICAGQSTQLCAAAGFASYLWSNGGTTNCISASVAGTYSVTVTDG
NGCQGICSTTVVVNPLPSCLITGNLAICAGQSTQLCVAAGLASYLWSTGGTTNCISTSVA
GTYSVTVTDGAGCQNICSATVVVNPLPSCLITGNVTICAGLSTQLCVAAGFASYLWSTGG
TTNCISASVAGTYSVTVTNGAGCQSICSTTVVVNPLPSCLITGNVTICAGQSTQLCVAAG
FASYLWSNGGTTNCISASVAGTYSVTVTDGTGCQSICSTTVVVNPLPSCLITGDIAICAG
QSTQLCVAAGFASYLWSNGGTTNCISASVAGTYSVTVTDGAGCQSICSTTLVVSPLPTCL
ITGNVTICAGQSTQLCVAAGFASYLWSTGEMTNCISASVAGTYSVTVTDGTGCQSICSAT
VVVNPLPTCLITGNVSICSGLSTELCVAAGFASYLWSNGGTTNCITASVAGTYSVTVTDG
AGCQSICSTTVVVNPLPSCLIIGQDAICAGLSTELCVLAGATSYLWSTGATTNCITVNAA
GTYSVTVTGVGGCTSVCSKTITISQQPTCLISGNDAICVGSSTQLCVPAGALSYLWSTGA
TTNCITVNAVGTYSVTVTNTGGCISICSKIITISPPIICLITGDVSICTGQSTELCVAAG
FASYLWSNGGTTNCITASAAGTYSVTVTDGAGCQSVCSTTVVVNPLPSCLITGDVTICVG
LSTELCVAPGFASYLWSNGGTTNCITASVAGTYSVTVTDGAGCQSVCSTTLVVNPLPSCL
ITGEDAICAGQSTELCVPAGAMGYLWSTGATTNCITVNAAGTYSVTVTNAAGCTSVCSKI
ITINQQTTCLITGNDAICAGQSTELCVSAGAMGYLWSTGATTNCITVNAAGTYSVTVTNA
AGCTSVCSKTITISQQGTCLITGNVGLCVGLSTDLCVPAGYASYLWSTGGTTNCITASVA
GTYSVTVTDGSGCQSICSTIVVVNPLPSCLITGVDAICAGQSTELCVEAGAMSYLWSTGA
TTNCITVNAAGIYSVTVTNAAGCTSVCSKIIAISQQTTCLITGNDAICAGQSTQLCVPAG
AISYLWSTGATTNCITVNAAGTYSVTVTDADGCISICSETVTISQQSTCLITGNDAICAG
QSTQLCVPAGAMSYLWSTGATTNCITVNAAGTYSVTVTDAAGCTSVCSETVTISQQTTCL
ITGNDAICAGQSTQLCVPAGAMSYLWSTGATTNCITVNAAGTYSVTVTDAAGCSSVCSET
VTISQQGSCLITGNNTTCLNQSTLLCAPAGALSYLWSTGATTNCIIVNAPGTYGVTVTDV
GGCTSVCSKTISLNQQNTCLITGEDAICIGQSTQLCVPAGEASYLWSTGATTNCITVNAT
GTYRVTVTDEFGCTSVCSKTIRTSQESTCLISGYDQVCVGQSTELCVPTGALSYLWSTGA
TTNCITVNAAGTYSVTVTFEGGCISTCSKTIKLSAAVSCLISGNSFICEGRLAQLCAPAL
ADAYLWSNGATTRCIHVSTPGTYSVTVTYVGGCVSTCSKTITLSEETACEITGNTVICEG
QTTRLCAVGGAVDYWWSTGEQTQCINVTAPGTYSLTLTTSGGCVTYCSKTVTLSPATCDI
ITGNDAMCIGQSTELCVPTGALSYRWNTGATTNCITVNTAGTYSVTVTYAPGCTSICSKT
VTIGRVDTCLITGNTNICPGQTTRLCVPLAGATDYWWITGAQTQCIDVTTAGTYSVTVTE
ANGCKSECSVIVTEGEADTCLITGNTTICPGQTTRLCVPLSGATDYWWITGAQTQCIDVT
TAGLYSVTVTEANGCKSECSVVVTMGETDTCLITETVICPGQSTRLCVPLAGASDYWWIT
GAQTQCIDVTTAGLYSVTVTDANGCKSECSVIVTMGETDTCLITGNTNICPGQSTRLCVP
LAGAIDYWWITGAQTQCIDVTTAGTYSVTVTDANGCKSECSVVVTEGEADTCLITGNTNI
CPGQTTRLCVPLSGATDYWWITGAQTQCIDVTTAGTYSVTVTEANGCKSECSVVVTMSEG
ATCLITGSDIIRPGQSTQLCVSSGALSYLWSTGATTNCITANAAGTYSVTVTYAGGCTSV
CSKTIAMVSEVNCIITGNSSICPGRLAQLCAPALAEAYLWSTGDTTRCIHVSSAGTYAVT
VTYVGGIVRTCSKTIGVNEDTTCEITGDTVLCPGKTTRLCAPEGAIDYWWSTGEQTRCIN
VTSPGTYALTLTTSGGCMSFCSKTVTRCPDTVNYTGRSIAKKVIQSDGNVEVRIYPNPLY
AKTMIEFQNTLSDSHVLIEIFSSTGSKVATLYNGNVEKNVLYNTELNAESLAGGVYYCRI
VHGRQTITRKLILLKN
NT seq
8151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaactttcctacccaagtacttaatcatccttctcctagcgctaattccgcgctta
aattacgggcaagcacccaatttaggttctgcggccagttttgcagtttttacggctgca
ggagaatttagcaatggcggagcaacacaaattacgggagatgttggcaccaatgtgggt
gcatttacgggctttcttccgggaattgtagtagggtctatccatgtggttaatacggct
tcagcagaagccgcaacagatgtggctactgcgtatggggaattgagtagtctagactgt
ggagcaatgattggcaccaccttaggcaatggacaagtcctaaccccgaacatttattgc
ctcggagctgcttctaccctagatggagaattaattttagatgcccagggtgatgcgggc
gctatctttatttttaagatagatggagcactctctactactacactatcgaaaattacg
ctcatcaatggagcttctttgtgcaatgtatactttcaagtaaatggagcagtcagttta
gggggaaattctaattctagtggcactgttattgctgccggtgccattagtttagcccag
ggcgcgtccctaactggtcaggccctgtcaacccaaggagcaatttcactaaacaacaac
acaattactggatcgggcccaagtgaatcaaccattgcgggcagtagcgccattacattt
tgcgcaggtgggagtgtggtactttccggaaacgtcggcggtacctggagcaatggttca
tctgcagaatcgatcaccgttaccacgagtggtgattattttgtaaccaatactgcgcca
tgtggttctgtaacttcaaatcatattatggtaacggttatcccgttgccgagttgcctc
atcacgggtgatattgcgatctgcgcagggcaaagcacggagctttgtgtagccgcggga
gctgccagctacttatggagtactggtggaacgacaaattgtatcactgtaagtgctgcg
ggtacctattctgttacggtaacggacgggaatggatgtcaaaatacatgtaacactaca
gtggttgtcaaccctctgccaagttgcctgatcacgggcgatgttacgatctgtgcaggc
caaagcacccagctttgtgcagccgcaggatttgccagctatttatggagtaatggtgga
acgacgaattgtatcagcgcaagtgttgcgggtacctattccgttacggtaacggatggg
aatggatgtcagggaatttgtagcactacagtagttgtcaaccccttgccgagttgcctg
atcacgggcaatctagcgatctgcgcaggccaaagcacccagctttgtgtagccgcagga
ttggctagttatttatggagtaccggtggaacgaccaattgtatcagcacaagtgttgcg
ggtacttattccgttacggtaacggatggggctggatgtcagaatatttgtagcgcgacc
gtggttgtcaaccccttgccaagttgcctgatcacgggcaatgtaacgatctgcgcaggc
ctcagcacccagctttgtgtagccgctggatttgcgagttatttatggagtactggcgga
acgaccaattgcatcagcgcaagtgttgccggcacctattctgttacggtaacgaatggg
gctggctgtcagagtatttgtagcacgacagtggttgtcaaccccttgccaagttgcctg
atcacgggtaatgtcacgatctgcgcaggccaaagcacgcagctttgtgtagccgcagga
tttgcgagttatttatggagcaatggtggaacaaccaattgcatcagcgcaagtgttgct
ggcacctattctgttacggtaacggatgggactggctgccagagtatttgtagcacgaca
gtggttgtcaaccccttgccaagttgcctgatcacgggcgatatagcgatctgcgcaggc
caaagcacgcagctttgtgtagccgcaggatttgcgagttatttatggagcaatggtgga
acgaccaattgcatcagcgccagtgtggctggcacctattccgttacagtaacggatgga
gctggctgtcagagtatttgtagcacgacactggttgtcagccccttgccaacttgcctg
atcacgggcaatgtaacgatctgcgcaggccaaagcacgcagctttgtgtagccgcagga
tttgcgagttatttatggagtactggcgaaatgaccaattgcatcagcgcaagtgttgct
ggcacctattctgttacggtaacggatgggactggctgtcagagtatttgtagcgcgact
gttgttgtcaaccccttgccaacttgcctgatcacgggcaatgtttcgatctgctcgggc
ctcagcacggagctttgtgtagccgcaggatttgccagttatttatggagcaatggcgga
acgaccaattgtatcactgcaagtgttgctggcacctattccgttacggtaacggatgga
gctggctgtcagagtatttgtagcactacagtagttgtcaaccctctgccaagttgcctc
atcatcggccaagacgcgatttgcgcaggcctcagcaccgagctttgtgtactagcgggt
gcgaccagttacctctggagcacaggagcaaccaccaattgcatcaccgtaaatgctgcg
ggcacctatagcgtgaccgtgaccggtgtaggcggctgcacgagtgtttgtagcaaaacc
atcaccataagccaacagccgacatgcctgatttcgggcaatgacgccatttgtgtcggc
tcaagcacacagctttgtgtgccagcgggcgctttgagttatctatggagcacgggagcg
accacgaattgcatcacggtaaatgccgtgggtacctatagcgtgaccgtcaccaatacg
ggtggctgcatcagtatttgtagcaaaataattaccatcagccctccgatcatttgtctg
atcacgggcgatgtttcgatctgcacagggcaaagcacggagctttgtgtagccgcggga
tttgccagttatttatggagtaatggtggaacgaccaattgcatcaccgccagtgctgcg
ggcacctattccgttacggtaacggatggggctggctgtcagagtgtttgtagcaccaca
gtggttgtcaaccctttgccaagctgcctcattacgggcgatgtaacgatctgtgttggc
ctcagcacggagctttgtgtcgctccagggtttgcgagttatttatggagtaatggtgga
acgaccaattgcatcaccgcaagtgttgctggcacctattccgttacagtaacggatgga
gctggctgtcagagtgtttgtagcaccacgttggttgtcaatcctttaccaagttgcctc
atcaccggtgaagatgcgatttgcgccggccaaagcacggagctttgtgttccagcgggg
gcaatgggttatctgtggagcacaggagcgactacgaattgcatcaccgtcaacgccgcg
ggcacctatagcgtgaccgtgaccaatgcagctggttgcaccagtgtttgtagcaaaata
attaccattaatcaacagacgacttgcctgattacgggcaatgacgctatttgtgccgga
caaagcaccgagctttgtgtctcagcgggggcaatgggttatctatggagcacaggagcg
accacgaattgcatcaccgtcaacgctgcgggaacgtatagtgtgacggtgaccaatgcg
gctggttgcaccagtgtatgtagcaaaaccatcaccatcagccaacagggcacttgtctg
atcaccggcaatgttgggctctgtgttggcttaagcactgatctttgtgtacccgctgga
tatgctagctatttgtggagtacaggtggaacgaccaattgtatcaccgcaagtgttgct
ggcacctattccgttacggtaacggatgggtctggatgtcaaagtatttgtagcactata
gtagttgtcaaccctctgccaagttgcctcatcaccggtgtagacgcgatttgcgccggc
caaagtaccgagctttgtgttgaagcgggcgcgatgagttatctgtggagcacaggagcg
accacgaattgcatcaccgtcaacgctgcgggcatctatagtgtgacggtgacgaatgcg
gctggctgcaccagtgtttgtagcaaaataattgccatcagccagcagacgacctgcctg
atcacgggcaatgacgccatctgtgccggacaaagcacgcagctttgtgttccagcaggt
gcgattagttatctgtggagtaccggagcgaccacgaattgcatcaccgtcaacgctgcg
ggcacctatagtgtgaccgtcaccgatgctgatggttgcatcagcatttgtagcgaaacc
gtcaccatcagccagcagagcacttgcctgatcacgggcaatgacgcaatttgcgccgga
caaagcacccagctttgtgttccagcaggcgcaatgagttatctgtggagcacaggagcg
accacgaattgcatcaccgtcaacgccgcaggcacttacagtgtgaccgtcaccgatgcg
gctggttgtaccagtgtttgtagcgaaaccgtcaccatcagccagcagacgacttgcctg
atcacgggcaatgacgcaatttgcgccggacaaagcacccagctttgtgttccagcaggc
gcaatgagttacctgtggagcacgggagcgaccacgaattgcatcaccgtcaacgccgca
ggcacttacagtgtgaccgtcaccgatgcggctggttgtagcagtgtttgtagcgaaacc
gtcaccatcagccagcagggctcttgcttgatcacgggcaacaacacgacttgtctaaac
caaagtaccttgctttgtgcgccagccggtgccctgagctacctctggagtacaggagcg
accacgaattgtatcatcgtcaatgctccaggtacctatggtgtgacggtgaccgatgtg
ggcggctgtaccagtgtttgtagcaaaaccatcagcctaaaccagcaaaacacttgtttg
atcactggtgaagacgcgatctgcattggccaaagcacccagctttgtgtgccagcgggc
gaagcaagttatctctggagtacgggagcgaccacgaattgtattaccgtcaatgccaca
ggcacctatagggtgaccgtaaccgatgaatttggttgcaccagcgtttgcagcaaaacc
attcggacaagccaggaaagcacttgcctcatctcgggctatgaccaggtctgcgttgga
caaagcaccgagctttgtgtgccaacaggtgcgctgagttatctctggagtacgggagca
actacgaattgcatcaccgtaaatgctgcgggaacgtatagcgtgaccgttacctttgag
ggcggctgtatcagtacatgcagtaaaacaattaagcttagtgcagctgttagctgcctg
atttcgggcaattcattcatttgtgaggggcgtttggctcagctttgtgcacctgctctt
gctgatgcctatttatggagtaatggcgccacaaccagatgtatccatgtaagtacacct
ggtacgtattcagttaccgtgacttatgttgggggctgtgtaagtacttgtagcaaaacc
attactttaagcgaagaaaccgcttgtgaaatcacgggcaatacggtcatttgtgaagga
caaacgacccgactctgtgcagttggaggagcagtggactattggtggagcacaggagag
caaacccaatgtatcaacgtaactgctcccggtacctattcgcttacccttaccacttcg
ggcggctgtgtgacttattgtagtaaaaccgttacgcttagtccggcaacttgtgacatc
atcaccggcaatgacgccatgtgcattggacaaagtaccgagctttgtgtgccaaccggt
gcgttgagttaccgctggaatacgggagcgacgacgaattgcatcacggtaaatactgcg
ggcacctattccgtaaccgttacctatgcacctggctgtaccagcatttgtagcaaaacg
gtgaccataggccgagtagatacctgcctgatcaccggcaataccaacatttgcccaggt
caaaccacccgactttgtgtacccctggcgggcgcgactgactattggtggatcaccgga
gcacaaacccagtgtatcgacgtcaccacggcgggcacctattcggtgaccgtaaccgag
gccaatggctgtaagagtgaatgcagtgtgatcgtgacagagggtgaagcagatacctgc
ctgatcactggcaataccaccatctgcccaggccaaaccacccggctttgtgtacccctt
tcgggtgcgactgactattggtggatcaccggggcacaaacccagtgcattgacgtcacc
acggcgggcctctattcggtgaccgtgactgaggccaatggctgtaagagtgaatgcagc
gtggtcgtgacgatgggtgaaacagatacctgcctgatcactgaaaccgtcatctgtcca
ggccaaagcacccggctttgtgtaccactggcaggcgctagtgactattggtggatcacc
ggcgcacaaacccagtgcattgacgtcaccacggcgggcctctattcggtaaccgtgacc
gatgccaatggctgtaagagtgaatgcagcgtgatcgtaacgatgggtgaaacagatacc
tgcctgatcaccggcaataccaacatctgcccaggccaaagcacccggctttgtgtaccg
ctagcgggcgcgattgactattggtggatcacgggcgcacaaacccagtgcatcgacgtc
accacggcgggcacttattcggtgaccgttaccgacgccaatggctgcaagagtgaatgc
agcgtggttgtgacagagggtgaagcagatacttgcctgattaccggaaataccaacatt
tgtccaggccaaaccacccggctttgtgtaccgctttcgggtgcgactgactattggtgg
atcaccggcgcacaaacccagtgcatcgacgtcaccacggcgggtacctattcggtgacc
gtgaccgaggccaatggctgcaagagtgaatgcagcgtggtcgtaacgatgagtgaagga
gctacttgtctcatcaccggcagtgacatcattcgcccaggtcaaagcactcaactttgt
gtatcaagcggggctttatcttatctctggagtacaggcgctactacgaattgtatcacc
gcaaatgcggcaggaacgtacagcgtgaccgttacctatgcaggtggctgcaccagcgtt
tgtagcaagacgattgcgatggtttccgaggttaactgcatcattacgggcaattcatcc
atttgtccagggcgattggctcagctttgtgcacctgctcttgctgaagcttatttgtgg
agcactggcgacacgaccagatgtatccatgtaagttcagctggtacgtatgcggtgacc
gtcacttatgttggaggtattgttcgcacttgttccaaaacaattggtgtaaacgaagat
accacttgtgagatcaccggtgataccgtcctttgcccgggcaaaactacccgactatgt
gctcctgagggcgcgattgactattggtggagcaccggagaacaaacccgttgtattaac
gtgacttctcctggtacctatgcacttaccctgactacttcggggggctgtatgagcttc
tgtagtaaaacggttacccgttgtcccgatacagtaaattataccggaagatccattgcg
aagaaagttattcaaagtgatggcaacgttgaggtaagaatttaccctaacccactttat
gccaaaacgatgattgaatttcaaaacacgctgtcagattcccatgtcctgattgagatt
ttcagctcgacagggagtaaagtcgccactttgtacaatggaaatgttgagaaaaatgta
ctgtacaataccgaattgaatgcagaaagcctggccggtggagtttactattgccgaatt
gtacatggccgccagacgatcaccagaaaactcatactactcaaaaactag
DBGET
integrated database retrieval system