Haemophilus haemolyticus: NCTC10839_00503
Help
Entry
NCTC10839_00503 CDS
T06216
Name
(GenBank) YadA-like C-terminal region
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
hhz
Haemophilus haemolyticus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hhz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hhz02000
]
NCTC10839_00503
Transporters [BR:
hhz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC10839_00503
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_anchor
ESPR
YadA_head
YadA_stalk
SlyX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SQH96641
UniProt:
A0A2X4R475
LinkDB
All DBs
Position
1:495106..498702
Genome browser
AA seq
1198 aa
AA seq
DB search
MNNIFKVIWNHATQTWTAVGELASAKGKSKSVKLAVISTALLVAATGVEAANVVSEAGEL
GQLSIATNKVTDQFFGNDRYKAETKLSKNVAGATVHAYDGIAIGNGAVSGAPAAPGATGG
NAHVAIGLMAHASGGGANGQNAAVALGAYSLATGQGGTAIGAHSIADALNSTALGKVAKA
NGDGSTAVGTNTRAEWQGTALGNTAEALANYATSIGVNSKANSHSSISIGRQAVVSGQNA
IGMGTQTQVNGDGTVAVGSSTNVSSKNVSTLGSNINVGSGRDGAVVLGHGSDAGGDSVVT
AVNSATAAGSPLIYKGFAGNLGDKSKDATNSEASNQGRIVSVGDDTKKIQVTTEVSNGTK
TTTTVIKNLITKEVTEIVETSTIKDGKDTITKVVNDITDPNNKKVKVPSKTEVKDTKAQP
HQDSAKQVGPEQTIYGERQIQHVAAGEITAGSTNAINGSQLYQVAKTLGTAAKGLADTLG
VELDEDGNLITPFKHTLNTSTSNYTGDKDASNVTTALTQLNAYVNAGWTVGNNAAEDVSK
ILPNGKVNFVNGEGTTSTVTANGTNGANVTFNVKKDVTANATTGLKDGGANNVLNVGKDG
VSVVSGTIDKATKETKGEVKAKDAKDNQVATVKNVVDAINSAGFVVSNGKSDKSELINAG
KTLTLKGGNGVNVEQEGSNFTFSIDSSTLLEGKTGNITVDEVKKAGETDAGKATVNNNDV
TKLATVKNVADAINGAKWFAKVENLSDSMNVRTQNDKDAEAQAMGAGDILTLKADKNLAV
KREGKDVTYGLASEIEVDKITVKAKAGETVKGTTVENGKVTNLDDHLKAPTKVTGGDVVN
ATEVKTPTLTDAEKKEAATVNDVLNAGWNLKTNGNQAAAITNGKGLDFASDDNSVTITPT
VDKDGNAKVNFSVNATSVINNNKGTIKEAATDPKAANAGTVTVSDADKGKLATVDTVAEA
INSAATFVKVADTQEVITASTADDNGVAVKSGETVTHTAGKNLKVKRDKQSITYALAQDI
DVNSVKATNGVTIGSGDNATKITSDDKGLNLAGKNGAATNINNVKDADLNATSKQAVNGS
QLHATNEKVANLGTTVKNLNSVVNRQAGAIDSLDRKVNKHSKQARAGIAGANAAAALPQA
YTQGKAMVAAAAGTFKGQNALAVGYSRISDNGKVILKLQGNANTSGDVGAGVGVGYQW
NT seq
3597 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaacattttcaaagtaatttggaatcatgccacccaaacttggactgctgtaggt
gaattggcatcagccaaaggcaaatcaaaatctgtaaaattagctgtaatttctaccgca
cttttagttgctgctactggcgttgaggctgcgaatgtagtaagtgaagcaggtgagttg
gggcagttatcaattgcaacaaataaagtaacagatcaattttttggaaatgatagatat
aaagctgaaactaagttaagtaaaaatgtcgcaggggcaacggtacatgcttatgatggt
attgcaattggtaatggagccgtttctggtgcgccagctgcgccaggtgctacaggtggg
aatgctcatgttgcgattggtttgatggcgcacgcaagtggcggtggcgcaaatggtcag
aatgcagctgttgcattaggtgcttattcattagcaacaggtcaaggtggtactgctata
ggggctcattcgattgccgacgcactaaattcaactgctttaggtaaagtagcaaaagca
aatggggatggctcaacggcagttggtacgaatacaagagctgaatggcaaggtacagcg
ttaggtaatacagccgaagctttggccaattatgctacatcaattggtgtaaattctaaa
gcaaattctcattcatcaatttcaattggtagacaggctgttgtttcaggccaaaatgct
atcggtatgggtacacaaactcaagtaaatggagatggaacagtcgctgttggtagtagt
acaaatgtatcaagtaaaaatgtatcaaccctaggttcaaatattaatgttggctctggc
cgtgatggcgctgttgtattaggtcatggcagtgatgcgggtggtgattcagttgtaacg
gcagttaattctgctacagcagctggttctccgttaatttataaaggttttgcaggaaat
ttaggggataaatctaaggatgctacaaacagcgaagcaagcaatcaagggcgaattgtt
tctgtaggggatgacacgaaaaaaattcaggttaccactgaagtatctaatggaacaaaa
acaacgactacggttataaaaaatcttattacaaaagaggtaacggaaattgttgaaacc
tcaactattaaagatgggaaagatactatcactaaggttgtaaatgatataacagatcca
aataacaagaaggtaaaagtcccaagtaagacagaggttaaagatactaaagcgcagcca
catcaagattcagcaaaacaagttggcccagaacaaacgatttacggtgagcgccaaatt
caacacgttgcagctggtgagattacggcgggttcaaccaatgcgatcaatggttcacaa
ctttaccaagtggctaaaactttaggtacagctgcgaaagggcttgctgatactttaggt
gttgagttggatgaagatggtaacttaattactccatttaaacatacgttaaatacaagc
acctcaaattatactggggataaagatgcctctaatgtaaccactgcactaactcaatta
aacgcttatgtgaatgctggttggactgtgggtaataatgctgccgaagatgtaagcaaa
attttaccaaatggtaaagttaactttgtgaatggagaaggcacaacttcaacagtaact
gcaaatggtactaatggtgcaaacgttacttttaatgttaagaaagatgtaactgcgaat
gcgactacaggattgaaagatggcggtgctaataatgttcttaatgtaggtaaagacggt
gtttctgttgtatctggcactattgataaagctacaaaagagacaaaaggagaggtaaaa
gctaaagatgcaaaagataaccaagtagcaacagttaagaatgttgttgatgctattaat
agtgctggtttcgttgtgtcaaatggtaagtctgataaaagtgaattgatcaatgcaggt
aaaacattgacgttaaaaggcggaaatggcgtaaatgtagagcaagaaggttctaacttt
actttcagcattgattcatcaacactcttagaaggtaaaactggtaacattactgtagat
gaggttaaaaaagctggagaaacggatgcgggcaaggctaccgtaaataataatgatgtt
actaaacttgctacagttaaaaatgttgctgatgcgatcaatggcgcaaaatggtttgcg
aaagttgaaaatttatctgactcaatgaatgtgcggacacaaaatgataaggatgctgag
gctcaagccatgggagcgggtgatattctaacgttgaaagctgacaaaaacttagcggta
aaacgtgagggtaaagatgttacttacggtttagcatcagaaattgaagttgataagatt
actgtgaaagctaaagctggtgaaactgttaaaggaaccactgttgaaaatggtaaagta
actaacttagatgatcatttaaaagcaccaactaaagttactggtggtgatgtagttaat
gcaactgaagttaaaacgcctacattaaccgatgcagagaaaaaagaagcagctacagtt
aatgatgtgttaaatgcaggttggaatttaaaaactaatggaaatcaggcggcggctata
actaatggtaaaggtcttgattttgcgagtgatgataattcagtaactattaccccaact
gtggataaagatggtaatgcgaaagttaacttttctgtaaatgcaacctctgttattaat
aataataaaggtactattaaagaagctgcaacagatcctaaagcagctaacgcaggtaca
gtgacagtttctgatgctgataaaggtaagttggcgacagttgatacagttgccgaggca
attaacagcgcagcaactttcgtgaaagtagctgatacgcaagaggttatcactgcttca
actgctgatgataacggagttgcagttaaatctggcgaaacggttactcacactgctggt
aaaaacttaaaagtaaaacgtgataaacaatctataacttatgcattagcacaagatatt
gatgtgaatagcgtaaaagcaacgaatggcgttactatcggtagtggtgataatgcaact
aaaattacctctgatgataaaggtttaaatcttgcaggtaaaaatggtgcagcaaccaat
atcaataatgtgaaagatgcggatcttaatgcaacatctaaacaagctgtgaatggtagc
caattacatgctacaaacgaaaaagtagcgaatttaggcacgactgttaagaacctaaat
agtgttgttaatcgtcaagctggtgctattgatagcctagacagaaaagtaaacaaacac
agcaaacaagcgcgtgcaggtattgcaggtgcgaatgcggcggcggcattaccacaagct
tatactcaaggtaaagcaatggtggctgcagcagcgggtaccttcaaaggtcaaaatgct
ttagctgtaggttactctcgtattagtgataatggtaaagtaatcttaaaacttcaaggt
aacgcaaacaccagtggtgatgtgggtgctggagttggcgtaggttaccaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system