Haemophilus influenzae KR494 (serotype f): HifGL_001407
Help
Entry
HifGL_001407 CDS
T02839
Name
(GenBank) hemophilus surface fibril
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
hik
Haemophilus influenzae KR494 (serotype f)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hik00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hik02000
]
HifGL_001407
Transporters [BR:
hik02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HifGL_001407
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TAA-Trp-ring
Trp_ring
Hia_Tpr_ring_dom
HiaBD2
ESPR
Phage_ssDNA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGV12201
LinkDB
All DBs
Position
complement(1421669..1428136)
Genome browser
AA seq
2155 aa
AA seq
DB search
MNKIFNVIWNVVTQTWVVVSELTRTHTKCASATVAVAVLATLLSATAEANDTLTIGGNTP
ATGGTATPKVNVTSTANGLNFAQEGKTGKEAYVHLNGIGSTLADTITGTTKTATNGVAVE
NHNRAASVADVLNAGWNIKGVKPNETTSDNVDFVRTYDTVEFLSANPETTTVTVESKDSG
VRTEVKIGAKTSVIKEKDGKLVTGKEKGENGSSTDEGKGLVTAKEVIDAVNNAGWRIKTT
ANGQADKFETVTSGTNVTFADGNGTTAEVTKDNNGITVKYNAKVGDGLKIDNISKKIVAD
TTALTVNDGKDVNNPKGKVKELASDDEKKKLVKAGDLVDALNKLSWTAKADKEDGGEVDN
TKAANGQEVKAGETVTFKAGKNLKVKQDGADFTYSLKDTLTGLTSITLNDATANGGNGAK
TEITKDGLTITPATNAGVTAKEEDKISVTKDGIKAGGKEITNVASALKTYGQANAQAQPQ
PADNTVDKAKQNLVDLSSVTTPAVGGATTNDELAKKAATVGDLAGLGWVLSADKTTKDGG
GVEDKAFHAAVKNANEVEFKGKGAATVSAKSDNNGKYTVTVDVAETQVGDGLEKADGKIK
LKASTDTNNVLTVNGNGASVTKGSFETVQTDATAAAGQAADANRGKVVVTGVTNGTPTDD
DKKKVATVVDVAKAINDAATFVKVENDDTEINDKPTDDGKNDALKAGDTLTLKAGKNLRV
KRDGSNVTFALAKDLDVKTATVSDTLTIGGGMPAAGGAATPKVNVTSTADGLKFTKEPAG
ANGDTTVHLTNIASTLADHRIGNTAHLDNQVDDAHRNRAATVGDVLSSGWNIKGAKTAGG
TVENIDFVATYDTVDFVDDGKTTTVTVTQKTDKKGAEVKIGAKTSVIAEKDGKLLTGKDN
KANGGTNTTPATDDTDDGKGLVTAETVIEAVNKAGWRVKTTATPQNGDGFETVASGTNVT
FASGNGTTAIVTKDINGITVKYEAKVGDGLKLDGDKIAADTTALTVENGKVKTPDTTNGG
NGNKLVNASGLAEALNKLSWTAKAEADTANGGELDGQATDKEVKAGDKVTFKAGKNLKVK
QEGANFTYSLKDTLSDLTSITLGKTGAGANGASTKITNEGLTITPNGGTTGADTANTISV
TKDGIKAGNKAITNVTSGLRAYDDKNFDLNNNSITDLNRHFEDAYKGLLNLNEKGADQQL
LVADSTAATVGDLRKLGWVVSTKNGTDEESYKVKQADEVLFTGSGAATVTSASENGKHTI
TVSVAETKADSGLEKNGDTIKLKVDKSTNNVLTVSENGTAVTKGEFNTVDTSVPADDATT
ETKNNRGKVTVKDADKADKSVATVKDVATAINSAATFVKTANLDTALNEADATDKGDDAL
KAGDTLTFNAGKNLKVKRDGKNITFDLAKNLEAKTATFSDKLSIGSGANAVDITNENGGL
KLAKGAADIQLRGIGSTLTDTITGTTTKAENGVDVKNHNLAASVKDVLSAGWNIKGVTTG
SATGKSENVDFVRTYDTVEFLSASADTTTVTVDSKDNGKTTKVKIGTKTSVIAEKDGKLV
TGKGNKDAGGTNANTADDTDAGKGLVTAETVIEAVNKAGWKVTGEGTTVGNNETALTKDN
AQTVTSGTSVNFKNGKTTTATVSKDDQGNITVKYDVNVGEVLKDNEFRAPDNTKLVKIGD
EYFSEEDIDPATGKPKETNGKKVAAKYKTVGNEVFAVNTDGTTTMGNAVTLTNQNQGVVT
GKQVAEAIAKSGWNLGLANADQAVSAFTTGGKALSDVMLERVNANDNVRFANGKNTVVKA
AVVEDVDKDGNKVTNTYVRTDVTGLPVQYTTENGKAVSKVGDKYYTLDDKGEPSATALTD
EQVGKLSVNLVSPTADSNKPTALGNLANGAKTFAAPTVDGKELALANDGKYYPKDTLGAN
NAAPTDGTASVKVANPGKAGLADLANSTSSNAATVGDLKNLGWQISVGDGYNDQVRNADK
VNFKGSNGISVSGKTLDGGRREITFELAKGEVVKSNEFTVKETNGKETSLVKVGDKYYSK
EDIDLTTGKPMAGKTEKYKVENGKVVSADGSSNTDVTLTNKGSGYVTGNQVADAIAKSGF
ELGLSNETEAKAAFGDKEKALSDTKLETVNAHDKVRFANGLNTKVSAATMQTAIK
NT seq
6468 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaatttttaacgttatttggaatgttgtgactcaaacttgggttgtcgtatct
gaactcactcgcacccacaccaaatgcgcctccgccaccgtggcagttgccgtattggca
accctgttgtccgcaacggctgaagcgaacgatactttaacgattggcggaaatacacct
gctacgggtggtactgcaacgccaaaagtaaatgtcactagcacggcaaatggcttgaat
tttgcacaagagggtaaaacaggtaaggaagcttacgttcatttaaatggcattggctct
accttggctgatactatcacgggtacaacaaaaactgcaactaacggtgtggctgttgaa
aatcataatcgtgctgcgagtgtagctgatgtgttgaatgcaggttggaacattaagggg
gttaaacctaacgagacaacttctgataatgttgattttgtccgtacttacgacacggtt
gagtttttaagtgcaaatccagaaaccacgactgttactgtagaaagtaaagatagcgga
gttagaactgaagttaaaatcggtgcgaagacttctgttatcaaagaaaaggacggtaag
ttggttactggtaaagaaaaaggcgagaatggttcttctacagacgagggcaaaggctta
gttactgcaaaagaagtgattgatgctgtgaacaatgctggttggagaattaaaacaaca
gctaatggtcaagctgataagtttgaaactgtcacatcaggcacgaatgtaacctttgct
gatggtaatggtacaactgcggaagtgaccaaagataacaatggcattactgttaaatat
aatgcaaaagttggcgatggcttgaagattgataacattagcaaaaaaatcgttgcagat
acgaccgcacttactgtgaatgatggtaaggacgttaataatccgaaaggtaaagttaaa
gagcttgcttctgatgacgagaagaaaaaacttgttaaggcaggcgatttagttgatgcg
ttaaataaattaagttggactgcaaaagctgataaagaagacggcggcgaggtagataat
acaaaagctgcaaacggtcaagaagtcaaagcgggcgaaacggtaacctttaaagcgggc
aagaacttaaaagtgaaacaagatggtgcggactttacttattcactgaaagatacttta
acgggcttaacgagcattactttaaatgacgctacagctaatggcggaaatggtgcgaaa
accgaaattaccaaagacggcttaaccatcacgccagcaactaacgcaggtgtaacagct
aaagaagaagataaaatcagcgtaaccaaagatggcattaaagcgggtggtaaagaaatt
accaatgttgcgagtgctttaaaaacttatgggcaagctaatgcacaagctcaacctcag
cctgcagataacactgttgataaagctaaacaaaatttagttgatttgagtagcgttaca
acacctgcagtaggtggtgctacaacaaatgacgagctagctaaaaaagctgccactgta
ggcgacttggcaggcttgggctgggtgctttcagctgataaaaccacgaaagatggcggc
ggtgttgaagataaggcattccacgcagcggttaaaaacgccaatgaagttgagttcaaa
ggtaagggtgcggcgactgtatctgcgaaatctgataacaacggaaaatatactgtaact
gttgatgtagcagaaacccaagttggcgacggtcttgagaaagctgatggcaagattaaa
ctcaaagcaagcacggataccaataatgttttaacggttaatggtaacggtgcgtctgtt
actaaaggtagctttgaaactgtgcagactgatgcaactgcagctgcaggtcaagctgca
gatgccaaccgcggtaaagtagttgtaactggtgtgacaaatggcacaccaactgatgat
gacaagaaaaaagtcgcgacagttgttgatgtagctaaagcgattaacgacgccgcaact
ttcgtgaaagtggaaaatgacgacactgaaattaatgataaaccaacagatgatggtaaa
aatgatgctctcaaggcaggcgacaccttaaccttgaaagcaggtaaaaacttaagagtt
aaacgtgacggtagtaacgtaacctttgctttagcgaaagaccttgatgtgaaaactgcg
actgtgagtgataccttaacgattggtgggggtatgcctgctgcaggcggtgctgcaaca
ccaaaagtgaatgtgactagcacggctgacggcttgaagttcactaaagagcctgcgggt
gctaatggcgatactacggttcacttgactaatattgcctcaaccttggctgatcatcgt
ataggtaatacagctcatctggataaccaagttgatgacgctcatcgtaatcgtgcagcg
actgttggcgacgtgttgagtagtggttggaatattaaaggtgctaagactgcaggtggt
actgttgagaatattgattttgttgcaacctacgatacggtagattttgtagatgatggc
aaaacaacgactgtaacggtaactcaaaaaactgacaagaaaggtgccgaagttaaaatt
ggtgcgaagacttctgttatcgctgaaaaagatggtaagttgcttactggaaaagataac
aaagcaaatggtggtacaaacaccactcctgcaactgatgatacggatgatggcaaaggc
ttagtgactgcagagactgtgattgaagcagtgaacaaagctggttggagagttaaaaca
acagcaactcctcaaaatggagatggttttgaaactgtcgcatcaggcacaaatgtaacc
tttgctagtggtaatggtacaactgcgattgtaactaaagatatcaacggtattaccgtt
aagtatgaagcgaaagttggagatggcttgaaactagacggcgataaaatcgctgcagat
acgaccgcacttactgtagaaaacggtaaggtaaaaacccctgatacaactaatggtggt
aatggtaataagcttgttaatgcaagtggtttagcggaagcgttaaataaattaagttgg
actgcaaaagctgaagcagatactgctaatggcggagagcttgatggacaagcgacagat
aaagaagtcaaagcgggcgacaaagtaacctttaaagcgggtaagaacttaaaagtgaaa
caagagggtgcgaactttacttattcactgaaagatacacttagtgatttaacaagtatt
actttaggtaaaacgggagctggtgcaaacggtgcaagcactaagattaccaatgagggc
ttaaccatcacgccaaatggcggtacgacaggtgctgacactgcaaacaccattagcgta
accaaagatggcattaaagcgggtaataaagctattactaatgttacaagtggtttaaga
gcttatgatgataagaattttgatcttaacaataactctataactgatttaaatagacac
tttgaagatgcttataaaggtttattaaatctaaatgaaaaaggtgcggatcaacagctg
ttggtggctgacagcactgcagcaactgtgggcgatttgcgtaaattgggttgggtagta
tcaaccaaaaacggtactgacgaggaaagctataaagttaaacaagctgatgaagttctc
tttactggatctggtgctgcaactgttacttctgcttctgaaaatggtaaacatacgatt
actgttagtgtggctgaaaccaaagcagatagcggtcttgaaaaaaatggcgatactatt
aagctcaaagtggataaaagcactaataatgttttaactgttagtgaaaacggcacagcg
gtaactaaaggcgaatttaatacagtggatacttcagttcctgctgatgatgcaactact
gaaactaaaaataatcgtggtaaggttactgtaaaagatgctgataaggcagataaatca
gttgcaactgtaaaagatgttgcaacagcaattaacagtgcggcaacctttgtgaaaaca
gcgaatttagataccgcacttaatgaagctgatgcgacagataagggagatgatgcactt
aaagcaggcgacaccttaacctttaacgcgggtaaaaacctgaaagttaaacgtgatgga
aaaaatattacctttgacttggcaaaaaaccttgaagcgaaaaccgcgacctttagtgat
aagttgtcgattggttctggtgcgaatgcagttgatattacgaatgaaaatggcggattg
aagttggcgaaaggtgctgctgatattcaattacgaggtattggttcaaccttaactgac
actatcacaggcacaacaacaaaagctgaaaatggtgtagatgttaaaaatcataacctt
gcagcaagtgtgaaagatgtgttgagtgctggttggaatattaagggtgttacaactggt
tccgcaacaggtaagtcagaaaatgttgattttgtccgtacttacgacacagttgagttc
ttgagtgcgagtgcagatacaacaacagtgactgtagatagtaaagataatggaaaaacc
actaaagttaaaatcggtacgaagacttctgttattgctgaaaaagacggtaagttagtt
actggtaaaggtaacaaagatgcaggtggcacaaatgccaatacagctgatgatacagat
gcaggtaaaggcttagtgactgcagagactgtgattgaagcagtgaacaaggctggttgg
aaagtcactggcgagggtacaactgttggtaataatgaaactgcattaaccaaagacaac
gcccaaaccgttacatcaggcacaagcgtgaacttcaagaacggtaagacaactactgcg
actgtaagtaaagatgatcaaggtaacattacggttaagtatgatgtaaatgttggcgaa
gtcttgaaagacaatgaattccgcgcaccagataacacaaaacttgtgaagatcggcgat
gaatacttcagtgaggaagatattgatcctgcgacaggtaaaccaaaagaaactaatggt
aagaaagttgctgctaaatataaaacagtgggtaatgaagtctttgccgttaatactgat
ggaactaccactatgggcaatgccgttactttaactaaccaaaatcaaggtgtggttaca
ggtaaacaggtggcagaagccattgcgaagtctggttggaatttaggtttggcgaatgct
gatcaagctgtttctgcctttacgactggtggcaaagccttatcagatgttatgcttgag
cgtgttaatgcaaatgataatgtgcgttttgcaaatggtaaaaataccgtagtgaaagcg
gctgtagtggaagatgtggataaagatggtaataaagttaccaatacttatgtccgcacc
gatgtaacaggtttgcctgttcaatacacaacagaaaatggcaaagcggtaagtaaagtg
ggggataaatactacactttagatgataaaggcgagccgtcagcaactgcattgactgat
gaacaagttggtaaattaagtgtgaatttggtaagcccaactgcagatagcaataagcca
acggctttaggcaatcttgcaaatggtgcgaaaacctttgccgctccaacagtagatggt
aaggaattagcattagcaaatgatggcaagtattatccgaaagatacattgggggcaaat
aatgccgcaccaacggatggtacagcttctgttaaagtagccaacccaggcaaggcagga
ttggcagacttggcaaattcaacatcaagcaatgcggcaactgtgggcgatttgaaaaac
ttgggctggcagatttctgtaggcgatggctacaatgaccaagtgagaaatgccgataag
gttaatttcaaaggtagtaacggtattagcgtttctggtaaaacactagatggcggtagg
cgtgaaattacttttgaattggctaaaggcgaagtggttaaatcgaatgaatttaccgtc
aaagaaaccaatggaaaggaaacgagcctggttaaagttggcgataagtattacagcaaa
gaggatattgacttaacaactggtaaaccgatggcaggtaaaactgaaaaatataaggtt
gaaaacggcaaagtcgtttctgctgacggcagcagcaataccgatgttaccctaaccaac
aaaggttctggctatgtaacaggtaaccaagtggcagatgcgattgcgaaatcaggcttt
gagcttggtttgtcaaatgaaacagaagcgaaagcagcgtttggcgataaagaaaaagcc
ttgtctgatactaaactggaaactgtaaatgcccacgacaaagtccgttttgctaatggt
ttaaataccaaagtgagcgcggcaacgatgcaaacggcgataaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
