Haemophilus influenzae 86-028NP (nontypeable): NTHI0291
Help
Entry
NTHI0291 CDS
T00248
Name
(GenBank) putative small-conductance mechanosensitive channel
KO
K05802
potassium-dependent mechanosensitive channel
Organism
hit
Haemophilus influenzae 86-028NP (nontypeable)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hit00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hit02000
]
NTHI0291
Transporters [BR:
hit02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NTHI0291
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MscS_porin
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAX87252
UniProt:
Q4QNZ5
LinkDB
All DBs
Position
270711..274049
Genome browser
AA seq
1112 aa
AA seq
DB search
MIRKLMKTPPFFTVLFASAMFTLSVSQGALGANSTNVLPTEQSLKADLANAQKMSEGEAK
NTLLAELQTSIDLLQQIQAQQKINDALQTTLSHSESEIRKNNAEIQALKKQQETATSTDY
NAQSQDDLQNSLAKLNDQLQDTQNALGAANAQLAGQNSISERAQAALTENVVRTQQINQQ
LANNDIGSALRKQYQIELQLIDLKNSYNQNLLKNNDQLSLLYQSRYDLLNLRLQVQQQNI
IAIQEVINQKNLQQSQNQLEQAQQQQQKTVQNDYIQKELDRNAQLGQYLLQQTEKANSLT
QDELRMRNILDSLTQTQHTIDEQISALQGTLVLSRIIQQQKQKLPTNLNIQGLSKQIADL
RVHIFDITQKRNELYDLNNYINKVESEDGKQFTEAERTQVKTLLTERRKMTSDLIKSLNN
QLNLAISLELTQQQITQISDQIQSKLEQQSFWVKSNNPINLDWIKMLPRALIEQFNGMLK
KLGFPTNYDNLPYLLMYFLGLFIVGGAIFKFKNRIKQQLNKINREIHRLDTDSQWSTPLA
LLLTAFLTLSSTLWFLAVCQMIGFFFFKNPEEFWHWSFSMAGYWWFFTFWISLFRPNGIF
VNHFESSKENAQRFRGVIQRIIIVIVLLLNTSVFSNVTDAGLANDVLGQINTITALIFCA
AIIAPRFNRVLRSYEPETNKHHWLIRIVQIGLRLIPVGLIVLIVLGYYYTALNLIEHFIH
SYIAWCVWWLVRNTIYRGITVSSRRLAHRRLAEKRRQKALENNYENISSDDVVAVGEPEE
GLALNDVRSQLLRFVDLFIWTALLGIFYYVWSDLVTVVSYLREITLWQQTTTTDAGTVIE
SITLFNLLVALVILGITYVLVRNISGILEVLIFSRVNLSQGTPYTITTLLTYIFIAIGGA
WAFATLGMSWSKLQWLFAALSVGLGFGMQEIFANFVSGIILLFERPIRVGDVVTINGVSG
TVAKIRIRAITLIDFDRKEIIVPNKSFVTGQVTNWALSSTMTRLVISVGVAYGSDLTLVR
QLLLQAADEQPTVLRDPKPSAYFLTFGASTLDHELRVYVEQVGDRTSTTDAINRRINELF
AEHNIDIAFNQLDVFIKNNDTGEEIPFVDVKK
NT seq
3339 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaggaaacttatgaaaacacctccattttttaccgtactttttgcctcggcaatg
tttacccttagtgtttcacaaggggcattaggggcaaattcaacaaatgtattaccaacg
gagcaatcgcttaaagccgatttggctaacgctcaaaaaatgagtgagggggaagcaaaa
aatacgttgttagcagaattacaaacatcaattgatttattgcagcaaattcaagctcaa
caaaaaatcaatgatgcattgcaaacaacattaagccattcagagagtgaaattagaaag
aataatgcagaaattcaagcattaaaaaaacaacaagaaacagcaacaagtactgattat
aatgcacagtcacaggacgatttacaaaatagtctcgctaagttaaatgatcaattacaa
gatacgcaaaacgcattaggcgcggcaaatgcacaattggcagggcaaaattctatttct
gaacgagctcaagcggcattaacggaaaatgttgtacgcactcagcaaattaatcaacaa
ttggccaataatgatattggtagcgcattacgaaaacaatatcagattgaattacaactg
attgatttaaagaatagttataatcaaaatttattaaaaaataatgatcagctttcttta
ctttatcaaagtcgttacgacctattgaatttacgtttgcaggtgcaacaacaaaatatt
attgcgattcaagaagtcattaatcaaaaaaatcttcagcaatcacaaaatcaactagaa
caagctcagcagcaacagcaaaaaactgtgcaaaatgattacattcaaaaagaacttgat
cgcaatgcacagcttggtcagtatctattacaacaaacagaaaaagcgaattcattaact
caagatgagttaagaatgcggaatattttagatagcctcactcaaactcaacatactatt
gatgaacaaattagtgcattacaaggcacgttagttctttcacgtattatccagcaacaa
aaacaaaaattaccgactaacttaaatattcaaggtttatcaaaacaaattgccgatttg
cgtgtgcatatttttgacattactcaaaaacgcaatgaactttatgatctaaataactat
attaataaagttgaaagtgaagatggaaaacaatttactgaggcagaaagaacgcaggtt
aaaacgctattaactgagcgtcgaaaaatgacatctgatctgattaaatctttaaataat
caattaaatctcgcgatttctttggaattaacgcagcagcaaattacacaaatcagtgat
caaattcaatctaaattagagcagcaaagtttttgggtgaaaagtaataatcccattaat
ttagattggataaaaatgctgccaagagctttaattgaacagtttaatggtatgttgaaa
aaattaggttttccaactaattatgacaatttaccttatttacttatgtatttcttaggg
ttatttattgtaggtggtgcaatttttaaatttaaaaatcgtattaaacaacaattaaac
aaaattaatcgtgaaatacatcgcttagatacagatagtcagtggagtactccacttgcc
ctgttattaactgcgtttttaacgctttctagtacactttggtttttagccgtttgccaa
atgatcggcttctttttcttcaaaaatccagaagaattttggcattggtcatttagtatg
gcaggttattggtggttctttacattttggatttcattgttccgtccaaatggtattttt
gttaatcattttgaatcttcaaaagagaatgcacaacgttttcgtggtgttatccaacgc
attattattgtgattgtattgcttttaaatacttctgtgtttagcaatgtcactgatgca
ggtttagctaatgatgtgttaggtcaaattaatactattacagctctaattttctgtgcg
gcgattattgctcctcgctttaatcgagtacttcgctcttatgaacctgaaacaaataaa
catcattggttaataagaattgtacaaattggtttaagattaattcctgtgggactaatc
gtacttattgttttaggctattattacactgctttaaatttaattgagcattttattcat
tcttatattgcttggtgtgtatggtggttagtacgtaatacgatttaccgtggtattacg
gtttcttctcgtcgtttagcacatcgccgtttagcagaaaaacgtcgtcaaaaagcactt
gaaaataattatgaaaatatttcctctgatgatgtggttgcagtgggagagccagaggaa
ggtttagcgttaaatgatgtgcgtagccaattattacgttttgtagatctctttatttgg
acagcattattggggattttctactatgtatggtcagatttagtcacagtagtgagctat
ttacgtgaaattacactttggcaacaaaccacgacaaccgatgctggcactgtaatagaa
agcattactttatttaatcttcttgttgctttggttatcctaggaattacttatgtgttg
gttcgtaatatttcaggtattttggaagtattaattttctctcgcgtgaatctttcacaa
ggtacgccttatacgattacgacattgctcacttatatttttatcgccattggtggtgcg
tgggcatttgcaaccttaggaatgtcttggtcaaaattacaatggttatttgccgcactt
tccgttggtcttggttttggtatgcaagaaatttttgcaaactttgtgtcgggcattatt
ttgctatttgaacgcccaatccgagttggcgatgtcgtaaccattaatggagtgagcggt
actgtagcgaaaattcgtattcgtgcaattacattaattgattttgatcgcaaagaaatt
attgtgccaaataaatcttttgtgacaggtcaagtaaccaattgggcattatctagcacg
atgacacgtttagtgattagtgttggtgttgcttatggttctgatttaacactcgttcgt
caattattacttcaagcagctgatgaacagccgactgttttacgcgatcctaaaccatct
gcttattttttaacttttggtgcaagtactttggatcacgaattacgtgtttatgtagaa
caagttggagatcgtaccagtactacagatgctattaatcgccgtattaatgaattattt
gcagaacataatattgatattgcctttaatcaattagatgtatttatcaaaaataatgac
actggcgaagaaattccctttgttgatgtaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
