Humulus lupulus (common hop): 133790415
Help
Entry
133790415 CDS
T11341
Name
(RefSeq) extensin-like
Organism
hlp Humulus lupulus (common hop)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
133790415
NCBI-ProteinID:
XP_062084027
LinkDB
All DBs
Position
7:4927078..4930632
AA seq
1101 aa
AA seq
DB search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NT seq
3306 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaggcatgtggctgctgaggcattggcctcaactattttttgctttagtgttttgc
cttatttctgattgttctaaaccttatgtttatgcttttgatcaaccaccaccggaccat
gttaatcaccctcccaacaatgatcagaagctaccaacgaagcttgtttcgtatccctac
cattacaaaccaccaccaccaccgccgccaccaccaaagcgtataacattcccaccattt
ttcaactggaattctccgcccccaccaccaaagcatgtaaagttcccaccttattacaac
aaaaagtccccaccgccaccaccaaagtatataaagttcccaccttattaccacaaaaaa
tccccaccgccaccaccaaagcaaataaagttcccaccttattaccacaaaaggtctcca
ccgccaccaccaaagcaaataaagttcccaccttattaccacaaaaggtctccaccgcca
ccaccaaagcctataaagttcccaccttaccacaaaaagtcaccgccgccgccacctcct
tcctattcaccaccaccacccctttcccattcaccaccaccacccccactctacttggcg
ccatttccttcacctggttcaccgtctccaccccactcaccatcaccaactccgtcacct
ggttcatcgccacctcatccatcccactctgcaccagctccttcacctggttcactgcct
ccacagcacccaccccattcaccgtcaccagctcccttacctaattcaccaccaccaccc
ccaccctactcagcaccagctccttcacctgattcatcatccccactgcactcaccgtca
ccagctccctcacctagttcacccccaccctactcagcgccatctccttcacctgaatcg
ccgcccccaacccactcactgtcaccagcttggtcacctagttcaccaccaccaccctac
tctgcgccagctccttcacctgattcaccactctcatcccagtcaccatcaccagctcct
tcacctgattcaccacccataatccactcaccgtcaccagctccgtcacctagttcacca
ccaccctattcagcgccagccccttcacctgattcaccaccccaaccccactcaccgtca
ccagctccctcacctagttcaccaccaccacccccaccctactcagtgccaactccttca
cctgattcaccacccccaacccactcaccatcaccagctctgccacctagttcaccacca
ccaccctactcagcgccagctccttcacctgattcaccacccccacctcagtcaccatca
ccaccagctcattcacctgattcaccacccccaacccacgcaccgtcaccagctccatca
cctagttcaccaccaccacaaccaccatactcagcgccagctccttcacctgattcacca
cccccaccccagtcaccatcaccagctccttcacctaattctccatccctaacccactca
ccgtcaccagctctgtcacctagttcaccaccaccaccctactcagcaccatccccttca
cctgattcaccaccccaaccccactcactgtcaccagctccctcacctagttcaccaccc
ctaccctacctagcgccagctccttcacctgattcaccacccccaacccactcaccgtca
ccgtcaccatcaccagccctgtcacctagttcaccaccaccaccctactcagcgccagct
ccttcacctgattcaccacccccaccccagtcaccatcaccatcaccatctccttcacct
gattcaccacccctaacccactcaccgtcaccagctcagtcacctagttcaccaccacca
ccctactcaacaccaaccccttcacctgattcaccacccccaccccagtcaccatcacca
actccttcacctaattatccacccctaacacattcaccgtcaccagctccgtcacctagt
tcaccaccaccaccctacttaacgccagccccttcacctgattcaccacctcaaccccac
tcaccgtcaccagctccctcacctagttcaccaccaccaccacctgcaccctactcagcg
ccagctccttcacccgattcaccacccccaacacactcaccgtcaccagctatatcacct
agttcaccaccaccaccctactcagcaccagctccttcacctgattcaccacccccacct
cagtcaccatcaccagctccttcacctgattcaccacccccaacccactcaccatcacca
gctccttcacttgattccccacccccatcccagtcaccatcaccaactccttcacccgat
tcaccatcaccaaccccctcacgtagttcatcacctccaccctcaccctactcaacgcca
attccttcacccgattcaccatccccaccccactcaccgtcaccagcaccctcacctagt
tcaccacaaccacccacaccttacttagcgccagttccttcacctaattcaccaccctta
ccccattcaccgtcaccagctccctcacttagttcatcgcctcctacacctagttcatcg
cctccactgccaccacctcactcggcgccaactccttcacctggttcaccgcccccacct
cgctcactgtcaccaactcccttagctgattcaccgactccacctccccaatcccattca
ccaccaccgtcactagctcccacacctagttcactgttaccacccctacctagcttggcg
ccaactccttcacctagttcactacctccactactagctccttcacctagttcaccgcca
ccaccctcacctagcacagggatgcctccctcacctagttcaccgcctccaccacaattg
tcaccaccgccaccactatattcaccacctccaccacactttccaccaccgcccccactt
cattccccacaagctcacccacgccactcaccgccaccgccgccacgctggtcactccca
cctcccccacgccactcaccgccaccaccgccacgctggtcaatcccacctccctcacac
cgctcaccgccaccaccgccacgacgttcaccgccaccgcccccacgccgctcaccgcca
ccgcctcctcgccgctcaccaccaccgcccccacgtcgctcaccaccaccgcccccacgc
cgctcaccgccaccgcctcctcgccattcaccaccaccgcccccacgtcgctcaccacca
ccgcctccacgtcgctcaccgccaccacccccacgccgctcaccgccacctcctccacac
tggtaa
DBGET
integrated database retrieval system