Humulus lupulus (common hop): 133815515
Help
Entry
133815515 CDS
T11341
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC133815515
Organism
hlp Humulus lupulus (common hop)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RVT_2
Retrotran_gag_2
gag_pre-integrs
SH3_retrovirus
Pol_BBD
rve
rve_3
DUF4219
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
133815515
NCBI-ProteinID:
XP_062104332
LinkDB
All DBs
Position
2:275438275..275443051
Genome browser
AA seq
1050 aa
AA seq
DB search
MAFPSNSQNNMLEGLSTTRAPFFNGVDFPYWKIRMETYLQSIDYDLWHIVSNGPYIPKHV
INGVEFIKTYEAYDEEDKKMLSKNAKAKYALICGLDRDVFKNIEQASTAHDMWKMLEVTH
QGTNAMKETKIQIYSTQYENFKMKVDETIANMYTCFTTITNGLNSLGKVLSQKEMVTKIL
RSLTKAYQGKVIAIQEAKDLSTLPLEELIGSLMNHLDSGCSKHMTGDPSRFSIFKSKESG
FVTFGDNSKGKILGIGDIGNIYSPCIKNVLLVDNLKHNLLSISQLCDKDFRVVFESSKCS
IENASTNEVIFVGERKDNVYVIDVDSFDSKNKCLTVMNDNSWLWHRRLGHASMDSISKLV
RKDLVVGLPSIPFVKDKLCDACQFGKQIKTSFHSKKEISTSRPLQLLHIDLFGPSRIASL
VGKYYAFVIVDDFSRFTWVIFLKLKNDVLENLVKFCKSVQNEKGYSITSIRSDHGGEFDN
DALELFCDEHGFNHNFSAPRTPQQNGVVERKNRTIQEMAMSMLNEISLPKYFWAEAVNTS
CYILNRVFIRPNMNKTPYELWKGRKPNIGYFRVFGCKCYILNTKDNLGKFDAKSDVGIFI
GYSTHSKAYRIYNKRTNVVEESIHVAFDLESIRMLLAFACHKNFALYQMDVKSAFLNGYI
MEEVYVSQPPGFQDHKHPNHVYKLKKALYGLKQAPRAWYDRLSTFLISNGFSMGKADNTL
FIKRKSKDIIIVQIYVDDIIFGATNDALCEEFSKCMHSEFEMSMMGELNFFLGLQIKQQK
NGIFISQSKYIKDLLQKFDLANAKSMKTPMSTSINMDKDESGKDVDITKYRGMIGSLLYL
TASRPNILFSVGLCARYQSCPKESHLSAVKRIFRYLIGTMNLGLWYPKNSNFEIISYSDA
DFAGCKSDRKSTSGTCHFLGNSLVSWFSKKQNSVALSTTEAEYIAAGSCCAQILWMKQTL
KDFDVDFECTPIKCDNTSAINLSKNPILHSRAKHIDIRHHFLRDHIQRGDIMLDFVSTNF
QLADIFTKPLSDERFSFIRRELGMTNINEI
NT seq
3153 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtttccaagtaattcacaaaataatatgttagaaggcttaagcacaactagagca
ccattcttcaatggagtagactttccctattggaaaattaggatggaaacttatcttcaa
tctattgattatgatttgtggcatatagtgtctaatggtccttacattcctaaacatgtc
attaatggtgtagaatttattaagacatatgaggcatatgacgaagaagataagaaaatg
ctttctaagaatgctaaagctaaatatgcacttatatgtggtttggatagagatgtgttc
aaaaatattgaacaagcctctaccgctcatgatatgtggaaaatgcttgaagtcactcat
caaggaacaaatgctatgaaggaaactaaaattcaaatttattctactcaatatgagaac
tttaagatgaaagtggatgaaactattgctaacatgtatacttgtttcactactatcact
aatggtttgaattctcttggcaaggtactttcacaaaaggagatggtgaccaagattttg
agaagtctcaccaaagcctatcaaggcaaagtgattgccattcaagaagccaaggatctc
tcaacacttcccttggaagaactaattggttcactcatgaaccatttggatagtggttgt
tccaagcatatgaccggtgacccatcaagattttcgatttttaagagcaaggaaagtggc
tttgtcacttttggagacaattcaaaaggaaaaatcttgggcattggtgatatcggtaac
atatactctccatgtattaaaaatgtgcttcttgttgataaccttaaacataatttactt
agtattagtcaactatgtgataaagattttcgtgttgtttttgaatcctcaaaatgctcc
attgaaaatgcttcaaccaatgaagttatttttgttggagaaaggaaggataatgtttat
gttattgatgttgattcctttgatagcaaaaataaatgtttaaccgttatgaatgataat
tcttggttgtggcatagaagattaggacatgctagtatggattctatttcaaagttggtt
agaaaagatcttgttgttggtttgccatctattccttttgttaaagataaactttgtgat
gcatgccaatttggaaaacaaattaaaacatcttttcattccaagaaagagatttcaacc
tctagacctttgcaattgcttcatattgatttatttggtccttcaagaattgctagtcta
gttggtaaatactatgcatttgtgattgttgatgatttttctagatttacatgggttata
tttttgaaactcaaaaatgatgttttggaaaatctagttaaattttgtaagagtgtgcaa
aatgaaaaagggtattcaatcacctccattaggagtgatcatggtggagagtttgacaat
gatgccttagaattgttttgtgatgaacatggttttaaccataacttttcggctccaaga
actccacaacaaaatggagttgtcgaaaggaagaatagaacaattcaagaaatggctatg
tcaatgctcaatgaaatctcattacctaaatatttttgggccgaggccgttaatacttct
tgttatattttgaaccgtgttttcattaggcctaacatgaataaaaccccttatgagctt
tggaaagggagaaaacccaacattggatattttagagtttttggatgtaaatgctatatt
ttgaacaccaaggacaaccttggaaaatttgatgcaaaatccgatgttggaatttttata
ggttattcaacacatagtaaagcttatagaatttataacaaaagaactaatgttgttgaa
gaatctattcatgttgcatttgatcttgagtccataagaatgttattagcttttgcatgc
cacaagaattttgccttgtatcaaatggatgttaaaagcgctttcttaaatggatacatt
atggaagaggtttatgtctctcaaccccccggttttcaagatcacaaacaccctaaccat
gtttataaattaaagaaagcattatatggtttaaagcaagctcctagagcttggtatgat
cgtttaagcacttttcttatctcaaatggtttttcaatgggaaaagcggataatacactt
tttattaaaagaaaatcaaaagacattattatagtacaaatctatgttgatgatattatt
tttggtgctactaatgatgctctttgtgaagaattttcaaagtgtatgcatagtgaattc
gagatgagcatgatgggagagctcaactttttccttggacttcaaataaagcaacaaaag
aatggaatattcataagtcaatccaagtacatcaaggatctacttcaaaagtttgactta
gccaatgcaaagtccatgaaaactcctatgagcacctccataaatatggacaaggatgaa
agtggtaaggatgttgacatcaccaagtatcgaggtatgattggttcattattatattta
accgctagtagacccaatattttgtttagtgttggtctatgtgctaggtaccaatcatgt
cccaaggaatcccacttaagtgccgttaagagaatctttagatacttgataggcacaatg
aatctaggactttggtatcccaagaactcaaactttgaaatcattagttactcggatgcg
gactttgccggttgtaagtcggataggaaaagtactagtggaacatgtcactttctagga
aactctttagtgtcatggtttagcaagaaacaaaactcggtagccctatccacaaccgaa
gccgaatacattgccgccggtagttgttgtgctcaaatactttggatgaaacaaactctt
aaggattttgatgttgattttgaatgtacacccataaagtgtgacaatactagtgccatt
aacctctctaagaatccaatcttgcattctagagccaagcatattgatataaggcaccac
ttccttagagatcatatccaaagaggtgacattatgctagattttgtgagcaccaatttc
caactagcggatattttcaccaagcctcttagtgatgagagatttagttttattagaaga
gagctaggaatgaccaacataaatgaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
