Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100197612
Help
Entry
100197612 CDS
T01080
Name
(RefSeq) A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 7 isoform X1
KO
K08631
a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 17 [EC:3.4.24.-]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
hmg01002
]
100197612
Peptidases and inhibitors [BR:
hmg01002
]
Metallo peptidases
Family M12: astacin/adamalysin family
100197612
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reprolysin
ADAMTS_spacer1
ADAMTS_CR_2
TSP1_ADAMTS
Reprolysin_3
Reprolysin_5
Reprolysin_4
TSP_1
Adt-1
Reprolysin_2
ADAMTS_CR_3
Peptidase_M10
TSP1_spondin
PP_kinase_C
DUF4953
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100197612
NCBI-ProteinID:
XP_012557771
LinkDB
All DBs
Position
9:45729694..45782673
Genome browser
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MRQNICFLSTSLFIIVLSAHLISVFDGNHQDVDVFIEDLQNDQEVLSGSKKETSHLHISQ
PVVEVFVVVDKYVIEFHGNSSIKTYIMTIMKMVSDIYSDSSLGIEIKIIVSRILVFHNDS
YNFTTNHNGEKILQSFCEWQLNNQEINSNNESLHDVIVLLTRKDICSKSNQSCGTIGFAY
NEGACTRNRKCILVEDTGLSTAYTIAHELGHSLGLTHDNLDNNCMFSSVDQPHIMVSKWP
VPIQLPFRWSSCSKKQLIEFLFSYKSSCLWIKSSSENWLDEKDLLHLLPGQIYDANKQCK
HHYGTLAEHCTHFKKTSLKTETCSQLWCQTNGSFECLSKGDPAAAGTKCADGMFCIDGQC
INSTSTLEPVNGGWSSENQWSVCSRSCGVGVSYTEMLCNNPIPKNGGRYCVGTSRKYKTC
NMKPCPLNSVSFRLQQCLQYGNNSMIDVYNQTQPCSLFCRNINIPNNDSIMFQVKVLDGT
PCHQDFFDFMRYTDYNEEMNGICVEGQCKKLGCDKQLDSEIHMDSCGVCGGIGDSCRVFE
GEFNQPFGRGYVDVANIPQGAMNLLVWEKKPCASFLALKSEHETFSINNHGVIELAGKYN
FNKTVVYYLRKSTQEFFYTVGPTPVKIKIMVLFQDFNFGVKYRYTLPLNIKFKNETKKRG
LYGWMEGDWEKCSALCGGGVMHQEKPKCVYMHEGYVHVVDKEKCSGAKLPQIITKSCNEQ
ECEKSWFVSDWSHCSAACGFGRMRRLVTCNKRFGNGTWTRQPLIKCLSMKRPPSVQKCFE
KPCESSWIISQWSKCYGPCFQVGIMVRNVTCPASNTCSEIEKPSTTTTCINSCARF
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacagaatatttgctttttaagtacttcattatttattatcgttctatcggcgcat
cttatttcagtgtttgatggaaaccatcaagatgtcgatgtttttatagaagatttgcaa
aatgatcaagaggttttatcgggaagtaaaaaagaaacaagtcatcttcacatctctcag
ccagttgttgaagtttttgtagttgttgataaatatgttattgaatttcatggaaatagt
tctataaaaacctacattatgaccataatgaaaatggtatctgatatctacagtgattca
agccttggtattgaaataaaaattattgtctccaggattctagtttttcataatgattca
tataattttactaccaatcataatggtgaaaagattcttcaaagcttttgtgaatggcag
ttgaacaaccaagaaataaattccaacaatgaaagcctacatgatgttatagtgctttta
acaagaaaagacatatgtagcaaatcaaatcagtcttgtggaacaattggttttgcatat
aatgaaggagcttgtactagaaatcgcaaatgtatattagttgaagatacaggattgagt
acagcatatacaattgctcatgaattaggtcatagtttaggtttgacacatgataacctt
gacaacaactgtatgttttcttcagttgaccaacctcatattatggtatcaaaatggccc
gttcctattcaactaccctttaggtggtccagttgtagtaagaagcaattgattgaattt
ttattttcatacaaaagttcatgtctctggataaaaagctcatctgaaaattggttggat
gaaaaagatttgttacatttgttacctggacaaatttatgatgctaataaacagtgcaag
catcattatggaactttggcagagcactgtactcattttaagaaaacaagtttaaaaact
gaaacgtgttctcaattatggtgtcaaactaatggaagttttgagtgtctttccaaaggt
gatcctgctgcagcagggacaaaatgcgctgatggaatgttttgtattgatggccaatgt
atcaatagcacaagtactttagagcctgtgaatggaggttggagttcagaaaaccaatgg
tctgtatgtagtagatcttgtggagttggggtttcttatacagagatgttatgtaacaat
cctataccaaagaatggaggaagatactgtgttggtacaagtcgtaaatataaaacatgt
aacatgaagccatgtccacttaattctgtgtcatttcgactccaacagtgtttgcaatat
ggtaacaactcaatgatagatgtctacaatcaaactcaaccatgttctttgttttgtaga
aacataaacattccaaacaatgattccattatgtttcaagtaaaagttcttgatggaacc
ccatgtcaccaagatttctttgattttatgagatatacagattacaatgaagaaatgaat
ggaatttgtgttgaaggtcagtgcaaaaagttaggatgcgataagcagttggattcagaa
atacatatggattcttgtggtgtctgtggagggattggagattcatgtagagtttttgaa
ggagagtttaatcagccatttggtagaggttatgttgatgtggcaaatattccacaaggt
gcaatgaatttgttagtttgggaaaaaaagccatgtgcaagtttcttagctttaaagagc
gaacatgaaacatttagtattaacaaccatggtgttattgagttggctggaaaatacaat
tttaataaaactgtagtttattatttgagaaaatccacccaagaattcttttacactgtt
ggaccaacaccagtcaaaataaaaataatggttttgtttcaagactttaactttggtgtt
aagtatcgttacactcttcctttaaatatcaaattcaaaaatgaaactaaaaagcgaggt
ctttatggatggatggaaggtgattgggagaaatgctctgctctttgtggtggaggtgtg
atgcatcaagaaaaaccaaaatgtgtttatatgcacgaaggttatgtacatgtggttgat
aaagaaaaatgttctggtgctaaattacctcaaataattacaaaaagttgtaatgagcaa
gaatgtgaaaaaagttggttcgtatctgattggagtcattgtagtgctgcttgtggcttt
ggtcgaatgaggcggttagtaacatgtaataaacgatttggaaatggcacttggaccaga
cagcctttaataaaatgcctatctatgaaaaggccaccatcagttcagaaatgttttgaa
aaaccatgtgaatctagttggataatttctcagtggtctaagtgttatggaccgtgcttc
caagtcggaattatggttcgaaatgtcacttgtcccgcttcaaacacatgcagcgaaata
gaaaaaccttcaacaacaactacttgcattaattcttgtgcgcggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
