Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100200359 Help Entry 100200359         CDS       T01080                                  Name (RefSeq) neogenin   KO K06766   neogenin Organism hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra) Pathway hmg04350   TGF-beta signaling pathway Brite KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]  09130 Environmental Information Processing   09132 Signal transduction    04350 TGF-beta signaling pathway     100200359  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    04515 Cell adhesion molecules [BR:hmg04515]     100200359 Cell adhesion molecules [BR:hmg04515]  Immunoglobulin superfamily   DCC/UNC5 family    100200359 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  fn3 Ig_3 I-set Ig_DSCAM-DSCAML_C Pur_ac_phosph_N dsrm Ig_2 Interfer-bind Neogenin_C fn3_4 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  100200359 NCBI-ProteinID:  XP_047132382 LinkDB All DBs Position 5:complement(18510725..18570122) Genome browser AA seq 1897 aa AA seqDB search MLRMLLLILFLLYSCQIGLSYTPPVLLEEPEDTFGYDKKPLTLKCRSSSSPPPRYLWFKD NNEVSNTRYTITSVGDLVISPFVATEDVGIYRCMVKVDVAINNAELKLVSRNAKVQIEEF PQIFASDISATTGYVNGALRLSVNVSNFNPKPKIGWNYRGKPSVQDNDPRFTVLSQGVLQ ISGLLSSDDGEIRAIAISKSNSNTMFGKFSKVTVEEASLRPQNKLFYFLGTPQNIELEWG HSTILEAFADSSTSVLYTWFKDGKKVILSDRLSIVGKGNLKIQFAKDEDTGLYKVIAESA GQQIEAIAQVKVISPVQIILSPPPQITAMEETQVKVNFSVSGNSPINWFHDGVLVDTSSA DYLQFGTNYVIINNIINSDAGMYQGRIGNTNLHISFELIVIPKDSIPTQDTVNSLLIPGK PLDVIAKARSATEIDLEWKEPAVPNGVITSYGIIYYDSPSTASKITVTDPTQRFITVKNL TPGTTYQFRLQAFNNKGPSLLTDAVGARTLDLSSLPGVVENLKVVPSKSSMIVSWDSPKS GAGSSGTGAGVRSYAVFYTPQGFSGNPFKKVGSGTTLQVDDLTPGASYRVWVVSYNNDIA GPKSQELIVDIPFASEAPQPVINLVVTPALTTVANVNWEPPQSGPVPTSYKVYYQDAEDS SSSLQVSTFSNPPANIRNLQPNTLYDFYVVAYNGAVAGLKSSIKKVKMLEEVPPAPSTLK IVSIGNDTLKVRWSPIDLKSFQGNLLSYELQYFEGDLRHTAKAISNIPKSSKEWKITKLS PQTVYNINVIGVSGNGRGSPSPTINVKTRELTSEGPSEPADIKLTHDPDVPDVLMITWDE PLYVSGDVKSYIIYYRANPSDNYISKTTIGTAKGFNITDVLLGKLYESYMVAVDNNGQGK KSSVFERMTMIEDVLPEPVSKLSVDPKADSLFVSWEPPVSSFNVIVRGYKINIFSAKTNA EIFQDTLIGRQNTHLLLYNGIEPNERYTVNVQAFNKFGKSDIVKKDATTLQASKSTILIT DVTKSSSTIFFKWIDTGIVSGVGNYIVRYDVYDINGIPETKNLAVFKNEALITDLVAFTN YNFYVKHATETTFPKDITVSARTLEAVPSAPLDLTAQGIAEYPSWLILSWQVPRYPNGKI KEYVILYSADESLDYKEWPKIETKSISMTYNITQLTTNTNYFFVVYAINGAGEGSKSAVY SKKTVGGGVVPITVIGAAASRDSGGWWWWWWIILAIILFILLLLLLLLICCCCCCGKYTE WCWGCCPCCKKCWFCCCLPLRSTCCFCCKSDKKKLYIATPVLTQTTNEKINGHIVNESKD VNVELTPLTSAVDGEIYGGDGGLGTNKSRMASSSLNSSRISLGNVKVPVPSDASFISYKT SLQDYCQNTGWILPVYTTSLGNTGWTSKVSFGKIHTYESAECGTSKQDAEQRAAHAGLIG LGVLDFRSKYSDDTCIAVPGQGDGSFISYKCSLHDFCQQCSIQPPKFVTSIYENGYSSSV KVGQHTFNTVGRSSTSQEAEQKVAFVALQGLCMVDSQAVYDPLVCYTVPGPGDISFISFK SNLHDFCQRFVLPPPQYITNQGQQGFSAKLKFGGLFFQSNDFFQTRLEAEQHAAFEALQG LGLLESTVTFDSAWESSTILRGNNMKHGSGIITLGNVGGSLPRSYSHQSSKHSRSGSIST SRQGSASDLKTSLNIPTDFVAAEITRLPPAPNIQSNQNVSFSMGPRTYSSGSGFDRTTLN DRVGSYSALGRIPSNNNILNYNTSISSGFPKGLSASQTHISHSTPYKEYNGGDALLRFDT DFKDSPKVNYISQQHTKKEVYRTGSAYSSSSMTVESSSTSQFSGPRNYPGSVRDVTYIET PRTVRTASHPALGDLENEMAGLEGLIKDLNGIASKPL NT seq 5694 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgctaagaatgcttctgttgattttatttttattatattcttgtcaaattggactttcc tatacacctcctgtacttttagaagagcctgaagatacatttggatatgataaaaagccc ttaactttaaaatgtagatcatctagttcaccacctccacggtatttatggtttaaagat aataatgaagtttctaacactagatatacaattacaagtgtgggtgatcttgtcatatca ccatttgttgcaactgaagatgttggaatatatagatgtatggttaaagtagatgttgca ataaataatgctgaattaaaactagtctctagaaatgcaaaggttcaaatagaagagttt ccgcaaatttttgcttctgatatatctgcaactactggttatgttaatggggcattgaga ttatctgtaaatgtgagtaattttaacccaaaaccaaaaattggatggaactatcgagga aaaccgtcagttcaagataatgatccacgttttactgtactttcacaaggagttttacaa ataagtgggttgttgtcatcagatgatggagaaatcagagctattgctataagcaaatct aacagcaacactatgtttggaaagttttctaaagttactgttgaagaagcatcacttcgg ccacaaaataaattgttttattttcttggaacacctcaaaatattgaacttgaatggggc cactcaacaattttggaagcatttgctgacagttctacttcagtattatatacttggttt aaagatggaaagaaagttatattaagtgatagattatccattgttggaaaaggtaattta aaaattcagtttgcaaaagatgaagatactggtctatataaagttatagcagaatcagct ggtcagcaaattgaagccattgcgcaagtcaaagttatcagtcctgttcaaattattcta agtcctccaccacagattactgctatggaggaaacccaggtcaaagtcaactttagtgtt agtggtaattcacctattaattggtttcatgatggagtccttgttgacacgtcatcagct gactacttgcaatttggaaccaactatgttattataaataatataataaactctgatgca ggaatgtatcaaggaagaattggaaacacaaatttacatatatcttttgagctaatagtt attccgaaagattccattcccacacaagatacagtcaacagtctgcttattcctggaaag cctttggatgttattgcaaaagcaaggtcagctacagagattgatttggaatggaaagaa ccagctgtaccaaatggagttataaccagttatggaatcatttactacgattctcctagc acagcatctaaaattactgttactgatcctactcaaagatttataactgtaaaaaacctt actcctggaactacctaccaatttagattacaggcatttaataacaaaggaccaagtctt ttaactgatgcagttggagcccgaactttggatctatcaagcttaccaggggttgtagaa aatttaaaagttgttccatctaaatcttcaatgatagtttcttgggattcaccaaaaagt ggagcaggaagcagcggaactggagcaggggttagaagttatgctgttttctatacacca caagggttttctgggaatcctttcaaaaaagtaggtagtggaactactttgcaagttgat gatcttactcccggtgcaagctatcgtgtttgggttgttagctacaataatgatattgct gggcctaaatcccaagagcttattgtagatattccatttgcatctgaagctcctcaacca gtcataaacctagttgttactccagcattaacaactgttgcaaatgtcaattgggaacct cctcaaagtggccctgtaccaacttcatataaagtttattatcaagatgcagaagattct tcatcctcattacaagtgagcactttttcaaatccacctgcaaacattagaaatttacaa ccaaacacgctttatgatttttatgttgttgcatataatggggctgttgcaggtttgaaa tcaagtataaaaaaagtaaagatgcttgaggaagtacctcctgccccatcaacacttaaa attgtttctattggcaatgacacattaaaagtgaggtggtcaccaatagatttaaaaagt ttccaaggtaacctgttatcatatgagctgcaatactttgaaggggacttaagacacact gcaaaagctatatcaaatatccctaaatcatcaaaagaatggaaaattactaaactttcc cctcagactgtatataatattaatgtgattggtgtgagtggaaatggacgaggttctcca tccccaacaataaacgtcaaaacaagagaacttacttcagaaggtcccagtgaacctgca gacataaaattgactcacgatcctgatgtacctgatgttttaatgataacatgggatgaa cctctttatgtatcaggcgatgtaaagagctatattatttattatcgagcaaacccatca gataattacatcagcaaaacaactattggtactgctaaaggtttcaacataactgatgtt ttgcttgggaagttgtatgaaagttatatggtagctgtcgataacaatggtcaagggaaa aaatcatctgtttttgaaagaatgactatgatagaggatgtactaccagaacctgtttca aagttatcagtagaccctaaggcagattcattatttgtttcatgggaaccacctgtttca agctttaatgttatagtcagagggtataaaatcaacatttttagtgcaaagaccaatgct gaaatattccaagatacattaataggcagacagaatacgcacttactactctataatgga atagagccaaatgaaaggtatacagtcaatgttcaagcatttaacaagtttgggaaaagc gatattgttaaaaaggatgctacaacacttcaagcatcaaagtctactatacttataact gatgtgacaaaaagttcaagcacaatattttttaaatggattgatactggtattgtatct ggtgttggaaactatatagtgaggtatgatgtttatgacattaatggcatccctgaaact aaaaatttagcagtgtttaagaatgaagcacttataactgatcttgtggctttcactaac tacaatttttatgttaaacatgctaccgaaacaacattcccaaaagatataactgtttct gcaagaactcttgaagcagtgcccagtgccccattagatttgactgcacaaggtattgca gagtatccatcatggttaattttaagttggcaagtcccaaggtatccaaatggaaaaatt aaagagtatgtcatcttatattcagctgacgaatcattagactataaagaatggcctaag attgaaacaaaaagtattagcatgacttacaatataacgcagcttacgactaatacaaat tacttttttgtggtttatgcaataaatggagcaggtgaaggctctaaatctgcagtttat tcaaaaaaaacagttggtggtggtgttgttcctattactgtgattggtgctgcagcaagt agagattcaggtggatggtggtggtggtggtggattattcttgctataattttgtttatt ttgctattgttgttgttactacttatttgttgctgttgttgttgtggaaaatacacagag tggtgttggggttgttgtccttgctgtaaaaaatgttggttttgttgctgtttacctttg cgctcaacatgttgtttttgttgcaagtctgataaaaaaaaactatatattgcaactcct gttttgacacaaaccacaaacgaaaaaattaatggtcatattgtaaatgagtctaaagat gtaaatgttgaactaactccattgacttctgctgttgatggcgaaatatacggaggtgat ggaggtttgggaactaacaagtcacgcatggcaagctcatcactaaattctagcagaatt tccttgggaaatgtcaaagttccagtcccaagtgatgcttcatttatatcatataaaacc tccttacaggactattgtcaaaatactggttggatacttcctgtctatacaactagtttg ggtaacacgggatggacttctaaagtgagttttgggaaaattcatacctatgaaagtgct gaatgtggaacttcaaaacaagatgctgaacaacgcgcagcacatgcaggtttaattggc ctcggtgtgttagatttccgaagtaaatatagcgatgatacctgcattgctgttcctgga caaggggatggctcgttcatatcttataaatgcagtttacatgatttttgtcaacagtgc agtatacaaccaccaaaatttgttacttcgatatatgaaaatggctattcatcatctgtc aaagttggccaacacacgtttaatactgtagggcgctcatctactagtcaggaagctgag caaaaagtagcgtttgttgctttacaaggattatgtatggtggattcacaagcagtttat gatccactagtatgctacacagttcctggtcccggggacatttcttttatttcatttaaa agtaacctgcatgatttttgtcaaagatttgttcttcctccacctcagtatatcacaaac cagggccagcaaggcttttctgcaaaactaaaatttggtggtttgttttttcaaagtaat gatttctttcaaactagacttgaggcagagcagcatgcagcgtttgaagcacttcaagga ctaggtttattagaatcaactgtgaccttcgattctgcatgggaatcttctactatactt cgaggtaacaacatgaaacatggtagtggaattattacattaggtaatgttggaggtagc ttacccaggtcctactcgcatcaaagtagcaagcattctagatctggatctatttccacg tctcggcagggctcagcatccgatttaaaaacatcactaaacattccaacagattttgtg gcggcagaaataactcgattacctccagcacctaatattcaatccaaccagaacgtttct ttttctatgggtccaaggacatacagctcaggaagtggttttgatcgaacaacattaaac gatagagtaggttcttacagtgctcttggtcgcattcctagcaataataatatattaaat tataatacatctattagcagtggtttcccaaaaggtttgtcagcctcacaaacgcatatc tcgcattctaccccatataaagaatacaatggaggcgatgctttacttcgatttgatacg gattttaaggattctcctaaagtcaactatatttcacaacaacacactaaaaaagaggtt tatcgtactggaagtgcttattcttcttcctcaatgactgtggaaagtagttcaacctct cagtttagtggaccaagaaattaccctggaagtgtgcgcgatgtaacctatattgaaaca ccacgcacagtgcgtacggccagtcacccggcgttgggagatcttgaaaatgaaatggca ggtttagaaggtctaatcaaagatttaaatgggattgcctcaaaacctttatag

DBGET integrated database retrieval system