Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100201018
Help
Entry
100201018 CDS
T01080
Name
(RefSeq) meiosis regulator and mRNA stability factor 1 isoform X1
KO
K17573
meiosis arrest female protein 1
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01009 Protein phosphatases and associated proteins [BR:
hmg01009
]
100201018
Protein phosphatases and associated proteins [BR:
hmg01009
]
Protein serine/threonine phosphatases
Phosphoprotein phosphatases (PPPs)
Protein phosphatase-1
PP1-interacting proteins (PIPs)
100201018
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OST-HTH
RRM_1
NYN
RRM_MARF1
RRM_5
DUF7923
zf-C2H2_4
zf-CCCH_3
HAD_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100201018
NCBI-ProteinID:
XP_047143399
LinkDB
All DBs
Position
11:16670548..16789355
Genome browser
AA seq
1610 aa
AA seq
DB search
MESREKGTSFPVWIGSLAESVNEQVLMMHFNKFGPIRGISIVRDLVTRKSKQFGYVNYSN
LEVAERAADQMNNVEICGKKIKTKGPHDQPIKSSISSERKLEIINLTDCYYFTQFGKCEV
NTGKTCQYRHFDLLQKTKEVCPNWGNKSCTNLKCPKLHPSQRQYKENSNNSEMVLERCKS
HNAFKCYGQCGKTDCDIHFNDERKLYDHITEGKSSLLPCKICNAVFFNKDEMERHSHPEY
STKYGSTAKLNSINTPAPHSGINVVPIGVFWDIENCQVPKNKSALAIVKKLRDRFYPGRK
EAEFICVCDTKKEKEDVLEDLNKAQVNVIHINASSKNAADDKLKQQLRRFAQSYPSPATV
LLVSGDINFVADLSDLRYRHNLHIILLHNKQASQALLQCAHESECFDIFTDSILPHSPML
MTSETKESNQLAVFNIPHCKNISTERITQRLNLLSQNTGGKVIKVKAFKSPSNNKAIISF
PNVDCARRALQRINGENIFGYTINVSFHFEKNKKIKNNEKKIQAEQPREHEDIENKTRNN
SASGVYTNLKKFSSASTPILNSVHGNSRRKKGINKQNANQNKVLNEEIAFKSNQNVVKFM
PPLIENSKQNDVNHTPFIIPPLMEVFPFGMPSLCNVNPVLPNGLIKPPFNKTEIFNGITI
QVSNLDKSKDFKEIKSGLDFLFRKYSKVLHISQGQTFSKTLNALVTVANMQDAQLCISKL
DNCLLFNRPIKLSQLNKDNIGLVKMKENVEAILCETFSGWLPLQDFLLKYKVKHEQPFHV
LNFEHMKDLIYIDGKPGYQFICLLSFRVGLTLKLDIEFQGKLEGVLLSHNRKVPLASLPG
LYWSYQQNLLPLGKGGIPLNHVLSKNITLVGLPGSQAVFHKKLPSVNGYSLSSFQSEIIL
LLKMSPKFEIPWNRFCLHYNLFFGRELCFQDFKCNDLEELISKVSEIVKVDIQNNNRVVT
FTRNFTVQILNEELDSLIMSCNRHKLPVTSLFTTYYRFFGHKFVLANYGFNSLQSLLSSL
QHPFKVFRVSDKQILTKVQAGVKKSSQSIKEFAEEIISIIKELPEKRVAINILSSEYRKK
YGRQLKLNKLGFSTFNDLVGALSGLVKVEVVDETKYLSLLENIEHPALWHEITLVIKKMP
YLTIMALHLPNYYTEMFRKPFPLVNLKTTTFFDIIPPTFLSIGAGSNRILMSKESCPCIL
RSILLENFLYSCEEFTSNSLEISNIFKKFGNILKPEEVKDIFGLCRHPSFKVVNNGITLA
QSAACKMFEHDIISLLHEEPELNLKLKDIIGKYQKKFGKTLKVTDFGYTTLHALCANLTG
GIVVVKRVNENDNENLVELGPLGKIYFKCKSVVDFHHGTLMLCNFATEYHKMHGTQIKLA
DYGFNKILDLINCFHKIFLVHTEKNMKLIISIEHLNNSSGFNQDFDIRHDLQLDQLKFDV
NSEESDEDNADLLEFDDDGKDDVLSDLMEKELANPLEWWMEPNPNLSDSVLEPELSQNVV
YDLISFTEFEDNQNIDNGGSDDFGKVNSVKPLHSHQVNDLAEVFSYETPIEKVANNFVES
ESCQSFNRYSCFPSSTSVAEGLQKTPNSNGINTSDKISVRPKLAANFSKN
NT seq
4833 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatctcgagagaaaggaacttcttttccagtctggattgggtctcttgcagaatct
gttaacgaacaagtattaatgatgcattttaacaagtttggccccattcgaggtataagc
attgtaagagatctagttactaggaaatcaaaacagtttggttatgtaaattacagtaac
ctagaagtagcagagcgagcagctgatcaaatgaataatgttgaaatatgtggaaagaaa
ataaaaacaaaaggtccccacgatcaaccaatcaaatcatctatttcatcagaaagaaaa
ttagaaattataaacttaacagactgctactattttacccaatttggtaaatgtgaagtg
aacacaggaaagacctgtcagtatcgtcactttgatttattacaaaaaacaaaagaagtt
tgccctaattggggtaacaaaagttgcactaatctgaaatgtcctaaattgcaccctagt
caaaggcagtataaagaaaacagtaataattctgaaatggttttggaacgttgtaaatct
cacaatgcatttaaatgctatggtcagtgtggcaaaactgattgtgatattcattttaat
gatgagcgaaaactctacgatcatataaccgagggaaaaagctcgttattaccctgcaaa
atatgtaacgctgttttcttcaataaagatgaaatggagagacattctcatcctgaatat
tcaacaaaatatggttctacagccaaactgaattctattaatactcctgctcctcatagt
ggcatcaatgttgtgccaataggtgttttttgggatatagaaaactgccaagttccaaaa
aataaatctgcactagcaattgttaaaaaattgcgggatcggttttatcctggccgcaaa
gaagcagagtttatttgtgtttgtgacactaaaaaagaaaaagaggatgttctcgaagat
ctaaataaagcacaagtaaatgttattcacataaatgcatcctctaaaaatgcagcagat
gacaagttaaagcaacaattaaggcgatttgcacaatcttatccatctcctgcaacagtt
ttacttgtatctggagatatcaattttgttgctgatttatcagatttgcgttatcgtcat
aacttgcatattatattacttcataataaacaagcttcacaagcacttctccagtgtgca
catgagagtgaatgttttgatatatttacagatagtattttgccacattctccaatgtta
atgacaagcgaaacaaaagagtcgaatcaacttgctgtattcaatattcctcactgtaaa
aatatatccactgaacgcataacacaacggttaaacttactttcacaaaatacaggagga
aaagtgattaaagtcaaagcttttaaaagtcctagcaataataaagctataattagtttt
ccgaatgttgattgtgctcgccgagcactacaacgaattaatggcgaaaatatttttggt
tacactattaatgtatctttccattttgaaaagaacaagaaaattaagaacaacgaaaaa
aaaattcaagctgaacaacctagagaacatgaagatattgaaaataaaacaagaaacaat
tcagccagtggtgtttacaccaatttaaaaaagttttcatctgcatctactcctatttta
aatagtgttcatggaaactctcgtagaaaaaaaggtataaacaaacaaaatgctaatcaa
aacaaagttttaaatgaagaaattgcatttaaaagtaaccaaaatgttgtgaaatttatg
ccacctctaatagaaaatagcaaacaaaatgatgtcaatcacacaccatttattattcct
ccattaatggaagtattcccatttggaatgccgagtttatgtaatgtaaatccagtgttg
cctaatggtttaataaaacctccttttaataaaacagaaatatttaatggcattaccatt
caagtttcaaacttagataagtctaaagattttaaggagatcaaaagtggtctagatttt
ttattccgaaagtattcaaaggtgttgcatatatctcaaggtcaaacttttagtaaaaca
ttaaatgcacttgtcacagtagcaaatatgcaggatgctcaactttgtatttcaaagtta
gataactgtttgttgtttaatcgtccaataaaattatcacaattaaacaaggataatatt
ggtttggttaaaatgaaagaaaatgtagaagctattttatgtgaaacattttctgggtgg
cttccattacaagactttcttctaaagtacaaagttaaacatgaacagccatttcatgtc
ttaaactttgagcatatgaaagacttaatttatattgatgggaagcctggttatcaattt
atatgcctactttcatttcgtgttggtttaacattaaaacttgatattgagtttcaagga
aaacttgaaggtgttttgctgtctcacaatcgcaaagttccattagcaagtcttccaggt
ctttattggagctatcagcaaaacctccttccattgggtaaaggaggaattccattaaat
catgttttgagtaaaaatatcactcttgttggtttgccaggatcacaagcagtttttcat
aaaaagttaccttcagtgaatggttactctttatcaagttttcagtcagaaattattttg
ttgttaaaaatgtctccaaaatttgaaattccttggaatcgtttctgtcttcactataac
ctattttttggtcgtgagctgtgctttcaagattttaaatgtaatgatcttgaagaattg
attagtaaagtttctgaaatagtgaaggttgatattcaaaacaataatagagtggtgact
tttactagaaacttcacagtacaaattttaaatgaagaattagattcactaataatgtca
tgcaatagacataaacttcctgttactagtctttttactacatattatcgcttttttgga
cataaatttgtgcttgctaattatggttttaactcgcttcaatcgctgctctcttctctt
caacacccttttaaagtgtttagagtaagtgataagcaaattcttactaaagttcaagca
ggagttaaaaagagttctcaatcaattaaagaatttgctgaagagattatctctattata
aaggaattacctgagaagagggtagccattaatattctgtcatctgaatatcgtaaaaag
tatggtcgccaactcaaactaaacaaacttggattcagtacgtttaatgaccttgttggt
gcattatctggattggttaaggttgaagttgttgatgaaacaaaatatttatcattgcta
gaaaacattgagcatcctgcattatggcatgaaattacacttgttatcaaaaaaatgcca
tatttgaccattatggctttgcatttgccaaattattacacagagatgtttagaaaaccg
tttcccttagtaaacttgaaaacaaccactttttttgatattattcctcctacatttctt
agcattggggctggatctaatagaatacttatgagtaaagaaagttgtccatgtatatta
cgttctattttgctggaaaacttcttatattcttgtgaagagtttacatcgaattctttg
gaaatttcaaatatttttaaaaaatttggtaatatattgaaaccagaagaagttaaggat
atatttggattatgcagacatccatcatttaaggtagttaacaatggcattactttggcg
cagtcagctgcttgcaagatgtttgagcatgacatcattagcttattacatgaggagcca
gagctaaatttaaaactgaaggatatcatagggaaatatcaaaaaaagtttggcaaaact
ttgaaagttactgattttggatatactactttgcatgccttatgtgcaaatctcactgga
gggattgttgtggtgaagagagttaatgaaaatgataatgaaaacttggttgagcttggt
ccactagggaagatttacttcaaatgcaaaagtgttgttgattttcatcatggaactctg
atgctttgtaactttgccacagaatatcataaaatgcatggcacacaaattaaactggca
gattatgggttcaacaaaatattggacctaataaattgttttcataaaatatttttagtt
cacactgaaaaaaatatgaagttaataatttcaattgagcacctgaacaattcaagtggg
tttaatcaagattttgacattagacatgacttgcaattagatcaactcaaatttgatgtc
aattctgaagaatcagatgaagataatgcggatcttctggagtttgatgacgatggcaag
gatgatgttttatcagatctaatggagaaagaacttgctaatccattggagtggtggatg
gaacccaatccgaatctctcagattcagttcttgaacctgagctcagtcaaaacgttgta
tacgatttgatttcttttacagaattcgaagacaatcaaaacattgataatggtggttca
gatgattttggaaaagttaattcagttaagcctttgcattctcaccaagtaaacgatttg
gcagaagtcttttcttatgaaacacccattgaaaaagttgcaaacaactttgttgaaagt
gagagttgtcaatcttttaatcgttactcttgttttccaagttctacgagtgttgctgaa
ggattgcaaaagaccccaaattcaaatggaataaatacgtctgataagatctctgtgcgt
ccaaaacttgctgctaatttttctaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
