Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100203678
Help
Entry
100203678 CDS
T01080
Name
(RefSeq) clathrin heavy chain 1
KO
K04646
clathrin heavy chain
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04142
Lysosome
hmg04144
Endocytosis
hmg05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
100203678
04142 Lysosome
100203678
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
100203678
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
hmg04131
]
100203678
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
hmg04147
]
100203678
Membrane trafficking [BR:
hmg04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Clathrin
100203678
Exosome [BR:
hmg04147
]
Exosomal proteins
Proteins found in most exosomes
100203678
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Clathrin
Clathrin_propel
Clathrin_H_link
TPR_COPA_B
TPR_PEP5_VPS11
TPR_Vps41
HEAT_Nup120
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100203678
NCBI-ProteinID:
XP_047141827
LinkDB
All DBs
Position
10:47885174..47914759
Genome browser
AA seq
1684 aa
AA seq
DB search
MAQLLPIRFQEHLQLQNVGINAANIGFSTLTMESDKFICVREKVGEQAQVVIIDMADPNN
PTRRPISADSAIMNPASKVIALKAAKTLQIFNIEMKSKMKAHNLTEDVIFWKWISVNTLG
LVTEASVFHWTMEGDSSPVKMFDRHQSLAGCQIINYKVDHSGQWLLLVGISAQQNRVVGA
MQLYSIERKVTQPIEGHAAVFSQFKMEGNAQPSNIFCFAVRGATASKLHIIEVGTPPTGN
QPFPKKAENIFFPPEADKDFPVAMQASEKYGVLYLVTKYGYIHLYDVESAQCIYSNRISA
DTIFVTAPYEPTEGIIGVNRKGQVLSVSCDEEKMVPFLIQVKQNGELARRMAERCNLPGA
DNLFIQTFNEKFAIGQYPEAAKIAAKAPKGILRTPQTIQKFQQLPSQPGQTSPLLQYFGI
LLDQGQLNKYESVELCRPVLMQNRKQLMEKWLKEDKLDCSEELGDLAKQFDNTLALSVYL
RANVPNKVIMCFAETGQFQKIVLYAKKVGFEPDYVTLLRNVMRVNTEAGSQFASMLIQDN
EPLADLNQIVDAFMEFNLVQNCTSFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLLSAPQVADAIL
GNQMVTHYDRAHIAQLCEQAGLLQRALEHYTDPYDIKRAIVHTHVLNPEWLVNYFGTLSV
EDSIECIRAMLTHNIRQNLQICVQIASKYYEQLTTSALIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
FSQEPDVHFKYIQAACKTGQMKEVERICRESNCYNAERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
FDFVHDLVLYLYKNNLQKYIEIYVQKVNPSRLSVVVGGLLDVDCSEDIIKGLILSVKGQF
STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESRIHEGSVEPATHNALAKIYIDANNNPERFLRENHFY
DSLVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNVNSLFKSLARYLVRRRNPELWQGVL
LEDNKYRRQLIDQVVQTALSETQDPEDVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLENSVFSD
HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYITRLDNYDAPDIASIAIGSELFEEAFAIFKKFDVNTS
AIQVLIENIQNLDRAYEFAERCNDPAVWSILGKAQLTQGLVKEAIDSYTKADDPSDYKEV
VEASKMAGSYEDLVKYLQMARKKAKEAFIDTELIFAFAHTGRLADLEEFVSSPNHANIGQ
VGERCFQEKMFEAAKILFNNISNFARLASTLVNLGAYQEAVDSARKANSTRTWREVCFSC
VDGKEFRLAQMCGLNIVVHADELEDLIKYYESRGYFEELITLMEAALSLERAHMGMFTEL
AILYSKYKTSKMKEHLELFWSRVNIPKVLRACEQANLWSELVFLYDKYEEFDNAVVTMMK
HPTVAWKEGLFKEVITKVANIELYYKALQFYLDHKPMLINDLLIVLTPRMDHTRGVSFFQ
KAGHLPLVKPYLRSVQFHNNKAINEELNNLLIKEEDYNGLRASIDAFDNFDNIALAQKLE
RHELIEFRRIGAYLYKGNNRWKQSVELCKKDHLYKDAMQFACESRDQSVAEDLLQWFLEV
NKTECFVATLFMCYDLLKPDVVLELAWKHNLIDFAMPYMIQVMREYLTKVDKLAEVSAKR
EEEHSTAPEAPIIGMDQLMITNGPAFLPPTAMYGINPGMPPGMMPPGMIPQAYQTMPPQY
YGGM
NT seq
5055 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgcagcttttgcctattcgatttcaagaacatcttcagcttcaaaatgttggaatt
aacgctgctaatattggtttctcaacacttacaatggaatctgacaagtttatttgtgtt
agagaaaaagttggggaacaggctcaagttgttattattgatatggcagatccaaacaac
cctacacgaagaccaatatctgctgattcagctataatgaatccagcttccaaagtaatt
gctcttaaagctgcaaaaactcttcaaatctttaatattgaaatgaaaagcaaaatgaaa
gcccataacttaactgaagatgttattttttggaaatggatttctgtgaacacattaggt
ttagttacagaagcatcagtttttcattggacaatggaaggtgattctagccctgtaaaa
atgtttgatagacatcaatctcttgctggttgtcaaataattaactataaagtagaccat
tcaggccagtggttgctgttggttggtatatcagctcagcaaaatcgtgttgttggtgca
atgcaattgtattcaattgagagaaaagttacgcagccaattgaaggtcatgctgctgta
ttttctcaatttaaaatggaaggtaacgctcaaccatcaaatattttctgctttgcagtc
agaggagctactgcttcaaagctgcacatcattgaagtgggaactccaccgactggaaat
caaccttttcctaaaaaagctgaaaatatattttttccacctgaggctgataaagacttt
cctgttgctatgcaagccagtgagaaatatggtgttttatatcttgttactaaatatgga
tatattcatttatatgatgttgaaagtgctcaatgtatttattcaaatagaattagtgct
gatacaatctttgtgactgccccttatgagccaactgaaggaataattggtgtaaacaga
aaaggacaggttctctcagtttcttgcgacgaggaaaaaatggttccttttttaatacaa
gtcaagcagaatggtgagctagctcgtagaatggctgaacgctgtaatttgccaggagca
gataacttgtttattcaaacatttaatgaaaaatttgccattggacaatacccagaagcc
gcaaagattgcagctaaagcacctaagggaatattaagaaccccacaaacaatccaaaag
tttcaacaactaccttcacaacctggtcaaacatctcctttgttgcagtactttggtatt
ttattggatcaaggtcagttaaataagtatgaatcagttgaactatgtaggccagtttta
atgcaaaatcgtaaacaacttatggaaaagtggttgaaagaggacaagcttgactgtagt
gaagaactaggcgatcttgcaaagcagtttgacaacaccttagctttatctgtttattta
agagctaatgtccctaacaaggtgataatgtgttttgcagaaactggtcagtttcaaaaa
attgttttatatgctaaaaaagttggttttgagccagactatgttactttgctcagaaat
gtaatgcgtgttaatactgaagctggttctcaatttgcatcaatgttaatacaagataat
gaaccactagctgatttaaatcaaattgtagatgcatttatggagttcaatttagtacag
aactgtacatcattcttgttggatgccctcaaaaataacagaccaagtgaagggccgttg
cagacaagacttttggaaatgaacttattatcagctcctcaggttgctgatgctatattg
ggtaatcaaatggttactcattatgatcgtgctcatattgcccaactttgcgaacaagct
ggacttcttcagcgagctcttgaacattacacagacccatatgatattaagcgagctatt
gttcacactcatgttctgaatcctgagtggttagttaactattttggaacgctgtctgta
gaagattcaattgaatgtattagagcaatgcttacacataatataagacaaaatttacaa
atatgtgttcaaattgcttcaaagtattatgaacagctgactacatctgcattgattgag
ttatttgaatcgtttaagagttttgaagggttgttttatttcttaggatctattgtaaat
ttttcacaggaacctgatgtacactttaaatatatacaagctgcttgcaagacaggtcaa
atgaaagaagttgaacgtatttgtagagaaagtaactgttataatgcagagagagtgaaa
aactttttaaaggaagctaaattaacagatcaacttccactcataattgtttgtgatcgt
tttgattttgttcatgatttagttttatatctttacaagaataacttgcagaaatatata
gaaatatatgtacaaaaagtaaacccgtctcgtttatcagtggttgttggtggtttgtta
gatgttgattgtagtgaagatatcattaaaggtcttattttatcagtcaaaggtcaattt
tcaactgatgaacttgttgctgaagttgaaaaaagaaaccggttaaaattgttgttaccg
tggcttgagtcaagaatacatgaaggctccgtagaaccagcaactcataatgcattagca
aagatatatattgatgcaaataataatcctgagagatttttgagagagaaccacttttat
gacagtttggttgttggtaaatattgtgagaagcgtgatcctcatttggcttgtgttgct
tatgagcgtgggcagtgtgatttagaattaattaatgtttgtaatgttaactcattgttt
aaaagtcttgcaagatatttagttagaagaagaaatcctgaattatggcaaggcgtttta
ttagaagacaacaaatatagaagacagttaattgatcaggttgtgcaaacagcgctttct
gagacacaagatcctgaagatgtatctgttactgtgaaggcgtttatgacagctgatcta
cctaatgagcttattgaacttctagaaaagatcgtattagaaaattctgtgtttagtgat
catagaaatcttcaaaacttgttaattttaactgccatcaaagcagatagaacacgggtt
atggaatacatcacacgtctagataactatgatgcacctgatattgctagtattgctata
ggtagtgaactatttgaagaagcatttgctattttcaaaaagtttgatgttaatacatct
gcaattcaagttctcattgaaaatattcaaaatctggatagagcttatgaatttgctgaa
agatgcaatgatcctgctgtgtggagcatacttggtaaagctcaacttacccagggactt
gtcaaagaagctatagattcttacactaaagctgatgatccttcagattacaaggaggtt
gttgaagcttctaaaatggcaggaagttatgaagatcttgttaagtatttgcaaatggca
cgtaaaaaagcaaaagaagcatttattgataccgaactaatttttgcatttgctcatact
ggtcgtttagctgatttagaagaatttgtatcaagtccaaatcatgctaatattggtcaa
gttggtgagcgatgtttccaagaaaagatgtttgaggctgcaaaaattttatttaataat
atttcaaactttgcaagattagcatcaacactagtgaatttaggggcgtatcaagaagct
gttgacagtgctagaaaagctaatagtacccgaacgtggagagaggtatgtttctcctgt
gttgatggcaaagaatttcgtcttgctcaaatgtgtggtttaaatattgtagttcacgca
gatgagttagaagatttaattaaatactatgaaagtcgaggttactttgaagaactgata
acactaatggaagcagcattgagtttagaaagagctcatatgggaatgtttactgaactg
gctattctctattcaaaatataaaacaagtaaaatgaaagaacatcttgagttgttttgg
tcacgtgttaatataccaaaggtgctacgtgcatgtgaacaagcaaatctttggtctgaa
ctggtatttttatatgacaaatatgaggaatttgataacgctgttgtaacaatgatgaag
catcccactgtagcatggaaagaaggactttttaaagaagttataactaaagtagccaat
atagaactatattataaagcattacaattttatttagaccataaaccaatgttaataaat
gacttactaatagttcttactccacgaatggatcatacaagaggtgtaagtttttttcaa
aaagctggacatctacctttagttaaaccttatttgcgttctgttcagtttcataataat
aaagctattaatgaggagttaaataacttattaattaaagaagaagattataatggtctt
cgtgcatcaattgatgcatttgataactttgacaatattgctctggctcagaagcttgaa
agacatgagttaatagaatttagaagaattggtgcatacttgtataaaggaaataacaga
tggaaacagagtgttgagttatgcaaaaaagatcacttatataaggatgctatgcagttt
gcttgcgaatctcgtgatcagtcagttgctgaagaccttctgcagtggtttttggaggtt
aataaaacagaatgctttgttgcaacattgtttatgtgttatgatttattaaaacctgat
gttgtgttagaattagcatggaaacacaatctaattgattttgcaatgccgtacatgatt
caagttatgcgagagtatctcactaaggtcgataaacttgctgaagtaagtgcaaagcga
gaggaggaacatagtactgctcctgaagctcctatcataggaatggatcaacttatgata
actaacggtccagcattcctgccgccaactgctatgtacggtattaatcctggaatgcct
cctggaatgatgccgccaggaatgatccctcaagcatatcaaacaatgccaccacagtat
tatggaggaatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system