KEGG   Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100203888
Entry
100203888         CDS       T01080                                 
Name
(RefSeq) tetratricopeptide repeat protein 37-like isoform X1
  KO
K12600  superkiller protein 3
Organism
hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    100203888
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:hmg03019]
    100203888
Messenger RNA biogenesis [BR:hmg03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ski complex
     100203888
SSDB
Motif
Pfam: TPR_2 TPR_1 TPR_12 TPR_8 TPR_16 TPR_19 TPR_14 TPR_11 TPR_CcmH_CycH TPR_17 ANAPC3 TPR_7 TPR_6 ARM_TT21_C TPR_Slam Cauli_AT PPTA ARM_TT21_5th T7SS_EccA1_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 100203888
NCBI-ProteinID: XP_047139336
LinkDB
Position
9:complement(29107293..29199649)
AA seq 1556 aa
MNGEMVDVKVELKLTRESINKKDYKAALVHCKNILKHDKENYNALVFFGVSATELKEFEQ
ARKAYDKAITINDKLPLAWQGLSSCLEKSQNAEWKQALIDSYFVLLNNHISENQKWIETC
CKLCDVLKDLNRLEEAVEWIKKIVQKCSNVNDVVAYWHNIIKIISDIGLATGFSKNYISE
IMNAYQHLFELSDIPVDVMENTCANYLDFLTKVDVEVSLSNIIMQTKKFHHKFPNNTKIF
EFLFKFLLYENLENSFDLKSQNFENFEFHAERANPETKCLVFAVTEFAGGNVQAAMKLLL
DSAYTINSPLLWYYVCIGQQKLHQNATISKSIGNCYSALSQVSFQEIKVTVKKMLFEIEA
ELYLEQESLNEIYSKEILEKTCNLQLNNYQIIVKAHIYFQLGNQQKCNEILDGLDKNMFD
VKTNSRYLYLKACISINENKLLDAELRLYEALGLFANSKCHYTLAKVYWKLGKSEHQYFP
KAYSSLMKAAMLDSYFASTFVYLGIYQRDFVKDKMKALKCFEKAFTLNRSHKEAGGNLSD
LYLELEMEEKAINVYETVISNGETGQISWACVRCGLIYLKLKNFDKAIICFQKALREQSN
ISHYWECLAEAYFNKGSYISALKSFKKSLQLDESSVYSKYMVAKVNQMLSMYKEAVTAYK
ELLESHPDYVPALLGLGLTYFHLEEAMLRNTFDGQAVQYAQNVVDTISTALKKQPHYSCL
WKTVGDALSALYLVKEERCKLVIPEFIQKMLVIMISDHATKKDVLMIAKRCYAAAVKLRE
DCASYWHDLAIITHRYFIYVGEQESNDGVQQSLDIVKKALSLDPNNSTIWNTLGVITGFS
GNVQKVCGYAIDDKHNAGLSQHAFIKSLQLNDQDAIVWANLGVLYLKHDKVQAAHEAFKR
AQATDPSLPQAWIGQACIAETIADTDAMDLFRHALELKFHCEAATAYGQSVIQLLESNKE
KSILLSTFPKPDLSHLSFYMRKVVSNASVALMKYTDRIQHNAFAFNTLGLLLEQECLFKQ
AEEAYSRARLCSNEPTSNDQSEQLRNVLLNQARVLCNLLKFEDAIEIYKICSLNSSLELC
QLAYAYYATSKWKESVETYEKALLLSTNSYEKACIHTALGQVFYLLKDVETAKSQFLKSI
QVDNSCEFGVMALASLGLLLGDATLATVSISELSKHKQDSEKFEIKKTLLMSTFYIFQGQ
LIPAQRQISRAIIRYPMNSLLWCSLSTFLIQHYPSKTLLAEQCSKITENLPPTHMSSMLQ
ALVSLVFPRNNDSLNAVKRYVHSYPHQPESWALLASTCFSHCASYESYNHKKLVTGLAHL
ALTKVDEINQSMQLKTIHNRLDETKMRATMTRLYYWLMKLFVVSHIYYGDVLLAQSFCNQ
VISSISNDKNLSEDFIFLKGVSLLQVKPGSDNQSGLENIRYLSTITQNAELWRWKFLSHL
YKFYRMPLGAELCYHEIIKLNLRHNCSNLSTFLNMCLLALQTFYISKDIDWLNRAQQTVD
ELLKLTEVDPHVIFSRAMLFYLQGNKKAALKYVQKLTSIEDKFIKETQQRLSVVWS
NT seq 4671 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatggagagatggttgatgtaaaagttgaacttaagttaacaagagaatcaataaat
aaaaaagactacaaagctgcattggttcactgcaaaaatattttgaaacatgacaaggag
aattataatgctttggtcttttttggtgttagtgctacagagttaaaagagtttgaacaa
gcaagaaaagcttatgataaagctattactattaatgacaaattaccacttgcttggcag
ggtttgagttcttgtctggagaaatcacaaaatgctgagtggaagcaagcattgattgac
tcatattttgtacttttaaataatcatattagtgaaaatcaaaagtggattgaaacatgt
tgcaaactttgtgatgttttgaaagatttaaataggttggaagaggctgttgaatggatc
aaaaagatagttcaaaaatgttcaaatgtgaatgatgttgtggcgtattggcataacata
attaaaattattagtgatatagggttagcaactggattttccaagaactatattagtgag
attatgaatgcttaccaacatctatttgaactatctgatattccagtagatgtaatggaa
aatacttgtgcaaattatttggattttttaactaaagttgatgttgaagtatctttatct
aatataataatgcaaacaaaaaagtttcatcacaagtttccaaacaataccaaaatattt
gagtttctcttcaaatttttgttatatgagaatttagaaaattcatttgatttaaaatcg
caaaatttcgaaaattttgagtttcatgcggaaagggcaaatcctgaaacaaaatgttta
gtttttgctgtgactgaatttgctgggggaaatgttcaagctgccatgaagcttcttttg
gattctgcctatactattaacagcccacttttatggtactatgtttgcattggtcaacag
aagttacaccagaatgctacaatatcaaagagtattggaaattgttatagtgctttatct
caagtttcattccaggagataaaagttactgttaaaaaaatgttatttgaaatagaagca
gagttatacctggagcaagagtcactcaatgaaatttattctaaagaaattcttgaaaag
acctgcaatcttcagctcaataattaccagataattgtaaaagcacatatttatttccaa
cttggtaatcaacaaaagtgtaatgaaattttggacggtttggataaaaacatgtttgac
gtaaaaaccaacagcagatacttgtatttaaaggcatgcataagcattaatgaaaataaa
cttttagatgcagaattaagattgtatgaagctcttggtctttttgctaattctaaatgt
cattatactcttgcgaaggtgtattggaagcttggaaaaagtgaacatcagtatttccct
aaagcctattctagtttaatgaaggcagccatgcttgattcatactttgcatctacattt
gtttaccttggaatatatcaacgagattttgtcaaagataaaatgaaagctttaaagtgc
tttgaaaaagctttcactttaaatcgctctcataaagaagctggaggcaacctaagtgat
ttgtatttggaacttgagatggaggaaaaagcaataaatgtatatgaaactgttatatcc
aatggagaaactggacagatcagctgggcgtgtgtgagatgtggtcttatttacttaaag
ttaaagaattttgataaagctataatatgcttccaaaaagccttaagagagcaatcaaat
ataagccattattgggaatgtcttgcagaagcttattttaacaaagggagttatatatct
gctttaaagtcattcaaaaagtcacttcagttagacgagtcttctgtatactcgaagtac
atggttgccaaagtaaatcaaatgttgagtatgtataaggaagcagttactgcatataaa
gagttgcttgagagtcatcctgattatgttcctgctcttttaggccttggattaacctat
tttcatttggaagaagctatgctgaggaatacctttgatggacaagctgttcaatatgct
caaaatgttgttgacactatatctactgcactaaagaaacaaccacattatagttgttta
tggaagactgtaggggatgctctttcagcattgtatttagtaaaagaagaaaggtgcaag
ctagttattccagagtttatccaaaagatgcttgttattatgatcagtgatcatgcaact
aagaaagatgttctcatgattgctaaaaggtgttatgctgcagcagtgaaattgcgtgaa
gattgtgcaagttactggcatgacttggctatcattacacatcgttattttatttatgta
ggtgagcaagaaagcaacgatggtgtacaacaaagtttagatatagtaaaaaaagcttta
agtcttgatcccaataattctacaatttggaacacactcggtgtcatcacaggtttttct
ggtaatgttcagaaagtatgtggatatgcaattgatgataaacataatgctggcttaagt
cagcatgcttttatcaaatcgttgcagttaaacgatcaggatgcaattgtttgggcaaac
cttggagttttatatctaaagcatgataaagttcaagctgctcatgaagcgttcaagcgc
gcacaggctactgatccctcacttccacaagcttggattggacaagcttgcatagcagaa
actattgccgatactgacgccatggatttgtttaggcatgcacttgaactcaagtttcat
tgtgaagctgctacagcatatgggcagtctgtcattcagttattggagagcaataaagaa
aagtctatcttattgagtacttttccaaaacctgatttatctcatctttctttttatatg
cgcaaagttgtatctaatgcttctgttgctttaatgaagtatacagatcgtattcaacac
aatgcatttgcttttaataccctgggtttgttacttgagcaagagtgtttatttaagcaa
gcagaagaagcgtattcaagagcacgtttgtgttcaaatgaacccacatcaaatgaccaa
tcagaacaactaagaaatgttttactaaatcaagctcgagttctctgcaatctattgaaa
tttgaagatgcaatagaaatatacaaaatttgcagcttaaactcttccttagagctgtgc
cagcttgcttatgcttactacgcaacttctaaatggaaggagagtgttgaaacatatgaa
aaagcattattactgtcaacaaatagctatgaaaaggcatgcatacatactgctcttgga
caagtattttatttactaaaagatgttgaaacagcgaaatcacagtttttaaaaagcatt
caggttgataactcatgtgagtttggtgtaatggcacttgcctcgcttggtttgcttctt
ggtgatgcaactcttgcaacagtttctatttctgaactctcaaagcataaacaagatagt
gagaagtttgaaatcaagaaaacattattaatgtctactttttatatattccaggggcaa
ctaattcctgctcaacgtcaaatttctcgagcaataattcgttatccaatgaactcactc
ttatggtgttctctgtcaacatttttgatccagcattatcccagtaaaactttacttgca
gagcaatgttcaaaaataacagaaaatttacctcctactcatatgtcttcgatgttgcaa
gctttggtttcacttgtttttccgcgcaataatgattcattaaatgcagtaaaaagatat
gtccacagctacccccatcaaccagagagctgggcgttgttagcttcaacttgtttttca
cattgtgcgtcatatgaaagttataatcacaaaaagttagttacagggttagcgcatctt
gcattaactaaagtggatgaaataaatcaatcaatgcaattaaaaacgatccataatcgt
ttggatgaaactaaaatgcgtgcaactatgacgagactatactattggttaatgaaactt
tttgtcgtctcgcatatatattatggtgatgttttgctcgcgcagtcattctgcaaccaa
gtaatatcctctataagtaatgataaaaatctttctgaagattttatatttttaaaaggt
gtgagtctgttgcaagtaaagccaggaagcgacaaccaatctggtttagaaaatatacgc
tacttgtcgacaattacgcaaaatgctgaactgtggcggtggaaatttctttcacatttg
tacaaattttatcgaatgccgcttggggccgagttatgctaccatgaaatcatcaaactt
aatttacgacacaactgttcaaacttgtcaacttttcttaacatgtgtttgcttgctctt
cagacgttttatatttctaaagatattgattggttgaatcgtgctcagcaaactgttgat
gagctgctaaagcttaccgaagttgatccacatgtaattttctctcgagcaatgcttttc
tacctgcagggcaataagaaggccgcattaaagtatgtgcaaaagttgacgtccattgaa
gacaagtttataaaagaaacgcaacaacgcctgtcggttgtgtggagttaa

DBGET integrated database retrieval system