Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100204144
Help
Entry
100204144 CDS
T01080
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase MIB1
KO
K10645
E3 ubiquitin-protein ligase mind-bomb [EC:
2.3.2.27
]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
hmg04121
]
100204144
Enzymes [BR:
hmg01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
100204144
Ubiquitin system [BR:
hmg04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
Other single Ring-finger type E3
100204144
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
MIB_HERC2
SH3_15
Ank_5
Ank_4
zf-C3HC4_3
Ank_3
ZZ
Prok-RING_4
Ank_KRIT1
zf-C3HC4_2
DUF6241
zf-RING_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100204144
NCBI-ProteinID:
XP_047141502
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(3920873..3978439)
Genome browser
AA seq
987 aa
AA seq
DB search
MATAHNISIDVCLSSTIGSRIVRGLDWKWGKQDGGEGHVGTIRSFESNEEVVVVWDNGTA
ANYRCSENYDLRILDSGPSGIKHDGTICDGCRCQPIYGMRWVCADCNNYDLCSVCYHADR
HQLRHRFYRIFAPNGNEVLMEPRKKAKKLISRGIFPGARVTRGVDWHWEAQDGEAGRRGK
VVDIQNWSATTPRSAAYVAWDTGAKNLYRIGFEGMVDLKCISDAKGSPFYRDHLPLLGEN
LTTSQSMTKHWKIGDFVRVDLDLDIVQTLQRGHGGWADGMVEAMGSIGVVFGFDEDRDVI
VSYASGNKWIFNPSVLTCGISESDGQIDALSEEIRSLQFLILSSGIQDSNETNTSFTKRL
AVGDIVQILNDQEQVSNLQIGHGEWTDVMVATLGKIGCVTKVYHDGDLKVEVNGTSWTYN
PKCLKRISSRGTNSASKILHFLESHSSKDPAELFIKAAAEGNVKNLEELCHFPNFDINVL
YAGHTALQLACQNGKLESIKFLLQLNADVEVEDNDGDKAVHHATFYDESRTFALLKEANA
DLNSRNKRRQTALHVAVNKGHIGNIKALLDAGVHVNLQDSEGDTALHDAISKKRDDIVEL
LLNSGTDISLSNNNGFNSLHHAALRGNVKAVQLILEKKDKPWIVNEQKDDGYCALHLASL
NNHLEVAKLLIKLGHANVNIQNTNLQTPLHLTVQKQHEEIVKLLVSEGANVNVQDKDGDS
PLHEALRNHTLLRLKEMQSVKDVSKLLMGFGSQDFTKTSSTSIACFLAEHGAQLACKNNK
GQTPLDLCPDPGLCNALRQSYGQSIQKNKKMLETECVVCSDMPREVIFSPCGHLVACSGC
APRIKKCLICKELVQSRQRIEECLVCSDKPASVLFQPCGHIPACSACSSLMKKCVQCRGT
ILKMVPSIDLCGLKESSSSSLICNNDILLLEKQIQEMKEQTTCVVCLDRRKNMIFLCGHG
SCQVCGDQLSECPMCRKLIEKKILLFC
NT seq
2964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccactgcacataacatatcaatagatgtttgtttaagcagcactattgggagtcgt
atagtgcgtggtcttgattggaaatggggtaaacaagatggaggtgaaggccatgttggt
acaataagaagttttgagagtaatgaagaagtggtggttgtttgggataatggcactgca
gctaattatagatgttctgaaaattatgatttaagaatactagattcagggcctagtggt
attaaacatgatggtacaatatgtgatggttgtagatgtcagccaatatatgggatgcgt
tgggtatgtgcagattgcaacaactatgatttatgcagtgtttgttaccatgctgataga
catcagttgcggcatcgattttacagaatatttgcaccaaatggaaatgaagtactgatg
gaaccacgcaaaaaagctaaaaagttaatttctcgtgggatctttcctggtgcaagggtg
actcgtggagttgattggcactgggaggcacaagatggtgaggctggccgaagagggaaa
gtggttgatattcaaaattggagtgctactaccccccgtagtgctgcttatgttgcttgg
gatacaggtgcaaagaatctctatcgtattggttttgaaggaatggttgatttgaaatgt
atttctgatgccaagggatcaccattttacagagatcatttgcctttacttggagagaat
ttaacaacttctcaatcgatgaccaaacattggaagataggtgattttgtgcgagtagat
cttgatttagatattgtgcaaactctccagcggggccatggagggtgggcagatggtatg
gttgaggcaatggggagcattggagttgtttttggatttgatgaagacagagatgttatt
gtttcctatgccagtggcaataagtggatattcaacccatcagttcttacttgtgggatt
tcagagagtgatggtcaaatagatgcattaagtgaagaaatacgctcattgcagttcctc
attctaagcagtggaattcaggattctaatgaaactaatacatcatttacaaaaagactt
gctgttggagatattgtgcagatcttaaatgatcaagaacaagtaagcaatttacaaatt
ggacacggagaatggactgatgttatggttgctaccttgggaaaaattggttgtgttact
aaagtttatcatgatggagatttaaaggttgaagttaatggaacaagctggacttacaat
ccaaaatgtctaaaaagaattagttcacgtggaacgaactcggcatccaaaattcttcat
ttccttgaaagtcattcgtctaaagaccctgcggaattatttattaaagctgctgcagaa
ggcaatgttaaaaatttagaagagttatgtcattttccaaattttgatataaatgttctg
tatgctggtcacacagcacttcaacttgcatgtcaaaatggaaaattagaaagtattaaa
tttcttctccaattaaatgcagatgttgaagttgaagataatgatggtgataaagctgtc
catcatgcaacattttatgatgaaagtagaacctttgctttgttgaaggaggcaaatgca
gatttaaactctcgcaataaaagacgtcaaactgcattacatgtagctgttaacaaaggt
cacatagggaatatcaaagccttgcttgatgcaggtgttcatgtcaatttgcaagactct
gaaggagatactgcattgcacgatgctatttccaaaaagcgagatgatattgttgagctt
ctactaaactctggtacagatatttcgctgtccaataacaatggctttaattcattacat
catgcagccttaagaggaaatgtaaaggcagtccaactgattttggaaaagaaagataaa
ccctggattgtcaatgaacaaaaagatgatggatattgtgccttgcatttagcttcatta
aataatcatttagaagtagcaaagctcttaataaaattaggacatgccaatgttaacatt
caaaatacaaatttacaaacaccacttcatctgactgtacaaaaacaacatgaagaaatt
gtaaagcttcttgtttctgaaggagcaaatgttaatgtgcaagacaaagatggtgattca
ccactacatgaagctttaagaaaccatacgttattaagattaaaagagatgcaaagtgtc
aaagatgtttctaagttattaatgggatttggatcgcaagactttacaaaaactagcagt
acctcaattgcttgttttcttgctgagcatggtgctcaattagcgtgtaaaaataataaa
ggtcagactcctcttgatctctgtccagatccaggtttatgcaatgcgctcagacaatct
tatggacaaagtattcagaaaaacaagaaaatgttggagacagaatgtgttgtttgttca
gacatgccgcgtgaagttattttctcaccctgtggtcaccttgtagcatgttctggttgt
gccccacgaattaaaaaatgtttaatttgcaaagagttggttcaatctcgacaaaggatt
gaagagtgtttagtgtgttctgataaacctgcaagcgttctttttcaaccttgtggtcat
attcctgcatgctctgcatgctctagcttaatgaagaagtgtgtccagtgtagaggaact
atattaaagatggttccttctatagatttatgtggcttaaaagaatcttcatcttcatct
ttaatttgcaacaatgatattcttttattggaaaaacagattcaagaaatgaaggagcag
acaacgtgcgttgtttgcttggatagacgaaaaaacatgatatttttgtgtggccatgga
tcatgtcaagtttgtggtgaccaattatccgaatgtcctatgtgcagaaaattaatcgag
aagaaaattttgctattttgctaa
DBGET
integrated database retrieval system