Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100204927
Help
Entry
100204927 CDS
T01080
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1 isoform X1
KO
K08843
leucine-rich repeat kinase 1 [EC:
2.7.11.1
]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01001 Protein kinases [BR:
hmg01001
]
100204927
Enzymes [BR:
hmg01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.11 Protein-serine/threonine kinases
2.7.11.1 non-specific serine/threonine protein kinase
100204927
Protein kinases [BR:
hmg01001
]
Serine/threonine kinases: TKL group
LRRK family
100204927
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
COR
Roc
LRR_4
Ank_2
Ank_3
Beta-prop_LRRK2
Ank
Ras
LRR_1
Ank_4
Ank_5
Arf
WD40_2
LRR_14
BBS2_Mid
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100204927
NCBI-ProteinID:
XP_047142009
LinkDB
All DBs
Position
2:5865241..5961223
Genome browser
AA seq
2064 aa
AA seq
DB search
MNIADFPDILKDACLNNDVDKLSQCILIDKVLTIKLLKGDDFYKVKNMFGLEPIPNSYMY
IACEHNSFEIVKQLLLHGVCDVSSPSIKNKSPILVACEKGSLECLKEMVSFGISLHPSNT
VTKDSCIYVATFFGQTCVVEYIVNSNHDILEKVFEGGLGQSPDISYADIWVGLSSVAKTE
KKIKSGSLLLYIACLLKHFDIVKFLLAQGVNANEQLLSTKSFYSSMYVPLAVACKNNDLK
IAEILFENGAEITSSIANQYPDTTALLLQSHVKISSECDNSEGNFNFINTSSECYSLCWS
NLRLHKLHRHWLSNNSENIYMLDLHDNSIEDIPFDFFILLPNIKEVDLSCNLLRKFPDQN
ANLSKIIKVVARKNKLKILPLSLFNNPNITHIDFSANEIINLPTHPEKLWECTMLKYLRL
SNNKIISIPSSISGANSLEKLYLNDNLIQSFECSWKCPLSELDLSNNQLVEFCPSFQIQW
SDTLIKLNLSKNQIESISSSICHLQNLHYLDLSFNTLRVLPPPDLWKCESLCKLNLSHNL
LSASTHTDGFVGVDMNKLVEAMGANSNLSVITSCEFPVEIFSENLTNLDLSYNLLENIPE
SLYFLINIQELNLSNNPCLTVLPAELSLLKNVWNLRLSGLNIPDLPFELNDKNLAKQVMP
YLCAKLRKSVSFNRMKLMVVGLQARGKTTLVATLQGKKPPPNISTVGISVEQWSLALPQR
LSISFWRDTSNNEEIKFSCWDLAGQHVYYATHQCFLTSNTLYLIVFNVTHGREGVDSLAP
WLLNIQSRAPLSRVIIVGTHIDCLPVESKASTLSRLKDEILMKYDKKGFPLIANCNFVSN
ITSEGLVDLRIEIYNVAKLINESSSHGLSRKKAPLSYIQLYDRILKENEARKEKLLPPIL
NTDEMLQLAQQNPDNDIYTVEELVTASKFLHENGILLHFNDHMRELNTLYFIDPSWLCEM
LSLVVTVRERNPFVLDGYIKKTDLLLVLRNPRLPEKFIPQYLRLLERFEIVLQLDDERFL
IPSMLPIKKPDDVDCILQFSYENIKRNYFMHYIPPGFWSRLIARTIIALTRWGTGLSAEV
NEEDYKTIFWREGILVLFNNCYFLVESFVENLDNVDQVEKGIAITVASQQRNYSAMAFIV
DHLDALITEWYPGLEDVDEFGDSLVSKLIPCPICVSKLENNSLHKKYSFTLNVCALAAVN
HQHILCARHPDVSVPLNLLVPDLLLTDLPSEFVISSNNLDFNTAESNRLGEGGSGGVYLG
RYKDKQVAIKQFHSATTSRKLTITSEDVETSSMYIPETESSLKMQIEDTKVLKGFSELRQ
EVAILCRLKHPNIVNFIGVCYRPFCFLLELAPLGSLHSTLVKTKNDKDHSSMVGPLLGEL
LTLKIALQVARALNYLHDSEIVYRDLKSDNILLWSLNENDCINVKLSDYGISTFATPQGV
IGEGGTPGFQAPEVKTGCSYDEKVDMFSYGIWLYELVSGNRPYKEYRSPSEMKRAVQRGV
RPSLYKDKIDLKMPYIEELMKDCWQEKPNQRPSAYEVVSRLQNISTYLLKHILEDTNCLN
KITCVSKWLPENCCELKNQPLLLLWCQENSNRICIVVDIENKLVVKKVACAGPRVLCLLQ
VEKFIWLGTEGEQIEVFGPIGSTEERILWSIPLKDHVMSMILYQHQKHIKVLASLANGTL
AVFRRLQTYLHEKLSKFSRKADIVDFEKRKWSDVNLIDLETKLPAKCMVLTQFNTELWVG
SGNKIVVVDPLSLKIIECIEALRTRHSLITAMVTDESNVWITYRRSSIVTQWCVNTRCLL
YSFQCNSLNPLSQMLFTKSAPHIEKQETSLLSPESPESSESLPPDFKTKVSFFKTISNNS
DIENDADGFLVSCDSFTFNNVQELSESSVIKNLCDVEESLPESSLIKKFKHSQGLIFKTF
KNNSIKKKIINTVDVDDSSILRPRTSALSKKTNNENCYVTCLYYNGNALWIGRSLGDIII
LNTKINNEKFGCVIAHLDKMYDKQLNKSIRSTIAFAPLKEYNCLVSVIRIEDNVLEKCQL
YHYKAMNIDELFDVENKLFREFSL
NT seq
6195 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatagcagattttccagatattttgaaggatgcttgcctcaataatgatgttgat
aaattgtcccaatgcatattaattgacaaagtgttaacaataaaacttctgaagggagat
gatttttacaaggttaaaaatatgtttggtcttgaacccattcctaatagctacatgtat
attgcttgtgaacataatagctttgagatcgtcaagcagttgcttttacatggtgtttgt
gatgtcagttcaccatcaataaaaaataaatcgcctatacttgttgcttgtgaaaaagga
agtttagagtgtcttaaggaaatggtatcatttggaatttctcttcatccatcaaataca
gtaacaaaagactcatgtatttatgttgcaacattttttggtcaaacatgtgtagttgag
tatatagtgaactcaaatcatgatatattagaaaaggtttttgaaggtggattaggacaa
agccctgatataagctatgctgacatttgggtaggattatcaagtgttgcgaaaacagaa
aagaagattaaatcaggtagtcttctactttatattgcatgcctattgaagcattttgat
attgttaagtttttgttagcacaaggtgttaatgcaaatgaacaactactgtcaacaaaa
agtttttattcaagcatgtatgtacctcttgctgtggcttgtaaaaataatgatctgaag
attgcagaaatcttatttgaaaatggagctgaaattacttcttcaattgctaatcaatat
cctgatactacagctttattattgcaaagtcatgttaaaatatcatctgagtgtgataat
agtgaaggtaattttaattttataaacacaagttcagagtgctattcattatgctggagt
aatcttcgactgcataagcttcatagacactggctttcaaataattcagaaaatatatat
atgcttgacttgcatgataattctattgaagatattccatttgatttttttatcttgctg
cccaatattaaagaagtagatttgtcttgtaatttactaagaaaatttcctgatcaaaat
gcaaacctttctaaaattataaaggtggttgcacgtaaaaataagctaaagatattgcca
ctttcattgtttaacaatccaaatattactcatattgatttctcagctaatgaaattatt
aatttgccaacacaccctgaaaagttatgggaatgtactatgttaaaatatttgaggtta
tctaacaataaaattatttctattccatcatcgatttctggagctaatagtttagaaaaa
ctgtatctcaatgataacttaattcagagttttgaatgttcttggaaatgccctctgagt
gaactagatctttcaaacaaccaacttgtagagttttgcccatcttttcaaatacaatgg
tctgatactcttatcaaattgaatctttccaaaaaccaaatagaatccatttcatctagt
atatgccatcttcaaaatcttcattatcttgatttaagttttaacactctaagagttctg
ccaccaccagatttatggaaatgtgaatccttatgcaagcttaatctttcccataacttg
ttatctgcatctactcataccgatggttttgttggtgttgatatgaacaaacttgtagaa
gccatgggggctaacagtaatttgtctgttattacttcttgcgagtttccagtagaaata
ttttcagaaaatcttaccaatttagatttgagttataatttgttagaaaacattcctgaa
tctttatattttcttataaatatacaagagttgaatcttagcaacaatccttgccttact
gttcttcctgctgagctaagtctgttgaaaaatgtatggaacttgagactctctggcctc
aatataccagatcttccttttgagcttaatgataaaaatctagcaaagcaagttatgcct
tacttatgtgccaaacttcgaaagtccgtttcttttaacagaatgaaattaatggttgtt
ggtttgcaggcacgaggaaaaacaacattggttgcaacacttcaaggaaagaaacctcct
ccaaacatttcaacagttggaatatcagttgaacagtggagtcttgctttgccacaaaga
ctttctattagtttctggagagacacatcaaacaatgaagagattaagtttagttgttgg
gatttagcaggtcagcatgtttattatgcaacacatcagtgctttttgacttcaaatact
ctctacttgattgtttttaatgtaacgcatggtcgagaaggggtagactcgcttgcacca
tggttgttaaatatacagtctagagctccactgtcacgtgttataattgttggtacacac
attgattgtctacctgttgaaagtaaagcatcaactctttcaaggttgaaagatgaaata
cttatgaaatacgataagaaaggatttcctcttattgctaactgtaattttgtctctaat
atcacaagtgaaggtcttgttgatcttagaattgaaatatataacgttgctaaactgatc
aatgaatctagtagtcatgggctatccagaaaaaaggctcctttaagttatattcaatta
tatgaccgcatactaaaagaaaatgaagctaggaaggaaaaactcctaccaccaattctt
aatactgatgaaatgttacagcttgctcaacaaaatcctgacaatgatatttatactgtg
gaggagttagtgacagcttcaaaatttcttcatgaaaatggaattttattgcactttaat
gatcacatgcgtgaactgaacacattatattttattgatccatcatggctttgtgaaatg
ctttcacttgtagtaactgtgagagagcgtaatccatttgttttagatggatatataaaa
aaaacagatttgttattagtactcagaaatcctcgtttaccagaaaaatttattcctcag
tatttacgcttacttgaaagatttgaaattgtgttacaattggatgatgagagatttttg
attccttcaatgcttccaattaaaaaacctgatgatgttgattgcattttgcaatttagt
tatgaaaatattaaaagaaattatttcatgcactacataccacctggattttggagccga
cttattgcacgaactattattgctcttacgaggtggggaacaggtttaagtgctgaagta
aacgaagaagattacaagacaatattttggagagaaggaattcttgttttattcaacaat
tgttatttccttgttgaaagttttgttgaaaatttagacaatgttgatcaagttgaaaaa
ggtattgcaattactgttgcatcacaacaacgcaattattctgctatggcatttattgtt
gatcatttagatgcgttaataacagagtggtatccagggcttgaagatgttgatgaattt
ggtgattcacttgtcagcaaattgattccttgtcctatatgtgtttccaagcttgaaaac
aattctcttcataaaaagtattcttttactttaaatgtttgtgcattagctgcagtaaat
catcaacacatcttgtgtgctagacatccagatgtttctgttcctttgaatttacttgta
cctgatttgttgttaactgatttaccttctgagtttgtaatttcttcaaacaatttggat
tttaacacagctgaaagtaatcgattaggtgaagggggttcaggtggtgtttatttaggt
agatacaaggacaaacaagttgcaatcaaacagtttcattctgctactacctccagaaaa
ttgactataacatcagaagatgtagaaacaagttctatgtatataccagagacagaatct
tctttaaaaatgcaaattgaagatacaaaagtcctgaaaggattctcggaactcagacaa
gaggttgctatactgtgtcgccttaaacatccaaatattgtgaattttattggagtatgt
tatagaccattttgctttctgctagaacttgctccattgggaagtctacactctactctt
gttaaaactaaaaatgataaagatcattcatctatggttggtccactgttaggagagctt
ctcactcttaaaattgctttacaggttgctagggctttgaattacctgcatgactccgaa
attgtttatagagatttgaagtctgacaatattcttttgtggtcattaaatgaaaatgat
tgcattaatgtaaagttgtctgattatggtatttcaacatttgctactcctcaaggagtt
attggtgaagggggaacgcctgggtttcaggctcctgaagttaaaactggttgctcatat
gatgaaaaggtcgacatgttttcttatggtatttggttatatgaacttgtgtcaggtaat
cgaccttataaagaatatcgatctccttctgaaatgaagcgagctgtacagagaggtgtt
agaccaagtttatacaaagataagattgatttaaagatgccttatattgaagaacttatg
aaggattgttggcaagaaaaacctaatcagagaccttctgcttatgaagtagtaagccgg
ttacagaacatatcaacatatcttttaaaacatatattggaagatacaaattgtttaaat
aaaattacatgtgttagtaaatggttaccagaaaattgttgtgaattgaaaaatcaacct
ttgctattgttatggtgtcaagaaaatagcaatagaatatgtatcgtggttgacattgag
aataaacttgttgtcaaaaaagtagcttgtgctggtcctcgtgttttatgtttgttgcaa
gttgaaaagtttatttggttgggaactgagggtgaacaaatagaagtgtttgggccaata
ggatcaacagaagagcgcattttatggagtatacctctaaaagatcatgttatgagtatg
attttataccaacatcagaagcacataaaagttctagcatctcttgcaaatggtactctt
gcagtgtttagaagactacagacttatttacatgagaaattatcaaaatttagtcgaaaa
gcagatatagttgattttgagaaaagaaaatggtcagatgttaatttgattgacttagag
acaaagctacctgcaaaatgtatggtgctcactcaatttaatactgaattatgggtaggc
tcaggtaataagatagtagttgttgatcctttgtctttgaaaataattgaatgcatagaa
gcactacgaacacgtcactctttaatcactgctatggttacagatgaaagtaatgtatgg
attacttatcgacgttcatctattgttactcaatggtgtgtaaacacacgttgtttactg
tattcatttcaatgtaatagtttgaatcctctttctcaaatgctttttactaaatcagca
ccacatattgaaaaacaagaaacaagtttattatctcctgaatctcccgaatcttccgaa
tccttacctcctgattttaagaccaaagttagtttttttaaaacaatatcaaataattca
gatatagaaaatgatgctgatggttttttagtttcttgcgatagttttacatttaacaat
gttcaagaattgtctgaatcatctgtaataaaaaatttgtgtgacgtagaagaatcctta
cctgaatcatctttaataaaaaaatttaagcatagccagggtttaatctttaaaacattt
aaaaataattcaattaaaaaaaaaatcataaacacagttgatgttgatgattctagtatt
ttgcgtccaagaacatcagctttgtcaaagaaaacaaataatgaaaattgttatgttact
tgtttatattataatggaaatgcattatggataggtcggtcacttggagatattataatt
ttaaatactaaaataaataatgaaaaatttggctgtgtgattgctcaccttgataaaatg
tatgataaacagttgaacaaaagcatacggtcaactattgcttttgcgccattgaaagag
tataattgcttagtatctgttatccgaatagaagataatgttttagaaaagtgtcaactt
tatcattataaagctatgaacatagatgaactttttgatgttgagaacaaactttttaga
gaatttagtttatga
DBGET
integrated database retrieval system
