KEGG   Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100205608
Entry
100205608         CDS       T01080                                 
Name
(RefSeq) polycystic kidney disease protein 1-like 2
  KO
K04986  polycystin 2
Organism
hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   03037 Cilium and associated proteins [BR:hmg03037]
    100205608
   04040 Ion channels [BR:hmg04040]
    100205608
Cilium and associated proteins [BR:hmg03037]
 Primary cilia and associated proteins
  Other primary cilia associated proteins
   100205608
Ion channels [BR:hmg04040]
 Voltage-gated cation channels
  Transient receptor potential channel (TRP)
   100205608
SSDB
Motif
Pfam: REJ PKD_channel Polycystin_dom PLAT PKD GPS ELMO_ARM
Other DBs
NCBI-GeneID: 100205608
NCBI-ProteinID: XP_047142860
LinkDB
Position
11:8726109..8840797
AA seq 2889 aa
MIIIIITIISNELCLLLVIFLNILIFFLVLSGCTNDSSTDFQLTASGYHVESNISCVSVC
NSYNPPVFIYAFFLEGQLCFCRNGSLPPLNISNFNSLCIRNTCLSDTAANCFLSNYEVLP
LTLGIVEWNITFYPPILLVDNEVQIKTNILKGDASSAFVRPVPNKFLSDVQTVNQMTMKK
HFYLPGLQQWSQEVGNNFTNPFVTTTWLQVDEKVGGIFVIPSMVSIDGFYNFLLVITQGT
NMNVTLSLPKNKTLFFNADVIHLTYGLDIPLIYTSSGQTCSLSRGFILKQVVLTSGYFTK
VKLKVSAVGVLEIAILRPICTNFTIFCSFTMECAKNCFLMNLLEDEVVVLNPSIITALVV
TKFLFLLNVTGIIEIPIQNKNNEIQENDMIWIGGNASLFCNGVINEKVQVAEAGKTMTFS
TNCITNNDFFISLLISNSFEYFIPTQSYTTSLFNFRVDASNHIPSFQQLNYSFKFQVPVS
GLRFAEQLPVSKFVAGYKPNTLVTLKAEIDSGSDVTYTFSIPKINYFRNASNENQFSHAF
TNLGVYSVFLTAANTLNSINTSIDISILSEVSRIYLYVEKNQLQDREFNATIQIFNGSNV
DLTVDFGDSSPVINITSIDATPVNGFVFTVAHKYSVCNNFTINASARYIFANSLGILNTA
IFFNSTDLTVFCPLSRLNVITTPNVSLNGYVYLHLSKSLILNINQNSGSFILYKVVWGDS
TYEIKNQTMNWNPVLFQVEHMYYKEGKYTVNVTSHNLLQTSYTLIKVEVRYCSAPEVSFF
YGTISSPVSIIRSVGANITAVVENISKVCPLENYSFEWNLAGAVSTSTVTFGFLSPQKVT
YTIAKNSLDIGLYKLSLQYNYGDVSNVYVAYLNVTFSPLYMEIDNGFFASIKYKRNNRYG
ISYQNFTISAKSSFDPDDPIAGIINITFNWKCKVASNFSVAQEVMERYKTLNLNFSSDTC
FNQNWISISSFTSEVTFSTQQFLEGISYHIEVCGTKYAGNNLDSVHVNKTGCFSQQLEII
SGDLPTIFARCMSNCDSKLNFMEPVIYSYVCEDCGSQKLIAEWRITDDTGNVPSEVMSKG
ATLTGFLTPSLVINKDILLESKNYTFTLDVGFADSLKHVIFKFTKATCSRPSSGVCYIYP
TEGFALETIFKLLCKDWRDSDGFLSYKFSYDDNPSQRLRYSSSSKVDYPRINIASTEQPS
LINFIMGPGYENNDYNISIIIEVCGKYNAYTKYKLWIKVHPSNKPINLQELVMGVSFNDV
QVITNIVQAVSSTINKIEPSYYKNNGSPLNELEDTGNGGQESHSHLRTKMIDLLSKTPIN
NLYFFKSISDTLTLLSHKPKELVPQSQNQAADIVKKLGDLLTKENLRVVGPKKFETLTQP
FVNSISKLFEANTPDTSSDEILSTTQTTTSTSSSNAEENENVGSRLFKCLDIYFMTLLSY
KVPGESATTQETKQFSFILKKDYVSSLSNTSIGSSEGGFILPDSKDMFNDSIANAEILIQ
NVRMKDNAYTWDSNRSQNILSETQSLSFSDSNGRPIKVSNSLQPINIAIQNIPEKMSGKN
ISLSMPNDIYQVKLPFLSDCNLLLNFVFKNDLNNLTNLIVYIQYGKVTTKLDFDIMLNIS
TNYGVVMTKNNISVFNAIVNNTTHEHRKNISSVLLRNQNARLLDDGTLILWNFSNSTYSF
LNKSELHLSFSYEGPIPDEKLDLNTYTFDAAESFGTFDYEMKSFCAECNYWNEDSNKWMS
DGCQFDVETSTFLVTKCKCNHLTAFGGFFVAPNPIPTPSLAMLKHGYVLLVTVGVIILLW
ILGLIFARKMDNKDISKVGVCPLLDNQIGESYLYQIIVNTGSQRNAGTKSNIFLTVFGEN
SDSGVRRLKDSERQCFQRSSCDVFIMTTQSSFGDIDFIRLWHDNSGGGWYLNNIIITDLQ
TDKQFLFIGHRWIAVDRGLCTLDCVIPTASAEETSDFKYIFTTKTSHDLSDKHLWFSIFA
RPPKSNFTRCQRLSVAVSLLMTSMMASTLFYGRIPPADPSVENKIGSFSFTWTQVYVALI
STCITIPVNIVLVQLFRTIKPFENIIKENSNEVQHWNEADELQEKNSCSSEFINSNNEKT
TTILIEKDKPSLLKEEKKKYLPPWCLYIAWFICVSSIFGCGFIILLNGMAFGNRKSLNWL
SSVSIGFVKDIFFIQPIKIFFLSIFVALIVKKIEEESCEVEIQGKMLAHDESWLHKPKNK
ATIFDRVDIEFKPPDCTTILKMREMGFKNMKMYSIIQEIVLYFFYAILVFFIGYMTREDF
AFYQTRNVEELFNLRLRHGVSYPDGTVFNQIQSSKDFWPWMEKLFLPQIYPDPWYNLSAF
YGNSETKNFPGKLFLNDLNSKIVNGIRIRQVRVLPNSCIKAESIVGYLELDCLSPYKSIV
EEKRDFYFNWSLPIKYKSAINPSTMPWRYQTWKDLDGYPYAADLNTYYGGGYVIEFFPKW
KNQYTLDKAKNHKWIDRQTRAIIIEFALFNPATNYFSMVTMVLEFLASGGVLPDFSVHTF
KLYSSTKGTGVAMLGSQILFIIMMLLFSIRECRFLYRTGWRYFLEFWNLVEVALILLSVV
AVGFFFYKNHLAKVLLQRMPAKKPQSFINFQFASYWDLTYLYIVSLIVFFVTLKFIKLLR
FNRRVSMLSSTLKAAWYPLSMFGIIFLIVLCSVISSASIVFGMLLEGYQNYFKTIASIIS
LLLGKFSYSQFENANSVLGPVFFFGFNVMVNWIIMNMFLSILNDVFAVVCTNIEYQNNDY
EMVDFVMEHFKDWFGWHSSKETELKLAIDTKVFDADKNNLLPVHYKEKSNYRKNKVKVNF
NKVNNKRYFDLKILLDEKLSKLRDYLEENELDIKADETLYKFINCINLLSFDGTEEVNLN
EPVTMEVKN
NT seq 8670 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcatcatcattatcaccatcataagtaatgaattgtgtttgttacttgtgattttt
ttgaacattttaattttctttttagttctctcaggttgtacaaatgacagttctacagat
ttccaattaacagcaagtggttaccatgttgagtcaaatatctcatgtgtcagtgtttgc
aattcttataatcctccagttttcatttatgctttttttcttgaaggtcaactctgtttc
tgcagaaatggttcacttccaccattaaacatatctaactttaatagcctttgtataaga
aacacatgtttgagtgacactgctgctaattgctttttaagcaactatgaagttttacca
cttacattaggtattgttgagtggaacataactttttatcctcccattttacttgtggat
aatgaagttcaaataaaaacaaatatcttaaaaggtgatgcgtcaagtgcatttgtgaga
ccagtaccaaataaatttttatcagatgttcaaacagtcaatcagatgacaatgaaaaag
catttttatttacctggtttgcagcagtggtcacaagaagtaggaaataattttacaaac
ccttttgttactacaacatggcttcaagttgatgaaaaagttggtggcatttttgtcatt
ccatccatggtttcaattgatggtttttataacttcttgttagttattacacaaggaaca
aacatgaatgtaactctttcacttccaaaaaataaaactttattttttaatgcagatgtt
attcatttgacatatggacttgatatacctttgatttatacctcctctggacaaacatgc
agtctttcaagaggatttattttaaagcaagttgttttaacatctggttattttacaaaa
gttaagttaaaagtctcagcagttggagtcttagaaattgctattttgcgaccaatatgc
accaattttaccattttttgttcctttaccatggaatgtgcaaaaaattgttttttaatg
aatttattagaagatgaagttgttgtgctaaatccatctataattacagcgttggtcgta
acaaaatttttattcttgttaaacgttactggaattattgagataccaattcagaataaa
aataatgaaattcaagaaaatgacatgatatggataggtggaaatgctagtttattttgt
aatggagttattaatgaaaaggtacaagttgcagaggctggaaaaacaatgacgttctct
actaattgcattactaacaatgatttctttatatcacttttaatatcgaattcatttgag
tactttattccaacgcaatcatacacaactagtttgtttaattttagagtagatgcttct
aatcatattccatcttttcaacagctaaattattcatttaagtttcaggttcctgtttct
ggtttgcggtttgctgaacaattgccagtatcaaagtttgtggctgggtacaagcctaat
acattggtaactttaaaagctgaaatagacagtggatcagatgttacatatacatttagt
attcctaaaattaattattttaggaatgcatcgaatgaaaatcaatttagtcatgctttc
actaatctaggtgtttactcagtgtttttgacagctgccaatacacttaactcaataaat
acttcaattgatatttctatattatcagaagtaagtagaatatatttgtatgttgaaaaa
aatcagctacaagatagggaatttaatgcaacaatacaaatatttaatggaagtaatgtg
gatttgacagttgattttggtgattcatcaccagttataaatattacaagtattgatgct
actccggttaatggttttgttttcactgttgcacataaatattctgtatgcaataacttt
acaatcaatgctagtgccagatacatttttgcaaactctcttggaattttaaacactgca
atttttttcaattctacagacttgactgttttttgcccattgtctagattgaatgttata
acaactccaaatgtttcactaaatggttatgtttatttacatcttagcaaaagtttaatt
ttgaacatcaatcaaaattcaggatcatttattttatacaaagttgtttggggagatagt
acttatgagattaaaaatcaaacaatgaattggaatcctgttttatttcaagtagaacat
atgtattataaagaagggaaatacactgttaatgttacatctcataacttattgcagact
tcatacaccttgattaaggtagaagtgaggtactgttcagcacctgaggttagttttttt
tatggaactatttccagtccagtgagcatcattcgaagtgttggtgcaaatattacagct
gttgttgaaaatattagcaaagtgtgtccacttgaaaattacagttttgaatggaatctt
gcaggtgctgtttcaacctctacagttacttttggttttttatctccacaaaaagttact
tacacaattgcaaaaaattcacttgatattggtttgtataaattatcattacagtataac
tatggagatgtttcaaatgtttatgttgcatatttaaatgttacattttctccactttat
atggaaattgataatggattttttgcttctataaaatataaaaggaataatagatatggc
atttcctaccaaaactttacaataagtgctaagtcaagttttgatccagatgatcctatt
gcaggaataataaatatcacttttaattggaaatgtaaagttgcttcaaatttctcagtt
gctcaagaagttatggaaagatataaaactttgaacttgaatttttctagtgatacatgc
tttaatcaaaattggattagcatttcttcctttacttctgaagttacttttagcacacaa
cagtttttagaaggtatcagttatcatattgaagtttgtggtacaaagtatgcaggaaat
aacttagattcagtgcatgtaaataaaacagggtgttttagccaacaacttgaaattatt
tctggtgaccttccaactatttttgcaaggtgcatgtcaaactgcgattcaaaacttaat
tttatggagccagtaatttattcatatgtatgtgaagattgtggttctcaaaagctaata
gcagaatggaggataacagatgatacaggaaatgttccttcagaagttatgtctaaaggt
gctacattaactggtttcttaactcctagccttgtaattaataaagatattctgcttgaa
tcaaaaaactacacatttacattagatgttggttttgctgattcattaaaacatgttata
tttaaatttacaaaagctacatgctctcgtccatcttcaggagtttgttacatttatcca
actgaaggttttgctcttgagacaatttttaaacttttgtgtaaagattggagagattct
gatggctttttgagctacaagttttcttatgatgacaatccatcacagcgattaagatat
agcagttcatcaaaggttgattatcctcgtataaatattgcatctactgaacaacctagc
ctaattaattttataatgggtccaggttatgaaaataatgattacaatattagcataatc
attgaagtatgtggtaaatacaatgcgtacacaaaatataaactttggattaaggtacat
cctagcaataagcctattaacttacaagaactggtaatgggagttagtttcaatgatgtg
caagttattactaatattgttcaagcagttagttctactattaacaaaatagaaccaagt
tactacaaaaataatggatcacctttaaatgaattggaagatactggcaatggaggtcaa
gaatctcattcacatttacgcacaaaaatgattgatttgctcagcaaaacacctatcaac
aatttatatttttttaagtccataagtgatactttgactttgttatcacataaaccgaaa
gaattggttcctcaatctcagaaccaagcagctgatattgtgaaaaaactaggcgatctt
cttaccaaagagaatcttagagttgtggggccaaaaaaatttgaaactttaactcaacca
tttgtaaattctatatcaaaattgtttgaggcaaatacaccagacacttcatcagatgaa
atactttccacaacgcaaacaacaacatcaacatcatcatcaaatgcagaggaaaatgaa
aatgttggatctaggttgtttaaatgtttggacatatatttcatgacattgttatcttac
aaagttccaggtgaaagtgcaacaacgcaagaaacaaagcagtttagttttatattaaaa
aaagattatgtaagcagcttaagcaatacttcaattggttcatctgaaggtggttttatt
ctaccagactcaaaagatatgtttaatgattctatagcaaatgcagaaatcttaattcaa
aatgtcagaatgaaagataatgcctacacatgggatagtaatcgctcacaaaacattctc
tctgaaactcaaagtctttctttttctgattctaatggtcgtccaataaaagtgagcaac
agcttacaaccaatcaacattgctatacaaaatattcctgaaaaaatgagtggcaaaaat
atatctttatcaatgcctaatgatatatatcaagttaagctaccatttttatcagattgt
aacttgctcctaaattttgtatttaaaaatgatctaaataatttaacaaatcttattgtt
tacattcaatatggaaaagttacaacaaaacttgattttgatattatgttgaatatttct
actaattatggtgttgttatgacaaaaaataacataagtgttttcaatgctatagttaat
aatactactcacgagcatagaaaaaatatttctagtgttttacttagaaatcaaaatgct
cgtcttcttgatgacggcacactaatattgtggaacttttcgaactcaacgtattctttc
ttaaataaaagtgaattgcatttatcattttcatatgaggggccaataccagatgaaaag
ctagacttaaatacatatacttttgatgcagctgaatcttttggaacatttgactatgaa
atgaaatcattttgtgctgaatgtaattattggaacgaagactcaaacaaatggatgtct
gatggatgccagtttgatgttgaaacgtctacatttttggtaacaaaatgtaaatgcaac
catttaacagcttttggtggtttttttgtggctcctaatcccataccaacaccttcatta
gcaatgttaaaacatggttatgttcttcttgttactgttggagttattattttgctttgg
atacttggattaatatttgctcgcaaaatggataataaagatatttccaaggttggtgtt
tgtccacttcttgataaccaaattggtgaatcttatctatatcaaataatagtaaatact
ggaagccaaagaaatgctgggaccaaatctaacatctttttgactgtatttggtgaaaac
agtgacagtggagttaggcgtttgaaagattctgaaaggcaatgttttcaaagatcaagc
tgtgatgtatttataatgactacacagagttcatttggtgacattgattttatacggctg
tggcatgataatagtggtggaggttggtacttaaataacattattataactgatcttcaa
actgacaagcagtttctttttattggtcatcgttggattgctgttgatcgtggcttatgt
actttagattgtgttataccaacagcatcagctgaagagacttcagattttaaatatatt
ttcacaactaaaacaagtcatgatctttcagacaaacatttatggttttcaatatttgct
cgtccacctaaaagtaattttaccagatgccaaaggttgtctgttgcggtatctttgtta
atgacttctatgatggcaagtacattattttatgggcgaattccaccagcagatccatca
gttgaaaacaagattggtagcttttcattcacatggacccaggtttatgtagctttaatt
agtacatgtatcaccatacctgtaaatattgttcttgttcaattgtttcgaactataaaa
ccatttgaaaatataataaaagaaaattcaaatgaagtccaacattggaatgaagctgat
gaattgcaagaaaaaaattcttgttcttcggagtttattaacagcaacaatgagaaaaca
acaacaattctcattgaaaaagacaaaccatctctattaaaagaagagaaaaaaaagtat
ctacctccatggtgtttgtacatagcatggtttatctgtgttagcagcatttttggttgt
ggtttcattattttgttaaatggaatggcttttggaaatagaaaatctttaaattggcta
tctagtgtatctattggatttgtgaaagacatattctttattcaaccaataaaaattttc
tttttgtcaatttttgtggctcttatagtaaaaaaaattgaagaagaatcatgtgaagtg
gaaatacaaggtaagatgttagctcatgatgaaagttggctccataaaccaaaaaataaa
gcaacaatttttgatcgagttgatattgagtttaaaccacctgattgtactacaatatta
aagatgcgagagatgggatttaagaacatgaagatgtactcaataattcaagaaattgtt
ttgtactttttttatgcaatattggtgtttttcattggctatatgacacgtgaggatttt
gctttttatcaaactcgcaatgttgaagaactttttaatttacgattgaggcatggagta
tcatatcctgatggtacagtttttaaccagattcaatcatcaaaagatttttggccatgg
atggaaaagcttttcttaccacaaatttaccctgacccttggtataatttgagtgctttt
tatgggaattcagaaactaaaaattttcctggaaaactgtttttaaatgatcttaactca
aagattgtgaacggaataagaattcgacaagttcgtgtgctgccaaattcctgcattaaa
gctgaatcgattgttggttatttggaacttgattgtttgtccccatataaatctatagtt
gaagaaaaacgagatttttattttaactggtcacttccaataaaatacaaatctgctatc
aatccatcaacaatgccttggagatatcaaacttggaaagatcttgatgggtacccatat
gcagcagatttgaatacttattatggtgggggttatgtcatagagttttttccaaagtgg
aaaaaccaatacacactagataaagcaaaaaatcataagtggattgatagacaaacacga
gctataataattgagttcgctttgtttaatcctgctacaaattactttagcatggtcaca
atggttttagaatttcttgcttctggtggagttttgcctgatttctctgtacatacattt
aagctatattcttcaacaaaaggaactggcgttgctatgttgggttcacaaattttgttt
attataatgatgctgttgttttctattcgcgaatgtcgttttttatatcgaactggttgg
aggtactttcttgagttttggaatttagtagaggttgctttaatacttttatccgttgtt
gctgttggatttttcttttataaaaatcatttggccaaagtgttattacaaagaatgccg
gctaaaaaaccacaatcatttatcaactttcaatttgcatcttactgggatttaacatat
ttgtacattgtatcactcattgttttttttgtaactttgaagttcatcaagcttttgcga
tttaatcgtcgtgtttcaatgctttcttcaacattaaaagctgcatggtatcctttgtca
atgtttggaattatattcttaattgttctatgttcagttatatcttctgctagcattgtg
tttggtatgctgttagaaggatatcagaactactttaaaactattgcatcaataatttca
ttattattgggaaaattcagttatagtcaatttgaaaatgctaactctgttcttggtcca
gttttcttttttggttttaatgtcatggtaaattggataattatgaacatgtttttatct
attcttaatgatgtttttgcagtagtctgtacaaacattgaataccaaaataatgattat
gagatggtcgattttgttatggagcattttaaagattggttcggatggcattcttccaaa
gaaacggaacttaagttggctattgacacaaaggtgtttgatgctgataaaaataatcta
ctacctgttcattacaaagaaaagtcaaattatagaaaaaataaagtaaaagttaacttc
aacaaagtgaataataaaaggtattttgatttaaaaattctgctcgacgagaaattatct
aagttacgtgattatttggaagaaaacgaacttgacattaaagcagacgaaaccctttat
aagtttatcaattgcattaacctcctctcatttgatggcaccgaagaagtaaatttgaat
gaacctgtaaccatggaagttaaaaattag

DBGET integrated database retrieval system