Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100205884
Help
Entry
100205884 CDS
T01080
Name
(RefSeq) HEAT repeat-containing protein 5B
KO
K24814
HEAT repeat-containing protein 5
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
hmg04131
]
100205884
Membrane trafficking [BR:
hmg04131
]
Endosome - Golgi transport
Others
Aftiphilin/p200/gamma-synergin complex
100205884
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laa1_Sip1_HTR5
HEAT
TOR1L1_N
HEAT_ECM29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100205884
NCBI-ProteinID:
XP_002158974
UniProt:
T2M3I3
LinkDB
All DBs
Position
5:37558790..37664162
Genome browser
AA seq
1993 aa
AA seq
DB search
MENLETWLAEENSIIQKEDSEKQVYLYDWLYRLNEYLLSKGSSEQGELKSIQPKIITTLH
KIVEINCSPTTRTQLAKCFATVYHTGTTLGLFDSVSKCIDLIKSRDDSPNQLPVKLTAIC
CMGSIYRKLGRMVGALFDAALQVLLKLIYKAEPHAKCEILLCFENMLHGMGSASKDGHKD
ICKACKATLIDKCLPVRWAGAKCALELTKHADFMFTSELDSMVSACLRGLEGSNYDVRVQ
IAQLFGVLMAGSQTHQPPSGVTKGKKTTEDMFNIMASAFLKGGSGFLRNGVESGMNREIR
IGVTQAYVVFFREMGSIWVAKHLGEIISHILELVASQKSTSSHIDNVYSRKCISFILNSV
LCGMLPESSKIQAIKELCKIILKQIEVIHGLITSENNSELIISNMDVRSTQYVLVCALSE
LSNLILALTSSIKSIMEEIVDAVFSTLTHPAPAVWLSAAWCIRSCGIALPSNITHLIDQC
VKKMKTLRFSADTVAGYGYTLSGIIGGLHMCPLGLPFKKAQAVFIFTEEIFKSASTNSKL
LQTGWVLLGSLCTLGPSFAKKNLPSMLDLWMSVFSFEKSDPNVDKGKGNVKTWQLTIENR
ANALCSMSSFIKHCKSLLVPDVLKKVMIPVESALSFLLQFQMLLKIHGPQLRPAIAMFKS
RLYCILLMLPANLFEGFFTPLLRNLAADFTLVDQGSVTTSLLQSLCHKDDNILLGSWVQE
TDYKDVEEQLQLNSAAGSGALEHDSFCIYSNLSEGEKIPGPLPLGVAVVDAAINLFGKLF
PYLPSKHCAQLMNHFNDCIIKNKGARQQAIHTNIFTAFLAALKNLSDSKSSFDDTTTLTH
AKTLILEALGNTDNILRCAAGEALGKLAQVMNDRNFVALMAQNSFDKCQKMSDAYVRTGH
ALSLGCLHRYVGGMESGQHLGNSVSILVALAKDVSSSLVQVWSLHGLTSIADSGGPMFRT
YVDQSFFTVIDLMLNTPSSAIEVHHCLGKCVNALITAIGPELQDDSKKMLRTRMFCMSAC
SIMQNHPDSFVQSESIHCLQQLHLFAPDLVNLSSLVPFLCNILLSPHLLLRKASIECLRQ
LAHREAKDISQWSKSTIANNPDIVKKMFNANYGLEGLLFSLLDAEVDIYILKHIREIISS
LLIALVDKELKSWLSLCKQVVLASNINEEQNENFGSGAGAADEDEEEDGQIVLNSKSNDT
PIITPKWPTRVFAMECLRMIIDVCKNYTEHMDLKEARKLKNNENEYLVMQLSELVRMAFI
AGTSSNDLLKLEGMKMLQDVVVLFANVPDPDTNNEQLILEQFQAQVDTALRPAFASNVPP
DVTAMACEVCSSWIGFGISKNVADVRRIQQLLVNSLVKIGKVDDVNRELYSESAYTLENL
AVLKAWAQIYIMAMNNEKELKSSDENISLGCLLDLIKGDLRLLVKHWLNALKDFVILTLP
QQYESQLPQQGGVFYSSETADSVRPHYKLCWPPIVHATALWLSSVSFQNSTEVLVGAEHE
VKTLNAIDPVKKTIEEVNTDRFYLLSGICVEAMCSPLSLYPVGTIEACASSFNALLSSHF
GRCIIGNNKILSIELLTVLHRLLLSRDEPSFQLIVLEIVFKCSTALGESSEPTEDEIVVK
KSVLFNILEICCYMVKRYAYSVMPEEIWKSLRTPRKLEFSASIMEVLAFVSSILSGIPKL
CTFSSSVVCLPTILFLLSSIFKYIVLNINENFSHESFLRTALTTLTQSFKEVITSPHALH
EENKEVWGSLIQSCLLSVLQTANAYTPCDNATHSVIITVWENIMIVVSVFVLFSPSNISN
SMLLSSCTNLFSGCIQKAPSKLRLLTLKIVGSIIKSPISCLSIPFIHECIPLVYDILETT
HSKRPGSESELLCCKESINLIEFILSIVEEDKRTLVMSVYIPALVPLLYDSTSLGKANSF
SRSLHDFCIQRLTATGPLYPISFKTCMANFPELKSKLTEGIKANESVKQKKNIIKGNDVQ
PQIKLKMDFSNFK
NT seq
5982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatcttgaaacatggctagcagaagaaaactcaattattcaaaaggaagacagt
gaaaagcaagtatatttgtatgactggctttatagactcaatgaatatcttcttagtaaa
ggttcttcagagcagggtgaattaaaaagtatacaaccaaagatcatcactactcttcat
aaaattgttgaaattaactgtagccctacaactagaacacaattagcaaaatgttttgca
actgtttatcatactggaacaacattgggtttgtttgacagtgtaagcaaatgcattgac
ctaatcaaaagtcgagatgactcacctaaccagcttccagtgaagttaactgcaatatgc
tgcatgggaagcatttatagaaaacttggaaggatggtaggagcacttttcgatgcagct
ttacaagtgttgcttaagcttatatacaaagcagagccacatgcaaaatgcgaaattcta
ctgtgttttgaaaacatgttacatggaatgggtagtgcttcaaaagatggccataaagac
atttgtaaagcttgcaaagccacccttattgataagtgtttgccagtgcgttgggcaggt
gcaaagtgcgccttggagttaacaaaacatgcagattttatgtttacatcagaattagac
tcaatggtatctgcatgtctcagaggtttggaaggttcaaactatgatgtcagagttcaa
attgcacagttgtttggtgttttaatggctggttcccagactcaccagcctccaagtgga
gtcactaaaggaaaaaaaactactgaagatatgtttaatattatggcttcagcattttta
aaaggtggtagtggcttccttaggaatggtgttgaatctggtatgaatcgtgagatacga
attggtgttactcaggcttatgttgttttcttcagagaaatgggttcaatttgggttgca
aaacacttgggagaaataatttctcatattttggaattagtagcaagtcaaaaatcaact
tcatcgcatatagataatgtttattctcgaaagtgcatttctttcattttaaattctgtg
ctttgtggtatgcttccagaatcttcaaagattcaagccatcaaagaactttgcaaaatt
attttaaagcaaatagaggtcattcatgggttgataacatctgaaaataattctgaattg
attatttctaatatggatgtacgaagtactcaatatgttcttgtctgcgcattatctgag
ttaagcaatcttatcctagcgcttacatcatctattaaatccataatggaagaaattgtt
gacgctgttttttcaacacttactcacccagcaccagctgtttggctatctgctgcatgg
tgcattagatcttgcggtatcgctcttccgtctaatattactcatttaattgaccaatgt
gtaaagaagatgaaaacactgcgcttttctgcagacacagttgcaggatatggttacaca
ttatcaggtattattggtggattacacatgtgccctcttggtttaccttttaaaaaagct
caggctgtatttatttttactgaggaaatttttaaaagtgcttccaccaatagtaagctg
ctgcagactggttgggttttgttgggaagcttgtgtacactaggaccttcttttgcaaaa
aaaaatcttccaagtatgcttgacttatggatgtctgtcttttcatttgaaaaaagtgat
ccaaatgtcgacaaaggtaaaggaaatgtaaagacctggcaactcacaatagaaaatcga
gcaaatgcactgtgctctatgtctagttttattaaacattgcaagagtttattggtacca
gacgttttgaagaaagtaatgattcctgttgaatctgctctgtcttttttattacagttt
caaatgttgttgaaaatccatggaccgcagttaagacctgcaattgctatgtttaaatca
cgcttatattgcatccttcttatgttacctgcaaatctttttgaaggcttttttactcca
ttattacgaaatttggctgcagattttacattggttgatcaaggttctgttactacttct
ttgttacaatctttgtgtcataaagatgacaatattttacttggttcatgggttcaagaa
actgattataaagatgttgaagaacagcttcaacttaatagtgctgctggatcaggagcc
cttgaacatgattcattttgtatatactctaatctttctgagggagaaaagattcctggt
cctctaccactcggagttgctgtagttgatgcagcaattaacttatttggtaaattgttc
ccatacttacccagcaaacattgtgcacaactgatgaatcattttaatgactgcattatc
aagaataaaggtgcaaggcagcaagctatacatactaatatttttacagctttcttagca
gcattaaagaacctatcagatagtaaatcatcttttgatgatacaaccactctgacacat
gctaaaacgcttattctagaagctcttggaaacacagacaacatcttaagatgcgctgct
ggagaggcattaggaaagttggcacaagttatgaatgacagaaattttgttgcactaatg
gctcaaaatagttttgataaatgtcaaaaaatgtctgatgcctatgttagaactggtcat
gctctatcactcggttgtttacatcgctatgttgggggaatggaatctggtcaacattta
ggaaatagtgtatccatattagtggccttagctaaagatgtttcatcttctctagttcag
gtatggtcattgcatgggttgacttcaattgcagattccggtggtccaatgtttcgaaca
tatgttgatcagtcatttttcactgtgattgacctaatgctgaatactccttcatctgca
atagaggtgcatcattgtcttggaaagtgtgttaatgcacttattactgctattggacct
gaattacaagatgactcaaaaaagatgttgcgtacacgaatgttttgtatgtctgcatgt
tcaattatgcaaaaccaccctgattcttttgtacaatcagagagtattcattgtttacaa
caacttcacttatttgctccagatcttgtcaacttaagcagtctagttccatttttgtgt
aacatattattaagtccacatcttttactcaggaaagccagtattgagtgtcttcgtcag
ttagctcatagggaagcaaaggatatcagtcagtggagcaaaagtacaattgctaacaat
cctgatattgttaaaaagatgtttaatgcaaactatggtctggaaggccttttgtttagt
ttattggatgcagaagttgatatttacatactgaaacacattcgtgaaattatttcaagc
ttacttatagcacttgtagataaagagcttaaaagttggttgagtctttgtaagcaagtt
gtacttgcttcaaatatcaatgaagaacaaaatgaaaattttggttctggtgctggtgct
gctgatgaagatgaagaagaagatggtcaaattgtgcttaattcaaaatcaaatgataca
cctattattactccaaaatggccaacccgtgtttttgcaatggaatgtcttcgaatgatt
attgatgtgtgcaagaattatactgagcatatggatttaaaagaagcaaggaaactaaaa
aacaatgaaaatgagtatttggtgatgcagttatctgagcttgttcgaatggcttttatt
gctggaacatcttctaatgatctccttaaattagaaggaatgaaaatgttgcaggatgtg
gttgttttatttgcgaatgttcctgatcctgacacaaacaatgaacagctaatattagaa
cagtttcaagcccaggttgatactgctttaagaccagcctttgcttcaaacgttcctcca
gatgttactgctatggcatgtgaggtttgctcttcctggattggttttggtatatcaaaa
aatgttgctgatgtaagaaggattcagcaacttcttgtaaattccttagtgaagatagga
aaagttgatgatgtcaacagagagttgtacagtgaaagtgcttatactcttgaaaattta
gctgtccttaaagcctgggctcaaatatatattatggcaatgaataatgaaaaggaattg
aaatcttcagatgaaaatattagtttgggttgtctattagatctaattaaaggagattta
agattgctggtaaagcattggctgaatgcattaaaagattttgttattttaacgctgcct
caacagtatgagtcacagctacctcaacaaggtggcgtgttttatagttcagaaactgca
gactctgttcgaccacattataaattgtgttggcctccaattgtgcatgctactgcctta
tggttatcttcggtttcattccagaattccactgaagtgttagttggtgcagaacatgaa
gtgaaaacccttaatgcaattgatcctgtgaaaaagacgatagaggaagttaacactgat
cgtttttatttgctttctggtatatgtgtagaagctatgtgctctcctttgtctttgtat
cccgttggaacaattgaagcatgtgcaagctcatttaatgcacttcttagttcacatttt
ggtcgctgtattattggaaacaataagattctatctatcgaattacttacagtgctacat
cgtttattgctgtcgcgagatgaaccttcattccaattaattgttttggaaatcgttttt
aaatgttctacagcattaggtgagtcaagtgaaccaacagaagatgaaattgttgtcaag
aagagtgttttgtttaatatattagaaatatgttgctatatggtaaaaaggtacgcttat
tcagttatgccagaagaaatttggaaatcactgcgaactccaaggaaattagaattttct
gcatcaataatggaagttcttgctttcgtttcatctatcctttctggtataccaaaattg
tgcacattttcatctagtgttgtatgtttgccaacaattttgtttttgttatcctctatt
tttaaatatattgtattaaacataaatgaaaacttttcgcatgagagttttttgagaact
gctttaactacattaacccaaagttttaaggaggtaattacttcgcctcacgcacttcat
gaagaaaacaaagaggtttgggggagcctcatacaaagttgtctgctatcagttcttcaa
acagctaatgcatacacaccgtgcgataatgcaactcactccgtaattataacagtttgg
gagaatattatgattgttgtatctgtttttgttttattttcaccgagcaatattagtaat
tcaatgcttctttctagttgcacaaatctcttttcaggttgcatccaaaaagctccctca
aaacttcgtttattaactttaaaaattgttggaagcatcattaaatctccaataagctgt
ctgtcaattccatttatccatgaatgtattccactagtttatgatatccttgaaactacg
cattcaaagcgacctggatcggagtctgaactgttatgctgcaaggaaagcatcaatctg
attgaatttattctttctatagttgaagaagataaacgtactcttgtgatgtcagtttat
attccagcattagtcccacttttgtatgattcaacatcgttaggaaaagccaatagcttt
tctagatcgcttcatgatttttgtatacaacgattaacggctactgggcctttataccca
atatctttcaaaacgtgcatggccaactttcccgaactcaaaagtaagctaactgaaggt
ataaaagcaaacgaatctgtaaagcaaaagaaaaatataatcaaaggtaatgatgtacaa
ccgcaaatcaaactaaaaatggactttagtaattttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
