Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100206247
Help
Entry
100206247 CDS
T01080
Name
(RefSeq) plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 isoform X1
KO
K05850
P-type Ca2+ transporter type 2B [EC:
7.2.2.10
]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
Enzymes [BR:
hmg01000
]
7. Translocases
7.2 Catalysing the translocation of inorganic cations
7.2.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
7.2.2.10 P-type Ca2+ transporter
100206247
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cation_ATPase_C
Cation_ATPase
E1-E2_ATPase
Cation_ATPase_N
Hydrolase
Hydrolase_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100206247
NCBI-ProteinID:
XP_012554571
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(6548764..6582911)
Genome browser
AA seq
1013 aa
AA seq
DB search
MGDYDDKVKLADAFEVGIDESDVCDKIRYSVTCQELVELMKRNDTSVAINEKFNGISGLV
KALNSSVSQGLLGTHSDIEDRKKKFGRNYIETRPPKTFLSLVWEALRDPILRILSVCAII
SFVLGMVIDNVKTGWIEGFAILVAVAICSLVAALNDWQKEKQFRQLQNKIDDEQVVNVLQ
SGDIVKQKVSELVVGDICFLNYGDLIPADGILLHANDLKVDESSLTGESNLVKKNLNYPA
LFSGTFVMEGSGKYIITAVGINSKSGSIMLLLGAAEKTNEVHIEIDESTEEVKTSKNQNK
EKEKSILQIKLTKLAVLIGWIGVAAGIITAFVIILRFCIQTYAVEKKPWDKKHLIDFLHA
IIVGITIMVVAIPEGLPLAVTISLTYSIKKMLLDNNLVRHLTACETMGNATVICSDKTGT
LTTNRMTVVESYMQCTHFNGTPMINALDSSFLELFCQSVSINSNSGSQIKPSETPNGFPN
QVGNKTECALLAFVLELGKTYQTYRDEVPQEKFVRVYTFNSLRKSMSTVINKPEGGYRMF
SKGASEILLKQCNRIVNKNGSIENFDQEQKENLKDTVIKDMASNGLRTICVAYKDFSSEQ
AAVDWEDESNVLSDLICLAIVGIEDPVRPEVPNAVRQCQSAGITVLMVTGDNINTARSIA
LKCGILEKNSDFLVIEGREFDSKIRDNKGKIQQELIDNIWPRIRVMARSSPEDKYNLVKG
IIDSKLSKSREIVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIQGTEVAKEASDIILTDDKFTSIV
KAVMWGRNVYDSISKFIQFQCTVNFAAIWISIIGSIVLSVSPLSAMQLLWINLIMDSFAS
LALATEHPTVELLKRKPYGRTKSLISHSMIRFILGHGFYQLIIILIITFRGHILFDIQYG
FTNPHIPSQHLTILFNTFVMLQIFNEINARMVHGERNVFKNIFENKLFSIIVIGTVIVQM
ILVEFGGSALAVHPLSIDQWFWCIFLGFSELLWGQVIITMPKFAKKIFHNLFR
NT seq
3042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtgactatgatgataaagttaaattagctgatgcttttgaagttggtattgacgaa
agtgatgtttgtgataaaatacggtattcagtcacctgtcaagaattagttgaactaatg
aagagaaatgatacatcagttgcaattaatgaaaagtttaacggtattagtggtcttgta
aaagctttaaatagttctgttagtcaaggtcttttaggtacccattctgatattgaagat
cgaaaaaaaaaatttggtagaaattatattgaaacaagacctccaaaaacatttctgagt
ctagtttgggaagcacttagagatccaatacttagaatattatctgtttgtgcaataata
tcttttgtgcttggaatggttattgataatgttaaaactggctggattgaaggttttgct
attttggttgctgttgctatatgttcacttgttgctgctctgaatgactggcaaaaagaa
aaacaatttagacaactacagaataagattgatgatgagcaagttgtaaatgtattacaa
agtggagatattgttaaacaaaaagttagtgagcttgtagttggtgatatttgtttcctg
aattatggggatttaattccagctgatggaattttacttcatgcaaatgatctaaaagtg
gatgaaagttcgttaacaggggagtcaaatttagtaaaaaagaatttaaattatccagca
ttgttttctggtacatttgttatggaaggcagtggtaaatatattattacagctgttgga
attaattctaagtcaggtagtataatgctgttattaggagctgctgaaaaaactaatgaa
gtgcatatagaaatagatgaatctactgaagaagtaaaaacttcgaaaaatcaaaataaa
gagaaagaaaaatctattttgcaaatcaaattaacaaagttggccgtattaattggatgg
attggtgtagctgctggcataattactgcgtttgttattattttaagattttgtattcaa
acatatgctgtagaaaaaaaaccttgggataaaaaacatttgatagattttcttcatgct
attattgttggaataacaattatggttgttgcaatccctgaaggtttgccacttgctgta
acaatatccttaacatattctatcaaaaaaatgttacttgacaataatttagtgcgtcat
ttgactgcttgtgagacaatgggaaatgcaactgtaatttgttcagataaaacaggcact
ttaacaacaaatcgaatgactgttgttgaaagttacatgcaatgtactcattttaatgga
actccaatgattaatgctcttgacagtagttttttagaacttttttgtcaatctgtctcc
attaatagcaactcgggatcacaaataaaaccttcagaaacacctaatggatttcccaat
caagttggtaataaaacagaatgtgctttacttgcctttgttttggaacttggtaaaaca
tatcaaacttatcgcgatgaagttcctcaagaaaagtttgtgcgtgtatatacttttaat
tccttgcgtaaatctatgtcaacagttattaataagcctgagggtggttatcgaatgttc
tctaaaggtgcttctgaaatacttttaaaacaatgcaatagaatagtgaataaaaatgga
agcattgagaattttgatcaagaacaaaaagaaaatctaaaagatactgtgattaaagat
atggcttctaatggattaagaactatttgcgttgcttataaagacttttcttctgagcaa
gcagcagttgattgggaagatgaatcaaatgttttatctgacttaatatgtttagcaata
gtaggaattgaggatcctgtcagaccagaggttccaaatgctgttagacaatgtcaaagt
gctggaatcactgttttaatggttacaggtgataacattaacacagctcgatctattgca
cttaaatgtggtatacttgaaaaaaatagtgatttcttggttattgaaggaagagagttt
gactcaaagataagagacaataaaggaaagattcaacaagagcttatagataatatatgg
ccaagaattcgtgtaatggcacgatcatcacctgaagataagtataaccttgttaaaggt
ataattgatagtaaactaagcaaatctagggaaattgttgctgtcactggtgatggtact
aatgatggtccagctctcaagaaagcagatgttgggtttgcaatgggaattcaaggaaca
gaagtagcaaaagaggcatctgatatcattctgacagatgataagtttacaagtattgta
aaagctgttatgtggggaagaaatgtttatgatagtatttctaagtttattcagtttcaa
tgtacagtaaattttgctgcaatatggatttcaataattggctcaattgttttatcagta
agccctttaagtgccatgcagctgctatggataaatttaattatggattcatttgcctca
cttgctcttgcaactgaacatcctacagttgaacttttaaaacgtaagccatacggacgc
actaaatctcttatttctcattcaatgattcgctttatacttggccatggattctatcaa
cttatcattattctaattattacctttcgtggtcatatcttgtttgacattcaatatggt
ttcactaatcctcatataccatcacaacatttaactatcttattcaatacatttgttatg
ttgcaaatctttaatgaaattaatgcaagaatggtgcatggtgaacgtaatgttttcaaa
aacatttttgaaaacaaactttttagtatcatagtcattggaacagttattgtgcagatg
attcttgttgagtttggtggtagcgctctagctgttcatcctttaagtattgatcagtgg
ttttggtgcatatttcttggatttagtgaacttttatggggacaagtaataataactatg
ccgaagtttgccaaaaaaatttttcataatttatttcgatag
DBGET
integrated database retrieval system