Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100206462
Help
Entry
100206462 CDS
T01080
Name
(RefSeq) ubiquitin conjugation factor E4 B
KO
K10597
ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:
2.3.2.27
]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04120
Ubiquitin mediated proteolysis
hmg04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
100206462
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
100206462
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
hmg04121
]
100206462
Enzymes [BR:
hmg01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
100206462
Ubiquitin system [BR:
hmg04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
U-box type E3
100206462
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ufd2P_core
U-box
Stap_Strp_toxin
PBP_dimer
Pex19
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100206462
NCBI-ProteinID:
XP_047139233
LinkDB
All DBs
Position
8:44523090..44598828
Genome browser
AA seq
1155 aa
AA seq
DB search
MSELTPDEIRQRRLARLSAGNASQATPQRDPSPNVTLLSFPSGHNTESPASNVIYSTGNT
PQGIPIRSNQLLGAIPLNLCSPTTSYIESISPASNAVLYGSQPMDIDDKSINQSVEKNNK
RPCIKSTPPRDGKLFRVSPKETEAVSEVNNTSTLLTCLEEIFHVKFRASDKNQYTFIEEV
SNQIYDGNQVKSIVNFKDIIQQVLMNKLLRSFYSHESSTPQVFQNNDVFIDSQVDKTSPS
KEFSKAGLNHHDTHELPFDYTMLEWRVAALRYLCDCYERAKASQGKNSNQQWKEILLNVN
DICINYAVLISQGKLSDKIMNNTSCIVTHFLLDEKYYFPADFLSSFVSTLWLSGDFQQIF
EPVLKSILEKISSCSLSDESFKYPLMALSTLCDIKVANGIRPLCSLMTSLHNWLPPPISM
ASGREIQMFSFLGPFLQLSVFFDDDPKVAKKYFPVGKQSSDNMLLTRSTLRTHLQLVRSE
MFKVVHSLLVTSELRGHCLDYFAAVLSRNSKKNQLQVNEKLLASDGFMLNVLSILQHLSV
KIKLDKVDLHYLHHPQCRLNTSQFSPIKAKKEEINALKEKLDKLNNWVEPKFPTECFFLT
YHCHHISVIPATRKYIQRMREIRDMNKLISELELRENDWKLAPSAARNRLLLKKWKAKIQ
VLTTQDACAVTGLVDENLMRRCLRFYSNAAEWLLSLILQDRCELSSDFPQNVPIEFGALP
DYYIEDMIECLLFIDFHMPQILDDAYVDNFVPLLVILMCNYNYIANPYLVAKLVEFLFAI
DPSLQPRAFNLYQKITSNTIGEVFLIPSLLKFYIDVETTGSSSEFYDKFGIRFHISVILK
GLWKKPMHKLAIVKESSTDNFTRFINMLINDTTYLLDESIDTLRNIRDIEDAMANTKEWE
QLSSEVRQTKQRQLATDERQCKSYLTLATETVDMLHYLTAEIKQPFLQQELGVRLSVMLN
YNVKQLTGDKYKNLKVRNPEKYGFEPKKLLDQIVDIYLHLDSDEFAQAVAADERSYRKEL
FDDCITLLQRTVLKSQTQLEQLRCFADRVERIIIENYKNAIDLDDAPDEFKDPLIDTVMF
DPVILPSGTIMDRSVILRHLLNSNTDPFNRQKLTEDMLKPASELKEKIQAWIELKKSKKH
NENLSVYKEQYELYN
NT seq
3468 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgagctaactccagatgaaataagacagcgtcgcttagctagactgagtgctgga
aatgcatcacaagccaccccacaaagagatccatcaccgaatgttacattattaagtttt
ccatctggtcataatacagaaagtccagcatctaatgtgatatacagtactggaaataca
ccacaaggcatacctattagatctaatcaattgttgggtgctatcccattaaacttatgt
tctcctactactagctatatagaaagtataagtccagcttcaaatgcagtattgtatggt
tcacaaccaatggatattgatgacaaatcaattaaccagtctgttgaaaaaaataacaaa
agaccatgtattaaaagcacacctcctcgtgatggaaagttatttcgagttagtcccaaa
gaaacagaggcagtttctgaagtcaacaacacctcaacacttttgacatgtttagaagaa
atttttcacgtgaaatttagagcgagtgacaagaatcagtatacatttattgaggaagtt
tctaaccagatatatgatggcaatcaagttaaaagtatagtaaactttaaagatataatt
cagcaagttctgatgaacaaactacttagatcattttattcacatgaaagtagcacgcca
caagtttttcaaaataatgatgtttttattgattcacaagttgataaaacaagcccatct
aaagaattttcaaaagccggcttaaatcatcatgatactcatgaacttccttttgattat
acaatgttagaatggcgtgtagctgcacttcgatatttgtgtgattgttatgagcgagca
aaagcttctcagggaaaaaattctaatcaacagtggaaagaaatactattaaatgttaat
gatatctgtatcaactatgcagtcttaatttcacaaggaaaactttcagataaaataatg
aataatactagctgtattgttactcattttttacttgatgaaaagtattattttccagca
gattttctttccagttttgtttctactttatggctctcaggtgattttcaacagattttt
gaacctgttttaaagtcaatcttggaaaaaatttcaagttgcagtctctcagatgaaagc
tttaagtacccactcatggcgctttctaccttatgtgatattaaagttgccaatggtatc
agaccactttgcagtttgatgacaagtttgcataactggttgccaccccctatttcaatg
gcaagtgggcgagaaattcaaatgttctctttcctgggacctttcttgcaactctctgtt
ttctttgatgatgatcctaaagtagcaaaaaagtattttcctgttggcaagcaaagctca
gataatatgctgttaactcgatcaacacttcgtacacaccttcagcttgtcaggtctgaa
atgttcaaagtggttcatagtttattggtaacttctgaattaagagggcactgtcttgat
tactttgctgcagttctaagtagaaattcaaaaaagaatcagcttcaggttaatgaaaag
cttttggcatcagatggttttatgttaaatgtcttatcaattcttcagcatctttctgtg
aaaataaaattagataaggtggatctccattatttacatcacccacaatgccgcttaaat
acttcacaattttcaccaattaaagctaaaaaagaagaaattaatgcattgaaagaaaaa
ctagacaaactaaataattgggttgagccaaaatttcctacagagtgtttcttcctaaca
tatcattgtcatcatatttctgttataccagctacacggaaatatattcagcgcatgcgt
gaaattcgtgatatgaataaacttattagtgagttagaattgcgagaaaatgattggaaa
cttgcgccttcagctgcaagaaacaggttgcttttaaagaagtggaaagctaaaattcag
gttttaacaactcaagatgcatgtgcagtaactggacttgttgatgaaaatttgatgcgt
agatgtcttcgattttatagcaatgcagctgagtggcttctttctcttattttacaagat
agatgcgagctatcttcagattttccacaaaatgtaccaatagaatttggagcactacct
gattactatatagaagatatgatagaatgtttattgtttattgattttcatatgcctcaa
attcttgatgatgcgtatgtagacaattttgttccacttcttgttattctcatgtgcaac
tataattatattgctaatccatatttagttgctaaacttgttgagtttttatttgcaatt
gatccttcactacaaccaagagcatttaatttatatcagaaaataacttcaaacactatt
ggtgaagtatttctcattccatctctactcaagttttatattgatgttgaaacaacagga
agttcaagtgaattctatgataagtttggaattcgctttcatatatctgtgatcttaaaa
ggtttatggaaaaaaccaatgcacaaacttgcaatcgtaaaagagagcagcactgataat
tttactcgtttcatcaatatgttaataaatgatacaacatatttactggatgaatctata
gacacactgagaaatattcgtgatatagaagatgctatggctaataccaaggaatgggaa
caactttctagtgaagtgcgccaaacaaaacaacgccagttagctacagatgagcgacag
tgcaaatcttatttaacacttgctacagaaactgtggatatgcttcattatttgactgct
gagattaagcaacctttcttgcaacaggaacttggggtacgtttatctgtcatgctaaat
tataatgtcaagcaattaacaggtgacaaatataaaaatttaaaggtaagaaaccctgaa
aaatatgggtttgaacctaagaagttgttggatcaaatagttgacatatatttgcatttg
gattctgacgagtttgctcaagctgttgctgcagatgaacgctcctacagaaaagaactt
tttgatgactgtataacgttgttacaaagaacagttcttaaatcacagactcagttagag
cagctacgttgctttgcagatagagtagaacgaattattatagaaaactacaaaaatgca
atcgatctagatgatgctcctgacgaatttaaagatcctttaatcgatactgtcatgttt
gatccagtgatcctgcctagcggtacaattatggatagatcagttattttgagacattta
cttaactccaatactgaccctttcaatagacaaaaattaactgaagatatgcttaaacca
gcaagcgagttgaaagaaaagatacaagcatggatagaactgaagaagtcaaaaaaacat
aacgagaacttgagtgtttataaagaacaatacgaattgtataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
