KEGG   Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100210445
Entry
100210445         CDS       T01080                                 
Name
(RefSeq) dmX-like protein 1
  KO
K24155  rabconnectin-3a
Organism
hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04142  Lysosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04142 Lysosome
    100210445
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:hmg04131]
    100210445
Membrane trafficking [BR:hmg04131]
 Exocytosis
  Small GTPases and associated proteins
   Rab associated proteins
    100210445
 Endosome - Lysosome transport
  Acidification regulators
   Rabconnectin-3 complex
    100210445
   RAVE complex
    100210445
SSDB
Motif
Pfam: Rav1p_C WD40 Beta-prop_THOC3 WD40_Prp19 Beta-prop_WDR5 WD40_WDHD1_1st Beta-prop_WDR3_1st WD40_CDC20-Fz Beta-prop_WDR3_2nd Beta-prop_EML_2 Beta-prop_TEP1_2nd EIF3I Beta-prop_WDR36-Utp21_1st Beta-prop_CAF1B_HIR1 WDR55 Beta-prop_EML Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd WD40_Gbeta Beta-prop_WDR90_POC16_2nd ANAPC4_WD40 Beta-prop_HPS5 WD40_MABP1-WDR62_2nd Beta-prop_TEP1_C Beta-prop_VPS8 Beta-prop_DCAF4 eIF2A HTH_92
Other DBs
NCBI-GeneID: 100210445
NCBI-ProteinID: XP_047139394
LinkDB
Position
9:37813283..37915213
AA seq 2797 aa
MRLHQVLTGAANVIEDSVAISHGNVNGYPFTVYGSGYEVVILDCHFNRVQIMSSHKVLIF
SIVKGISCAKADGKIAVSFGKKVVLYQAEKVQATTEMKLPYLWKIVTIIPFDSEVEKLCW
DVEGERLLIGSDNLHMWKLNTDISDDDDVNKWTCVWHRRFATPPKHLLFSPDGHYFASAG
QGDRMVKIWFHAPKVCQTTTTARPFHRSYSGHSCASEDNYNFVYIFHPSEVVSFSWRNTS
KHMPTCSVPNVLLTSCADNICRIWSETVKYKPSNHTTPHQPSEYSSPTKSSSSTKKKKDS
IEKLLQSDIQSDMDNTYFSKDHQNYHLISLFHFHLAAVINPTSDIALLSTIPTTSIFGRC
FQLHWLNNKEIQFTTAIEAMHENFKKSAEANYTDETDDPFSIIGGVDTEIGDPELYDKVK
TLDRNLEDDYSEDEEDDAMLETQALNAPQKTDFIPSDIDFPGFDASSYKGQLDNLLHKWM
TSTDTLFCIHPFDGSLLIWIVDYLDNFKVSCYRQVQVSFASRIPSTFTKADASSLCWMRS
YHYTQPVQKELSSGGFLFTFNPGYKATGRLSKGSANEQLSLLQVSYLISAHADGSLNLWL
VTFSDTGSFTGITSITHVTRSCGPRFETTKLISHPVLPLVLGTSKRTNDICYHRHEIETT
NIADIESELILWHTKHVSPLSTFKGVTEMARISSPNPLAFSSIAWVPALYQHSLLSITSN
EIELLPDGPCTCFVVASNSGIELYQVLLDAKNLLSNLAYQNSLPDVPMMAKNLSSFIISE
QSGSHSACIMKLCTLESSQDLQRTKFLHVYSKHSMLPKTVLSASKSDVKLDSFFIASVST
TSDNRDIINVWCIDIELLGKYNTKTSVTPQSPDSILSNDSFSSMPVISSSHCLKQSHIYN
DFLHESYKKICAASDLHCSNSLNPSCPLNFNFVTYSDESIKFWNFVLSEDEKDKNVCTLE
ELNDSLKEQGVIVCLNCASTELFAFVVELFDSNLNKMYNICIYENQSTGGLYWVKKQTIP
IINVLVLEENMIELSWLHLENGSYLLALAFNNSIFIYNKDRKEFENDLQSSIWVVLKDFS
LFDDKSPLRLTTISWSRGGFFMVGVENEIQVYSQWEDTEEVTLNNKTISLFDGGRVNEHG
FIITKNSFTEACKSMCTLPQYHPYHLIELLNLGKLRRVRLILRHLLHCVSGTQLTSDSNL
EADDQKDHEVKLQPRTRTFSEISTFSSNGDNSILKTNSNVTISVIPPLMLSTLTSVDRNK
NIETIDGQNAAVQGVYSILFNQKVDDDDEDRLDSPKSSTHYGVSQAKQLNEYLEKSQLPG
ITSQEQMYLLLLSETVASTDYDLEVGVNEKNQKTKDSDLDVLHGVGGGGYAASVAASGSS
LDDCGLRYMLAARHYTALLKCGRHKNNLQLGMRTSDICWAFHSDCKEDLLTVIPSMLKNS
TTWKDLRDHGAGWWIRSNDMLRRTVEKVAKVQFQINQDPMDCALFYLAMKKKSLLCTLYR
SLRDNKMSLFFANDFTQDRWRKAALKNAFVLLGKQRFEHAAAFFLLGNALWDAIQVCLIR
LKDIQLALVISRLYENNNDVHNEILQRYVIQGELDPPITDPFIISMSHWILNDYRKSLEV
LLLSTANEQELVNYPAIFNFYFFLQSHPMLTKLYKTKMNFSESLYNINLEELKVCERKLF
FKTALFHLESGLPDIAIEVLSMQDLVSTINVNENDNTDFSYKTGSDIISTSQANNSIDWS
KPVVKQEMDTTDWSKPVTVIDDEEYKGLSLDDSSSDTVSNKSEDNSKTLAVVNNDNNKSI
NQKQKLNNKTDILALNLKFICVMQCLIESLKALSSKCMLENVKLRSALSELLNHELAFLH
LNCDYNFDGLEIEYSTEQDNRFLVKKRASTLYDLGSLIKLNNDSSLGEKVEAITLHSEWL
RSNHSVLSSLYEYCLMVGTGHAELTAVCLELLLLLHEVEDHRVLSAPLSSSISAGPNAPP
LLLASMTSFSLVISPTMFLKSMAHDLLHTVINLPGLPNPQNPVTRLSDMESLLFSLSSCV
YHSLCGGDEDKLLASLKKGETELVGMQSSDGKLIRMSPGNLFVDLDPTSAPSQWPGVKFL
ITLLTSSSRDRSQQIRLLLCEISVAIYLSMLVSASSRLSCQNLYRLVTNSLSEKMWNAAF
GGGTKVVVHAPDETDKPFYAQSPNFDLKRDTTRMRWNYKLLGNKSLSTANIGEEERGLVR
HELFILPKSTLCDYFLRKPQRTSFNYDSEEDEFSDDEDKTKDHEEDDPLKSESEIKIKRD
LKELENKKLNEHCDSMSYAWLIMQLGIVKLTSLNINNFISMLGFEILDLPTQSLLLYNAT
KILIRWEQLLTVQINASPALTENVISYHPPVSGDGFQRGGVALNRLKTLLDPQNTPFSNK
TTKSQPAKRLWHSLVSHESLRAMFLHYAFSSVSEGDDEIDYDSYSCRVLHKDPEPVTNLC
LNKSNLDYMAISTTQEIIEYDISGAFKVDLFSFDVEGNSNSNENSAFAEDRPMKKPFTPN
IIQRRTCSGIRRMASHPTLPYYVTGGADGSVRMWEFVHPDQIHLFRGPGQNERVNKVQFY
GLGNKFAVVDDSGYLSMWMITNTQNSTPFLTLRCHTKFCYDFAYLGSSSLIATVGFTNDK
KNICIWDTLLPEKNALIHRFAHNIHGAQSLAYVSSQQTIISGGKRGDVSIFDIKQRQLLH
TFQAHDCLVKTIAIDPVEQFFVTGTIDGDLKVWDLTTLKMVESFSREHSRGTVSLRHVSP
GVQCIKILEGNQMFSCGGDGSVKWRVLKLNNILTGVK
NT seq 8394 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagacttcaccaagttcttactggtgcagcaaatgtgatagaagattctgtagctatt
tctcacggaaatgttaatggctacccttttacagtttatggttcaggttatgaagttgtt
atccttgattgtcatttcaatcgtgtgcaaatcatgtcaagccacaaagttttgatattt
tcaattgttaaaggcatctcttgtgcaaaagcagatggaaagatagctgtttcttttgga
aaaaaagttgtactatatcaagcagaaaaagttcaggccacaacagaaatgaaattgcca
tacttatggaaaattgtgactataataccttttgatagcgaagttgagaaactatgttgg
gatgttgaaggtgaaagattgcttattggtagtgataatttgcatatgtggaaattaaac
acagatatatctgatgatgatgatgttaataaatggacttgtgtttggcatcgcagattt
gctactccaccgaaacatttacttttttcacctgacggccattattttgcaagtgcaggc
cagggtgatcgaatggtaaagatttggtttcatgctccaaaagtatgtcaaaccactact
actgctcgtccatttcatcgttcctattcaggacattcttgtgcaagtgaagacaattac
aactttgtatatatttttcatccgtctgaggttgttagtttttcttggaggaatacaagc
aaacatatgccaacgtgttctgttcctaatgttttgttaacatcgtgtgcagataatatt
tgtcgcatttggtcagaaactgtgaaatacaagccttcaaatcacacaacacctcaccag
ccatcagaatatagttctccaactaaatcaagttcatcaactaaaaaaaaaaaagattct
atagagaaattattgcagtctgatatccagtcagatatggacaatacatatttttccaaa
gatcatcaaaattatcatttaataagtttgtttcattttcaccttgcagcagttattaat
ccaacctctgacattgctcttttgtcaactattccaacaacttcaatatttggtcgttgt
tttcaattgcattggttaaataacaaagaaattcagttcaccacagctattgaagcaatg
catgaaaactttaaaaagtctgcagaggcaaattacactgatgaaactgatgatcctttt
tctataattggtggtgttgatactgaaatcggggatccagaattatatgataaagtcaaa
actttagacagaaacctggaagatgactacagtgaagatgaagaggatgatgcaatgctt
gaaacgcaagccttaaatgcacctcagaaaacagattttattccttctgacattgatttc
cctggttttgatgctagctcatataaaggacagttagataacttactccacaaatggatg
acatcaactgatacacttttttgtattcatccttttgatggctcattattaatttggatt
gttgactatttagataattttaaagtttcttgttaccgacaagtacaggttagctttgca
tcaagaataccttctacatttacaaaagctgatgctagctcactttgttggatgcgttca
tatcattatacacaaccagttcaaaaggaattatcatcaggaggatttctttttacattt
aatccaggttataaggcaactggaagattatctaaaggttccgcaaatgagcagttgtct
ttgcttcaagtttcttatttgatctcagcacatgccgatgggagtttaaatttatggcta
gttacattctcagacacaggttcatttactggtataaccagtataactcatgttacaaga
agttgtgggcctcgatttgaaactacaaaactaatcagccaccctgtgttgccgttggtt
ttaggaacatctaagaggacaaatgacatttgctatcaccgccacgaaattgaaactaca
aacattgcagatattgagtctgaattaattttatggcacactaaacacgttagtccatta
tccacatttaaaggagttacagaaatggcacgtatttcctctccaaatccactggctttt
tcttcaatagcttgggtgccagctttatatcagcattcccttctttcaattacaagtaat
gagattgaacttcttcctgatggaccatgtacttgttttgttgttgcttccaactctgga
attgagttgtaccaggttttgcttgatgcaaaaaatctattgtctaatcttgcatatcaa
aatagtcttcctgatgtgcctatgatggctaaaaatttatcttcatttattataagtgag
caatcaggttcacattctgcttgcattatgaagttatgtaccttagaaagttcacaagat
cttcaaaggacaaagtttttgcatgtatatagcaagcattccatgcttcctaagacagtt
ttaagtgcatctaagtctgatgtaaaacttgatagtttttttattgcatccgtcagtacc
acttcagataatagagatattataaatgtatggtgtatagatatagaattacttggaaaa
tacaatacaaaaacatcagttactccacaaagtcctgattcaattttaagcaatgactct
ttttcctctatgccagttatttcatccagtcattgtcttaaacaatctcatatttataac
gattttttgcatgaatcttataaaaagatttgcgctgcttcagatttacactgttcaaat
agtttgaatccctcttgcccgctaaattttaactttgttacttattctgatgagtcaatt
aaattttggaattttgtgttgtctgaagatgaaaaagataaaaatgtttgcacattagaa
gaattaaatgactctttaaaagagcaaggagtaattgtttgtctgaactgtgctagcacc
gaactgtttgcttttgtagttgaactctttgatagcaacttaaataaaatgtataatatt
tgcatatatgaaaatcaatcaacaggtggtttatattgggtgaaaaaacaaacaattcca
attatcaatgttttagtgcttgaagaaaatatgattgagttatcttggcttcatttagaa
aatggttcttatttattagctttagcctttaataattctatttttatttataacaaagac
agaaaagaatttgaaaatgatttacagagttctatttgggttgttctaaaggatttcagt
ctctttgatgacaaatcacccttacggttgactacgatatcatggagtcgtggcggtttt
tttatggtaggagttgaaaatgaaatacaggtttattctcaatgggaagatacagaagaa
gtcacattaaataataaaactatttctttgtttgatggggggagagtaaatgaacatggt
ttcataataacaaaaaattcatttactgaagcatgcaaaagtatgtgtactcttcctcaa
tatcatccttaccatttgattgagctattgaatcttggaaagttaagaagagttcgttta
attttgagacacctgctacattgtgtttctggcactcaattaacatcggattcgaattta
gaagcagatgatcaaaaagaccatgaagtaaaattacaacccagaacaagaaccttcagt
gaaatttcaaccttctcttcaaatggtgataattcaattctcaaaacaaattcaaatgtt
actatttctgttataccacctttaatgctttcaacattaacatctgttgatcgaaataaa
aatattgaaacaattgatggtcaaaatgcagctgttcaaggtgtctattcaattttgttc
aaccaaaaagtagatgacgatgatgaagacaggttagattctccaaaaagttcaacgcat
tatggtgtgtctcaggcaaaacaacttaatgagtacctagaaaaatcacagctacctggt
ataacaagtcaagagcaaatgtatcttcttttactttctgaaactgtggcttctactgat
tatgacttagaagttggtgttaatgaaaaaaatcaaaaaacaaaagatagtgatttggat
gttctgcatggtgttggaggaggtggttatgcagcaagtgtagctgctagtggaagcagc
ttagatgattgtggtttacgctatatgcttgcagctcgacattataccgctttgcttaag
tgtggacgacataaaaataatctacaattgggaatgcgtacctcagatatttgctgggct
tttcactctgattgtaaagaagacttactcactgttataccgagtatgttaaagaattca
acaacctggaaagatctgcgcgaccatggtgctggctggtggatcaggagcaatgatatg
ttaagaagaacagttgaaaaggttgcaaaggttcaatttcaaataaatcaagatcccatg
gattgtgcattgttttatcttgcaatgaagaaaaagtctttattgtgcactttgtataga
tcattaagagataacaaaatgtcacttttttttgccaatgacttcacacaagatagatgg
agaaaagcagcattaaaaaatgcatttgtactattgggtaagcagaggtttgaacatgct
gcagcttttttcctattaggaaatgcattatgggatgcaattcaagtttgtcttattcgt
ctgaaggacattcaattggcattagtaatttctcgtttatatgaaaataacaatgacgtg
cataacgaaatcttacagagatatgttatacaaggtgaactggatccgcctattacagat
ccatttatcattagtatgtcacattggattcttaatgactacagaaaatctcttgaagtt
ttgctcttatcgactgctaatgagcaggagctggttaattatcctgccatttttaatttt
tatttttttttacaatcacaccctatgttgacaaaactctataaaactaaaatgaacttt
tctgaatctctgtataatatcaatttagaagaactgaaagtttgtgaacgtaaacttttt
tttaaaactgctttgtttcatttggagtctggtttgcctgatatagcaatagaagtttta
tcaatgcaagatttagtttctacaattaatgtcaatgaaaatgataatactgatttcagt
tataaaacaggatctgacattatctcaacatctcaagcaaataacagcatagattggagt
aagcctgtggtaaagcaggagatggataccacagattggagtaaaccagttactgttatt
gatgatgaagaatataaaggactttctcttgatgacagtagttctgacactgtgtccaac
aaaagtgaagataattcaaaaactctagctgttgtaaataatgacaataataagtcaata
aatcaaaaacagaagttaaataataaaactgatattttagctttgaacttgaaatttatt
tgtgtaatgcaatgtttgattgaaagcttaaaagctctatcgtcaaaatgcatgctggag
aatgttaaacttcgatcagctttgagtgaacttctcaatcatgaacttgcttttttgcat
ttaaactgtgattataattttgatggattggagattgaatacagtacagaacaagacaat
cgatttctcgttaaaaaacgagcgtctactttatatgaccttggttcgttaattaaactt
aataatgattcttcacttggtgaaaaagttgaagcaattactcttcattcagaatggcta
cgtagcaatcatagtgtgcttagcagtttatatgaatattgtcttatggttggcacaggg
catgctgaattaactgctgtgtgtttggaattgctgttattattgcatgaagttgaagac
caccgcgttttatctgcccctctttcttcaagtatttcagcaggacccaatgctcctcca
cttttattagcttcaatgacatcattttcattggtaattagtcctacaatgtttttaaaa
tctatggcacatgacctgctgcatactgtcattaatcttcctggtctaccaaacccacaa
aaccctgtcacgaggctttcagatatggagagtctgttgttttctttatcatcatgcgtt
taccacagtttatgtggtggagatgaagacaaacttttagcatctttaaaaaaaggagaa
actgaacttgttggaatgcaaagttctgacggcaagctgattcgtatgtcaccaggaaat
ttatttgttgatttggatccaacttctgctccttcacaatggcctggtgttaaattttta
ataactctgcttacatcaagcagccgggatcgttctcagcaaattcgcttattgttatgt
gaaataagtgttgctatttatttaagtatgcttgtcagtgcatcatcacgactttcttgt
caaaatctatatcgtctggtaacaaatagtttatctgagaaaatgtggaatgcagcattt
ggaggtggtactaaagttgtggtgcatgccccagatgaaactgataaaccattttatgct
caatcgccaaattttgatttaaaaagagatactactaggatgagatggaattacaagttg
ctaggtaataagagtttatctacagctaacattggtgaagaagaaagagggctagttcga
catgaactttttattttaccaaaatcaactctatgcgactattttctgagaaagccacaa
agaacttcctttaattatgactctgaagaggatgaattttctgatgatgaagataaaaca
aaggatcatgaggaagatgatcctttaaaaagtgaatctgaaatcaagataaagagagat
ttgaaagaactagaaaacaaaaagctaaatgaacattgtgacagtatgtcatatgcatgg
cttattatgcagcttggaattgttaaacttacatctttgaatataaataactttatctcc
atgttaggattcgaaattttagatctaccaacacagtcacttcttctttataatgcaaca
aagattttgattcgctgggaacaactgttaactgttcaaattaatgcttctccagcttta
actgaaaatgtaataagttaccatccacctgtttctggagatggttttcaaagaggcggt
gtagcactaaatagactaaaaacactattagacccacaaaataccccttttagtaacaaa
acaactaaatcacaacctgcaaaaagattgtggcatagtctagtttctcatgaatctctg
agagcaatgtttcttcattatgcttttagttctgtttctgaaggagatgatgaaatcgac
tatgattcttattcctgtcgtgttttgcacaaagatcctgagcctgttacaaatttatgt
ctaaataaatccaacttggactacatggcaatttccacaactcaagaaatcattgaatac
gatatttctggtgcatttaaagttgatttgttttcttttgatgtggaaggaaatagtaat
tctaatgaaaatagcgcatttgctgaggatagaccaatgaagaaaccatttactccaaat
attattcaaagaagaacgtgttcaggaattcggcgcatggcttcacatccaactttacca
tattatgttactggaggtgctgatgggagtgttcgcatgtgggaatttgttcatcctgat
caaattcatttgtttcgtggaccaggacaaaatgaaagagtcaataaagttcagttttat
ggccttggtaataagtttgctgtcgttgatgatagcggatatctttcaatgtggatgatt
acaaacactcaaaattcaacaccttttcttactctacgttgtcacacaaaattttgttat
gattttgcatatttgggttcaagcagtttaatagctactgtaggctttactaatgataaa
aaaaatatttgtatatgggacacactgctacctgaaaagaatgctttaattcatcgattt
gcccacaacatacacggcgctcaatcgcttgcgtatgtatcaagtcagcaaactattatt
tctggaggaaaacgaggcgacgtatcaatttttgatattaaacagcgccaactgttgcat
acgtttcaagctcatgattgtcttgtcaaaaccattgccatagatccggtggaacagttt
tttgttactggtactattgatggcgatttaaaggtttgggatcttacaactttaaaaatg
gttgaaagtttttcaagagaacattcccgtggcactgtttctctacgtcatgtaagtcct
ggtgtacaatgtataaaaatattggaaggaaaccagatgttttcgtgcggtggcgatggt
tcggtgaaatggagagtgttaaagttaaataatatattgacgggtgttaagtaa

DBGET integrated database retrieval system