Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100213514 Help Entry 100213514         CDS       T01080                                  Symbol LOC100213514 Name (RefSeq) protocadherin Fat 4 isoform X1   KO K16507   protocadherin-16/23 Organism hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra) Pathway hmg04519   Cadherin signaling Brite KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04519 Cadherin signaling     100213514 (LOC100213514)  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    04515 Cell adhesion molecules [BR:hmg04515]     100213514 (LOC100213514) Cell adhesion molecules [BR:hmg04515]  Cadherins   Cadherin related    100213514 (LOC100213514) SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Cadherin Cadherin_FAT4_N Ig_CLSTN Cadherin_CELSR2_9th Ig_3 I-set Ig_2 Ig_Cad99C_N ig V-set hEGF Ig_4 EGF Motif Other DBs NCBI-GeneID:  100213514 NCBI-ProteinID:  XP_065679738 LinkDB All DBs Position 07:4134284..4270480 Genome browser AA seq 3030 aa AA seqDB search MKEAISKVKYQRSITSTGDALTTLVDKIYTEKSGMRSDKSIPKIGILLTDGYSNGEIDVY YAAKRVKEAGISMFVIGVSASVYMPEILAIASPPENQHYILIDSYLDLSGFLSQITAVSC DEGAQLSQCDSIKTAVDGGSFKYFQSNFKGIKQGSYKRVSFELVDKQGMSFIYTSTKLRN PGPLSEEKDVNKSESNISPRIISIDLSSVNETIIYIAVLGQKDYNVFELSIWESLFSTDQ IFVNISENENAGQQVFVVQTINNPKSFNYMIKDGLNSGDFQIDNNGQITTNKSLDRENIS SYKLSVIAEDKNDKCHKGLISIVINVDDKNDNKPEFENQEYKVELREDTPLNQFVIQVQA TDKDIGKNAELTYELSGSNQDIFKIEKKTGIIRTNKTLDYESKSSYTIELVVRDSGANVL VGYANLIVSVTDVNEPPEFLNCKIPRSCVFSIDENQPENSIVGTNITAIDPDTTSCNLSY SIVSLDKQYFKITGNTIQTRMSLDREAKESYSLEVSVKDCGKPPLYTFTIITVVLNDLND NNPKFSEPSYKCFAKEDLPKNATLCAVTANDIDAGINAKIIFSISSSNEGIRINSNNGIL TLDNSLDRETKPVIELVITAIDQGTPSLHSSVILIIVVVDVNDNAPTFIGNRNLSIDENV ETRTLVTKLNAVDIDEGLNAQVRFLITSGNTDGMFTINNQGELVTQKQPDRENIDFYSLN ITVHDLGDPSLSNTAVYTIQINDLNDNSPVFDRYRYILTVKENQLVNTIIIKINATDIDI GINKEITYRILGGNKENVFSLDPNIGSLTLIATLKFRKQKKYTLTVAATDKGSPSRSFIT FIEITVEDTNDFTPIFIDQPYVKSLNENVEIGTNVLLINAKDNDFGLNGDLTFSLENLQS LPFAINSKTDLNINTHRKCVMGQKSVSEATKWQVIGMKDGSMINNREIARKLKILENCKM LMDRDSGGVSRESGGLWRNGSKYSPVGTFVCSVDASDVDAGENATLSFFIFSAMLKIDQI SGEIRTNSLIDREVLNNIKATIQVKDNGKNQRESKTLLSVTILDENDNKPKFDFISYNFS FVEEQNAGTEVGKVFVTDEDMGINKEIVFDVIHTDRFWVDSLDNGIGIIKAKKLNREEKD LYKFIVRASDKGTPPLFSLVNVVVTITDINDNMPLIEDKRYQISIKETVSFATFVLKITA SDLDIGKNGQFVYKIKSSPNSHHFFINSSTGVIMTATALDYETVSSYILNIETIDKGSPP LSDSAVVNISINHEDNTAPKFEQVKGVSIYEDLGVNQPVVQFNASDVDGSNITYKIIGGI NEDTFQINKVTGLLFLKKNIDHEKKDFYNISVEASDARKKEVIYLPVDVIDVNDNYPIFN QASYSGNVEEESDDFTRVIVTVIASDKDSNLNAEIEYKIVSGNNSVFEIDSKLGILRSKK KLDREETETYIIEVAAVDKGTPSLCTSVFITINVADINDNYPQFENDVYNISVKENLGAG LFLIQLRAFDIDKNENGTVVYSINADFESLFSINESTGLLYALINFDREEKDSYTIKVKA FDHGIPSKSSETLVNIIVLDVNDNAPVIQTKTLPAVNESVSIGTNLFQILADDSDIGINK VLVFSITPDIFRIDNNGNIFLNRPLDRELVSQHNVFVKVEDTGEPRLHTSISYIIDVTDD NDNAPVFLNTPYYVDLEENFQSKKLLFKAHANDIDIGINSQIAYSILNNKEVFSINATTG DIYTTKAVDYETVQSFVLNISASDWKFTTFATVVVTIINLNDNYPQFEMFEYFASILENA TRNSLVVNVNANDLDAFGKLSYILFNTTDLPFKIESETGSIKVSDNLDREKIRSYSFKVI VFDSGNPKLHNETNIVVKILDVNDNRPKFKSNVEVISLKENKPVGTSISLLSPTASDEDI EENAILRYEAVQSSDDLYVDYVTGEIKTLRIFDREFQSSITFNYIAYDLGNPQLVSEKRV IVLNIEDENDNAPMWITNTSLSILEDYSINTQIFVMEAFDNDLGQNADINYYIKDNSMFQ ISSSGSVSLRKSLDRETKDIYNLTIFARDNGDVPLENFITVNITVLDVNDNYPIFNEDEL HAEIKENCKGISDLVKLQATDQDIGSNAQILYSLQHDLFSIDSITGQVKVLRALDREEIS QYNITVVARDKGNPSLHTEAFLIVYVLDMDDNCPVFTSSFYKETILENLPYGTFILQVTA TDKDIGANADLNYGILESNDRGAFKIDSVSGWITVMTSDKVDREFSEVYHLLIKAGSTSC GYTESDNVGEEGEVKNNYTVANVYITVTDINDNAPIILNVENKIYYENVLTTDIVVVNAT DKDLGKGGEIEFSIIRIDQKVVSNQVQNHVMVGVSDKGDKPLSSNATFIVINTVTCDAMY FSITEVGLLKVSSLCSVQNQNSQSEIVVLVNNSVSLSCIATGNSPVIYRWSKDGSLISGW SNDGNISLPSVKPDYEGSYSCIASSKPGVIQSNVTKLLIHEKPSILKQPTNVVVNERETA ILTVKATANPRPTYQWFKNDLPIKHATQDEFVLESTIPADSATYFCNITNNQGQVQSEKV KINVVNRESVVELNIKILKPNIKNMCFDFFLEDFEEQAKVILNRPLFVTNFRNTDDIKKL CNRTACSKNPCRNKGLCEIIDTGFQCVCTDSWQGQTCEENVNECAPDSNTCNKGNCTDLV GSFSCACPQGKSGNRCQYSSNACQSNKCIEKNEVCVPSKSNLFRCINKSNIMTLISKPIT NWSLQTQYDLELSLNRIIKTMITSVPADRKRKRKDISVVDFGHCIVHVIDHVLENDESKV FFILDCTISKLGSNKSAIFFLPDVVKEFCLQLLSSDDAFSQCGQLDEFMHKPVLPKMTTL NANVHFVIKDDNEKILPADKAIQIMTENDFAYRLEKYNYKVTSFWSAHDKPIQEKKGRTL MIALSASCAVVILAVVFVFVYQRRCLKSNDKNNQSSIMFQRSMMVPNASTSNLIPDYTSK RNKVFDEKNEVVNDDAFMSEVPTELISKKY NT seq 9093 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaggaagctatcagtaaagtaaagtaccagagatcaatcacttcaacaggtgatgcc ttaacaactttagtggataagatttatactgaaaaaagtggcatgagaagcgataaatct ataccaaagattggaattttattgactgatggttactcaaatggtgaaattgatgtctat tatgccgcaaagcgtgttaaggaagctggtattagcatgtttgttattggagtatctgct agtgtatatatgcctgaaatactagctattgccagtccaccagaaaatcagcattacatt ttaattgacagttatctagatctttctggcttcctcagtcaaattactgctgtttcctgt gatgaaggggctcagctgagtcaatgtgatagtataaaaacagctgttgatggtggatct tttaaatattttcaatccaacttcaaaggaattaaacaaggaagttacaagcgtgtctct tttgagttagttgataagcaaggaatgtcttttatttacacttcaacaaagctacgtaat cctgggcctttgtcagaagaaaaagatgtaaacaagagtgaaagcaacatatcacctcga ataatatcaatagatctatcttctgttaatgaaactatcatttacattgctgtcctaggt caaaaagattacaatgtgtttgaattgagtatatgggaatcattattttcaactgatcaa atctttgttaacatatcagaaaatgaaaatgccggacagcaagtttttgttgtacaaaca ataaataatccaaaaagctttaactatatgatcaaagatggtttgaatagtggtgacttc caaattgacaacaatggacaaataacaacaaataaaagtcttgacagagaaaatatatct agttataagttaagtgttatagccgaagataaaaatgataaatgtcacaaaggtttaata tcaattgtaataaatgttgatgataaaaatgacaacaaaccagaatttgaaaatcaagaa tacaaagtagaactaagagaagatactccattaaatcagtttgtcatacaggttcaagct acagacaaagatattggaaaaaatgctgagctgacttatgaactatctggctcaaatcaa gatatttttaagattgaaaaaaaaacaggtataattagaacaaacaaaactcttgattat gaatctaaatcaagttatacgattgagttagttgttcgtgattctggtgctaatgtgctg gttggatatgccaatctaattgtaagtgtgactgatgtgaatgagccaccagagtttcta aattgtaagataccaagaagttgtgtttttagtattgatgaaaaccaaccagaaaactca attgttggaacaaatataactgctatagatccagatacaacttcatgtaacctaagttac agcattgtttctcttgataaacagtattttaaaattacaggtaacacaatacaaacaaga atgtctcttgatagagaagcaaaagaaagttattctttagaagtgtctgttaaagattgt ggaaaacccccactctacacattcacaattattaccgtggttttaaatgatttaaatgat aataacccaaagttctctgaaccttcttataagtgttttgctaaagaagacttgcctaaa aatgctacattgtgtgcagtgacagcaaatgatattgatgctgggatcaatgctaaaatt attttcagtatttccagttctaatgaaggtatacgtatcaatagcaataatggaatactt accttggataatagtttagacagagaaacaaaaccagttattgaattagtaataactgct atagaccaaggaacaccttcgcttcattcatcagtcatcttaataattgttgtggttgat gtcaatgataacgctccaacattcattggaaatagaaaccttagtattgatgaaaatgtt gaaactagaacgctggttaccaaacttaatgctgtagatattgatgaaggtctaaatgcc caagttcgttttttaatcacttctggtaatacagatggcatgtttactatcaacaatcaa ggagagttagttactcaaaagcaaccagatcgtgaaaacattgatttttatagtcttaat ataactgtgcatgatttgggcgatccatctttatcaaatacagctgtgtatacaattcaa atcaatgatcttaatgacaacagtcctgtttttgatagatatcgatacattttgactgtt aaagaaaaccaactggtcaacaccataattataaagatcaatgcaactgatatagatatt ggtattaataaagagattacttacagaattttgggtggaaacaaagaaaatgttttttct cttgatcccaacattggaagtttaacgttaatagctactcttaaattcagaaaacagaaa aaatacaccctgactgttgctgctactgataaaggatcaccatcaagatcttttataact tttattgaaattactgtggaagatacaaatgattttacaccaatatttattgatcaacct tatgtaaagtctttaaatgagaatgtagaaattggaactaatgttttgttaatcaatgct aaagataatgattttggtctaaatggagatctcactttttcattagagaatctgcaaagt ctaccatttgctataaattctaaaacagacctaaacataaatacacatagaaagtgtgtc atgggtcaaaaatcagtaagtgaagcaacaaaatggcaagtaataggtatgaaagatggc tcaatgatcaataatagagaaatagctagaaaattaaaaattttagagaattgtaaaatg ttgatggacagagattcaggcggtgtaagtagagaatcgggtggtctttggagaaatgga agcaaatattctcctgttggtacatttgtatgttctgttgatgcaagtgatgttgatgct ggagaaaatgccacattgtcattttttatatttagcgccatgttaaaaatagatcagata agtggagaaatcagaaccaacagtttaatagatagagaagtgttaaacaacataaaagct acaatccaagtgaaagacaatggcaaaaatcaaagagaatcaaagactctgttgagtgtt acaatacttgatgaaaatgacaataaaccaaaatttgattttatcagctacaactttagt tttgttgaagagcaaaatgctggaacagaagttgggaaagtttttgtcactgatgaagac atgggaatcaataaagaaattgtctttgatgtaatacatactgatagattttgggttgat agcctagacaatggaataggtattataaaggctaaaaaactgaatcgcgaagaaaaagac ttgtacaagttcatagtaagagcctctgataaaggaacacctcctcttttttctttagtc aatgttgttgttactattacagatataaatgataacatgccattaattgaagataagaga tatcaaataagtattaaagaaactgtatcatttgcaacatttgttcttaagattactgcc tctgaccttgatattggtaaaaatggtcaatttgtttacaaaattaaaagcagtccaaac tctcatcatttttttattaattcaagtacaggtgtgatcatgacagctacagccttagat tatgaaacagtttcatcttatattttaaatattgaaactatagataaagggtcaccgcct ttatctgacagtgcagttgttaacataagtatcaatcatgaggacaacacagctccaaag tttgaacaagtaaagggtgtatctatatatgaagatcttggtgtaaatcaacctgtcgtg cagtttaatgcaagtgatgttgacggttcaaacattacatataaaattattggaggaatt aatgaggatacatttcaaattaacaaagtcacaggtttattgtttttaaaaaaaaatata gatcatgagaagaaagatttttacaacatcagtgttgaagcttccgatgcaagaaaaaaa gaggttatatacttaccagtagatgtcatagatgtaaatgataattatcctatttttaat caagcatcatattctggaaatgttgaagaagagagtgatgattttacaagagtcattgtt actgtcatagcatctgacaaagattctaatttaaatgcagaaattgaatacaaaattgtt tctggaaataatagtgtgtttgaaatagactcaaaattaggtatattgcgttccaagaaa aagttggatcgtgaagaaacagagacttacataattgaagttgcagctgtagataaaggt acaccttctctttgcacaagtgtttttatcactatcaatgttgctgatattaatgacaac tatccacagtttgaaaatgatgtttataacatttctgtcaaggaaaatttaggagctggt ctctttttaatccagttaagagcatttgatattgacaagaatgaaaacggaacagtcgtt tacagtattaatgcagattttgagagtttgttttcaatcaatgaatcaactggactgtta tatgcattgattaattttgatagagaggaaaaagattcttatacaatcaaagtgaaagct tttgatcatggtattccatcaaaatctagtgaaactttagttaacatcatagttttagat gtaaatgataatgcacctgtaatccaaacaaaaacattacctgctgtaaatgaaagcgtt tctataggaacaaatctttttcagatcttagcagatgattctgatattggtattaataag gttttagtttttagcatcacacctgatatctttcgcattgataacaatggaaatattttt ttaaatagacctttagatcgtgagcttgtttctcaacataatgtttttgtaaaggttgaa gatacaggtgaacctagacttcatacaagtattagttatattatagatgtcacagatgat aatgataatgcaccagtatttttaaacactccttattatgttgacttagaagaaaatttt caatcaaaaaagttattatttaaagcccatgctaatgatattgatattggaataaattct caaatagcttatagtattcttaacaacaaagaagttttttcgatcaatgctactacgggt gatatttataccacgaaagctgtagactatgaaactgtacaatcttttgtattaaatatt tctgcttctgattggaagttcactacctttgctactgttgtagttactattattaatctt aatgataattatcctcaatttgagatgtttgaatattttgcttctatacttgaaaatgct acaagaaatagtcttgttgtaaatgtaaatgccaatgatcttgatgcattcggaaagctt agttacattttatttaatacaacagatcttccttttaaaattgagagcgaaacaggaagt atcaaagtatcagataatttagatagagagaaaattagaagttattcctttaaagttatt gtttttgacagtggcaatccaaaattacacaatgaaactaatattgtagttaaaatctta gatgtcaacgacaaccgtcctaaatttaaatcaaatgtagaagttatttctttaaaagaa aataaaccagtaggcacatcaatatctttattatcgcccacggcatctgacgaagatatt gaagagaatgccattctgcgatacgaggctgtccaaagtagtgatgatctttatgtagac tatgtaactggtgaaataaaaacattgcgtatttttgacagagagtttcagtcaagtata acttttaattatattgcatacgatcttggaaatcctcaacttgtttctgaaaaacgggta atagttctaaatattgaagatgagaatgacaatgctccaatgtggattacaaatacatct ctatctattcttgaagattattcaattaatactcaaatttttgttatggaagcctttgac aatgacctgggacagaatgctgatataaactattatattaaagacaattcaatgtttcaa atttcctcttcaggttcagtttccttaagaaaaagtttggatcgggaaactaaagacatt tataatttgacaatttttgcacgtgataatggagacgtacctcttgaaaattttattact gttaatatcacagttttagatgtcaatgacaattatccaatttttaatgaggatgaattg catgcagaaataaaagagaactgtaaaggaataagtgatttagtgaagcttcaagcaaca gatcaagatattggtagtaatgcacagatattgtactctcttcaacatgacttattttcg attgattctataactgggcaagtcaaagttcttcgagcactagatcgtgaagaaataagt caatataatattacagttgttgccagagacaaagggaatccgtcactgcacacagaagct tttttaattgtgtatgttttagatatggatgacaactgtccagtatttacctcgtctttt tataaagaaacaattttagaaaatctaccatatggaacgttcattttgcaagtgacagct actgacaaagatattggggcaaatgctgatttgaactatggcattctagagagcaatgat cgtggggcatttaaaatagactctgtttcaggctggattactgttatgacttcagataaa gtagatcgtgagttttcagaagtatatcatcttttaataaaagcaggctctacctcatgt ggatatactgaaagtgacaatgtgggtgaagagggggaagtaaaaaataattacacagta gcaaatgtctatattactgtaacagatataaatgataatgcaccaataattttaaatgtt gaaaacaaaatctattatgaaaatgttctcacaacagatattgttgttgtgaatgcaact gataaggatttaggaaaaggtggagagattgaatttagtataatacgaattgaccagaaa gttgtttctaatcaagttcagaatcatgtgatggtaggtgtatcagataaaggtgataaa cctttatcaagcaacgccacttttattgttatcaacactgttacatgtgatgctatgtat ttttctatcactgaagttggtcttttgaaagtaagcagtttatgctctgtgcaaaatcag aattcgcaatctgagattgtagttttggtaaacaattcagtttctttgtcatgcattgca actggtaattctcctgtaatctatcgatggtcaaaagacggaagtcttatttctgggtgg tctaatgatggtaatatatcattgccatcagtaaaacctgattatgaaggatcctattcg tgcattgcatcaagtaaaccaggagttattcagtcaaatgtgacaaaactgttaatacat gaaaaaccctccattctgaaacaacctactaacgttgttgtaaacgaaagggagactgct attttaacagtcaaggctaccgcaaatccacgtccaacatatcaatggtttaaaaatgat ttaccgataaaacatgcaactcaagatgaatttgttttggaatcaacaataccggcggat tctgctacttatttttgtaatattacaaacaaccaaggacaagttcagtccgaaaaagta aagataaacgttgttaatcgggaaagcgtggttgaactaaatataaagatattaaaacca aacattaaaaatatgtgttttgattttttcttagaagattttgaggagcaagctaaagtt atattaaatcgaccactgtttgttacaaactttcgaaataccgatgacataaaaaaactt tgtaaccgaacagcttgcagtaaaaatccttgccgaaataaaggtttatgcgaaatcata gataccgggtttcaatgtgtttgcacagactcctggcaaggtcaaacatgcgaagaaaac gtaaatgaatgtgctccggattcgaacacttgtaataaaggaaattgcactgatctagtc ggttcgtttagctgtgcttgtccgcaaggaaagtctggaaatcggtgtcaatatagttca aatgcatgccaaagtaacaagtgtattgaaaagaatgaagtttgcgtaccttccaaaagc aaccttttccggtgcatcaataaatctaacataatgacgctgatatcaaaacccattacg aattggagtcttcaaactcaatacgatttggaactttctcttaatcgcataataaagaca atgatcacgtccgtacctgcagatagaaaacggaaaaggaaagatatttctgtcgtggat ttcgggcactgcattgtacatgtgatagatcacgttttagaaaatgatgaatcaaaagtg ttttttatacttgattgcacaattagtaagttgggtagcaataaatcggccatctttttt ttacctgacgttgtaaaagaattttgtttgcaattactttccagcgacgatgcttttagt cagtgcggacaacttgatgaatttatgcataaacctgtattgccaaaaatgacgacatta aacgccaacgttcactttgttataaaagatgacaacgaaaaaatactaccagctgataaa gccattcaaatcatgacggaaaatgatttcgcttatcgtttagaaaaatataattataaa gttacaagtttttggagtgctcacgataaaccaatacaagaaaaaaaaggacgaactctc atgatagctctttccgcttcctgcgctgtcgttatattagctgttgtttttgtgtttgtt taccaacgccgttgcttaaaatcaaacgataaaaataaccaatcatctataatgtttcag cgatctatgatggtgcccaacgctagtacttctaatcttattcctgattatacaagcaaa agaaacaaggtttttgatgaaaaaaacgaagttgttaatgatgatgcattcatgtctgaa gtgccgactgagcttatttcaaaaaaatattaa

DBGET integrated database retrieval system