Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100213595
Help
Entry
100213595 CDS
T01080
Name
(RefSeq) DNA polymerase zeta catalytic subunit isoform X1
KO
K02350
DNA polymerase zeta [EC:
2.7.7.7
]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg03460
Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03460 Fanconi anemia pathway
100213595
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
hmg03400
]
100213595
Enzymes [BR:
hmg01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
100213595
DNA repair and recombination proteins [BR:
hmg03400
]
Eukaryotic type
TLS (translesion DNA synthesis) factors
B-family DNA polymerases
100213595
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_B
POL3_N
DNA_pol_B_exo1
REV3_N
zf-C4pol
HTH_NOL4_2nd
CRR7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100213595
NCBI-ProteinID:
XP_047128299
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(17005871..17071626)
Genome browser
AA seq
2137 aa
AA seq
DB search
MPAFSLRIIDASYYMEKPIQGLDFCFSEFRQTAIYHVPVIRIFGTTPLGQKSCLHIHQIF
PYLYVPLPAGVDNGLRFCKEFAMSLDSALTISFGKSVSQQRQHVFKVEIVKKIPFYGYYK
NEKDFLQVYLYNPNHVSVAGDLLINGSVMNQFFQPFETHIPFILQFFIDYNLHGMNFINL
SSVLFRTPLPKKDTVSNLTFSSPQTSDLFQSPSIKKSNFEVFTEETIHESHLLYVKKQST
CAVEVDAIESAILNKNSIMENIGTNPGLNELWEDEKQRLRDNHENSIIKISESQDREEFI
TNDEKLSLKKLKGIIDERRLKLSEDLLNLSTTSDQGSCFNSLLATTLEQDSLALDSTADQ
SLVNILLNMAEEEELHNSLEPLSALSETSLINNGLGHEEDDEHDDDENESILMSQTVNDI
INYPDNSFLSSQSYIWSNPLLDDQENQCVEMLSNSPIESIKCDNSKDSTVFNESRVNKEK
NFIPQLDGNSDLCRDSSSEDFQSYSRKRKRKKLKSKSKKKSSSFEINTSLDSSTISSLTL
ENISNKSSLECRKNCVDNNLKYNLKDNFVYPKVYPSRVKNKNSLEISAMPVLCSKDCLLK
SSPNMKQEKKKRTLKTTLKSEKSEFFLKNKEYLQKKYNLKNCQVVLCNNKSITQQHCSSS
KLQDSKNKLKYNLTSTTNKHFSSKKYKTQSDVNQIKTSLEYNTDQEECLISESPGEIDCS
RNLIMLTGVTSVTSFKENHSPTLISSSQFIEEQVLNTNQTCSNDKGSERTCSKDEVFEQI
CLNDVVSKQSFLNDVVLKQIFSNDESSEQTCLNDVVSEQIFSTDDSSEQTCLNDVVLEQI
FSNNESSEQTCSNDLILEQIFSNNDSSEQTCLNDVVLEQIFSNDESSEQTCSNNLVLEQI
FSNDESSEQTCFNDKNLKPTWSYDEKSEQTCSNNKISEPTCSNDAEIMQTSLNEEIRNNT
LNSNLKVLSYCNKEPETLTLRETLFYKEDNTSYNETALPFTKVGVLEINDSADKASTKSS
QQNYLENKKKTCHKRLKYPVSSVQNCSSSFTFSMNNYIYTPLEKPPSYNKVLSTLGKNNL
QEITYEVPFYSDKTDVAGTLTEKNNPSCRTKVKALPKYSTNLPLVTLDYLQQNQLQQLQL
DIFTSPSGYDQAHPLLADILNSSKIVVITPCLQPPKYSAVLHWLHNQKECKSPIKKSHIH
EKYLKPDGDIALQKESLQVNPDIENACLFPALATSPSLQNSNEPEISTPCGFFSDKDPIV
AFEVGEIQSHKKTTFKGINSSDIEGFTPNNTYAFKTTQQNISNAKAIHFNQSLTIVSIEL
HIQTRRNLRPDPTIDPINSIFYTMHQELLNIDVSGVFITDTCMISQNSTQLLKKAGIAIS
STHCFSDELLMLKGFSSFIQEHDPDILVGYEVQMLSIGYLIERAAALNYNMCHAMSRISS
TEVYSKKIQKDQEDNWFGQLVSMEITGRIILNLWRIMRSEIALQIYTFENVFYHICHQRV
AAYSFCSLSEWWLTNSSRWRVIDYYLKRCQGNIRLLDQIDFINRTSELARIFGILFYSVI
SRGSQFRVESMMLRIAKPMNFIPMSPSPHQRARMSAPECIPLVMEPESRFYVDPVIVLDF
QSLYPSIIIAYNYCFSTCIGRVKLCAENELFNFGAASLNLPFHVLQELLNDSNVHISPNG
VGFVKKDVRTGIIPRMLDEILLTRVMVKSSMKKAKANKVLYKLLDSRQLGLKLIANVTYG
YTAANFSGRMPCIEVGDSVVRKGRETLERAIHLVNSTEKWNAKVVYGDTDSLFVLLKGAS
KETAFAVSAEIVDAVTALNPKPIKLKFEKVYQPCFLITKKRYVGYMYESLDQKVPIFDAK
GIETVRRDNCPAVGKVLEKSLRILFEKNDLSLVKKYVQNQFVKIMEGNVILRDFIIAKEY
RGLNNYKPGACVPALALTRKQLKLDRRAEPRIGERVPYVISHGSPGLTLIQLVRSPMELI
HNNNLRLNEAYYITKQLCPSLDRIFSLIGVNVAKWFVDLPRITRVNDREFECDDNKKGMI
SHYFSSNHCLICSQLTNHKVCIDCRNDSQRTVFFLNSKCRAIERRYIHFTTLCQHCTSTR
FLQSNCVSLDCPIFFKLSNISRDLQRTKEVRHIISEF
NT seq
6414 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctgccttttcgcttcgaattattgatgcaagttattatatggagaaacctatacaa
gggttagatttctgtttttcagaatttcggcaaactgcaatttaccatgttcctgtgata
cgcatttttggtacaacacctcttggacaaaaatcttgtcttcatattcatcaaatcttt
ccatacttatatgttcctctacccgctggtgttgataatggtttaagattttgtaaagag
tttgcaatgagtttagattctgcactaacaatttcttttgggaaaagtgtatcacaacaa
cgtcaacatgttttcaaagttgagatagtaaaaaaaataccgttttatgggtattacaag
aatgagaaggattttcttcaagtttatttatataatcccaatcatgtttcagtagctgga
gatttgctcataaatggctcagtaatgaatcagttctttcaaccttttgaaacacatata
ccatttattcttcagttttttattgactacaatttgcatggaatgaattttattaatctt
tcgagcgttttgtttcgaacaccactaccaaaaaaagatacagtttctaatttaactttt
tcaagtccacaaacttctgacttgtttcagtctccttcaattaaaaagtcaaactttgaa
gtgtttactgaagaaactatccatgagtcacatttgctgtatgtaaaaaagcaaagtact
tgtgcagtggaggtagatgcaattgaatcagccattttaaataaaaatagtatcatggaa
aatattggaactaatcctggtttaaatgagttatgggaagacgaaaagcaacgactaaga
gacaaccatgaaaattctataattaagattagtgaatctcaagatagagaagaatttata
accaacgatgaaaagctgagtcttaaaaaactaaaaggcatcattgatgaaagaagatta
aagttaagtgaagatctattaaatttatcaacaacttcagatcaaggttcttgttttaac
agtttattagctacaactttagaacaagattcattagcacttgactctactgctgaccaa
agtttggttaatatacttttaaatatggcagaagaagaagagctccataacagcttagaa
cccctttctgctctatctgaaacaagtttaataaataatggcttaggtcacgaagaagat
gatgaacatgatgatgatgaaaatgaaagcattttgatgtcgcaaacagttaatgacatc
ataaattatcctgataattcatttttgtcttctcagtcttacatatggagcaatccttta
cttgatgatcaagaaaaccaatgcgtagaaatgttaagtaattcaccaatagaaagcatt
aaatgtgacaatagtaaagattcaactgttttcaatgaatcaagagtaaataaagaaaaa
aattttattcctcagttagatggaaattccgatttatgcagagattcgtcaagtgaggat
tttcaatcatattcaaggaaaagaaaacgaaaaaaattaaaaagtaaatcaaagaaaaaa
tcttctagctttgaaattaatacaagcttagatagttctactatctcctctcttacttta
gaaaatatctccaacaaaagttctctagaatgtagaaaaaattgtgttgataataattta
aaatataatttaaaagataactttgtttatccaaaagtttatcctagtcgagttaaaaat
aaaaattctctcgaaatttccgctatgcctgtgttatgttcaaaagattgtttgctaaaa
tctagtccaaatatgaaacaggagaaaaaaaagcgtactctaaaaactactttaaaatca
gagaaatcagagttctttttaaaaaataaagaatacttgcaaaaaaagtacaacttgaaa
aattgtcaggttgttttatgcaacaacaaatctataacacaacaacattgctcttcttca
aaacttcaagactccaaaaataaattgaaatataatttaacgtcgaccactaacaaacat
ttctccagcaaaaaatataaaactcaatcagatgtgaatcagattaaaacaagtcttgag
tataacacagatcaagaagagtgtcttatttcagaaagccctggagaaattgattgttca
agaaacttgataatgctgacaggtgtaacaagtgtaacttcgtttaaagaaaatcattct
cctactttaatttcttcttcacagtttattgaagaacaagttttgaataccaaccaaaca
tgttcaaatgataaaggatcagagcgaacttgctcaaaggatgaagtatttgagcaaatc
tgcttgaatgatgtagtatcaaagcaatccttcttgaatgatgtagtattgaaacaaatt
ttttctaatgatgaaagttcagagcaaacctgcttgaatgatgtagtgtcagaacaaatc
ttttctactgatgatagttcagagcaaacctgcttgaatgatgtagtattggaacaaatc
ttttctaataatgaaagttcagagcaaacctgctcaaatgatttaatattggaacaaatc
ttttctaataatgacagttcagagcaaacctgcttgaatgatgtagtattggaacaaatc
ttttctaatgatgaaagttcagagcaaacctgctcaaataatttagtattggaacaaatc
ttttctaatgatgaaagttcagagcaaacctgttttaatgataaaaatttaaaaccaacc
tggtcttatgatgaaaaatcggaacaaacctgctctaataataaaatatctgagccaacc
tgctcaaatgatgcagaaataatgcaaaccagtttaaatgaagaaataaggaacaatact
ttaaatagtaatttaaaagttttatcttattgtaataaagaacctgaaacattaacactg
agagagacacttttttataaggaagacaacacaagttacaatgaaacggcactaccattt
acaaaagttggggttttagaaattaatgattctgcagataaagcttcaacaaaaagtagt
caacaaaactatttagaaaataaaaaaaaaacttgtcacaaaagacttaagtatccagtt
tcctctgttcaaaattgctcatcaagttttaccttttcaatgaataactatatatatact
ccccttgagaagccaccttcatataacaaagttttaagtacgctaggtaaaaataatctc
caggaaataacttatgaggtgccgttttatagtgacaaaacggatgtagctggaacacta
actgaaaagaacaatccaagttgtagaacaaaagtaaaagctcttccaaaatattctaca
aaccttcctcttgtaacacttgattatttacaacaaaatcagcttcagcaactacaatta
gatatatttacatctccaagtggctatgatcaagcacatccattactagctgatatattg
aactcaagcaaaatagtagtaataacaccgtgtttgcaaccacctaaatattctgcagtg
cttcattggttacacaatcaaaaagaatgcaagagtccaataaaaaaatctcatattcat
gaaaaatatttaaaaccagatggtgatattgctttacagaaagaatcacttcaggttaat
cctgatatagagaatgcatgtttgtttccagctttagcaacatctccttctttgcagaac
tcaaatgaacctgaaatatctactccatgtggtttttttagtgataaagatccaatagtt
gcttttgaagttggtgaaattcagagtcataagaaaaccacctttaaaggcatcaattct
tctgatattgaaggatttacacctaataatacatatgcattcaagacaacccagcaaaac
atttccaatgctaaagctattcattttaatcaatctcttacaattgttagcattgagctt
catattcaaacaagaagaaatcttagacctgatccaactattgatcctataaattcaata
ttctacactatgcatcaagaattgttaaacattgatgtttctggagtgtttattactgat
acctgtatgatttcccaaaatagtactcaattgttgaagaaagctggtattgctatatca
tcaactcactgttttagtgatgagctgcttatgctgaaagggtttagctcttttatacaa
gagcatgatcctgacattcttgttggttatgaggttcaaatgctttcaattggttattta
attgaaagagcagcagctctaaattataacatgtgtcatgctatgtctcgtattagtagt
actgaagtttactccaaaaagattcaaaaagatcaggaagacaactggtttggccagctc
gtttccatggaaattactggaagaataattttaaacctgtggagaataatgagaagcgag
attgcattgcaaatatacacttttgaaaatgtgttttatcatatttgtcatcaaagagtt
gctgcttattcattttgcagtttatctgaatggtggcttacaaatagctcacgttggaga
gttattgattattatttaaaacggtgtcaaggaaacattaggttattggaccaaattgat
tttataaatagaacaagcgaactggcaagaatatttggaattttattctactcagttatt
tctcgtggttcgcagtttcgagtcgaatcaatgatgttaagaattgcaaagccaatgaac
ttcattcctatgtcacctagtcctcatcaaagagcaagaatgtctgctcccgagtgtatt
ccactagttatggagccagaatcacgtttttatgttgatcctgtaattgtattagatttt
caatcattgtatccatctattataattgcatacaactactgtttttcgacttgcattgga
agagttaaactttgtgcagaaaatgagctgttcaacttcggtgcagcatctttaaatctt
ccatttcatgtgttacaagaacttttaaatgattcgaatgttcatatttctccaaatggt
gtaggttttgtcaagaaagatgtcagaaccggaattataccaagaatgttagacgaaatt
ttattgactcgtgtaatggtgaaatcatcaatgaaaaaagctaaagctaataaggtgctt
tataaactattggactctcggcagttaggcttaaaattaattgctaatgtaacatacggc
tatacagcagctaatttttctggccgaatgccatgcattgaggttggagatagtgttgta
agaaaaggaagggaaacattagagcgagcaatacatttagttaactctacagaaaaatgg
aatgctaaagttgtttatggtgatactgacagcttgtttgttttgctaaaaggtgcttca
aaagaaactgcttttgctgtttcagcagaaatagtagatgcggttacagcactaaaccca
aagccaataaaattaaagtttgaaaaggtttatcagccttgttttttgattacaaaaaag
cgctatgtgggttacatgtatgaaagtcttgaccagaaggtacctatatttgatgccaaa
ggtattgaaacagttcgaagagataattgccctgcggttggtaaggttttagagaaatct
ttacgtatactctttgaaaaaaatgacttgagtttggtaaaaaaatacgtacaaaatcaa
ttcgttaaaattatggaaggaaatgtcattttgcgtgacttcattattgctaaagaatac
cgtggtttgaacaattataaacccggggcttgtgtacctgcactagcgctgacaaggaaa
cagttaaaactagatcgtcgtgcagagcctcgtattggcgagcgagtaccatatgtaatt
tctcacggaagtcctggattaacattgattcaattagttcgaagtcccatggaattgatt
cataataacaatttacgtttgaatgaagcgtactacattactaagcagctatgcccatca
ttagatagaatattctcattgattggggtgaatgtagcaaaatggtttgttgatttacct
cgaataacgcgtgtcaatgatcgtgaattcgaatgtgatgacaacaaaaaaggtatgatt
tcgcattacttttccagtaaccactgtttaatttgttcacaattaaccaaccataaagta
tgtattgattgtcgaaatgattctcaacgtaccgtcttttttcttaactctaagtgtaga
gcaattgagcgtcgttacatacattttactacgctgtgtcagcattgcacaagtactcgt
tttctccaatcaaactgtgtatctttagactgtccaattttcttcaaactttcaaatata
tccagagatcttcaaagaactaaagaagttcgccatattatttcagaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
