Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 101234870
Help
Entry
101234870 CDS
T01080
Name
(RefSeq) proteasome activator complex subunit 4A
KO
K06699
proteasome activator subunit 4
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg03050
Proteasome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03050 Proteasome
101234870
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03051 Proteasome [BR:
hmg03051
]
101234870
Proteasome [BR:
hmg03051
]
Eukaryotic proteasome
Regulatory particles
PA200
101234870
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HEAT_PSME4_mid
HEAT_PSME4
PSME4_C
Anoctamin
HEAT_GCN1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101234870
NCBI-ProteinID:
XP_047137768
LinkDB
All DBs
Position
8:50170429..50259906
Genome browser
AA seq
1836 aa
AA seq
DB search
MDKPLKYQHSNIYNNLLPYSKDLEKEALQNFSEIKYNLGRAVLFVEFSPGVLVWCNRLES
YIRFYGFKFSKTDHVLLIKLIYQLLIIPDLEPQYVKGFTNILCKLLKKEKLLARNDLELE
WRPLYKLIQAARCNKLTQIGLKKYPCKYLESLVQLVKIARSYFSVESTVEMLLEWRPLMC
VFDATKRDAAFYFSCFLPTWLPYEHHNKGFRLWFTEFLEYWFHCTHNHANVAESYMNLFA
RLTQSNVGFIDWNPYLPKIFNQFLSGLNLPVTGAAHHKSSRQDVLLIAVYTKWFVYMIGG
QCKVLEFLENLFVTLESFYHPSNHGGFSHVLLVLVHTLAQHFVQRLHIERYAKPNWQNQI
RDEFKITDKDIERFVLMLKDICLLSMYSKSGSGSAAVTLQNLALLRADIVLPSVIDRTVE
ALETIVEPHQVTAALQCLTSVSRTLVSGGDHFPAAPTHILTLLYAVLPGIDPNDFHKTMA
SFSFISSILGQIPLVNCMSALNAGIEMTEIERELCLMSGQLEDYLLQLIDRCFFLVENLS
TEQISEQDNKLMENMNVQEGMLGIGLSSTVQVVFTQSSPTIFKALLDCLFTFVTNHVLEV
NVAGKIVSDMCRAAAKAYPTITLKKFFTHISSVIVDLSTAEGVKNEENVDPKLLWYLEVL
SEIYCDGMELLPYREMLNKVLSLTLHMKCKKVYSRAGKLLKHVLCSCSNTYAVEFRSLNI
PFDRDPVEHFYIRDWGKCGHVNELKMNWHTPSVDEQMFVNELLKQHLLPELEMVESYISG
KHMTRDELHRRIQIIAVCISGCAALLPMWNDILVEVTGPSSMVSRQRLPLLLNQSDLPII
EMCVSRKLIIDLMHRLYEFILAQNEDDTKSFRIVARIYEYLNSHFGVNLHEFNQRMKNAG
LVKAALADKLHGCKYHLRAILVEHIQLHHEMRVLYRVSSLYTLTDQIIVHDLVKMSTSAY
TEVRIDAQKILSQQLNIFDYSARSILPLLLGNLKEDPSISHEKLKGTLYLFLNSNLLNLI
THYFEVLDYSWPVFVQANHSEKLSIVTLIQNLCSKISLKYDTLGIKRQMTENCEKAAYDI
LKSDKPTPSLLNNEQKESENPVPIESLIMIAKSKVEESNQQRLKFYYSLHDQLVDLCNSK
SLHWRGVEYCIKFLLLLRFESVEIPIKTASLFVNLLVSDSLVIRQDALRGVNSILHQQKP
KFEKVVLDYKKYGFSSSPSELLNLQPGDNRLDNEWLQFKWIFEPKSQEDLEKYHYVDKTH
WSFQTWPVELKIYSPTCLVERTYNESNPYHMLFKKFFSDEELTNSFFKFVSLEVKKGEDS
FYVHHFQHFKLLCQNFGSTLLVEFKKRIEEFLSENIESKHRCAAEMISGIIRGCRNWKYD
DLESFWSFVCLQLKAVFSTNIMPELLTDWSTALAHSTESRDPNRLHHLFRMLLENPISSV
GGSFGDSSRLFILIRTIAQQEWRMADVYHDLLEYLKPHFSHYFKNVRDRIGSVLSHLFMY
DLKYGGYTKTKSPHIDQFIDFVLPELVHLKLEILNESSVSNKDHVVIDNSKTNHSNHEIP
IRSEESKSRDRVAKTVLGFLFNTAFMMQPMNKEIFKLIPVLMVLEAREDDQEMVQLCKKA
FSTLATKQLDNDVIEVAIPLLKEVCSLKSWNARKAGLNYFKIMIFHNFFTFNNDVIKKEV
KDLVLERLKDEQLEVRDEAATLLSGLIHYGYFTVTKELCTVFSEMARTKVKKLRYGVILE
DPHFNTSFFHIKHGGVLGLSACVLAYPYEVPIWMPEVLLDLGNYIHSYPQIQATVKKALS
EFRRTHHDSWHIHRQKFTEDQLTQMNDLLASPSYYA
NT seq
5511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaccattgaagtaccaacatagtaatatttataacaatctacttccatattca
aaagatttagagaaagaagcattacaaaatttctctgaaataaaatacaacttgggcaga
gctgttttgtttgttgaattttctcctggagtacttgtctggtgtaataggcttgaatcc
tatattcgattttatggatttaaattttcaaaaactgatcatgttcttttaatcaaattg
atttatcaacttcttattattcctgatcttgaaccacaatatgtcaaaggatttacaaat
attttgtgtaaactattaaaaaaagaaaaactacttgcaagaaatgacttggaattagaa
tggagaccactttacaagttaatccaagctgcacgatgcaataaattaacacaaatcgga
cttaagaagtatccttgcaaatatttagaatcacttgttcaactggtaaagatagctaga
agttatttctcagttgaatctactgtggaaatgttgctagaatggcgtcctcttatgtgt
gtgtttgatgctactaaaagagatgctgcattttatttctcctgctttcttccaacttgg
ctgccttatgaacatcataataaaggattcagattatggtttacagagttcttagagtat
tggtttcattgtacccataatcatgctaatgttgcagagagttatatgaatttatttgca
aggttgactcaatcaaatgttggttttattgattggaatccatatttgcccaagatattc
aatcagtttttaagtggtttaaatcttcccgttactggggctgcgcatcataaatcttct
cgtcaggatgttttgcttattgcagtatatacaaaatggtttgtctatatgataggtggt
caatgtaaagtgttggaatttttagaaaacttatttgtaactttagaatctttttaccat
ccatcaaatcatggaggcttctctcatgtacttcttgtattagtccatactctagctcaa
cattttgttcaaagactgcacattgaacggtatgctaagcctaactggcaaaatcaaatt
cgtgatgaattcaaaataactgataaggatattgagcggtttgtgttaatgcttaaggat
atatgtttactatctatgtacagtaagtctgggagtggaagtgctgctgtaactttgcaa
aacttagctttacttcgtgctgatattgttttgcctagtgttattgatcggacagttgaa
gcattagaaacaatagttgagcctcatcaagtaacagcagcattacaatgtttaacttca
gtatctaggacacttgttagtggtggtgatcactttccagcagctccaactcatattttg
acgttgttatatgctgttttacctggaattgatccaaacgattttcataaaaccatggct
tctttctcatttatatcatcaattttagggcagataccattagttaattgcatgagtgct
ttaaatgctggtatcgaaatgacagaaattgagagagaattgtgtttaatgtctggacag
ttggaggattatttacttcaactcattgataggtgttttttcttggttgaaaatttatca
actgagcaaatttcagaacaggataataaacttatggagaatatgaatgttcaagaagga
atgcttggaataggactttcatcaacagttcaagttgtattcactcaatcgtccccaact
atttttaaagcgttattagactgtttatttacatttgtgacaaatcatgtgcttgaagta
aatgttgccggaaaaatagtttcagatatgtgtcgtgcagctgcaaaagcttatcctact
ataactttgaagaaattttttacccatattagttctgttattgttgatttatcaacagcc
gaaggtgtgaagaacgaggaaaatgttgaccctaaactcctttggtaccttgaagtacta
tctgagatttactgcgatggaatggagttactaccttatagagaaatgttgaataaagtc
ctcagcttaacattacacatgaaatgtaaaaaggtgtacagcagagcaggaaaattgctg
aaacacgttctttgctcctgcagcaatacatatgctgtagaatttagaagtttaaatatt
ccatttgaccgagaccctgtagaacacttttacatccgagactggggaaaatgtggtcat
gtaaatgaactaaaaatgaattggcacactccaagtgttgatgaacaaatgttcgtaaat
gagctgttaaagcaacatttattacccgagttagaaatggttgaatcctatatctctggg
aaacatatgacaagagatgaattacatagaagaatccaaattatagctgtatgtatatct
ggttgtgctgccctacttcctatgtggaatgatatacttgttgaggttactggcccatca
tcaatggtttctaggcagcgtttgccattattgctcaatcagtccgacctaccaataatt
gaaatgtgtgtgtcacgcaaactaataattgatcttatgcatcggctatatgagtttatt
ttggctcaaaatgaggatgacaccaaatcatttaggattgttgctagaatttatgaatat
cttaatagtcactttggtgttaatttgcatgagttcaatcaaagaatgaaaaatgctggt
cttgtgaaagctgctttagcagataaacttcatggatgcaaatatcatttacgtgctatt
cttgttgaacatattcaacttcaccacgaaatgagagttttatatcgagtctcttcctta
tacacattaacagatcaaattattgttcacgatcttgtaaaaatgagcacaagtgcttac
acagaggttcgtattgatgcacaaaaaatactttcgcaacagttgaacatatttgattat
agcgccagatcaattttgccattactacttgggaatttaaaagaagatccaagtatctct
catgaaaagttaaaaggaacattgtatttatttttaaacagtaacttactcaatttaata
acacattattttgaggttttggattattcatggcctgtttttgttcaagccaatcattcc
gaaaagctatctattgttacattaattcaaaacttatgttctaaaatatcattaaaatat
gatacacttggtattaaaagacagatgacagaaaactgtgaaaaggctgcatatgatatt
ttaaaatcagataaaccaactccatcattattaaataatgaacaaaaggagagtgaaaat
cctgttccaatagagtcgcttataatgattgcaaaaagtaaagttgaagaatcaaatcaa
caacgacttaagttttattacagtcttcatgatcagttggttgacttatgtaattcaaaa
agtttgcattggcgaggtgttgaatactgcataaagtttttgcttcttctaagatttgaa
agtgtggaaattccaattaaaacagcaagtctgtttgttaatttacttgtcagtgattcg
cttgttataagacaagatgctttgagaggagttaattctattttacatcaacaaaagcct
aaatttgaaaaggttgtgttagactataaaaagtatggattttcttcaagtccaagtgaa
ttattaaatttacaacctggagataatcgactggataatgagtggttacagtttaaatgg
atatttgaacccaaaagtcaagaagacctggaaaaatatcattacgttgataaaacacac
tggagtttccaaacatggcctgtagaacttaagatatattcacctacttgtttagttgaa
aggacttataatgaatctaatccatatcatatgttatttaaaaaatttttttctgatgaa
gaattaactaatagtttttttaagtttgtgtcattggaagtaaaaaaaggagaagattcg
ttttacgtgcaccattttcaacattttaagttgttatgccagaactttggatctactttg
cttgtggaatttaaaaaaaggattgaggaatttctaagcgaaaatattgagagcaaacac
aggtgtgctgctgagatgatctctggaattattcgaggttgtagaaattggaagtatgat
gaccttgaatcattttggagttttgtttgtcttcaattaaaagctgttttctcaacaaat
attatgccagaacttctaacagattggtcaacagcacttgctcattcaacggagtctcgt
gatccaaatcgtttacatcatttgtttcgaatgttactcgaaaatcctattagttctgtt
ggtggttcatttggggattctagtcgtttattcattcttatacgcactattgcacagcaa
gaatggagaatggcagatgtatatcatgatctcttagagtatttaaaacctcattttagc
cactactttaaaaatgttcgagatagaattggaagtgtactatctcacttgtttatgtat
gacttaaaatatggtggttacactaaaaccaagtcaccacatattgatcagttcattgat
tttgttttacctgaattagttcatctgaaattagaaatattaaacgagtcgagtgtttct
aataaagatcatgttgtcatagataatagtaaaacaaaccattctaaccatgaaattcca
atcagaagtgaagagagtaagagcagggatagagtcgctaaaactgttcttggtttttta
tttaatactgcttttatgatgcagccaatgaataaagaaattttcaagctgataccagtg
ttgatggtacttgaagctcgtgaagatgaccaggaaatggttcagttgtgtaaaaaggca
ttctctactcttgctacaaaacaacttgataatgatgtcattgaggtggctatcccgctt
cttaaagaagtttgttcattaaaatcttggaatgctcgaaaagccggactaaactacttt
aagatcatgatttttcataacttttttactttcaacaatgacgtaattaaaaaagaagta
aaagacctggttttagaacgtcttaaagatgaacagcttgaagtcagagatgaagctgca
actttacttagtggtttaattcattatggttactttactgttactaaggagctttgcaca
gttttttcggaaatggctagaacaaaggtaaaaaagttaagatatggtgttatacttgaa
gatcctcatttcaacacatccttttttcacattaaacatggtggggttcttggtttatca
gcttgtgtattagcttatccatatgaagttcctatttggatgccagaggtattgcttgat
ttaggaaattacattcacagctatccacagattcaggctactgtcaaaaaggcattgtca
gaattccgtcgaacccatcacgatagttggcatattcacagacaaaagtttaccgaagat
caactaactcaaatgaatgacttacttgcatcaccaagctattatgcatag
DBGET
integrated database retrieval system
