Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 101235065
Help
Entry
101235065 CDS
T01080
Name
(RefSeq) nicastrin
KO
K06171
nicastrin
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
101235065
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ncstrn_small
Nicastrin
DUF2062
PrnB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101235065
NCBI-ProteinID:
XP_047131126
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(48670192..48715068)
Genome browser
AA seq
703 aa
AA seq
DB search
MAASSMVLVLLICLNNYVSSSKIEFKIYKSIKSYSPCILLTNATHQVGCTSNMGGNRGIL
HVVESDDDVDWLIDKGTNQPYIPLLNSSFFNENVMNKLMNSKKISGVLVVHKSTTVLPTS
FSPDSKCPLDQFGAYSNDKENGNCQKIKWNPTGNDMSKKYYGIPIFALADGEEINELVKC
YQKHNKLKEAEATPSFPLCAIEMKDFMFASKDTPTCRRKTEMPNPIQSTYCDPLGDNNIY
GSLFPMVDKIENDEVIMAATRLDSTAFFHDFAPAADNGVTGIVTLLAAAHALGDYKRYII
SENITEKLKPIVFTFFNGEVWDYIGSSKMVYDMERDSFPYSLKKSNTIKNSSKPDDGAWT
SKFNLKNIAYFMEITQVGLSDKIYAHTDPVSLKDNVTMNKVEEMLKYTKESFENAFMPFD
VVNQSLKQPLPPASFQRFLRSYKKIPGVVLADHDKEFINKFYNSRFDNLDNVGLYVKSIN
NVSYLKIHGPLVKRLTNLSEAVANSLYLLASGGIPPKQRIVVPANLTANLLYCLMISANC
PSYKEVLGKKSNPLPNVPMSRYVSVLQIDNPITQVIHRLLSYYTGEWLEETQCENKAKTS
LPYAFSYFAVTGRGSMVCVRSTTYMTPAVSPAFELQDYHSSEYSTWAESMWNSDIGMQMY
LVASPASETGVLFTGIVIFAISFALVYLINRNVEVLFTPTPSM
NT seq
2112 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgcttcttctatggtgttggttttgcttatttgtttaaataattatgtttcatca
tctaaaattgaatttaaaatatataaatccattaaaagttattctccttgtattctgctg
acgaatgcaactcatcaagttggttgtacatcaaatatgggtggtaatcgtggtatcttg
catgttgttgaaagtgatgatgatgtggattggctgattgataaaggaaccaatcaacct
tatattcctttacttaattcctctttttttaatgaaaatgttatgaataaactcatgaat
tctaaaaagatatctggagttcttgtggttcacaagtcaacaacagttttgccaacatcc
ttttcacctgactctaaatgtcctttggatcagtttggtgcttactcaaatgacaaagag
aatggaaattgtcaaaagattaagtggaatccgactgggaatgatatgtcaaaaaagtat
tatggaataccaatatttgcactagccgatggagaagaaattaatgagctcgtcaaatgt
taccaaaagcacaacaagctaaaggaagcagaagcaactcctagttttccactttgtgca
attgaaatgaaagactttatgtttgcttccaaagacacaccaacatgtcgtcgaaaaact
gaaatgccaaaccctattcagagtacatactgtgaccctcttggagataacaacatctat
gggagtctttttccaatggttgataaaattgaaaatgatgaagttattatggctgcaact
aggcttgacagcacagcatttttccatgattttgcacctgctgctgataatggtgtgaca
ggtattgtgacacttcttgctgcagctcatgccttaggagattataaaagatacattatt
agtgaaaacatcactgaaaagttaaaaccaattgtatttactttttttaatggagaagtg
tgggactacattggttcatcaaagatggtatatgatatggagagagatagtttcccttac
agcttaaaaaaaagtaatacaataaaaaatagttcaaagcctgatgatggagcttggacg
agcaagtttaacctaaaaaatatagcttattttatggagataactcaggttggtttgagt
gataagatttatgctcatactgatccagtatcactaaaagataacgtaactatgaataag
gttgaagaaatgttaaagtatacaaaggaatcttttgaaaatgcttttatgccttttgat
gtagttaaccagtcattaaaacagcctttacctcctgcatcatttcaacgatttcttcgt
tcttacaaaaaaattcctggtgtggttttggctgatcatgacaaagaatttataaataag
ttttataatagtcgatttgacaatcttgataatgttggcctgtatgttaaatccatcaac
aacgtatcgtacctaaaaatacatggaccgctagtaaaaagattaaccaatctttctgaa
gctgttgctaattcactatatttactagcatctggtggaatacccccaaagcagcgaata
gttgttcctgccaacttgactgcaaatctactttattgtcttatgatatcagcgaattgt
cctagctataaagaggtacttggtaagaaatctaatccgttgccgaatgtacccatgtca
cgatatgtaagtgtcttacaaattgacaatcctattacccaagtaatccatcgtttactg
agttactacactggagagtggttggaggaaacacaatgcgaaaataaagccaaaacctct
cttccctatgctttctcgtactttgctgttaccggtcgagggtcaatggtgtgtgttcgc
tcgacaacatatatgacaccggcggtttcgccagcattcgaactgcaagattatcattca
tcagaatattcaacatgggctgaaagcatgtggaattccgatattggcatgcaaatgtat
ttagttgctagtcccgcgtcagagacgggtgtattgttcacgggaatcgttatatttgct
atctcgtttgctctggtttatttaatcaataggaacgttgaggtattgtttacgccgact
cctagcatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
