Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 101237623
Help
Entry
101237623 CDS
T01080
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC101237623
KO
K04984
transient receptor potential cation channel subfamily A member 1
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
hmg04040
]
101237623
Ion channels [BR:
hmg04040
]
Voltage-gated cation channels
Transient receptor potential channel (TRP)
101237623
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
Ank_5
Ion_trans
Ank_KRIT1
ANK_LRRK2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101237623
NCBI-ProteinID:
XP_047127742
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(41385032..41507425)
Genome browser
AA seq
2443 aa
AA seq
DB search
MANNVENPITQISPFNDKNKAELTSMYDANKPIQLLKIKNGFETQKNNSMNSFLLHQAAI
EGLIDQVKLLIKKSYYNIEEIDRINLQGCTPLHLASRFNRLKVVEYLLENGSQINKTTEE
ENNTPLLLAAKYNMTDIAKFLCEHGADVRIKNIHGSTALHLAASKGNIEICYALIQHGSD
INATDSRNCTPLHMAIHGGSETITKLLIENGADVYAKDAEGEGPIHYAAAMDQGELIILL
TKGALAIVDEENWEETQRKYVNLRTKKKDAALHIAAREGYLDTVKALVSIGANINICSAA
LYTPLHLAAINGNKDMVQYLLEHNAKINVFDHQNMTPTHKACQFGRLDVIKLLIEQGAQI
DSKDCDSFTPLMSAVSEGHSDAVKYLLKCGASVAISEMNMKNVLHLAIENGHSSTLKVLL
QNGGSFLINSHDMDFKRPIHYAAMSDFEEQRKRASKKRANYNEEEQNKKHEQGKLRMRAY
RQRQKALKESIEAHEETPYKTKSAEKRAINRVLFQVNSTMPHSPRKCAFVKHNVSQHLLG
KSPSNLIVSHRSTALSPEVVELVINFFQENDISRMAPGQRDFLKDGDKLIQKRHLQLTLR
EAHKRFQQSYKNVKIGKSKFASLCPKHVLLCAETPHNVCVCSIHYNFIHVVNVLAPYFES
IPLYDNEWTEVNAVCINPSEKCFFNECTFCQNAASFQHLAVENEEIMVSVSQWQKTTNEL
LGRKQFVKVTVTQSLISLLESVKILIQESADTEVTDNEEKTPLHIAAEYGKVDCLLKLVK
NSTRNINCTDEKGQSPLHLAAKNGWTDTSLVLIEMGAQISGRDDSNWTPLDYAARNGHTK
IVIALIKNGACVNEYDPNRLTPLHHASINGHVKCINILLNHGANISFQNADGKNCLDLAL
ENHHTEACRIFITHKRWKEVLNHIDNEGCSPMEKLISYAPEIAQIVLDKCIEYSKLDENS
EEYYIRYDFKYLDSHPENSSKRIYFGPSCMITFNQENLLSHPLTVQLINYKWSRLGRWIH
LISLFIYVLFVAMLTGLLIIDKEREKKEKNGFQKIIPTVILILSSFEICKEFVQAYLLKK
DYFKDFNNYLELILYSSTFIFMLSFIKHVTMNIKWTAGVFSILFAWTNLLLYLKRDTFFG
VYVVMIIEVLKSLINVIMVFVMIIIAFSLSFFVLFENSSFSSPEWSMVKTIVMTLGETDF
NDLFINNNTTVDNSDLPYPEMSYILFTLFLIVCPIVLMNLLVGLAVGNIADVRDSAYILM
LKAQVDILKALESRYPKKLLKKTYHEILTVYPNTVSWKKSFFQLFGIPDFNSLKDKQESR
SKWKTNIARDLELEHIEFDHLEKRIETIKMLMRKHLEITDDIIVALKISENLAAKEGAIE
RIRHIIEECKRNNSISSKEFVNVRDKLNEKGFSALHLAARYNNVNVVAYLLENGALIDSP
DRDDGNTPLLLAAKYKKTNTAVFLIEKGANVLIRNYFGTTALHYASRRGDKKLVIKILKI
PFVNINVEDDNLATPLHLAMNDGCKQVVNVLINNGANVLAKNNKGERPIHNAASSNADYT
RDYIVSNEISKKIQDFQHVPSSIAEDLIELLLRGALQNVSSEDYRKQKNDYVNSRTNENY
TPLHFAARCGNEKSLNKLIRIGGDVNAQTNTGSTPLHLAAISGHEKVVNMLITYKADIQS
VDKDLMTPLHRACQFGRLSVVRLLDEKRAILDVNDKKNYTPVMCAIWKGHLEVIKYLIGQ
GIQINSTDINYKNCIHIALKENQIEVIKFLLDNDQFNKMNSVDKNNRAPVHYAALKGNSQ
ALQLLINKNAPIDIGDNQEKTPLHLASEFGHLHCVKLLISTSPGEVNATDARGMTPLHLA
VLNDHRDVIKLLIVSGANVYLRDNLDWSSLDYAAQNGKEKSLNILLSALLKKDYVNASDK
NRYTPLHHAATEGHVECINLLLEHGANVQLQTNENKNCLYLAVENLQKEACMAIMQHERW
REALLSMDNSGTHVMKKMIELTPEVGEKALDNCIICSKLDIKNPDYSVEYNFEFIDKDPM
NPDNSFFAPLLMVKYKRGKLLSHPLVVELINQKWSRMGQWIYLCSLCFYLIFVSFLTALV
ILERINSKSEFPHQCKNHENHFAVVISWLTLSIACIQIFFKLILAAYIGRSYMFDPVKLL
EFFLYTSTALFMVSFVACKYNLEAMKRQSGSVSILLAWSKLMLYLENLPFLGLYFVMFTE
VLYTFLKVLLVFSILLIGFGLSFFTLLHNQQPFSGYFRSIVKTFVMMLGELTYGSTFKQE
NKKAHNEDLSIIIFLLFAIIMVIVVMNLLVGLAVGDIESVRKNAYLRVLQRKVYYLNILD
RTYPKFIQMFVYQKSYTKKPNIKSWYEKLMLWMGKFHKKGIEEKQFNAKKQLIMREVLSN
KGALLKQKQNTKLILYNLENQIEKTKKIAKSISQNSNVKIFFD
NT seq
7332 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaataatgtcgaaaacccaatcactcagatttcaccatttaatgacaaaaataaa
gcagaactcacaagcatgtatgatgcaaataaaccaattcaacttttaaaaatcaaaaat
ggttttgaaactcaaaagaacaactcaatgaatagttttttactccatcaagctgcaata
gagggtttaattgatcaagttaagttgcttattaaaaagagttattataacattgaagag
attgatcgcataaacttgcaaggttgcactccattgcatttagcatctcgatttaatagg
ttaaaagttgttgaatatttattagaaaatggatcacagataaacaaaactactgaagaa
gaaaataatactccacttctccttgctgcaaagtataatatgacagatatcgcaaagttt
ttatgtgaacatggtgcagatgttaggataaaaaatatccatggttctactgctcttcat
ttagcagctagtaaaggaaatatagaaatttgctatgctttgattcaacacggttctgat
ataaatgctacagacagcagaaattgcacaccacttcatatggcaattcatggaggcagt
gaaactataacaaagttgcttatagagaatggtgcagatgtttatgcaaaagatgctgaa
ggggaggggcctattcattatgctgctgctatggatcaaggagagctaattattttacta
acaaaaggagctcttgcaatagttgatgaagagaactgggaagaaacacaaagaaagtat
gtcaatctaagaactaaaaaaaaagatgctgcacttcacattgctgctcgggaaggttat
ttagatacagtaaaggccttggtgtctattggtgccaatataaatatttgttctgctgcg
ctttatacgccattgcatcttgcagcaataaatggcaataaagatatggttcaatatctg
ttagaacataatgccaaaataaatgtgtttgatcaccaaaatatgactcctacacataag
gcatgtcagtttggcagattagatgtaataaaattgttaattgaacaaggagcacaaatt
gactctaaagattgtgattcttttactccgcttatgtcagctgtttcagaaggtcatagt
gatgctgttaaatatttgttgaaatgtggagcgagtgtggccataagtgaaatgaatatg
aaaaatgttcttcatttagcaatagaaaacggtcatagttcaacacttaaggtcctttta
caaaatggaggttcttttttaattaattcacatgatatggactttaaaagaccaatccat
tatgctgctatgagtgattttgaggagcaaagaaagagagcgagcaaaaagagagcaaat
tacaatgaggaggagcagaataagaagcatgaacaaggtaaattaaggatgcgagcatat
agacaaagacaaaaagcattgaaagagtcaatagaagcacatgaagaaactccatacaag
acaaagagtgctgagaaacgtgccatcaatagagttctatttcaagtcaattcaacaatg
cctcattctccaaggaaatgtgcatttgtcaagcataacgtttctcaacacttattagga
aagtctcccagcaatcttattgtgtcacaccgttcaactgctttgtctcctgaagtggta
gagcttgtgataaatttttttcaagagaatgatatctcaagaatggcaccaggacaaaga
gactttcttaaagatggtgacaaattaattcaaaagagacatcttcagctaacattaaga
gaggctcacaagcggtttcagcagtcgtacaaaaatgtaaaaattggaaaatcaaaattt
gctagtttatgtccgaaacatgttttactctgtgctgagacacctcacaatgtctgtgtc
tgttctattcactacaactttatacatgtagtgaatgtgttagcaccatactttgaatcc
attcctctttatgataatgaatggacggaagtcaatgctgtttgtatcaacccatcagaa
aagtgcttcttcaatgaatgcacattctgccaaaatgctgcatcttttcagcaccttgca
gtcgaaaatgaagaaataatggtcagcgttagtcagtggcagaaaacaacaaatgagctt
ctaggcagaaaacaatttgttaaggtgaccgtgactcagtcgttaattagccttcttgag
tcagtcaaaatacttattcaggaatcagctgatactgaagttactgataatgaagaaaaa
actccattgcatattgcagctgagtatggaaaggttgattgtttgctaaaattagtcaaa
aactcaacaagaaatataaattgtactgatgagaaaggacagtcacctttgcatttagct
gcaaaaaatggctggacagatactagtttggttctaattgaaatgggtgctcaaatttca
ggacgagatgattcaaactggacaccacttgactatgctgcaagaaatggacatacaaaa
attgtgatagctcttattaaaaatggcgcttgtgtaaacgaatatgatccaaacagacta
acccctcttcaccatgcttctattaatggacatgttaagtgtataaacattttattgaat
catggtgcaaacatatcatttcagaatgcagatggaaaaaattgtcttgatctagcttta
gaaaatcatcatacagaagcttgcaggatatttatcacacataaaagatggaaagaggta
cttaaccatattgataatgaaggatgcagtccaatggaaaaattgatatcatatgctcct
gaaattgctcaaattgttctagacaagtgcatagaatactctaaacttgatgaaaattct
gaagaatactacataagatatgactttaaataccttgattctcatcctgaaaattcatca
aaaagaatttattttggaccttcttgcatgatcacattcaatcaagaaaacttactttct
catccacttacggttcaattaattaattataagtggtcacgtctgggtcgctggattcac
ttaatcagcttgtttatttatgttttgtttgtggctatgcttactggtctacttatcatt
gataaagaaagagagaaaaaagaaaaaaatggatttcaaaaaataatccctacagtgata
cttattctatcaagttttgaaatttgtaaagagtttgtacaggcttacttattgaagaaa
gactattttaaagacttcaacaattacttggagttaatactttactcatctacttttata
tttatgttgtcatttattaaacatgtcactatgaatataaagtggactgctggagtattt
tcaattttatttgcttggactaatttgttactttacttaaaacgagataccttttttgga
gtttatgttgttatgattattgaagttttaaaatcgttgattaatgttattatggtattt
gtgatgatcattatagcattctctttatcattttttgttctttttgaaaattcatctttt
tcctctcctgaatggtctatggtaaaaaccattgtcatgacacttggggagactgatttt
aatgacttgttcataaataacaatactacagttgataatagtgatttaccatacccagaa
atgtcatatatcttgttcacattgttcttgattgtttgccctatagtacttatgaacttg
ttagttggtttagctgtaggtaatatagctgatgttagagattcagcttacatactaatg
ttgaaagctcaagttgatattctaaaagcacttgagtcaagatatcctaaaaaattgctg
aaaaaaacttatcatgagatacttactgtttaccctaacactgtttcctggaaaaaaagt
ttttttcaactgtttggtattcctgacttcaattccttaaaagataaacaagaaagtaga
tccaaatggaaaacaaacattgcaagagatttagaattggaacatattgagtttgatcac
ctagaaaaaagaatagaaacaataaaaatgttgatgagaaaacatctagagataacagac
gatataattgttgctctgaagattagcgaaaaccttgcagcaaaagaaggtgcaattgag
cgtattcgacacatcattgaggaatgtaaaagaaataactcaatatcatcaaaagaattt
gttaatgttagagataaattaaatgagaaaggttttagtgctttacatttagctgcacga
tataataatgtaaatgttgtggcatatctgctggaaaatggggctttaattgatagtcca
gatagagatgatggtaatacacctttactattggcagcaaaatataaaaagacaaatact
gctgtgtttcttattgaaaaaggtgcaaatgtcttgatcagaaattattttgggacaaca
gcattgcactatgcaagtagacgtggtgataaaaagcttgtaataaagattcttaaaatc
ccatttgttaacattaatgtagaagatgacaatttggctactcctctacatctagcaatg
aatgatgggtgtaaacaggtagtgaatgttcttataaataatggagccaatgtacttgct
aaaaataataaaggagaaagaccaattcataatgctgcatcttccaatgcagattataca
agagattacattgtgtcaaatgaaataagtaaaaaaattcaagattttcaacatgttcct
tcatcaatagcagaagatcttattgagttacttctcagaggagctcttcaaaatgtttct
tcagaagactacaggaaacaaaaaaatgactatgtaaacagtagaactaacgagaattat
acacctttgcattttgcagcacgttgtggtaatgaaaaatcattaaacaagttaataaga
attggtggagatgttaatgcgcaaacaaatactggttcaactcctttacatttggctgca
atcagtggacatgaaaaggttgtgaatatgcttataacctataaagctgatattcaatca
gttgataaagatttgatgacacctctgcacagggcatgtcaatttggacgattatcagtt
gtaagattgttagatgagaaaagagccatacttgatgtcaatgataaaaaaaattatact
cctgttatgtgtgctatatggaaaggacatttagaagttataaagtatttaattggtcaa
ggtattcaaataaattcaactgatattaactacaaaaattgcattcatattgcacttaaa
gaaaatcaaatagaagttataaaatttttattggataatgatcaatttaacaaaatgaac
agcgtggataagaataatagagcacctgtacattatgcagctttgaagggaaatagtcag
gcattgcaacttttaattaacaaaaatgctcccatcgatataggtgataatcaagaaaag
acacctcttcatttagcatctgagtttggtcatttacattgtgtaaaactgcttatttct
acctctcctggtgaagtaaatgcaactgatgctcgtggaatgactccacttcatttggca
gttttaaatgatcacagagatgtaataaagctactaattgtgtctggcgctaatgtttac
ttacgtgataatcttgactggagttctttggattatgctgcacaaaatggtaaagagaag
agtttgaacattttgcttagtgctctgctcaaaaaagattatgttaatgcttctgacaaa
aatcgttatacacctcttcatcatgcagcaactgaaggccatgttgaatgcataaattta
ttgttagagcatggagctaatgttcagttacaaacaaatgaaaataaaaattgcttgtac
cttgcagttgaaaacttacaaaaagaagcatgtatggcaattatgcaacatgaacgatgg
cgtgaagcacttcttagtatggacaatagtggaacacatgttatgaaaaaaatgattgag
ctaactccagaagtcggagaaaaggcactagataactgcattatatgttctaaacttgat
atcaaaaatcctgactattcagttgaatacaattttgaatttatagataaggaccctatg
aatcctgataattcattttttgcaccattactaatggtaaaatataaacgcggaaagttg
ttgagccatccccttgttgttgaacttatcaatcaaaagtggtctcggatgggtcaatgg
atttatttatgctcgctttgtttttatttaatatttgtttcatttcttaccgcacttgta
attttagaaagaattaattctaaaagtgagttccctcatcaatgcaaaaatcacgaaaat
cattttgctgtggttatctcatggttgactcttagtatagcatgtattcaaatttttttt
aaattaatattagctgcatatattggtagaagttacatgtttgatcctgttaaattacta
gagttctttttgtacacatcaacagccttgtttatggtttcttttgttgcttgcaagtac
aacttagaagccatgaagcgacaatcaggatctgtttcaattttacttgcgtggtcaaag
ctaatgctgtatttggagaatttaccttttcttggcttatattttgtcatgtttacggag
gttttgtacacatttttaaaagttttgttagtcttcagcattcttctaattggttttggt
ttgtcgttttttacattactccataatcagcaaccatttagtggttatttccgttcaatt
gtgaaaacatttgttatgatgcttggagagttaacttatgggtccacctttaaacaagaa
aataaaaaagcgcataatgaggatctctctataataatttttcttctatttgctattatt
atggtcattgtagttatgaatttacttgttggtttagctgttggtgatatcgaatccgtg
cggaaaaatgcatacctaagagttttgcagagaaaagtttattacttaaacatattagat
cgaacttatcctaaattcatccaaatgtttgtgtatcaaaaatcatatacaaaaaaacct
aacattaaaagctggtatgaaaagttaatgctttggatgggtaagtttcataaaaaagga
atagaagagaaacagtttaatgctaaaaaacaattgataatgcgtgaagttttatcgaat
aaaggagccttattgaagcagaagcaaaatacaaagcttattttatataatcttgaaaat
caaattgaaaaaacaaaaaaaatcgctaaatctatttcacaaaattccaacgttaaaatt
ttttttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system