Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 105844068
Help
Entry
105844068 CDS
T01080
Symbol
LOC105844068
Name
(RefSeq) Fanconi anemia group D2 protein isoform X1
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FancD2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105844068
NCBI-ProteinID:
XP_047146076
LinkDB
All DBs
Position
14:20397459..20526136
Genome browser
AA seq
1405 aa
AA seq
DB search
MVRSSRRPQSLLSNSFQSDRKKQKISDLADNPLCVLVTKCGFIFSDNINQPNELGVDQIM
FQKDLSKALKNINEELKSNLINGLMDLWKDHKRFCFSLLPTISADICVNSSRGKQQESFV
RLLLGISYLQTPVAIALLEKMPEISIDEELIKTAEELGDINLHQRMVDQLRWLDKIYDSK
VLVEKVFEIISISDVNAQREIILCVPDFMDESNHDEVVGNLHQLLCSNSQLTSSLMEAFS
CINLKTNLLEQVRDSAIKILDSADISNIAGIVKFLQQSLNDKSVHQIVAKIREKVDFNSS
SLRYTPAHRTKEENNEKQHMDGIFNAIKTGILFQKIIADEWVKVLESISNSKEQKVLDVF
VLLVLVRNKTKSKVIETLMRAKIKKKIFTECTIGLAFKEYYNIFSEYLHEILYLAESFIR
SPEAIVSSYGTCLYTMSFICFNNESKQKIVEALVTHITGNTHSAELEVAMSILCYLMSEH
YEKICSFATTIKKIGEFIENISVSQMRKLFSVLAKLSYGSVNCDSNDDLQEMIFRNLSSS
IWRLKRIGIIGAMMVVATLGKIANDFTNEKSTLNESRLLEKNTFNNKKAVQYLTVAQESV
KAQPEALSLFYDELASIVLREKLDPKLLAWISEKTFIDFQNEFLLDVEFIKTSNDHQMQL
SFDLDHTEEGGISINILPLIINKIMDKNGERVSSQAKTKNKLIYLHSHFRLIQVCEKKQN
GSLDGIDALLGCPLVLFDERTLETFPIMNEQDRIVVCSTFINAINWLREVINAFTIESAS
YETQVKIVSRLKTLVALTETLQLHLVITPNFKLPLVDYSIDDDLLSSIKPIKVLADAKLF
KKPKKSKLKKKVQANDENEDPEKSSDKEDKLFENIEKDSINQSILLSNFPASLRPLDLDI
FYILTYKNVLQCVANKMKKDNQKEVLSSNEIIFLLKDFRMKLEHALQSNNRSLFLKQSIT
KLVGFSNLPCATNVMKFYMKLQPSLFIIFNNCYNYFEKILSDNDGVIDSKEMKSLDTRQM
QMIYQLLFDCLHIVLQWDGFETELNEESLMMILQCFTKNKAKSPLQDLAREFFQSIVSFS
ATVTSIHLAATLLKILLLTLKWNVEKETIKKKIRDIAVSFLEKSWFDNNGEKDKGPLFNT
NLSYLIKLSITLSEEPLTAINDICNNVCNGLIVDPEKKNIDVFIKSLPSLTKNTLLTCYK
CLFEELNTITKLNISTVLSDAVMANMTSDANIVEKMVKVETSIKVFHVLVDIVKNTESHA
LLGSALKYSRIYLETFLKYAMPFLEKTLRLQKDLVHAILKNLQQSTRLLQHLCGHTKFEK
SSSLTAFVPALKKCLETFVYRVKALLAYNNCENAFWLGNLKNRDLKGNEISSQVESSIAD
DESATEVDDEEIMDEGDENENSESF
NT seq
4218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtacgatcatcaaggcggccacagtctttactgtctaattcatttcaaagtgataga
aagaagcagaagatatctgatcttgctgataacccactttgtgttttagtcacaaaatgt
ggttttattttttccgataatattaatcaaccaaatgagctaggtgtcgatcaaattatg
tttcaaaaagatttatcgaaagctttaaagaatataaatgaagagttaaagtctaatctt
atcaatggccttatggatttgtggaaagaccacaaaagattttgctttagcttgttgcct
acaatttcagcagatatatgtgtaaatagctctcgtggtaaacaacaggaaagctttgtt
cgtttacttcttggaatttcttatttgcagactccggtagcaattgctttacttgaaaaa
atgcctgagataagcatagatgaggagctgataaagacagctgaggagctaggtgatatt
aaccttcatcaaagaatggttgaccaattgcgttggttagataaaatatatgatagcaag
gtacttgttgaaaaagtctttgaaataatatcaatctctgatgtaaatgctcaacgtgaa
attattttatgtgtgccagattttatggatgaaagcaaccatgatgaagtagttggtaat
cttcaccaattgctatgcagtaactctcaattgacatcatctcttatggaagcatttagt
tgcattaacttaaagacaaatcttcttgaacaagttcgtgattcagctataaaaatttta
gattctgctgacatcagcaatattgcaggaattgtcaaatttttgcagcagtctctaaat
gataaaagtgttcatcaaattgttgctaagatacgtgaaaaagttgactttaactcatca
agcttaagatatactccagctcatagaacaaaagaagaaaacaatgaaaaacaacatatg
gacggcatctttaatgctattaaaactggaattttgtttcaaaagataattgctgatgaa
tgggttaaggttctggaatcaatatcaaacagcaaagagcagaaggttttagatgttttt
gtattattggtgcttgttagaaacaaaacaaagagtaaagtcattgaaacacttatgcgt
gcaaagattaaaaaaaaaattttcactgagtgcactattgggcttgcatttaaagaatat
tataatatttttagtgaatatctgcacgaaatcctgtacttggcggaatcatttattaga
tcacctgaagctattgtttcaagttatggaacctgtctgtacactatgtcttttatatgt
tttaataatgagtctaagcagaaaattgttgaagctttggtcacgcatattactgggaac
actcacagtgcagagctagaggttgctatgtccatactttgctatctaatgtctgaacat
tacgaaaagatttgctcatttgcaactacaatcaagaaaattggagagtttattgaaaat
atatctgtgtcacaaatgagaaaattgttttcagtattagcaaaattatcttatggatct
gttaattgtgattcaaatgatgatcttcaagaaatgattttcagaaatctatcaagttca
atatggcgtcttaaaagaattggtataattggagctatgatggttgttgcaactcttggt
aaaattgcaaacgatttcacaaacgagaagagtacactaaatgaaagtagattactggaa
aaaaatacatttaataataaaaaggcagttcaatatttaacagtagctcaagaaagtgtt
aaggcccaacctgaagctttgtctttattttatgatgaacttgcaagtatcgtcttgaga
gaaaaactggatccaaaattgttggcttggatatctgagaagacttttatagattttcag
aatgaattcctattggatgttgaatttataaaaacaagcaatgaccaccagatgcaactt
tcttttgatttggatcatacagaggaaggaggaatctctatcaatatacttcctttaatt
atcaataaaataatggataaaaatggcgaaagagttagctcgcaagcaaaaacaaaaaat
aagctcatttatttacattctcattttcgtttgatacaagtttgtgaaaagaaacaaaat
ggtagtttggatggtattgatgctttactaggctgtccattggttcttttcgatgagcgt
acactagaaacatttccaattatgaatgaacaagatagaattgttgtgtgctctacattt
ataaatgctattaactggttacgtgaggtcataaacgctttcactattgagtctgccagt
tatgaaacacaagtaaagattgtaagtcgcttgaagactctagtagcgttaacagagact
ttgcagttgcatttagttattactcctaactttaaacttccactggtagactacagcatt
gatgatgatcttttgtctagtataaagccaatcaaggttttagctgatgcaaaactattc
aaaaaacctaaaaaaagcaaactaaaaaaaaaagttcaggcaaatgatgaaaatgaagat
cctgaaaaaagttctgacaaggaagataaactttttgaaaatatagaaaaagattcaatc
aaccagtcaatattgttatcaaactttccagcatctttgaggcctttggatttagatata
ttttatattctaacatataaaaatgttttacagtgtgttgcaaataaaatgaaaaaagat
aaccagaaggaagtcctttcctcaaatgaaataatttttttgttgaaagattttcgaatg
aagcttgaacatgctttacaatctaataatcgaagtttatttttaaagcaatccatcaca
aagttagttgggttttcaaatttaccatgtgccacaaatgtcatgaagttttatatgaag
ctgcaaccttcattgtttattatttttaataattgttataattattttgagaaaattcta
tcagataatgatggtgttatagattctaaagaaatgaaatctctagatactagacagatg
cagatgatatatcagctgctttttgactgtctgcatattgttttgcaatgggatggtttt
gaaactgagcttaatgaagaaagtttaatgatgatacttcaatgttttacaaaaaataaa
gccaaaagtccacttcaagatttagcaagagagttctttcaaagtattgtgtcattcagt
gcaacagtaacatctattcatttggcagccactttgctgaaaattctacttttgacttta
aaatggaatgttgaaaaggagacaattaaaaaaaaaattagagatattgctgtttcattc
ctggaaaaatcttggtttgacaataatggagaaaaggataaaggaccgttgtttaataca
aacctttcatatcttatcaagctcagcataactctttcagaagaaccattgaccgctatt
aatgatatatgtaacaatgtttgcaatggactaatagtggacccagaaaagaaaaatatt
gatgtgtttataaaaagtttaccttcattgacaaaaaatactttactaacttgttataaa
tgcttatttgaggagttaaatactattactaaacttaacatttcaacagtactatcagat
gcagtaatggcaaacatgacatcagatgcaaatattgtggagaaaatggttaaagtagaa
acatcaataaaagtttttcatgttcttgttgacattgtcaagaatacagagagtcacgct
ttattgggttctgcattaaaatactcacggatttatcttgaaacatttttaaagtatgca
atgcctttccttgaaaagactcttcgtttgcaaaaggacctagttcatgcaattttaaaa
aatcttcaacaaagtacacgcttattgcaacacttgtgtggtcatacaaagtttgaaaaa
agctcatcactaactgcatttgtcccagccctaaagaaatgtttggaaaccttcgtatac
agagtaaaagccttgcttgcctacaataattgcgaaaatgcattttggctaggcaatcta
aaaaatcgtgacttaaaaggcaacgagatctcatctcaggtagaaagtagcattgcagat
gatgagtcggcaactgaggtggatgatgaagaaataatggatgagggtgatgaaaacgaa
aacagtgaaagtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
