Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 105847033
Help
Entry
105847033 CDS
T01080
Symbol
LOC105847033
Name
(RefSeq) fibropellin-1 isoform X1
KO
K17307
fibulin 1/2
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
105847033 (LOC105847033)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
hmg04147
]
105847033 (LOC105847033)
Exosome [BR:
hmg04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other cancer cells
105847033 (LOC105847033)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
cEGF
CUB
FXa_inhibition
EGF_CA
Ldl_recept_a
EGF
EGF_3
CUB_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105847033
NCBI-ProteinID:
XP_047124234
LinkDB
All DBs
Position
12:56321366..56405189
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MKKRLWHLVFAFINCYSVETLTKNEECQFILNEESGTVKSPRYPKPYSNNLNCSWKITVP
NGRQIILTVNKFQIESSYNCESDALYIYDGPNDKANLYSKPYCGTNAPSVIKSKSNDLFL
RFITDNLDNNIGFLIQYNSVKICDYELEKSNGTFTSPNFPQYYYANANCSYLIKAKIGKT
IVLQFTNVVLENEVNGNCLDSISVYDIINNEIKLLKKFCGSPHLIQEFHSSYNQMLVKFH
SDDLINKPGFFANYYSLNTKCQQNEFQCANDKCIALNLECNHKKDCDDNSDEIGCHCQEF
QCLNEKCIESKYVCDGLNQCGDGSDESQCSNPTTVKTQLVSSKPVICGYADFKCNNDKCI
RYTQRCNGQNDCGDNSDESSCIGFCKNSNGGCDHICEYDLKNGVQCSCYLGFKLDSNRQS
CIDINECSSRPCPEHCTNEYGSFKCGCNPGFQLQDDQRTCVDIDECASNINLCEQQCINQ
VGSFNCTCFSGYLYKNKVCEDINECEINNGGCAEKCINTIGSFICSCNWDGHKMLKDNTS
CEDIDECADGSSKCDHFCKNTDGSFECSCQPGFYLDHDGKKCVDVNECHVGTPGCLGNCI
NTKGSYICKCAEGYRSINNETSCEDVNECEILNGGCSHRCENTKGSYICKCREGYTARDH
SSFTCNDKNECEDNPCEGTCTNYIGTFECGCETGFQLVAQVKCQDIDECMSTELNKCEHT
CVNIPGSYFCTCRDDYILHSDKMSCKKSVASIGCQRTAINIKEISSSGWDNVLDGWGWQV
SLNIDFTHFTTPRFNCMGILVSEEFILITGHCLRFSDDIKIPPQIILVSLGSYTFGFYDN
ENNIHASEIIYHPTLDLALIRMLEKPTISNQIQPICLPQTVHDVDISQDKEIIVVTWLPD
HASLRHIVAKIVKHECCEQDIKINQENLVNQSLCIQFNKTEFHLPMSGSPILGISREVSN
QTDQKWLLTGILIRGSYHPDVELVSTKSCVGYYKAVMFVDWIRNITLN
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacgactttggcatttagttttcgcttttattaattgttattcagtggaaact
ttaacaaaaaatgaagagtgtcaatttatattaaatgaagagagtggcacagtgaaaagt
ccaagatatccaaagccatattccaacaacttaaattgctcatggaagataactgtacca
aatggtcgtcaaattattctcacagttaataagtttcaaatagaaagcagttataactgt
gaatcagatgctttgtacatttatgatggtccaaatgacaaagctaatctttattctaaa
ccatattgtggcactaatgctccatctgttattaaatccaaaagcaatgatttgtttctt
cgctttataactgacaatttagataataatattggatttttaatacaatataattcagta
aaaatatgtgattatgagcttgaaaaatcaaatggtacttttacttcacccaatttccct
caatactattacgctaacgctaattgctcatatctaattaaagcaaagatcggaaaaaca
attgtacttcagtttaccaatgttgttttggaaaacgaggtaaatggaaactgtttggat
tctatcagcgtttatgatataatcaataatgaaattaaacttttaaagaaattttgtgga
tcaccccaccttattcaagaatttcattcatcgtataatcagatgctagtcaaatttcat
tcagatgatttaatcaataaacctggtttttttgcaaactactacagtcttaatactaaa
tgccaacaaaatgaattccaatgtgccaatgataaatgtattgctttgaatcttgagtgc
aatcataaaaaagattgtgatgataattcagatgaaattgggtgtcactgccaagaattt
caatgtttaaatgagaaatgcattgaatcaaagtatgtttgcgatggcttaaatcaatgt
ggtgatggcagtgatgaaagtcaatgctcaaacccaacaactgtcaaaactcaattggtt
tcatcaaaacctgttatctgtggttacgcagactttaaatgtaacaatgataaatgcata
cggtatactcagcgatgcaatggccaaaacgattgtggagacaacagtgatgaaagtagt
tgcattggtttttgtaaaaattcaaatggtggttgtgatcatatttgtgaatatgaccta
aagaatggtgtccagtgttcctgctatttaggctttaagcttgattctaatcgtcagtct
tgtatagatattaatgagtgttcttcacggccttgtcctgaacattgtacaaatgaatat
gggtctttcaaatgtggttgtaatccaggatttcaattacaagatgatcaacgtacatgt
gttgatatagacgagtgtgcatctaatataaatctgtgtgagcaacaatgcatcaaccaa
gttggttcatttaattgtacttgtttcagtggttatttatacaaaaacaaagtttgcgaa
gatatcaatgaatgtgaaataaataatggggggtgtgctgagaaatgtattaatacaatt
ggaagtttcatttgcagttgcaattgggatggtcacaaaatgttaaaagacaacacctca
tgtgaagatattgatgaatgtgctgatggctcatcaaagtgtgaccatttctgcaaaaat
acagatggaagttttgagtgtagctgtcaacctggtttttatttggaccatgatggaaaa
aaatgtgtggatgttaatgaatgtcatgtaggaacaccaggctgtctaggaaactgtatt
aataccaaaggaagctacatatgtaaatgcgcagaaggttatagatcaattaacaatgag
acaagttgcgaagatgtgaatgagtgtgaaattttaaatggaggttgttcacatcggtgt
gaaaatacaaaaggaagttacatttgtaaatgtcgagaaggctatacagcaagagatcat
agttccttcacttgtaatgacaagaatgaatgtgaggacaatccttgcgaaggtacttgc
acaaattatatcgggacatttgaatgtggatgtgaaactggttttcaacttgtagctcaa
gtaaagtgtcaagatattgacgaatgcatgtctacagagttaaacaagtgtgaacacact
tgtgtcaacattcctggcagttatttttgcacatgtcgtgatgattatatcttgcactca
gataaaatgtcttgcaaaaaatctgttgctagcataggttgtcagagaactgctataaat
ataaaagagatttcttcaagtggatgggataatgtcttggatgggtggggatggcaggtg
tcattaaatattgattttactcacttcactacaccaagatttaattgtatgggaatactt
gtgagtgaagagtttattcttatcactggtcactgtttgcgttttagtgatgatataaaa
attcctcctcaaatcattcttgtttcattgggcagttatacgtttggtttttatgataat
gaaaacaacattcatgcaagcgaaataatttatcatccaacattggacttggctttaatt
cggatgttagagaaaccaacaatatccaatcagattcaacctatttgtttacctcaaaca
gtacatgatgttgatatatctcaagataaagaaattatagttgtaacttggttaccagat
catgcaagtttacgccatattgttgctaaaattgtgaaacatgagtgttgtgaacaagat
ataaaaattaaccaagaaaatctagttaatcaatctttatgtatacagtttaacaaaaca
gagtttcatctcccgatgagtggctcgccgatcctgggaatatcacgtgaagtcagtaat
caaactgatcaaaaatggttgctgacaggaattcttatacgtggttcttatcatccagac
gttgaattagtttcgacaaaatcctgtgtcggctattataaagcagtaatgtttgttgat
tggatacgtaacataaccctcaactaa
DBGET
integrated database retrieval system