KEGG   Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 105848862
Entry
105848862         CDS       T01080                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC105848862 isoform X1
  KO
K11592  endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-]
Organism
hmg  Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hmg00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:hmg03036]
    105848862
Chromosome and associated proteins [BR:hmg03036]
 Eukaryotic type
  Gene silencing
   RISC (RNA-induced silencing complex)
    105848862
   microRNA pathway
    RISC loading complex
     105848862
SSDB
Motif
Pfam: Ribonuclease_3 Ribonucleas_3_3 Dicer_dsRBD PAZ
Other DBs
NCBI-GeneID: 105848862
NCBI-ProteinID: XP_047132511
LinkDB
Position
5:20239701..20292914
AA seq 1183 aa
MESKSYFVYLVFGRKKISSLMFKLVRSLDNDYKVMILYCNHMHNTTLDTLHMCRRFLFAD
NALSSYNFNEFYTDCVSHSLCSDNNNPAIILNICLQDDCLFQFKSLCCLLPAHLKLYVFV
EFCEKQYAIMNIEDFFPTALWRFWTNCLVNSYLDSPVQVAIRDISELDYGITFWGYVAQL
LLKEIFLKLNSEKNDGSSTKISVFVTETQIQAAAVYDNILRFFNELQLYFESSIVFISSL
VQPKFSCQTLAVITCKEIFFNIPLFACKHLILYHSVHCYTEWIQLKKKAKKAERCTVISD
NDEKFKLFNRIDEELRCKMNTMTPHKRNSMKNLRNEISYDFSILPENLLQVNSNIKTEDL
QIASEDLNTKDKHHTYVYVVSFSDSKTKESDLIGLCVNAPLPFIFPFVLFDHYQPNNVKI
KFGFEYNMKSSEMELIKKFMHFIFHAVLKMTVMSYDGYLCVLLHLENGVHKIDFNKMSSM
IAAQMNLCETKINLLKNRQGFKTYDRNIYEVTNKTNEIKIVENICNNTLKVSLNGPSCLT
DCVKSCHHMLENKDIRIKKFYEKHYNTLFIQIHVSKECFFHLDRAKSEKTILASDPFPDN
SKAVSYKEYFMKRYNLFINDDDLMAPLNYFKPKFNALNKKVSNKKRTIIYLPLSFLCPVD
FIGLGLLCCFCLMPSVVFYIKLNLNVFHIHSSINNFSKEKCFSLDYFTHEECDISLTLGT
APNNVSSNKSVYSESQSEDILKTHHFFLQSLVAANAALDINNDLLEFLGDSVLKYIITAE
LHLAFPGVKSTQLVFYRNKILSNKYLSELGFLRHMDKIIIFEIFEPAKAFSSNNSSKIRT
ILEKLSLNDANERLLANVVEAFIGACFLTLPQDSLYNVFRYFGFNIMKLSLLHKNGYYRA
NYPLECASFKRVEAFKSLELKLGYKFQNPTLYFNACLHHSYADVLYLNGKKNEFDIDAAI
KLGTNECLELIGDAVLDILVTKEIFSRNNISGANKSGNLSFIRSAIVNTYTFSVLATDLE
LHKHLIFSSYKLSQKIIDWLNVFEEMKKTGNLYNKATFNSFVAFHNNQFVEVPKELANIY
EAIAGAVYLDTDGNLDEVWRVFFPFMKSLIDFVYNTIPQSILQLLSEAHPDVSFKELPPQ
VNGEYTCVMSYDKEEFVATAKSYRIAKSILAVKVFEKLKNSSV
NT seq 3552 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaagtaagagctattttgtttatctggttttcggcagaaaaaagatttcaagttta
atgtttaagctagtgagatctttagacaacgattataaagttatgattttgtattgtaat
catatgcataacacaacattggatactcttcacatgtgcagaagatttttgtttgctgat
aatgcattatcaagttataactttaatgagttttacactgattgtgtgtctcatagcctt
tgcagtgacaacaacaaccctgcaattatattaaatatttgtttacaagatgattgctta
tttcagtttaaatcattatgctgtttattaccggcccatttgaaattatatgtatttgta
gagttttgtgaaaagcaatatgctattatgaatattgaagatttttttccaacagctcta
tggagattttggaccaattgtttggttaacagttatctggactctccagttcaggttgcc
attagagatatttctgaattagattatggaattacattttggggatatgttgcacaacta
ttattgaaagaaatttttttaaaactaaattcagaaaaaaatgatgggagttcaacaaaa
atatctgtgtttgttacagaaacacaaatacaggcagctgctgtatatgataacatcctt
aggttctttaatgagctgcagttatatttcgaatcttcgattgtttttatctcaagttta
gtacagccgaagtttagttgtcagacccttgctgtaattacttgtaaagaaatctttttt
aatattcctctgtttgcttgcaagcatttgatactgtatcattcggtgcattgttacaca
gaatggatccagttaaaaaaaaaagcaaaaaaagcagaacgatgcactgttatatctgat
aatgatgaaaagtttaagttgttcaatagaattgatgaagagcttcgatgtaaaatgaat
accatgacaccacacaaaagaaatagcatgaagaatttaagaaatgaaatcagttatgac
tttagcattcttccagagaatttacttcaagttaatagtaatattaagactgaagacctt
cagatagccagtgaagatctaaatactaaagataagcaccatacttatgtgtatgtagtt
tctttttctgattcaaaaacaaaagaatctgatttaattggactttgtgtaaatgcacca
cttccttttatttttccgtttgtactttttgaccactatcaaccaaataatgtaaaaatt
aaatttgggtttgagtataacatgaaatcaagtgaaatggaattgattaaaaagtttatg
cactttatttttcatgctgtgctgaaaatgacagtgatgagctatgatggttatttgtgc
gtcttattgcatttagagaatggagtacataaaattgatttcaacaaaatgagttctatg
attgcagcgcaaatgaatttatgtgaaacaaaaataaacctccttaaaaatagacagggc
tttaaaacctatgacagaaatatatatgaagtgacgaataaaacaaatgaaattaaaatt
gttgaaaatatttgtaacaacactttgaaagtgtctttgaatggaccaagttgtttaact
gattgcgttaaaagttgtcatcatatgctagaaaataaagatataagaataaaaaagttt
tatgaaaaacattacaatactctttttatacagattcatgtctccaaagaatgttttttt
catttagaccgcgcaaaatctgaaaaaacaattttagcctcagacccatttcctgataat
tcaaaagccgtctcttacaaagaatattttatgaaaagatataatttatttattaatgat
gatgacctgatggctcctttaaattattttaaaccaaaatttaatgctttaaacaagaag
gttagtaataaaaaaagaactataatatatttaccattatctttcctatgtccagtggac
tttattggcttgggtttgttgtgctgtttttgtttgatgccttctgttgttttttatatt
aagcttaatttaaatgtttttcacatacatagttcaataaataatttctcaaaggaaaaa
tgcttttccttggattattttactcatgaagaatgtgatattagtttaactttgggtact
gctccaaataatgtttcatcaaataaaagtgtctattcagaaagccagtcagaagatatt
ttaaaaactcatcatttttttttacagtctcttgtggcagcaaatgctgctttagacatc
aacaatgacttgcttgagtttttaggtgattcagttctgaaatacataattacagcagaa
ttacatttggcttttcctggtgttaaaagcacacaattagttttttatagaaataaaatt
ttgtcaaacaaatatttatctgaactaggatttttaaggcatatggacaaaataataata
tttgaaatatttgaacctgctaaagcattttcatcaaataattcaagtaaaattcgcact
atcttagaaaaattgagtttaaatgatgcaaacgaaagattacttgcaaatgtagttgaa
gcttttattggtgcatgttttttaacattgcctcaagattcgctttacaatgtgtttaga
tattttggctttaacataatgaaactgtcgttgttacataaaaatggctactatagggct
aattaccctttagaatgtgcatcatttaaaagagtagaagcatttaaatctcttgaatta
aaattaggctacaagtttcaaaacccaactctatatttcaatgcatgtttacaccacagc
tatgctgatgtgttatatttgaatggaaaaaaaaacgaatttgacattgatgctgccatc
aagctgggaactaatgaatgtttagagttaattggcgatgctgttcttgacatattagtt
acaaaagaaatatttagcagaaacaatatatcaggtgctaacaaaagtggcaatctttct
tttattcgctctgccatagttaatacctacactttctctgtattagccactgacttggaa
ttacataaacatttgatttttagctcttacaagttgtcgcaaaaaataattgattggctt
aatgtatttgaggaaatgaaaaagactggaaatctctataataaagcgacatttaattca
tttgtagcttttcacaacaatcaatttgtagaagtacctaaagaattagcaaatatttat
gaagctattgctggtgctgtttacttagatactgatggtaacttagatgaagtttggcgt
gtgttttttccatttatgaagagtttaatagattttgtttacaacactattcctcaatct
attttacaattacttagtgaggcacaccctgatgtttcttttaaagagctcccgcctcaa
gtgaacggcgaatatacttgtgtcatgtcttatgacaaagaagaatttgttgccactgca
aaatcttatcgcatcgcaaaatcgattttagccgtaaaggtttttgaaaaactaaaaaat
agttcagtttga

DBGET integrated database retrieval system